SAXSdb — 6ilz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C iota type

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 249–588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 249–588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 249–588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 249–588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6ILZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VD2 Solution Structure of the PB1 domain of PKCiota 提交 2004-03-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 16–99（84 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride；压力 ambient NMR样品组成 1mM PKCiota PB1 U-15N, U-13C; 50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 5mM ditiothreitol; 0.05%(w/v) sodium azide; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM PKCiota PB1 U-15N, U-13C; 50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 5mM ditiothreitol; 0.05%(w/v) sodium azide; 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
1WMH Crystal structure of a PB1 domain complex of Protein kinase c iota and Par6 alpha 提交 2004-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 16–99（84 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；sodium formate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.224
1ZRZ Crystal Structure of the Catalytic Domain of Atypical Protein Kinase C-iota 提交 2005-05-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 224–587（364 aa）片段：catalytic domain, residues 224-587	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	BI1 3-{1-[3-(DIMETHYLAMINO)PROPYL]-1H-INDOL-3-YL}-4-(1H-INDOL-3-YL)-1H-PYRROLE-2,5-DIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 400, sodium acetate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.333
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588 链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588 链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
5LI1 Structure of a Par3-inhibitory peptide bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 248–596（349 aa）片段：UNP residues 246-589	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 K POTASSIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
5LI9 Structure of a nucleotide-bound form of PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 FMT FORMIC ACID × 7 IMD IMIDAZOLE × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；25% Morpheus precipitant mix 4, 10% Morpheus Carboxylic acids, Morpheus Buffer system 1	分辨率 1.79 Å R-free 0.231
5LIH Structure of a peptide-substrate bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 3.25 Å R-free 0.284
5LIH Structure of a peptide-substrate bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 3.25 Å R-free 0.284
8R3X Crystal structure of aPKC Iota kinase domain with LLGL2 peptide 提交 2023-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 241–596（356 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
8R3X Crystal structure of aPKC Iota kinase domain with LLGL2 peptide 提交 2023-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 241–596（356 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
8R3Y Cryo EM structure of a stable LGL/aPKC Iota/Par-6 complex 提交 2023-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 248–585（338 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4 ul of aPKCiota-Par6-Llgl1 complex at a concentration of 0.4 mg/ml was applied to R1.2/1.3 Quantifoil 300 mesh copper grids which had been glow-discharged for 45 s at 45 mA . Grids were blotted for 2.5 s at 100% humidity using an FEI Vitrobot MK IV.	分辨率 3.68 Å
9EJK Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6b complex in nucleotide-free form. Head sub-complex region subtracted 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9EJL Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in nucleotide-free form. Conformation with visible head sub-complex. 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9EJM Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in its ADP-bound form 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å

共 14 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KPCI_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–345； UniProt 249–588 作者链 C； PDB构建体 6–345； UniProt 249–588 作者链 E； PDB构建体 6–345； UniProt 249–588 作者链 G； PDB构建体 6–345； UniProt 249–588

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ilz
沉积日期 deposition_date	2018-10-21
结构标题 title	Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor
关键词 keywords	Kinase, Atypical kinase, phosphorylation, inhibitor, PKCiota, iota type, kinase domain, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.75 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.44 Å
零角强度 I(0) i0	287145000.00
分子量 molecular_weight	137010.0 kDa
排除体积 excluded_volume	170880 Å³
包络体积 envelope_volume	244370 Å³
水化壳体积 shell_volume	52769 Å³
包络直径 envelope_diameter	132.2 Å
壳层 Rg shell_rg	44.14 Å
包络 Rg envelope_rg	38.41 Å
形状 Rg shape_rg	39.43 Å
总 Rg total_rg	39.79 Å
总原子数 total_atoms	9673
残基数 n_residues	1260
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	131.3 Å
Rg (实空间) rg_real	39.68 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.12 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.8710e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.7390e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.73 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	287200000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8927
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	52.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.241
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.457
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	55010000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.898; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.914

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6ilzA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzE02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	6ilzG02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	87.870 Å
晶胞边长 b length_b	87.630 Å
晶胞边长 c length_c	105.181 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	114.69 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.261 Å
最低分辨率 resolution_low	51.579 Å
R 因子 r_factor	0.3096
R_work r_work	0.3057
R_free r_free	0.3477

描述 description	Protein kinase C iota type
分子量 formula_weight	39854.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	9673

Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C iota type

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

描述 description	2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide
分子量 formula_weight	374.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

fit	/app/data/saxs_computation/il/6ilz/6ilz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/il/6ilz/6ilz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/il/6ilz/6ilz.dat