SAXSdb — 6jly

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–341 链 B； UniProt 1–341	未记录	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6JLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5B04 Crystal structure of the eukaryotic translation initiation factor 2B from Schizosaccharomyces pombe 提交 2015-10-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 1–341（341 aa）链 B 1–341（341 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG200MME, sodium chloride, Na/K phosphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.271
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–341（341 aa）链 B 1–341（341 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.35 Å R-free 0.253

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EI2BA_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341 作者链 B； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt Q9UT76

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–393 链 D； UniProt 1–393	未记录	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6JLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5B04 Crystal structure of the eukaryotic translation initiation factor 2B from Schizosaccharomyces pombe 提交 2015-10-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 C 1–393（393 aa）链 D 1–393（393 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG200MME, sodium chloride, Na/K phosphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.271
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–393（393 aa）链 D 1–393（393 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.35 Å R-free 0.253

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	EI2BB_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 7–399； UniProt 1–393 作者链 D； PDB构建体 7–399； UniProt 1–393

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt P56288

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–458 链 F； UniProt 1–458	未记录	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6JLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5B04 Crystal structure of the eukaryotic translation initiation factor 2B from Schizosaccharomyces pombe 提交 2015-10-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–458（458 aa）链 F 1–458（458 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG200MME, sodium chloride, Na/K phosphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.271
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–458（458 aa）链 F 1–458（458 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.35 Å R-free 0.253

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	EI2BG_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 F； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt Q09924

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–467 链 H； UniProt 1–467	未记录	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6JLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5B04 Crystal structure of the eukaryotic translation initiation factor 2B from Schizosaccharomyces pombe 提交 2015-10-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 G 1–467（467 aa）链 H 1–467（467 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG200MME, sodium chloride, Na/K phosphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.271
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–467（467 aa）链 H 1–467（467 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.35 Å R-free 0.253

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	EI2BD_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467 作者链 H； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt P56287

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–678 链 J； UniProt 1–678	未记录	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6JLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5B04 Crystal structure of the eukaryotic translation initiation factor 2B from Schizosaccharomyces pombe 提交 2015-10-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 I 1–678（678 aa）链 J 1–678（678 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG200MME, sodium chloride, Na/K phosphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.271
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–678（678 aa）链 J 1–678（678 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.35 Å R-free 0.253

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	EI2BE_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–678； UniProt 1–678 作者链 J； PDB构建体 1–678； UniProt 1–678

Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P20459

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 1–304 链 M； UniProt 1–304	未记录	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6JLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1Q46 crystal structure of the eIF2 alpha subunit from saccharomyces cerevisia 提交 2003-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–176（175 aa）片段：N-terminal two thirds of eIF2a	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate (pH=4.6), 1.8-2.5 M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.86 Å R-free 0.236
2A19 PKR kinase domain- eIF2alpha- AMP-PNP complex. 提交 2005-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 4–176（173 aa）片段：eIF2alpha	突变：residues 4-175	MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.286
2A1A PKR kinase domain-eIF2alpha Complex 提交 2005-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 4–176（173 aa）	突变：residue 258-551	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric	链 j 1–300（300 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)	分辨率 4.00 Å
3JAP Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2015-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).	分辨率 4.90 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 j 3–265（263 aa）	未记录	7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 j 3–265（263 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.75 Å
6I3M eIF2B:eIF2 complex, phosphorylated on eIF2 alpha serine 52. 提交 2018-11-06	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	突变：serine 52 to SEP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：serine 52 to SEP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging	分辨率 3.93 Å
6I7T eIF2B:eIF2 complex 提交 2018-11-17	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging	分辨率 4.61 Å
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–304（304 aa）链 M 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol	分辨率 3.35 Å R-free 0.253
6QG0 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 1) 提交 2019-01-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QG1 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 2) 提交 2019-01-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QG2 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model A) 提交 2019-01-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.55 Å
6QG3 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model B) 提交 2019-01-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
6QG5 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model C) 提交 2019-01-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.10 Å
6QG6 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model D) 提交 2019-01-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–304（304 aa）链 L 1–304（304 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.40 Å
8QEL PKR kinase domain- eIF2alpha in complex with compound 提交 2023-08-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–176（173 aa）	未记录	UH3 (3~{Z})-3-[(4-methyl-1~{H}-imidazol-5-yl)methylidene]-2-oxidanylidene-1~{H}-indole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MOPS pH 7.5, 10% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate	分辨率 2.45 Å R-free 0.278
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric	链 j 1–304（304 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IF2A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304 作者链 M； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6jly
沉积日期 deposition_date	2019-03-07
结构标题 title	eIF2a - eIF2B complex
关键词 keywords	Translation Initiation, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	56.12 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	55.54 Å
零角强度 I(0) i0	2836850000.00
分子量 molecular_weight	452700.0 kDa
排除体积 excluded_volume	569570 Å³
包络体积 envelope_volume	830100 Å³
水化壳体积 shell_volume	121790 Å³
包络直径 envelope_diameter	196.0 Å
壳层 Rg shell_rg	59.64 Å
包络 Rg envelope_rg	55.40 Å
形状 Rg shape_rg	55.53 Å
总 Rg total_rg	55.67 Å
总原子数 total_atoms	31811
残基数 n_residues	4044
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	186.4 Å
Rg (实空间) rg_real	56.02 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.52 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.8370e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3990e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	56.18 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2837000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8814
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	66.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.273
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.432
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	275600000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.834

