SAXSdb — 6mwc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1

Eastern equine encephalitis virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 960	E2 × 240 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 240 EEEV-5 antibody light chain × 240 （G0YP42）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	E2 × 4 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 4 EEEV-5 antibody light chain × 4 （G0YP42）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 80	E2 × 20 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 20 EEEV-5 antibody light chain × 20 （G0YP42）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 96	E2 × 24 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 24 EEEV-5 antibody light chain × 24 （G0YP42）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	E2 × 4 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 4 EEEV-5 antibody light chain × 4 （G0YP42）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E9KXM2_EEEV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 E； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 I； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 M； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242

E2

Eastern equine encephalitis virus

UniProt E9KXL2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 960	E1 × 240 （E9KXM2） EEEV-5 antibody heavy chain × 240 EEEV-5 antibody light chain × 240 （G0YP42）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	E1 × 4 （E9KXM2） EEEV-5 antibody heavy chain × 4 EEEV-5 antibody light chain × 4 （G0YP42）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 80	E1 × 20 （E9KXM2） EEEV-5 antibody heavy chain × 20 EEEV-5 antibody light chain × 20 （G0YP42）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 96	E1 × 24 （E9KXM2） EEEV-5 antibody heavy chain × 24 EEEV-5 antibody light chain × 24 （G0YP42）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	E1 × 4 （E9KXM2） EEEV-5 antibody heavy chain × 4 EEEV-5 antibody light chain × 4 （G0YP42）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E9KXL2_EEEV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744 作者链 F； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744 作者链 J； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744 作者链 N； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744

EEEV-5 antibody light chain

物种未注明

UniProt G0YP42

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 960	E1 × 240 （E9KXM2） E2 × 240 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 240	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	E1 × 4 （E9KXM2） E2 × 4 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 4	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 80	E1 × 20 （E9KXM2） E2 × 20 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 20	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 96	E1 × 24 （E9KXM2） E2 × 24 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 24	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	E1 × 4 （E9KXM2） E2 × 4 （E9KXL2） EEEV-5 antibody heavy chain × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0YP42_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 98–214； UniProt 117–233 作者链 H； PDB构建体 98–214； UniProt 117–233 作者链 L； PDB构建体 98–214； UniProt 117–233 作者链 P； PDB构建体 98–214； UniProt 117–233

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6mwc
沉积日期 deposition_date	2018-10-29
结构标题 title	CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody
关键词 keywords	Alphavirus, EEEV, Eastern Equine Encephalitis Virus, Sindbis, Fab, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex; VIRUS/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6mwc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6mwc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6mwc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	311.70 Å
总 Rg	311.80 Å
原子数	2131680
残基数	276960
排除体积	37730000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6mwc__assembly_1__model_1`	960-meric （960）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6mwc__assembly_2__model_1`	hexadecameric （16）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`6mwc__assembly_3__model_1`	80-meric （80）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`6mwc__assembly_4__model_1`	96-meric （96）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`6mwc__assembly_5__model_1`	hexadecameric （16）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	E1
分子量 formula_weight	47938.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E,I,M
原子数 atom_count	35528

YEHTAVMPNKVGIPYKALVERPGYAPVHLQIQLVNTRIIPSTNLEYITCKYKTKVPSPVVKCCGATQCTSKPHPDYQCQVFTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQMSEAYVERSEECSIDHAKAYKVHTGTVQAMVNITYGSVSWRSADVYVNGETPAKIGDAKLIIGPLSSAWSPFDNKVVVYGHEVYNYDFPEYGTGKAGSFGDLQSRTSTSNDLYANTNLKLQRPQAGIVHTPFTQAPSGFERWKRDKGAPLNDVAPFGCSIALEPLRAENCAVGSIPISIDIPDAAFTRISETPTVSDLECKITECTYASDFGGIATVAYKSSKAGNCPIHSPSGVAVIKENDVTLAESGSFTFHFSTANIHPAFKLQVCTSAVTCKGDCKPPKDHIVDYPAQHTESFTSAISATAWSWLKVLVGGTSAFIVLGLIATAVVALVLFFHRH

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
通用名 common_name	EEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Mesocricetus auratus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	E2
分子量 formula_weight	47047.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F,J,N

DLDTHFTQYKLARPYIADCPNCGHSRCDSPIAIEEVRGDAHAGVIRIQTSAMFGLKTDGVDLAYMSFMNGKTQKSIKIDNLHVRTSAPCSLVSHHGYYILAQCPPGDTVTVGFHDGPNRHTCTVAHKVEFRPVGREKYRHPPEHGVELPCNRYTHKRADQGHYVEMHQPGLVADHSLLSIHSAKVKITVPSGAQVKYYCKCPDVREGITSSDHTTTCTDVKQCRAYLIDNKKWVYNSGRLPRGEGDTFKGKLHVPFVPVKAKCIATLAPEPLVEHKHRTLILHLHPDHPTLLTTRSLGSDANPTRQWIERPTTVNFTVTGEGLEYTWGNHPPKRVWAQESGEGNPHGWPHEVVVYYYNRYPLTTIIGLCTCVAIIMVSCVTSVWLLCRTRNLCITPYKLAPNAQVPILLALLCCIKPTRA

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
通用名 common_name	EEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Mesocricetus auratus

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	EEEV-5 antibody heavy chain
分子量 formula_weight	23743.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,G,K,O

QIQLVQSGREVKNPGETVKISCKASGYTFTEYPMLWVKQAPGKGFRWMGLIYTNTGEPTYAEEFKGRFVFSLEISASTAYLQINNLTNEDTATYFCVRDYFISLDYWGQGTTLTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGGTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPALLQSGLYTLSSSVTVTSNTWPSQTITCNVAHPASSTKVDKKIESRR

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	EEEV-5 antibody light chain
分子量 formula_weight	23177.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H,L,P

QAVVTQESALTTSPGETVTLTCRSNIGAVTSSNCANWVQEKPDHFFTGLIGDTNNRRSGVPARFSGSLIGDKAALTITGAQTEDEAIYFCALWYNNLWVFGGGTKLTVLGQPKSSPSVTLFPPSSEELETNKATLVCTITDFYPGVVTVDWKVDGTPVTQGMETTQPSKQSNNKYMASSYLTLTARAWERHSSYSCQVTHEGHTVEKSLSRADC

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分辨率 resolution	7.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	6583

CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

E2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EEEV-5 antibody light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mwc__assembly_1__model_1

6mwc__assembly_1__model_1 | I(q)

6mwc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

E2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EEEV-5 antibody light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mwc__assembly_1__model_1

6mwc__assembly_1__model_1 | I(q)

6mwc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)