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6kif

Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA-flavodoxin supercomplex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 252.9 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

UniProt Q31LJ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–763 链 G； UniProt 1–763 链 e； UniProt 1–763 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 A 1–763（763 aa）
链 G 1–763（763 aa）
链 e 1–763（763 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAA_SYNE7
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–763； UniProt 1–763 作者链 G； PDB构建体 1–763； UniProt 1–763 作者链 e； PDB构建体 1–763； UniProt 1–763

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt Q31LJ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–734 链 H； UniProt 1–734 链 f； UniProt 1–734 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 B 1–734（734 aa）
链 H 1–734（734 aa）
链 f 1–734（734 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAB_SYNE7
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–734； UniProt 1–734 作者链 H； PDB构建体 1–734； UniProt 1–734 作者链 f； PDB构建体 1–734； UniProt 1–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt Q31QV2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–81 链 N； UniProt 1–81 链 g； UniProt 1–81 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 C 1–81（81 aa）
链 N 1–81（81 aa）
链 g 1–81（81 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAC_SYNE7
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 N； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 g； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II

物种未注明

UniProt Q31PI7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 2–142 链 O； UniProt 2–142 链 h； UniProt 2–142 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 D 2–142（141 aa）
链 O 2–142（141 aa）
链 h 2–142（141 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q31PI7_SYNE7
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 O； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142 作者链 h； PDB构建体 1–141； UniProt 2–142

Photosystem I reaction center subunit IV

物种未注明

UniProt Q31NL7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–75 链 Q； UniProt 1–75 链 i； UniProt 1–75 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 E 1–75（75 aa）
链 Q 1–75（75 aa）
链 i 1–75（75 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAE_SYNE7
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75 作者链 Q； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75 作者链 i； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75

Photosystem I reaction center subunit III

物种未注明

UniProt Q31NT9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–159 链 R； UniProt 1–159 链 j； UniProt 1–159 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 F 1–159（159 aa）
链 R 1–159（159 aa）
链 j 1–159（159 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q31NT9_SYNE7
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 R； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 j； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

Photosystem I PsaI protein

物种未注明

UniProt P95823

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 1–38 链 S； UniProt 1–38 链 k； UniProt 1–38 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 I 1–38（38 aa）
链 S 1–38（38 aa）
链 k 1–38（38 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P95823_SYNE7
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 S； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 k； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt Q31NU0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 1–41 链 T； UniProt 1–41 链 l； UniProt 1–41 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 J 1–41（41 aa）
链 T 1–41（41 aa）
链 l 1–41（41 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAJ_SYNE7
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41 作者链 T； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41 作者链 l； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

Photosystem I reaction center subunit PsaK

物种未注明

UniProt Q31PR9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 K； UniProt 1–84 链 U； UniProt 1–84 链 m； UniProt 1–84 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 K 1–84（84 aa）
链 U 1–84（84 aa）
链 m 1–84（84 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q31PR9_SYNE7
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84 作者链 U； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84 作者链 m； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

Photosystem I reaction center subunit XI

物种未注明

UniProt P95822

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 L； UniProt 1–166 链 V； UniProt 1–166 链 n； UniProt 1–166 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 L 1–166（166 aa）
链 V 1–166（166 aa）
链 n 1–166（166 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAL_SYNE7
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166 作者链 V； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166 作者链 n； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166

Flavodoxin

Synechococcus elongatus (strain PCC 7942)

UniProt P10340

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 P； UniProt 2–170 链 X； UniProt 2–170 链 p； UniProt 2–170 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 （P15347） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1CZH COMPARISONS OF WILD TYPE AND MUTANT FLAVODOXINS FROM ANACYSTIS NIDULANS. STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE REDOX POTENTIALS. 提交 1999-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：N58G SO4 SULFATE ION × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULPHATE, POTASSIUM PHOSPHATE, POTASSIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.86 Å R-free 0.209
1CZK COMPARISONS OF WILD TYPE AND MUTANT FLAVODOXINS FROM ANACYSTIS NIDULANS. STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE REDOX POTENTIALS. 提交 1999-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：D100N FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUN SULPHATE, POTASSIUM PHOSPHATE, POTASSIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.200
1CZL COMPARISONS OF WILD TYPE AND MUTANT FLAVODOXINS FROM ANACYSTIS NIDULANS. STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE REDOX POTENTIALS. 提交 1999-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULPHATE, POTTASIUM PHOSPHATE, POTASSIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.218
1CZN REFINED STRUCTURES OF OXIDIZED FLAVODOXIN FROM ANACYSTIS NIDULANS 提交 1999-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULFATE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.210
1CZO COMPARISONS OF WILD TYPE AND MUTANT FLAVODOXINS FROM ANACYSTIS NIDULANS. STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE REDOX POTENTIALS. 提交 1999-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：N58G SO4 SULFATE ION × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULPHATE, POTSSIUM PHOSPHATE, POTASSIM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.202
1CZR COMPARISONS OF WILD TYPE AND MUTANT FLAVODOXINS FROM ANACYSTIS NIDULANS. STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE REDOX POTENTIALS. 提交 1999-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：D90N FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUNM SULPHATE, POTASSIUM PHOSPHATE, POTASSIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.193
1CZU REFINED STRUCTURES OF OXIDIZED FLAVODOXIN FROM ANACYSTIS NIDULANS 提交 1999-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULFATE, POTASSIUM PHOSPHATE, POTASSIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.184
1D03 REFINED STRUCTURES OF OXIDIZED FLAVODOXIN FROM ANACYSTIS NIDULANS 提交 1999-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：N58G FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULFATE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.172
1D04 COMPARISONS OF WILD TYPE AND MUTANT FLAVODOXINS FROM ANACYSTIS NIDULANS. STRUCTURAL DETERMINANTS OF THE REDOX POTENTIALS. 提交 1999-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；AMMONIUM SULPHATE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.207
1OFV FLAVODOXIN FROM ANACYSTIS NIDULANS: REFINEMENT OF TWO FORMS OF THE OXIDIZED PROTEIN 提交 1992-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å
8HGQ The apo-flavodoxin dimer from Synechococcus elongatus PCC 7942 提交 2022-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–170（169 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4; 0.1 M imidazole PH8.0; 0.2 M NaCl
分辨率 2.09 Å R-free 0.239
8HGR The apo-flavodoxin monomer from Synechococcus elongatus PCC 7942 提交 2022-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–170（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 M Magnesium chloride; 0.1 M Tris-HCl pH8.5; 30% PEG4000
分辨率 1.84 Å R-free 0.201

