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6o47

human cGAS core domain (K427E/K428E) bound with RU-521

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 68.8 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cyclic GMP-AMP synthase

Homo sapiens

UniProt Q8N884

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 152–522 突变：K427E, K428E CIT CITRIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 LLS (3~{S})-3-[1-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-3-methyl-5-oxidanyl-pyrazol-4-yl]-3~{H}-2-benzofuran-1-one × 1 AEV 2-(4,5-dichloro-1H-benzimidazol-2-yl)-5-methyl-4-[(1R)-3-oxo-1,3-dihydro-2-benzofuran-1-yl]-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.064 M sodium citrate 7.0, 0.1 M HEPES, pH 7.0, 10% PEG5000MME 分辨率 2.20 Å R-free 0.221

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6O47 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4KM5 X-ray crystal structure of human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) 提交 2013-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：UNP residues 157-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.044M potassium chloride, 0.01M magnesium chloride, 0.025M Tris pH 7.0, 0.015M Tris pH 9.0, 6.9% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
4LEV Structure of human cGAS 提交 2013-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：human cGAS catalytic domain, UNP residues 157-522
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20-30% Jeffamine M-600, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.202
4LEV Structure of human cGAS 提交 2013-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 157–522（366 aa） 片段：human cGAS catalytic domain, UNP residues 157-522
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20-30% Jeffamine M-600, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.202
4LEV Structure of human cGAS 提交 2013-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：human cGAS catalytic domain, UNP residues 157-522
链 B 157–522（366 aa） 片段：human cGAS catalytic domain, UNP residues 157-522
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20-30% Jeffamine M-600, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.202
4LEW Structure of human cGAS 提交 2013-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 157–522（366 aa） 片段：Catalytic domain, UNP residues 157-522
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15-20% PEG 3350, 0.2 M A.S., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.04 Å R-free 0.223
4LEW Structure of human cGAS 提交 2013-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：Catalytic domain, UNP residues 157-522
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15-20% PEG 3350, 0.2 M A.S., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.04 Å R-free 0.223
4MKP Crystal structure of human cGAS apo form 提交 2013-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；PEG 3350, NH4NO3, NaCl, CYMAL-7, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.252
4O67 Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with GAMP 提交 2013-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 1SY cGAMP × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；2% Isopropanol, 0.01 M MgSO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.44 Å R-free 0.281
4O67 Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with GAMP 提交 2013-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；2% Isopropanol, 0.01 M MgSO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.44 Å R-free 0.281
4O67 Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with GAMP 提交 2013-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；2% Isopropanol, 0.01 M MgSO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.44 Å R-free 0.281
4O68 Structure of human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) 提交 2013-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 147–522（376 aa） 片段：UNP residues 147-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；6% PEG 3,350, 0.1 M Hepes, pH 7.8, 0.05 M NaCl, 0.01 M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.44 Å R-free 0.244
4O69 Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with sulfate ion 提交 2013-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.25 Å R-free 0.224
5V8O Discovery of a high affinity inhibitor of cGAS 提交 2017-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 161–522（362 aa）
链 B 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 8ZM 5-phenyltetrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-ol × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein was concentrated to 6 mg/ml, and then mixed at a 2:1 ratio with PEG 3350 (18-20% v/v), 0.2 M ammonium citrate (pH 7) in a sitting drop well at 277 K. Cryoprotectant was made using mother liquor at a final concentration of 23% PEG 3350.
