6dvr

Crystal structure of human CARM1 with (R)-SKI-72

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone-arginine methyltransferase CARM1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 146–489 链 B； UniProt 146–489	未记录	HDG (2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) × 2 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5	分辨率 1.54 Å R-free 0.215
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 146–489 链 B； UniProt 146–489	未记录	HDG (2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) × 8 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5	分辨率 1.54 Å R-free 0.215

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6DVR	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2Y1W CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482 链 B 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482 链 C 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482 链 D 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482	未记录	SFG SINEFUNGIN × 4 849 2-{4-[3-FLUORO-2-(2-METHOXYPHENYL)-1H-INDOL-5-YL] PIPERIDIN-1-YL}-N-METHYLETHANAMINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE.	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
2Y1X CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482 链 D 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 845 N-(3-{5-[5-(1H-INDOL-4-YL)-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-PYRAZOL-1-YL}BENZYL)-L-ALANINAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
2Y1X CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482 链 C 135–482（348 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 845 N-(3-{5-[5-(1H-INDOL-4-YL)-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-PYRAZOL-1-YL}BENZYL)-L-ALANINAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
4IKP Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with methylenesinefungin 提交 2012-12-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480 链 B 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480	未记录	4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 25	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Di-AMMONIUM TARTRATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.231
4IKP Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with methylenesinefungin 提交 2012-12-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480 链 D 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480	未记录	4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Di-AMMONIUM TARTRATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.231
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	突变：aa 134-479 突变：aa 134-479	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	突变：aa 134-479 突变：aa 134-479	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 1.93 Å R-free 0.238
5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 1.93 Å R-free 0.238
5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 1.94 Å R-free 0.246
5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 1.94 Å R-free 0.246
5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.07 Å R-free 0.244
5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 2.07 Å R-free 0.244
5DXJ Crystal structure of CARM1 and sinefungin 提交 2015-09-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.231
5DXJ Crystal structure of CARM1 and sinefungin 提交 2015-09-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.231
5U4X Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with TP-064 提交 2016-12-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480 链 B 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 7VM N-methyl-N-[(2-{1-[2-(methylamino)ethyl]piperidin-4-yl}pyridin-4-yl)methyl]-3-phenoxybenzamide × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M Tris pH8.5	分辨率 1.88 Å R-free 0.215
5U4X Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with TP-064 提交 2016-12-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480 链 D 140–480（341 aa）片段：UNP residues 140-480	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 7VM N-methyl-N-[(2-{1-[2-(methylamino)ethyl]piperidin-4-yl}pyridin-4-yl)methyl]-3-phenoxybenzamide × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M Tris pH8.5	分辨率 1.88 Å R-free 0.215
6ARJ Crystal structure of CARM1 with EPZ022302 and SAH 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW4 methyl 2-[2-{2-chloro-5-[(2R)-2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy]phenyl}-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350	分辨率 1.92 Å R-free 0.212
6ARJ Crystal structure of CARM1 with EPZ022302 and SAH 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW4 methyl 2-[2-{2-chloro-5-[(2R)-2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy]phenyl}-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350	分辨率 1.92 Å R-free 0.212
6ARV Crystal structure of CARM1 with Compound 2 and SAH 提交 2017-08-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 B 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW7 (2R)-1-amino-3-{3-[4-(morpholin-4-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-yl]phenoxy}propan-2-ol × 2 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
6ARV Crystal structure of CARM1 with Compound 2 and SAH 提交 2017-08-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479) 链 D 134–479（346 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW7 (2R)-1-amino-3-{3-[4-(morpholin-4-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-yl]phenoxy}propan-2-ol × 2 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
6D2L Crystal structure of human CARM1 with (S)-SKI-72 提交 2018-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 146–489（344 aa）链 B 146–489（344 aa）链 C 146–489（344 aa）链 D 146–489（344 aa）链 E 146–489（344 aa）链 F 146–489（344 aa）	未记录	FTG (2S,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-hydroxyphenyl)ethyl]hexanamide × 6 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.236
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 145–477（333 aa）	未记录	XJ2 (2R)-1-(methylamino)-3-(1,3,4,5-tetrahydro-2-benzazepin-2-yl)propan-2-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 145–477（333 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 145–477（333 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 145–477（333 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 145–477（333 aa）链 B 145–477（333 aa）链 C 145–477（333 aa）链 D 145–477（333 aa）	未记录	XJ2 (2R)-1-(methylamino)-3-(1,3,4,5-tetrahydro-2-benzazepin-2-yl)propan-2-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6S70 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM251 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KYB 1-[5-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]pentyl]guanidine × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 24 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.211
6S70 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM251 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KYB 1-[5-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]pentyl]guanidine × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 24 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.211
6S71 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor WH5C 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KYE (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(5-carbamimidamidopentyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 20 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.06 Å R-free 0.210
6S71 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor WH5C 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KYE (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(5-carbamimidamidopentyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 20 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.06 Å R-free 0.210
6S74 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM305 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KY8 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyrimidin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.216
6S74 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM305 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KY8 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyrimidin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.216
6S77 Crystal structure of CARM1 N265Y mutant in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	突变：N265Y 突变：N265Y	KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 26 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.12 Å R-free 0.246
6S77 Crystal structure of CARM1 N265Y mutant in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	突变：N265Y 突变：N265Y	KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 26 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.12 Å R-free 0.246
6S79 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
6S79 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
6S7A Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA175 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KY5 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350	分辨率 1.86 Å R-free 0.220
6S7A Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA175 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KY5 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350	分辨率 1.86 Å R-free 0.220
6S7B Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM249 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KYH 1-[4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]butyl]guanidine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M potassium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.66 Å R-free 0.227
6S7B Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM249 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KYH 1-[4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]butyl]guanidine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M potassium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.66 Å R-free 0.227
6S7C Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM079 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 135–479（345 aa）链 C 135–479（345 aa）	未记录	KY2 1-[3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]propyl]guanidine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 21 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.233
6S7C Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM079 提交 2019-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 135–479（345 aa）链 D 135–479（345 aa）	未记录	KY2 1-[3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]propyl]guanidine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 21 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.233
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 142–477（336 aa）	未记录	XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 142–477（336 aa）	未记录	XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 142–477（336 aa）	未记录	XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 142–477（336 aa）	未记录	XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 142–477（336 aa）	未记录	XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 142–477（336 aa）	未记录	XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 142–477（336 aa）	未记录	XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 142–477（336 aa）	未记录	XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0	分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7U9I Co-crystal structure of human CARM1 in complex with MT556 inhibitor 提交 2022-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 146–489（344 aa）链 B 146–489（344 aa）	未记录	44T 7-[5-S-(4-{[(4-ethylpyridin-3-yl)methyl]amino}butyl)-5-thio-beta-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2M di-Sodium Tartrate	分辨率 2.00 Å R-free 0.267
8G2H Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1113 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–480（341 aa）片段：methyltransferase domain	未记录	YVU 5'-S-[2-(benzylcarbamamido)ethyl]-5'-thioadenosine × 2 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate, 0.05 M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400, 0.002 M Spermine	分辨率 1.49 Å R-free 0.177
8G2I Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1290 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–480（341 aa）片段：methyltransferase domain	未记录	I0B 5'-([2-(benzylcarbamamido)ethyl]{3-[N'-(3-bromophenyl)carbamimidamido]propyl}amino)-5'-deoxyadenosine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.1 M BICINE pH 9.0, 2.0 M Magnesium chloride hexahydrate	分辨率 2.17 Å R-free 0.225
8SIG Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-288 提交 2023-04-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–480（341 aa）片段：methyltransferase domain	未记录	GWU 5'-{(3-aminopropyl)[2-(benzylcarbamamido)ethyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 2 NA SODIUM ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400	分辨率 1.78 Å R-free 0.199
8SIH Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-289 提交 2023-04-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–480（341 aa）片段：methyltransferase domain	未记录	I1K 5'-{[2-(benzylcarbamamido)ethyl][3-(N'-cyclopentylcarbamimidamido)propyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 2 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；3.5 M Ammonium chloride, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.246
8UQH X-ray crystal structure of PRMT4 bound to compound YD-1130 提交 2023-10-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 139–479（341 aa）链 B 139–479（341 aa）链 C 139–479（341 aa）链 D 139–479（341 aa）	未记录	X9L 5'-S-(2-{[(3-bromophenyl)methyl]amino}ethyl)-5'-thioadenosine × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；7.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1M Tris, 0.08M sodium formate, pH 7.5	分辨率 1.87 Å R-free 0.253
9O37 The structure of PRMT4 in complex with YD1305 提交 2025-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 145–477（333 aa）片段：UNP Residues 145-477	未记录	A1B7X 5'-{[2-(benzylcarbamamido)ethyl](3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M calcium acetate hydrate, 0.1M HEPES: NaOH, pH 7.5, 10% (w/v) PEG 8,000	分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–476（331 aa）	未记录	A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350	分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 146–476（331 aa）	未记录	A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350	分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 146–476（331 aa）	未记录	A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350	分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 146–476（331 aa）	未记录	A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350	分辨率 1.97 Å R-free 0.269