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLAV_SYNE7
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 4–172； UniProt 2–170 作者链 X； PDB构建体 4–172； UniProt 2–170 作者链 p； PDB构建体 4–172； UniProt 2–170

Iron stress-induced chlorophyll-binding protein

物种未注明

UniProt P15347

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric（54） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–342 链 2； UniProt 1–342 链 3； UniProt 1–342 链 4； UniProt 1–342 链 5； UniProt 1–342 链 6； UniProt 1–342 链 Y； UniProt 1–342 链 Z； UniProt 1–342 链 a； UniProt 1–342 链 b； UniProt 1–342 链 c； UniProt 1–342 链 d； UniProt 1–342 链 q； UniProt 1–342 链 r； UniProt 1–342 链 s； UniProt 1–342 链 t； UniProt 1–342 链 u； UniProt 1–342 链 v； UniProt 1–342 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （Q31LJ0） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （Q31LJ1） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （Q31QV2） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （Q31PI7） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （Q31NL7） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （Q31NT9） Photosystem I PsaI protein × 3 （P95823） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （Q31NU0） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （Q31PR9） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （P95822） PsaM × 3 Flavodoxin × 3 （P10340） CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 12 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KIF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6KIG Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex 提交 2019-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：51-meric
链 1 1–342（342 aa）
链 2 1–342（342 aa）
链 3 1–342（342 aa）
链 4 1–342（342 aa）
链 5 1–342（342 aa）
链 6 1–342（342 aa）
链 Y 1–342（342 aa）
链 Z 1–342（342 aa）
链 a 1–342（342 aa）
链 b 1–342（342 aa）
链 c 1–342（342 aa）
链 d 1–342（342 aa）
链 q 1–342（342 aa）
链 r 1–342（342 aa）
链 s 1–342（342 aa）
链 t 1–342（342 aa）
链 u 1–342（342 aa）
链 v 1–342（342 aa）
未记录 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ISIA_SYNE7
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 2； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 3； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 4； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 5； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 6； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 Y； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 Z； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 a； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 b； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 c； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 d； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 q； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 r； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 s； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 t； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 u； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 v； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6kif

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6kif
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6kif
沉积日期 deposition_date2019-07-18
结构标题 titleStructure of cyanobacterial photosystem I-IsiA-flavodoxin supercomplex
关键词 keywordsPhotosystem, Antenna, Chlorophyll-binding protein, Membrane protein, Photosynthesis, iron stress-induced protein A, Flavodoxin; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier96.34 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron95.34 Å
零角强度 I(0) i034467100000.00
分子量 molecular_weight2020400.0 kDa
排除体积 excluded_volume2681600 ų
包络体积 envelope_volume3457300 ų
水化壳体积 shell_volume284010 ų
包络直径 envelope_diameter290.4 Å
壳层 Rg shell_rg93.12 Å
包络 Rg envelope_rg96.06 Å
形状 Rg shape_rg95.43 Å
总 Rg total_rg94.86 Å
总原子数 total_atoms144258
残基数 n_residues13395
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax252.9 Å
Rg (实空间) rg_real93.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.66 Å
I(0) (实空间) i0_real3.3110e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.1990e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal95.87 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal34410000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9121
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary94.8 Å
偏度 Skewness skewness0.189
峰度 Kurtosis kurtosis-0.707
角度范围 angular_range— – 0.0800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.9685
最高正则化参数 α highest_alpha3101000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.999; Stabil: 0.954; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (23)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)