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
5VDO Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 2',2'-cGAMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 1YC 2-amino-9-[(1R,3R,6R,8R,9R,11S,14R,16R,17R,18R)-16-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,11,17,18-tetrahydroxy-3,11-dioxido-2,4,7,10,12,15-hexaoxa-3,11-diphosphatricyclo[12.2.1.1~6,9~]octadec-8-yl]-1,9-dihydro-6H-purin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.22 Å R-free 0.258
5VDO Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 2',2'-cGAMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 1YC 2-amino-9-[(1R,3R,6R,8R,9R,11S,14R,16R,17R,18R)-16-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,11,17,18-tetrahydroxy-3,11-dioxido-2,4,7,10,12,15-hexaoxa-3,11-diphosphatricyclo[12.2.1.1~6,9~]octadec-8-yl]-1,9-dihydro-6H-purin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.22 Å R-free 0.258
5VDP Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 2',3'-cGAMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 1SY cGAMP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
5VDP Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 2',3'-cGAMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 1SY cGAMP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
5VDQ Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 2',5'-GpAp 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BG 2',5'-GpAp × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.25 Å R-free 0.265
5VDQ Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 2',5'-GpAp 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BG 2',5'-GpAp × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.25 Å R-free 0.265
5VDR Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 3',3'-cdIMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9B7 3',3'-cdIMP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.04 Å R-free 0.254
5VDR Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 3',3'-cdIMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9B7 3',3'-cdIMP × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.04 Å R-free 0.254
5VDS Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 3',3'-cdUMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BJ 3',3'-cdUMP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.77 Å R-free 0.245
5VDS Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 3',3'-cdUMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BJ 3',3'-cdUMP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.77 Å R-free 0.245
5VDT Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 3',3'-cGAMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 4BW 2-amino-9-[(2R,3R,3aS,5R,7aR,9R,10R,10aS,12R,14aR)-9-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,5,10,12-tetrahydroxy-5,12-dioxidooctahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]tetraoxadiphosphacyclododecin-2-yl]-1,9-dihydro-6H-purin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.58 Å R-free 0.236
5VDT Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with 3',3'-cGAMP 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 4BW 2-amino-9-[(2R,3R,3aS,5R,7aR,9R,10R,10aS,12R,14aR)-9-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,5,10,12-tetrahydroxy-5,12-dioxidooctahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]tetraoxadiphosphacyclododecin-2-yl]-1,9-dihydro-6H-purin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.58 Å R-free 0.236
5VDU Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with Compound F2 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BS 2-(pyridin-2-yl)pyrimidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.73 Å R-free 0.252
5VDU Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with Compound F2 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BS 2-(pyridin-2-yl)pyrimidine × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.73 Å R-free 0.252
5VDV Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with Compound F3 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BV tetrazolo[5,1-b]quinazolin-9-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5VDV Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with Compound F3 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BV tetrazolo[5,1-b]quinazolin-9-ol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5VDW Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with Compound F1 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BY [2-(1,3-thiazol-4-yl)-1H-benzimidazol-1-yl]acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.71 Å R-free 0.257
5VDW Human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with Compound F1 提交 2017-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP residues 161-521
未记录 ZN ZINC ION × 1 9BY [2-(1,3-thiazol-4-yl)-1H-benzimidazol-1-yl]acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；18-20% PEG 3350, 0.2 M ammonium citrate pH 7
分辨率 2.71 Å R-free 0.257
6CT9 Structure of the human cGAS-DNA complex 提交 2018-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 157–522（366 aa）
突变：K187N, L195R ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES-NaOH pH 7.0, 1.4 M sodium citrate
分辨率 2.26 Å R-free 0.228
6CTA Structure of the human cGAS-DNA complex with ATP 提交 2018-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 157–522（366 aa）
突变：K187N, L195R ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES-NaOH pH 7.0, 1.4 M sodium citrate
分辨率 2.78 Å R-free 0.245
6EDB Crystal structure of SRY.hcGAS-21bp dsDNA complex 提交 2018-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M L-proline, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 8% PEG3350 (v/v), 10 mM MgCl2
分辨率 3.21 Å R-free 0.302
6EDC hcGAS-16bp dsDNA complex 提交 2018-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 157–522（366 aa）