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha
分子量 formula_weight	37817.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	31811

MVESDSSGIVRHSQGEFDIVQVYKKFLQDDPEITMPVAAIEALVQLLSRSQAKTISEFMDILQNGSNTLKEGVQNNISLSAGCDIFQRFVTRSLHDVGDFEQCKRHLVENGKLFIQRARACRQRIAHLGYPLIRDGSVILTHGFSRGVAAVLLAAAKRHVRFKVFVTESRPSGSGCLMTRTLKNACIPTCMVLDSAVSFTMNRVDLVLVGAEGVVENGGLINQIGTFQLAVFAKHAHKPFYAVAESHKFVRMFPLSQYDIPFSRPILEFDDPSPETVHPEPEPIPTPSDAIHNELIMNEEQIRNNPTLDVTPPEFVSGLITDLGIIDSKSGVSEELIKLYL

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta
分子量 formula_weight	43897.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GPISEFMSTINVEHTYPAVSSLIADLKSRKVQGPFAVAVETALVMRQVISQTRWSTVDQLIDTVRAVGSTLVKAQPTEFSCGNIIRRILRLIREEYQELLKTADENEKLIVSSSNSSSPSQKRDIPSNEKLVQSHEPVSVQMYSSMLNLLGRPTLESPTHSKTVGDSRVTGGMDMRAVIISGIQDVIDELDKINTDIEVQSMDHLHSNEIILTQGCSKTVEAFLRFAAKKRKFSVIVAEGFPNNQKGSHAMAKRLAQAGIDTTVISDATIFAIMSRVNKVILGTHAILGNGGLVTYSGAQLVAQAARHHATPVVVCSGIYKLSPVYPYDLESIIQLSSPDKIMSFNEGDLISRAEILNPYYDYIPPDLVDLFITNLGGYPPSYLYRIMNDTYDASDTIL

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma
分子量 formula_weight	50551.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MSLYEHAALPLASSPSILGPISGGRNRGNIQLQSIPIEFQAVVFAGFGNSLYPLTGSDALPKALLPIGNKPMLHYPLYWLEAAGFTSAILICMEEAEAHINAWLRSGYEGHMRIHVEAPTILDDSKSSADALRAVSHLIKNDFVCLSCDSIVGLPPYTVLDKFRLDNPSALAVYSPVLKYEHITSQSKEIDAKQLIGIEEKTSRLLYAKSSADVGSDFTFRMSLLWKHPRVTLNTNLSDAHIFVFKHWVIDLIREKESISSIRGDLIPYLVKCQYQKSFTVRENIQRFLSSPNNIDNYDGGLSSQEIKINALIAKDGIICSRANNLPNYFELNKCIAKLTPEQRLVDVTVSERALVGADCMVNEGTTIKDNSNIKKSIIGKNCVIGKGVVVSNSILMDNIVVEDGVRLESCIVASGAQIGAKSKLRECEIGVDHRVEAGRIARGERLVDMEKIETDMD

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta
分子量 formula_weight	51652.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

