6mzf

Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1A chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Tubulin beta chain × 4 （P02554） Protein Stu2p/Alp14p × 2 Designed ankyrin repeat protein (DARPIN) D1 × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 8 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Tubulin beta chain × 4 （P02554） Protein Stu2p/Alp14p × 2 Designed ankyrin repeat protein (DARPIN) D1 × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 8 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBA1A_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 C； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 H； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 J； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 O； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 Q； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 V； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 X； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451

Tubulin beta chain

物种未注明

UniProt P02554

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Tubulin alpha-1A chain × 4 （P02550） Protein Stu2p/Alp14p × 2 Designed ankyrin repeat protein (DARPIN) D1 × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 8 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Tubulin alpha-1A chain × 4 （P02550） Protein Stu2p/Alp14p × 2 Designed ankyrin repeat protein (DARPIN) D1 × 4 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 8 GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBB_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 D； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 I； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 K； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 P； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 R； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 W； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 Y； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6mzf
沉积日期 deposition_date	2018-11-05
结构标题 title	Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
关键词 keywords	;Microtubule, Tubulin, Tubulin polymerization, Heat repeats, Microtubule polymerase, TOG arrays, and Wheel-like assembly., CELL CYCLE ;; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6mzf__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6mzf__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6mzf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	74.42 Å
Rg（电子密度）	73.90 Å
总 Rg	73.97 Å
原子数	39005
残基数	4993
排除体积	691540 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6mzf__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6mzf__assembly_2__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tubulin alpha-1A chain
分子量 formula_weight	50121.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,H,J,O,Q,V,X
原子数 atom_count	78030

MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFSVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRAHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYEPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tubulin beta chain
分子量 formula_weight	49907.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,I,K,P,R,W,Y

MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEGEEDEA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein Stu2p/Alp14p
分子量 formula_weight	63099.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,L,S,Z

MADQDDVDFTTLPLEQRASHKVWKARLNAYQELNNLFTKSSVISPPNDVANYWLDPELFASYIVDSNVVAQENAIIALHTLLEYISQVPNVSTSKLRLQWIPPLVEKGLSSSRAATKAKATDCIMLLTQSDTSIQQTVNLMLPSLSNKLPRLVSSCVKCLATIIEEFGFINVSDINILLSEILEPLPKLSSHADRNVRSETMNLILQIYKWFGKELLQELLLEKLKPIQQRDLSRMFEKYEGTIPPKQQPRLFQWQKEQEQEQEQILQTDKDGDTLMGNLLAYQDTNASAIHPATKPAVDPFELLPPSVILDKFPADFQTRISSTKWKDRVEALEEIHNNVLKPVKKLAHKNQDYSDYLRVLANVIQKDANVQAVTIAANSVQLLCNSLRSNFTRSYGAIVLVPLLERTKEKKPSVNEAICSALDAVATYCGFDDCLEETLNYMKHKTPQVRIECTKFLTRMLQGWKSDGPLQNQLLFKLLPEVTTAVLKIVNDTQPTTRNTGFECFATLMKLVGERELADPLEKLDNLKKKKIYEYYEKVEVATGLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Lachancea kluyveri NRRL Y-12651
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	226302
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Designed ankyrin repeat protein (DARPIN) D1
分子量 formula_weight	18068.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,G,M,N,T,U,a,b

MRGSHHHHHHGSDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGADVNATDASGLTPLHLAATYGHLEIVEVLLKHGADVNAIDIMGSTPLHLAALIGHLEIVEVLLKHGADVNAVDTWGDTPLHLAAIMGHLEIVEVLLKHGADVNAQDKFGKTAFDISIDNGNEDLAEILQKLN

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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晶胞边长 a length_a	218.800 Å
晶胞边长 b length_b	107.650 Å
晶胞边长 c length_c	282.740 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.38 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.400 Å
最低分辨率 resolution_low	96.592 Å
R 因子 r_factor	0.2331
R_work r_work	0.2247
R_free r_free	0.2515

Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mzf__assembly_1__model_1

6mzf__assembly_1__model_1 | I(q)

6mzf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mzf__assembly_1__model_1

6mzf__assembly_1__model_1 | I(q)

6mzf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)