突变：K299E, R300A, K301E ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.5, and 28% PEG400 (v/v)
分辨率 2.71 Å R-free 0.278
6LRC Human cGAS catalytic domain bound with the inhibitor PF-06928215 提交 2020-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 KHM (1R,2S)-2-[(7-hydroxy-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonyl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2M AMMONIUM CITRATE (PH 7)
分辨率 1.83 Å R-free 0.219
6LRE Human cGAS catalytic domain bound with compound 3 提交 2020-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 EQL 1,3-bis(oxidanylidene)benzo[de]isoquinoline-6,7-dicarboxylic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2M AMMONIUM CITRATE (PH 7)
分辨率 2.65 Å R-free 0.268
6LRI Human cGAS catalytic domain bound with compound 17 提交 2020-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 EQR 3-[5-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-3-oxidanylidene-[1,2,4]triazino[2,3-a]benzimidazol-2-yl]propanoic acid × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2M AMMONIUM CITRATE (PH 7)
分辨率 2.50 Å R-free 0.265
6LRJ Human cGAS catalytic domain bound with compound 23 提交 2020-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 EQX 4-[2-(2-methyl-[1,2,4]triazolo[1,5-c]quinazolin-5-yl)hydrazinyl]-4-oxidanylidene-butanoic acid × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2M AMMONIUM CITRATE (PH 7)
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
6LRK Human cGAS catalytic domain bound with compound 40 提交 2020-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ER6 (3R)-1-pyrrolo[1,2-a]quinoxalin-4-ylpiperidine-3-carboxylic acid × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2M AMMONIUM CITRATE (PH 7)
分辨率 2.25 Å R-free 0.238
6LRL Human cGAS catalytic domain bound with compound s2 提交 2020-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ER9 3-[[5-(1,2,4-triazol-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]carbonylamino]benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2M AMMONIUM CITRATE (PH 7)
分辨率 2.65 Å R-free 0.290
6MJU human cGAS catalytic domain bound with the inhibitor G108 提交 2018-09-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 152–522（371 aa）
未记录 JUM 1-[6,7-dichloro-9-(1H-pyrazol-4-yl)-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-hydroxyethan-1-one × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.064 M sodium citrate 7.0, 0.1 M HEPES, pH 7.0, 10% PEG5000MME
分辨率 2.45 Å R-free 0.256
6MJW human cGAS catalytic domain bound with the inhibitor G150 提交 2018-09-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 152–522（371 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 JUJ 1-[9-(6-aminopyridin-3-yl)-6,7-dichloro-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-hydroxyethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.064 M sodium citrate 7.0, 0.1 M HEPES, pH 7.0, 10% PEG5000MME
分辨率 2.40 Å R-free 0.257
6MJX human cGAS catalytic domain bound with cGAMP 提交 2018-09-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 152–522（371 aa）
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Bicine 8.5, 10% PEG6000, final PH 9.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.265
6NAO Discovery of a high affinity inhibitor of cGAS 提交 2018-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 KHM (1R,2S)-2-[(7-hydroxy-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonyl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML, AND THEN MIXED AT A 2:1 RATIO WITH PEG 3350 (18-20% V/V), 0.2 M AMMONIUM CITRATE (PH 7) IN A SITTING DROP WELL AT 277 K. CRYOPROTECTANT WAS MADE USING MOTHER LIQUOR AT A FINAL CONCENTRATION OF 23% PEG 3350., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.23 Å R-free 0.253
6NAO Discovery of a high affinity inhibitor of cGAS 提交 2018-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 KHM (1R,2S)-2-[(7-hydroxy-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonyl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML, AND THEN MIXED AT A 2:1 RATIO WITH PEG 3350 (18-20% V/V), 0.2 M AMMONIUM CITRATE (PH 7) IN A SITTING DROP WELL AT 277 K. CRYOPROTECTANT WAS MADE USING MOTHER LIQUOR AT A FINAL CONCENTRATION OF 23% PEG 3350., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.23 Å R-free 0.253
6NFG CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE in complex with compound 16 inhibitor: 7-hydroxy-N-methyl-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 KKP 7-hydroxy-N-methyl-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML, AND THEN MIXED AT A 2:1 RATIO WITH PEG 3350 (18-20% V/V), 0.2 M AMMONIUM CITRATE (PH 7) IN A SITTING DROP WELL AT 277 K. CRYOPROTECTANT WAS MADE USING MOTHER LIQUOR AT A FINAL CONCENTRATION OF 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
分辨率 2.76 Å R-free 0.244
6NFG CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE in complex with compound 16 inhibitor: 7-hydroxy-N-methyl-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 KKP 7-hydroxy-N-methyl-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML, AND THEN MIXED AT A 2:1 RATIO WITH PEG 3350 (18-20% V/V), 0.2 M AMMONIUM CITRATE (PH 7) IN A SITTING DROP WELL AT 277 K. CRYOPROTECTANT WAS MADE USING MOTHER LIQUOR AT A FINAL CONCENTRATION OF 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
分辨率 2.76 Å R-free 0.244
6NFO CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE in complex with compound 20 inhibitor: 7-hydroxy-N-[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 KKM 7-hydroxy-N-[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML, AND THEN MIXED AT A 2:1 RATIO WITH PEG 3350 (18-20% V/V), 0.2 M AMMONIUM CITRATE (PH 7) IN A SITTING DROP WELL AT 277 K. CRYOPROTECTANT WAS MADE USING MOTHER LIQUOR AT A FINAL CONCENTRATION OF 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.93 Å R-free 0.231