共 32 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CARM1_HUMAN
Isoform	Q86X55-1
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–344； UniProt 146–489 作者链 B； PDB构建体 1–344； UniProt 146–489

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6dvr
沉积日期 deposition_date	2018-06-25
结构标题 title	Crystal structure of human CARM1 with (R)-SKI-72
关键词 keywords	CARM1, PRMT4, SKI-72 inhibitor, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone-arginine methyltransferase CARM1
分子量 formula_weight	38976.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.319
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6056

AVQYFQFYGYLSQQQNMMQDYVRTGTYQRAILQNHTDFKDKIVLDVGCGSGILSFFAAQAGARKIYAVEASTMAQHAEVLVKSNNLTDRIVVIPGKVEEVSLPEQVDIIISEPMGYMLFNERMLESYLHAKKYLKPSGNMFPTIGDVHLAPFTDEQLYMEQFTKANFWYQPSFHGVDLSALRGAAVDEYFRQPVVDTFDIRILMAKSVKYTVNFLEAKEGDLHRIEIPFKFHMLHSGLVHGLAFWFDVAFIGSIMTVWLSTAPTEPLTHWYQVRCLFQSPLFAKAGDTLSGTCLLIANKRQSYDISIVAQVDQTGSKSSNLLDLKNPFFRYTGTTPSPPPGSHY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;(2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) ;
分子量 formula_weight	618.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL
分子量 formula_weight	296.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	UNKNOWN ATOM OR ION
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	405

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d6dvra_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

结构域编号 domain_id	d6dvrb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family family	c.66.1.6 — Arginine methyltransferase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6dvrA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

结构域编号 domain_id	6dvrB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11 — Hnrnp arginine n-methyltransferase1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	74.366 Å
晶胞边长 b length_b	98.579 Å
晶胞边长 c length_c	207.375 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.540 Å
最低分辨率 resolution_low	44.560 Å
R 因子 r_factor	0.1949
R_work r_work	0.1946
R_free r_free	0.2152