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6ekc

Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)

UniProt Q8DIS5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 11 与蛋白数一致
10 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 7 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 12 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 7 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 8 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 10 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 10 与蛋白数一致
7 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 11 与蛋白数一致
8 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 10 与蛋白数一致
9 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein × 8 （Q9SN73） ZINC ION × 16 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2ybv 3zxw 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc

共 12 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RBL_THEEB
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 A8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 Q8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S1； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S2； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S3； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S4； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S5； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S6； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S7； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 S8； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475

DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9SN73

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 11 与蛋白数一致
10 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 7 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 12 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 7 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 8 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 10 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 10 与蛋白数一致
7 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 11 与蛋白数一致
8 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 10 与蛋白数一致
9 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （Q8DIS5） ZINC ION × 16 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
6ekb

共 1 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 6ekc 8ilb 8ilm

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9SN73_ARATH
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 B8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 D8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 F8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 J8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 L8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 N8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T1； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T2； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T3； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T4； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T5； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T6； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T7； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 T8； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ekc
沉积日期 deposition_date2017-09-26
结构标题 titleCrystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus
关键词 keywordszinc finger, assembly chaperone, assembly intermediate, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ekc__assembly_8__model_1

Assembly 8 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ekc__assembly_8__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ekc__assembly_8__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）48.44 Å
Rg（电子密度）47.42 Å
总 Rg47.81 Å
原子数32120
残基数4160
排除体积569410 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6ekc__assembly_1__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6ekc__assembly_2__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 6ekc__assembly_3__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 6ekc__assembly_4__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 6ekc__assembly_5__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 6ekc__assembly_6__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 6ekc__assembly_7__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 6ekc__assembly_8__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 6ekc__assembly_9__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 6ekc__assembly_10__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)