6NFO CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE in complex with compound 20 inhibitor: 7-hydroxy-N-[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 KKM 7-hydroxy-N-[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML, AND THEN MIXED AT A 2:1 RATIO WITH PEG 3350 (18-20% V/V), 0.2 M AMMONIUM CITRATE (PH 7) IN A SITTING DROP WELL AT 277 K. CRYOPROTECTANT WAS MADE USING MOTHER LIQUOR AT A FINAL CONCENTRATION OF 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.93 Å R-free 0.231
6Y5D Structure of human cGAS (K394E) bound to the nucleosome 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 K 161–522（362 aa）
链 L 161–522（362 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 9 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6Y5E Structure of human cGAS (K394E) bound to the nucleosome (focused refinement of cGAS-NCP subcomplex) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 161–522（362 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 K 151–522（372 aa）
链 k 151–522（372 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CCQ Structure of the 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 157–522（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7CCR Structure of the 2:2 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 K 157–522（366 aa）
链 V 157–522（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7FTF Crystal Structure of apo human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.51 Å R-free 0.214
7FTG Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with cGAMP 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.73 Å R-free 0.230
7FTG Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with cGAMP 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa）
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.73 Å R-free 0.230
7FTH Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with cGAMP 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.55 Å R-free 0.256
7FTI Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-(4-fluorophenyl)-2-methylpyrazole-3-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 YMI 3-(4-fluorophenyl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.00 Å R-free 0.272
7FTJ Crystal Structure of apo human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.46 Å R-free 0.210
7FTK Crystal Structure of apo human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.12 Å R-free 0.278
7FTK Crystal Structure of apo human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.12 Å R-free 0.278
7FTL Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 8-chloro-2-(2-hydroxyphenyl)quinoline-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 YME (2P)-8-chloro-2-(2-hydroxyphenyl)quinoline-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.20 Å R-free 0.287
7FTM Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[2-(4-fluoroanilino)-1,3-thiazol-4-yl]acetic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 YO6 [2-(4-fluoroanilino)-1,3-thiazol-4-yl]acetic acid × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
7FTN Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with propanedioic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
7FTO Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-5-fluoro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YM9 (5M)-5-(2-chloro-5-fluoro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.40 Å R-free 0.272
7FTP Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(4-chlorophenyl)-10,11-dimethoxy-7-methyl-2,4,6-triazatricyclo[7.3.1.05,13]trideca-1(12),2,4,7,9(13),10-hexaene 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQ8 4-(4-chlorophenyl)-7,8-dimethoxy-5-methyl-4H-pyrido[2,3,4-de]quinazoline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.48 Å R-free 0.277
7FTQ Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-5-fluoro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YM9 (5M)-5-(2-chloro-5-fluoro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.08 Å R-free 0.253
7FTR Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with (Z)-N-(4-acetylphenyl)-2-cyano-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 YQH (2Z)-N-(4-acetylphenyl)-2-cyano-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.64 Å R-free 0.252
7FTS Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-bromo-N-[[2-fluoro-5-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]methyl]-2-hydroxybenzamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YPU 5-bromo-N-{[(5P)-2-fluoro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]methyl}-2-hydroxybenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.21 Å R-free 0.281
7FTT Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-bromo-N-[[2-fluoro-5-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]methyl]-2-hydroxybenzamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YPU 5-bromo-N-{[(5P)-2-fluoro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]methyl}-2-hydroxybenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.23 Å R-free 0.287
7FTT Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-bromo-N-[[2-fluoro-5-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]methyl]-2-hydroxybenzamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YPU 5-bromo-N-{[(5P)-2-fluoro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]methyl}-2-hydroxybenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.23 Å R-free 0.287
7FTU Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with (Z)-N-[4-(4-chlorophenyl)sulfonylphenyl]-2-cyano-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 YPD (2Z)-N-[4-(4-chlorobenzene-1-sulfonyl)phenyl]-2-cyano-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.65 Å R-free 0.247