MGFSAEQAKKDGKDQSPVSESSSVGGTSPATASSVVSPNEPKLSGKEAKALKKARKQASRRAKAEAAAANNPPGVSEEKKVAIPNKNSNQQKKASKQNPQNSPETDANLQEKKIFEEKQVSIFSHLDWRRRRTTENIPKDIHPAVIRLGLKLANYKIFGSNQRCIDLLKTFKIVIQDYQTPYGTTLSRHLTTHINSQIAYLVSTRPLSISMGNAIRFLKLEISVLDIDLTDDEGKELLLEKIDSYIRDRIIIAGQVIVQAATEKIQDGDVILTYLHSSTVNDVLIHAKNVGKKFRVVVVDSRPEFEGRVCLKLLTEHGIECTYVMISALSYIMQEVTKIFLGGHAMLSNGALYSRAGTSLISLLGHESNVPVIACCESYKFTERIQLDSLVYNELAPGDQLVNMGVDDFEEKPGVLANWKSVKNLKLLSLKYDVTPPRLITVCVCEMGLLPSTSVPAIINEFKQVYA

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon
分子量 formula_weight	76413.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J

MPPSKGLNGKLEKPKHALQAIVLSDSYNYRFRPLTLDKPRCLLPLANTPLIEYTFEFLALAGVQEVYVFCCAHAGQIREYIEKSKWNLPSSPFSVNTIVSRESLSVGDALRELDSKQLITSDFILVSGDVVSNVPLNEVLKEHRKRREDDKNAIMTMVVREASPFHRTRARTESSVFVIDKKTSQCVHYQANERGKHYVSMDPEIFNEHEELEVRNDLIDCQIDICSNDVPALFTENFDYQDIRKDFVYGVLTSDLLGKKIHCHVAKENYAARVRSLQTYDAISKDVLSRWVYPFVPDSNLLNQTFSYQRHQIYKEEDVVLARSCIIKARTLIGAYTKVGDASVVANTIIGRNCTIGSNCSIDSAFLWEDVVIGDNCRIGKAILANSVKIGNNCSIEDGAIVAAGVVIGDNTIIEKNKRLTTFESHSQGTLNDPSLVGIGGRGQEYHAEEDSDDEGEFMEASGLIESTNELHLSDSESSETSSSSEEDMEFIPFSARRDSANTINSEDFDEGDFNKEAQQSLERAFEENHQIDIAALELNTLRMAMNANYHEVRSAIVLALLRRIMHLDVSPKEALAKVMTRWGPLLAKLTFSHEEQVDNVLTLQKYCVRLSMTRHFLQLLGYFYQLEIAEENAIQEWYSDPRSSEGELAALRDAGGKQFVDWLNTAESESESEEGSE

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha
分子量 formula_weight	34763.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

MSTSHCRFYENKYPEIDDIVMVNVQQIAEMGAYVKLLEYDNIEGMILLSELSRRRIRSIQKLIRVGKNDVAVVLRVDKEKGYIDLSKRRVSSEDIIKCEEKYQKSKTVHSILRYCAEKFQIPLEELYKTIAWPLSRKFGHAYEAFKLSIIDETVWEGIEPPSKDVLDELKNYISKRLTPQAVKIRADVEVSCFSYEGIDAIKDALKSAEDMSTEQMQVKVKLVAAPLYVLTTQALDKQKGIEQLESAIEKITEVITKYGGVCNITMPPKAVTATEDAELQALLESKELDNRSDSEDDEDESDDE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6jlyA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1070 — Translation initiation factor eIF-2B, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6jlyA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10470 — Translation initiation factor eif-2b; domain 2

结构域编号 domain_id	6jlyB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1070 — Translation initiation factor eIF-2B, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6jlyB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10470 — Translation initiation factor eif-2b; domain 2

结构域编号 domain_id	6jlyL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6jlyL02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — Translation initiation factor 2; subunit 1; domain 2

结构域编号 domain_id	6jlyM01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6jlyM02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — Translation initiation factor 2; subunit 1; domain 2

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	155.563 Å
晶胞边长 b length_b	207.992 Å
晶胞边长 c length_c	155.595 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.20 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.500 Å
最低分辨率 resolution_low	49.314 Å
R 因子 r_factor	0.2245
R_work r_work	0.2239
R_free r_free	0.2598

fit	/app/data/saxs_computation/jl/6jly/6jly.fit
pddf	/app/data/pr_computation/jl/6jly/6jly.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/jl/6jly/6jly.dat

eIF2a - eIF2B complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)