SAXSdb — 6mbb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bcl-2-related protein A1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–151	未记录	dF1 × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 1.59 Å R-free 0.196

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6MBB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2VM6 Human Bcl2-A1 in complex with Bim-BH3 peptide 提交 2008-01-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）片段：RESIDUES 1-149	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1M BIS, TRIS PH 5.8, 2M AMSO4	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
3I1H Crystal structure of human BFL-1 in complex with BAK BH3 peptide 提交 2009-06-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）片段：residues 1-151	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；1.5 M sodium malonate, pH 5.8 protein 1.67 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
3MQP Crystal Structure of human BFL-1 in complex with NOXA BH3 peptide, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR2930 提交 2010-04-28	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；296 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution: 1.5 M Sodium Malonate, 0.1 M sodium Acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 2.24 Å R-free 0.230
4ZEQ Crystal Structure of human BFL-1 in complex with tBid BH3 peptide, Northeast Structural Genomics Consortium Target HX9247 提交 2015-04-20	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；295 K；Sodium Malonate	分辨率 1.80 Å R-free 0.239
5UUK Human Bfl-1 in complex with a Bfl-1-specific selected peptide 提交 2017-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）片段：UNP residues 1-151	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0	分辨率 1.20 Å R-free 0.163
5UUL Human Bfl-1 in complex with PUMA BH3 提交 2017-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）片段：UNP residues 1-151	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0	分辨率 1.33 Å R-free 0.155
5UUP Human Bfl-1 covalently cross-linked to an electrophilic variant of a Bfl-1-specific selected peptide 提交 2017-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）片段：UNP residues 1-151	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0	分辨率 1.73 Å R-free 0.206
5WHH Crystal Structure of Bcl-2-related protein A1 in complex with stapled peptide (AQ7)T(0EH)LRRFGD(MK8)INFRQ(NH2) 提交 2017-07-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）	突变：C4S, C19S	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG3350 20%, 0.2M Sodium malonate	分辨率 2.38 Å R-free 0.293
5WHI Crystal Structure of Bcl-2-related protein A1 提交 2017-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）片段：BFL1	突变：C4S, C19S	CAD CACODYLIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG2000	分辨率 1.69 Å R-free 0.233
6E3I Human Bfl-1 in complex with the Bfl-1-specific designed peptide srt.F4 提交 2018-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0	分辨率 1.48 Å R-free 0.173
6E3J Human Bfl-1 in complex with the Bfl-1-specific designed peptide srt.F10 提交 2018-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 7.0	分辨率 1.48 Å R-free 0.178
6MBC Human Bfl-1 in complex with the designed peptide dF4 提交 2018-08-29	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；1.8 - 2.0 M NH4SO4, 50 mM MES pH 6.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.212
6RJP Bfl-1 in complex with alpha helical peptide 提交 2019-04-29	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6 16% (w/v) PEG smear high	分辨率 2.57 Å R-free 0.266
6RJP Bfl-1 in complex with alpha helical peptide 提交 2019-04-29	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6 16% (w/v) PEG smear high	分辨率 2.57 Å R-free 0.266
6VO4 Crystal Structure Analysis of BFL1 提交 2020-01-29	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；3.5M Sodium formate, pH 7.0	分辨率 1.74 Å R-free 0.283
8RPO BFL1 in complex with a reversible covalent ligand 提交 2024-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1H2C (~{E})-2-cyano-3-(2-dimethylphosphorylphenyl)-~{N}-[[1-[4-(trifluoromethyl)phenyl]cyclopropyl]methyl]prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；sodium citrate 0.3M, PCTP pH 6	分辨率 1.79 Å R-free 0.262
9EW8 Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-04-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1H7Q 1-[(2R)-2-phenylpyrrolidin-1-yl]propan-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.85M sodium citrate, 0.1M PCTP pH 6	分辨率 1.49 Å R-free 0.271
9FKY Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1IDP ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[3-cyano-4-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 5, Na3 Cit 1.1M	分辨率 1.56 Å R-free 0.237
9FKY Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–151（151 aa）	未记录	A1IDP ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[3-cyano-4-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 5, Na3 Cit 1.1M	分辨率 1.56 Å R-free 0.237
9FKZ Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1IDO ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(4-chlorophenyl)methyl]prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；Na3 Cit 1M, PCPT 0.1M pH 7	分辨率 1.68 Å R-free 0.339
9FL0 Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1IDG ~{N}-[(4-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(4-fluorophenyl)prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 7, Na3 Cit 1M	分辨率 1.94 Å R-free 0.281
9FL0 Discovery of a Series of Covalent, Cell Active Bfl-1 Inhibitors 提交 2024-06-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–151（151 aa）	未记录	A1IDG ~{N}-[(4-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(4-fluorophenyl)prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；PCPT 0.1M pH 7, Na3 Cit 1M	分辨率 1.94 Å R-free 0.281
9GIP BFL1 covalently bound to inhibitor compound 7 提交 2024-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1ILY ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.71；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, 2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 8.71, Na3 Citrate 0.93 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.	分辨率 1.46 Å R-free 0.249
9GIQ BFL1 covalently bound to inhibitor compound 13 提交 2024-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	BUD (2S,3S)-butane-2,3-diol × 1 A1ILV ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-azanylcyclopentyl]oxyphenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)-3-methyl-3-oxidanyl-butyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, 2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 9.50, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.	分辨率 1.42 Å R-free 0.257
9GIR BFL1 covalently bound to inhibitor compound 39 提交 2024-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1ILX ~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{R})-1,1-bis(oxidanylidene)thiolan-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxy-3-chloranyl-phenyl]-~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.71；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, 2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 4.78, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.	分辨率 1.07 Å R-free 0.210
9GIS BFL1 covalently bound to inhibitor compound 17 提交 2024-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1ILU ~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{S})-pyrrolidin-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxyphenyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.93；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, 2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 7.93, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.	分辨率 1.39 Å R-free 0.254
9GIS BFL1 covalently bound to inhibitor compound 17 提交 2024-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–151（151 aa）	未记录	A1ILU ~{N}-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-~{N}-[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{S})-pyrrolidin-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxyphenyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.93；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, 2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 7.93, Na3 Citrate 0.60 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.	分辨率 1.39 Å R-free 0.254
9GIT BFL1 covalently bound to inhibitor compound 43 提交 2024-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1ILW (3~{S})-3-[[4-[(1~{R},3~{R})-3-[[(3~{R})-1,1-bis(oxidanylidene)thiolan-3-yl]carbamoylamino]cyclopentyl]oxy-3-fluoranyl-phenyl]-propanoyl-amino]-3-(4-chlorophenyl)propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.14；293 K；Protein:ligand complex at ~4mg/ml in 20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, 2 mM TCEP, 1%DMSO. 150nL mixed with 150nL of well solution, 0.1M PCPT* pH 7.14, Na3 Citrate 0.92 M. *PCPT = Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, bis-tris propane buffer system. Using STPLabtech Mosquito.	分辨率 1.15 Å R-free 0.212
9S6M Structure of BFL1 in complex with a covalent inhibitor, alternative series, cmpd25 提交 2025-08-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–151（151 aa）	未记录	A1JL2 (1~{R},2~{R})-2-azanyl-~{N}-[4-[(1~{R})-1-[propanoyl-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]amino]ethyl]phenyl]cyclopentane-1-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization of adducted protein was carried out using a 2D optimization grid, (sodium citrate 0.6-1.1 M, vs PCTP buffer, 0.1 M pH 4.5-9.5). 300 nL drops (150 nL protein, 150 nL mother liquor) were incubated at 293 K in a sitting drop vapour diffusion format, dispensed using a Mosquito (SPT Labtech) and SWISSCI MRC 2-drop plates	分辨率 1.43 Å R-free 0.214
9S6M Structure of BFL1 in complex with a covalent inhibitor, alternative series, cmpd25 提交 2025-08-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–151（151 aa）	未记录	A1JL2 (1~{R},2~{R})-2-azanyl-~{N}-[4-[(1~{R})-1-[propanoyl-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]amino]ethyl]phenyl]cyclopentane-1-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization of adducted protein was carried out using a 2D optimization grid, (sodium citrate 0.6-1.1 M, vs PCTP buffer, 0.1 M pH 4.5-9.5). 300 nL drops (150 nL protein, 150 nL mother liquor) were incubated at 293 K in a sitting drop vapour diffusion format, dispensed using a Mosquito (SPT Labtech) and SWISSCI MRC 2-drop plates	分辨率 1.43 Å R-free 0.214