7FTV Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-bromo-2-hydroxy-N-(quinolin-6-ylmethyl)benzamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YP3 5-bromo-2-hydroxy-N-[(quinolin-6-yl)methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.88 Å R-free 0.253
7FTW Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-bromo-2-hydroxy-N-[[3-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]methyl]benzamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YPL 5-bromo-2-hydroxy-N-{[(3M)-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]methyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.21 Å R-free 0.261
7FTX Crystal Structure of apo human cyclic GMP-AMP synthase - hexagonal form 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.83 Å R-free 0.278
7FTY Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(4-phenylphenyl)methylamino]-5-propyl-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one:2,2,2-trifluoroacetic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQZ (8R)-2-{[([1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]amino}-5-propyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.30 Å R-free 0.290
7FTZ Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[2-[3-[[(5-bromo-2-hydroxybenzoyl)amino]methyl]anilino]-1,3-thiazol-4-yl]acetic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQQ (2-{3-[(5-bromo-2-hydroxybenzamido)methyl]anilino}-1,3-thiazol-4-yl)acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
7FTZ Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[2-[3-[[(5-bromo-2-hydroxybenzoyl)amino]methyl]anilino]-1,3-thiazol-4-yl]acetic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQQ (2-{3-[(5-bromo-2-hydroxybenzamido)methyl]anilino}-1,3-thiazol-4-yl)acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
7FU0 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(4-phenylphenyl)methylamino]-5-(trifluoromethyl)-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YTU (8S)-2-{[([1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]amino}-5-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.97 Å R-free 0.280
7FU1 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-[3-[[(5-bromo-2-hydroxybenzoyl)amino]methyl]phenyl]-2-methylpyrazole-3-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YU2 (3P)-3-{3-[(5-bromo-2-hydroxybenzamido)methyl]phenyl}-1-methyl-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.07 Å R-free 0.276
7FU2 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-5-fluoro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YM9 (5M)-5-(2-chloro-5-fluoro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.30 Å R-free 0.287
7FU3 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 8-chloro-2-(2-hydroxyphenyl)quinoline-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YME (2P)-8-chloro-2-(2-hydroxyphenyl)quinoline-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.82 Å R-free 0.264
7FU4 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(2-fluoro-4-phenylphenyl)methylamino]-5-propyl-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YMO (8S)-2-{[(3-fluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]amino}-5-propyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.93 Å R-free 0.259
7FU5 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YMO (8S)-2-{[(3-fluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]amino}-5-propyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.18 Å R-free 0.278
7FU5 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YMO (8S)-2-{[(3-fluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]amino}-5-propyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.18 Å R-free 0.278
7FU6 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-benzyl-6-(2-chloro-4-methylphenyl)indazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YMT (6M)-2-benzyl-6-(2-chloro-4-methylphenyl)-2H-indazole-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.37 Å R-free 0.263
7FU7 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YNW (6M)-2-(benzylamino)-6-(2-chloro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.24 Å R-free 0.246
7FU8 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(2-chloro-5-pyridin-4-ylphenyl)methylamino]-5-propyl-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YOB (8S)-2-({[2-chloro-5-(pyridin-4-yl)phenyl]methyl}amino)-5-propyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.72 Å R-free 0.227
7FU9 Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(2-chloro-5-pyridin-4-ylphenyl)methylamino]-5-propyl-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 YOB (8S)-2-({[2-chloro-5-(pyridin-4-yl)phenyl]methyl}amino)-5-propyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.67 Å R-free 0.258
7FUA Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with phosphate 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.44 Å R-free 0.213
7FUB Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-4-methylphenyl)-3-(pyridin-4-ylmethyl)benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQ3 (5M)-5-(2-chloro-4-methylphenyl)-1-[(pyridin-4-yl)methyl]-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.98 Å R-free 0.273
7FUC Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-4-methylphenyl)-2-(morpholin-4-ylmethyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQL (6M)-6-(2-chloro-4-methylphenyl)-2-[(morpholin-4-yl)methyl]-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.52 Å R-free 0.291
7FUD Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-benzyl-2-[[2-chloro-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]methylamino]-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YP8 (8S)-5-benzyl-2-({[(5P)-2-chloro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methyl}amino)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.03 Å R-free 0.249
