6kzh

14-3-3 protein in Complex with CIC S173 phosphorylated peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 83.9 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3 protein theta

Homo sapiens

UniProt P27348

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 2–234 链 B; UniProt 2–234 未记录 CIC pS173 peptide × 2 (Q96RK0) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 分辨率 2.65 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 1433T_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 31–263; UniProt 2–234 作者链 B; PDB构建体 31–263; UniProt 2–234

CIC pS173 peptide

Homo sapiens

UniProt Q96RK0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 170–177 链 Q; UniProt 170–177 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 14-3-3 protein theta × 2 (P27348) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 分辨率 2.65 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CIC_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–8; UniProt 170–177 作者链 Q; PDB构建体 1–8; UniProt 170–177

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6kzh

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6kzh
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6kzh
沉积日期 deposition_date2019-09-24
结构标题 title14-3-3 protein in Complex with CIC S173 phosphorylated peptide
关键词 keywords14-3-3 protein, CIC, phosphorylation, transcriptional regulation, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier27.47
回转半径 Rg (电子) rg_electron26.63
零角强度 I(0) i048099500.00
分子量 molecular_weight53098.0 kDa
排除体积 excluded_volume66240 ų
包络体积 envelope_volume85394 ų
水化壳体积 shell_volume26831 ų
包络直径 envelope_diameter84.5
壳层 Rg shell_rg33.86
包络 Rg envelope_rg26.12
形状 Rg shape_rg26.64
总 Rg total_rg27.39
总原子数 total_atoms3723
残基数 n_residues469
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax83.9
Rg (实空间) rg_real27.41
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.56
I(0) (实空间) i0_real4.8100e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.3450e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal27.43
I(0) (倒空间) i0_reciprocal48100000.0000
解质量估计 total_estimate0.9148
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary31.8
偏度 Skewness skewness0.174
峰度 Kurtosis kurtosis-0.710
角度范围 angular_range— – 0.2900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha7802000.0000
实空间数据点数 n_real_points59
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.979; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.958

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd6kzha1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.7 — 14-3-3 protein
家族 Family familya.118.7.1 — 14-3-3 protein
结构域编号 domain_idd6kzha2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6kzhb1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.7 — 14-3-3 protein
家族 Family familya.118.7.1 — 14-3-3 protein
结构域编号 domain_idd6kzhb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)