共 25 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2LA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–152； UniProt 1–151

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6mbb
沉积日期 deposition_date	2018-08-29
结构标题 title	Human Bfl-1 in complex with the designed peptide dF1
关键词 keywords	anti-apoptotic Bcl-2, inhibitor, design, Apoptosis; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.34 Å
零角强度 I(0) i0	7238640.00
分子量 molecular_weight	19961.0 kDa
排除体积 excluded_volume	25142 Å³
包络体积 envelope_volume	28043 Å³
水化壳体积 shell_volume	15140 Å³
包络直径 envelope_diameter	51.9 Å
壳层 Rg shell_rg	21.60 Å
包络 Rg envelope_rg	15.73 Å
形状 Rg shape_rg	15.30 Å
总 Rg total_rg	16.61 Å
总原子数 total_atoms	2801
残基数 n_residues	174
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	51.7 Å
Rg (实空间) rg_real	16.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.2390e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.3210e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.73 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	7239000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8145
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	22.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.083
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.405
角度范围 angular_range	— – 0.4750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1396000.0000
实空间数据点数 n_real_points	78
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.871; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Bcl-2-related protein A1
分子量 formula_weight	17442.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3026

GMTDCEFGYIYRLAQDYLQCVLQIPQPGSGPSKTSRVLQNVAFSVQKEVEKNLKSCLDNVNVVSVDTARTLFNQVMEKEFEDGIINWGRIVTIFAFEGILIKKLLRQQIAPDVDTYKEISYFVAEFIMNNTGEWIRQNGGWENGFVKKFEPK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	dF1
分子量 formula_weight	2523.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

XSYVDKIADVMREVAEKINSDLTX

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	128

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6mbbA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	43.223 Å
晶胞边长 b length_b	42.920 Å
晶胞边长 c length_c	47.718 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	115.96 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.590 Å
最低分辨率 resolution_low	42.904 Å
R 因子 r_factor	0.1683
R_work r_work	0.1651
R_free r_free	0.1957

fit	/app/data/saxs_computation/mb/6mbb/6mbb.fit
pddf	/app/data/pr_computation/mb/6mbb/6mbb.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/mb/6mbb/6mbb.dat

Human Bfl-1 in complex with the designed peptide dF1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bcl-2-related protein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)