7FUD Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-benzyl-2-[[2-chloro-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]methylamino]-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YP8 (8S)-5-benzyl-2-({[(5P)-2-chloro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methyl}amino)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.03 Å R-free 0.249
7FUE Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[[2-chloro-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]methylamino]-5-(2-phenylethyl)-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YQC (8S)-2-({[(5P)-2-chloro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methyl}amino)-5-(2-phenylethyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.17 Å R-free 0.270
7FUF Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-benzyl-2-[[2-chloro-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]methylamino]-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YP8 (8S)-5-benzyl-2-({[(5P)-2-chloro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methyl}amino)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.92 Å R-free 0.245
7FUG Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-benzyl-2-[[2-chloro-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]methylamino]-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YP8 (8S)-5-benzyl-2-({[(5P)-2-chloro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methyl}amino)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.11 Å R-free 0.253
7FUG Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 5-benzyl-2-[[2-chloro-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]methylamino]-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YP8 (8S)-5-benzyl-2-({[(5P)-2-chloro-5-(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)phenyl]methyl}amino)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 2.11 Å R-free 0.253
7FUH Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with phosphate 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals
分辨率 1.94 Å R-free 0.250
7FUI Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with (Z)-2-cyano-N-[4-(3-fluorophenyl)-5-methylsulfonylpyrimidin-2-yl]-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 YR6 (2Z)-2-cyano-N-[(4P)-4-(3-fluorophenyl)-5-(methanesulfonyl)pyrimidin-2-yl]-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.74 Å R-free 0.271
7FUJ Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with (Z)-2-cyano-N-[4-(3-fluorophenyl)-5-methylsulfonylpyrimidin-2-yl]-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 5 YR6 (2Z)-2-cyano-N-[(4P)-4-(3-fluorophenyl)-5-(methanesulfonyl)pyrimidin-2-yl]-3-hydroxy-3-(5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)prop-2-enamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.79 Å R-free 0.254
7FUK Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-4-methylphenyl)-3-(2-phenylethyl)benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 YQU (5M)-5-(2-chloro-4-methylphenyl)-1-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.61 Å R-free 0.236
7FUL Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-4-methylphenyl)-3-[3-(methanesulfonamido)propyl]benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YUO (5M)-5-(2-chloro-4-methylphenyl)-1-{3-[(methanesulfonyl)amino]propyl}-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.30 Å R-free 0.273
7FUM Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(4-benzylpiperazin-1-yl)methyl]-6-(2-chloro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YU6 (5M)-2-[(4-benzylpiperazin-1-yl)methyl]-5-(2-chloro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.06 Å R-free 0.269
7FUN Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(4-benzylpiperazin-1-yl)methyl]-6-(2-chloro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YU6 (5M)-2-[(4-benzylpiperazin-1-yl)methyl]-5-(2-chloro-4-methylphenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 IOD IODIDE ION × 7 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.07 Å R-free 0.294
7FUO Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 2-[(2-chlorophenyl)methylamino]-5-[(2-fluoroanilino)methyl]-4H-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-one 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YUB (8R)-2-{[(2-chlorophenyl)methyl]amino}-5-[(2-fluoroanilino)methyl][1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.81 Å R-free 0.259
7FUP Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with methyl 1-benzoyl-3-methyl-5-(1,2-oxazol-5-yl)pyrazole-4-carboxylate 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 PPI PROPANOIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 2.41 Å R-free 0.227
7FUQ Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 6-(2-chloro-4-methylphenyl)-3-phenylbenzimidazole-4-carboxylic acid 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 YUF (5M)-5-(2-chloro-4-methylphenyl)-1-phenyl-1H-benzimidazole-7-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.76 Å R-free 0.234
7FUR Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with 1-[9-(6-aminopyridin-3-yl)-6,7-dichloro-1,3,4,5-tetrahydropyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-hydroxyethanone 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa） 片段：UNP RESIDUES 161-522
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 JUJ 1-[9-(6-aminopyridin-3-yl)-6,7-dichloro-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-hydroxyethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；10-12 mg/mL protein in 25 mM Tris/HCl pH7.5, 500mM NaCl, 2mM TCEP, supplemented with 10x molar excess of ligand and, if needed, with 10 mM MgCl2 and 5mM ATP, then mixed 1:1 with reservoir of the Procomplex screen. Several conditions resulted in crystals.
