6lx3

Cryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-2,Immunoglobulin heavy constant alpha 1

Homo sapiens

UniProt P01876

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 6 Immunoglobulin J chain × 1 (P01591) Polymeric immunoglobulin receptor × 1 (P01833) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IGHA1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 60–291; UniProt 122–353 作者链 B; PDB构建体 60–291; UniProt 122–353 作者链 C; PDB构建体 60–291; UniProt 122–353 作者链 D; PDB构建体 60–291; UniProt 122–353

Interleukin-2,Immunoglobulin heavy constant alpha 1

Homo sapiens

UniProt P60568

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 6 Immunoglobulin J chain × 1 (P01591) Polymeric immunoglobulin receptor × 1 (P01833) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–21; UniProt 1–21 作者链 B; PDB构建体 1–21; UniProt 1–21 作者链 C; PDB构建体 1–21; UniProt 1–21 作者链 D; PDB构建体 1–21; UniProt 1–21

Immunoglobulin J chain

Homo sapiens

UniProt P01591

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 6 Interleukin-2,Immunoglobulin heavy constant alpha 1 × 4 (P01876,P60568) Polymeric immunoglobulin receptor × 1 (P01833) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IGJ_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–159; UniProt 1–159

Polymeric immunoglobulin receptor

Homo sapiens

UniProt P01833

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 6 Interleukin-2,Immunoglobulin heavy constant alpha 1 × 4 (P01876,P60568) Immunoglobulin J chain × 1 (P01591) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PIGR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–565; UniProt 1–565

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6lx3
沉积日期 deposition_date2020-02-10
结构标题 titleCryo-EM structure of human secretory immunoglobulin A
关键词 keywordsimmunoglobulin, dimer, transcytosis, secreted, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6lx3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6lx3__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6lx3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)45.24 Å
Rg(电子密度)45.39 Å
总 Rg45.49 Å
原子数11503
残基数1490
排除体积204660 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6lx3__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd6lx3a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6lx3a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)
结构域编号 domain_idd6lx3b1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6lx3b2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)
结构域编号 domain_idd6lx3c1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6lx3c2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6lx3d1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6lx3d2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id6lx3A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3C01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3C02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3D01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6lx3D02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
▶

7. 引用文献 (1)