SAXSdb — 6mi6

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein CheA

Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	SULFATE ION × 2 ;5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy{[(1-hydroxy-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl]disulfanyl}phosphoryl]oxy}phosphoryl]adenosine ; × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	;5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy{[(1-hydroxy-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl]disulfanyl}phosphoryl]oxy}phosphoryl]adenosine ; × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	SULFATE ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHEA_THEMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–187； UniProt 353–539 作者链 B； PDB构建体 1–187； UniProt 353–539 作者链 C； PDB构建体 1–187； UniProt 353–539 作者链 D； PDB构建体 1–187； UniProt 353–539

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6mi6
沉积日期 deposition_date	2018-09-19
结构标题 title	STRUCTURE OF CHEA DOMAIN P4 IN COMPLEX WITH AN ADP ANALOG
关键词 keywords	bacterial chemotaxis, histidine kinase, Thermotoga maritima, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6mi6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6mi6__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6mi6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.36 Å
Rg（电子密度）	17.33 Å
总 Rg	18.30 Å
原子数	1474
残基数	183
排除体积	26310 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6mi6__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6mi6__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6mi6__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`6mi6__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chemotaxis protein CheA
分子量 formula_weight	20966.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.13.3
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	5687

IRMVPISFVFNRFPRMVRDLAKKMNKEVNFIMRGEDTELDRTFVEEIGEPLLHLLRNAIDHGIEPKEERIAKGKPPIGTLILSARHEGNNVVIEVEDDGRGIDKEKIIRKAIEKGLIDESKAATLSDQEILNFLFVPGFSTKEKVSEVSGRGVGMDVVKNVVESLNGSISIESEKDKGTKVTIRLPL

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	;5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy{[(1-hydroxy-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl]disulfanyl}phosphoryl]oxy}phosphoryl]adenosine ;
分子量 formula_weight	628.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d6mi6a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.122 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
超家族 Superfamily superfamily	d.122.1 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
家族 Family family	d.122.1.3 — Histidine kinase

结构域编号 domain_id	d6mi6b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.122 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
超家族 Superfamily superfamily	d.122.1 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
家族 Family family	d.122.1.3 — Histidine kinase

结构域编号 domain_id	d6mi6c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.122 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
超家族 Superfamily superfamily	d.122.1 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
家族 Family family	d.122.1.3 — Histidine kinase

结构域编号 domain_id	d6mi6d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.122 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
超家族 Superfamily superfamily	d.122.1 — ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
家族 Family family	d.122.1.3 — Histidine kinase

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晶胞边长 a length_a	83.703 Å
晶胞边长 b length_b	75.145 Å
晶胞边长 c length_c	86.580 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.01 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.950 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	0.2398
R_work r_work	0.2325
R_free r_free	0.2977

STRUCTURE OF CHEA DOMAIN P4 IN COMPLEX WITH AN ADP ANALOG

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein CheA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mi6__assembly_1__model_1

6mi6__assembly_1__model_1 | I(q)

6mi6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

STRUCTURE OF CHEA DOMAIN P4 IN COMPLEX WITH AN ADP ANALOG

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein CheA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mi6__assembly_1__model_1

6mi6__assembly_1__model_1 | I(q)

6mi6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

7. 引用文献 (1)