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
8IME Human cGAS catalytic domain bound with baicalin 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 0XE 5,6-dihydroxy-4-oxo-2-phenyl-4H-chromen-7-yl beta-D-glucopyranosiduronic acid × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CIRTATE (pH 7)
分辨率 2.63 Å R-free 0.276
8IMF Human cGAS catalytic domain bound with baicalein 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 3WL 5,6,7-trihydroxy-2-phenyl-4H-chromen-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 2.40 Å R-free 0.270
8IMG Human cGAS catalytic domain bound with C20 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 7XZ 2-[2-hydroxy-2-oxoethyl-[3-(7-methoxy-4-methyl-2-oxidanylidene-chromen-3-yl)propanoyl]amino]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 1.80 Å R-free 0.249
8OKX Structure of cGAS in complex with SPSB3-ELOBC 提交 2023-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 156–522（367 aa）
突变：K285A R300A K428A ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 K 161–522（362 aa）
突变：K285A R300A K428A ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8SHZ Structure of human cGAS 提交 2023-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 157-522)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 8% w/v PEG8000
分辨率 2.40 Å R-free 0.258
8SI0 Structure of binary complex of human cGAS and bound cGAMP 提交 2023-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 157-522)
未记录 1SY cGAMP × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298.15 K；5 mM magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 8% w/v PEG8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.280
8SJ8 Structure of binary complex of human cGAS and bound ppp(2'-5')GpG 提交 2023-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 157-522)
未记录 ZN ZINC ION × 1 OKR [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298.15 K；5mM magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl pH8.5, and 8% (w/v) PEG8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.271
8WR8 The Crystal Structure of cGAS from Biortus 提交 2023-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 161–522（362 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Imidazole pH8.0, 16% PEG8,000
分辨率 3.10 Å R-free 0.329
8WR8 The Crystal Structure of cGAS from Biortus 提交 2023-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 161–522（362 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Imidazole pH8.0, 16% PEG8,000
分辨率 3.10 Å R-free 0.329
9C3G human cGAS core domain (K427E/K428E) bound to Cladophorol A 提交 2024-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 152–522（371 aa） 片段：residues 152-522
突变：K427E, K428E A1AVI cladophorol A × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；295.15 K；100 mM MES/Sodium Hydroxide pH 7.2, 1% PEG 20000
分辨率 2.75 Å R-free 0.258
9C8N Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with AMPPNP and compound 1 提交 2024-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa）
突变：K427E A1AU3 1-[(1S)-6,7-dichloro-1-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-methoxyethan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Tris pH 8.0, 0.1 M Lithium Sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 1.55 Å R-free 0.214
9C8T Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase in complex with AMPPNP and compound 2 提交 2024-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa）
突变：K427E MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 JUJ 1-[9-(6-aminopyridin-3-yl)-6,7-dichloro-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-hydroxyethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Tris pH 8.0, 0.1 M Lithium Sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 1.47 Å R-free 0.212
9ELX Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with compound 5; 3-((2-((3-chloro-4-fluorophenyl)amino)-2-oxoethyl)carbamoyl)picolinic acid 提交 2024-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 A1BJH 3-{[2-(3-chloro-4-fluoroanilino)-2-oxoethyl]carbamoyl}pyridine-2-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；(5mg/ml) HcGAS catalytic domain was mixed with 17/16 bp dsDNA in a molar ratio of 1:1.25 protein:DNA in a buffer containing 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 10mM MnCl2, 1mM TCEP, 5mM AMPPNP and 1mM compound. Crystals were obtained with sitting drop vapor diffusion in drops mixed 1:1 with a reservoir of 0.1M Tris pH 8.0, 0.1 M Lithium Sulfate, 20% PEG 4000 and cGAS crystal seeds. Crystals were cryo-protected using reservoir solution supplemented with 25% ethylene glycol and flash-frozen in Liquid N2.
分辨率 1.53 Å R-free 0.200
9J2W Human cGAS catalytic domain bound with XL-3156 提交 2024-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 A1EAH 2-(1~{H}-benzimidazol-2-yl)-4-[[1-(1~{H}-benzimidazol-2-yl)-3-methyl-5-oxidanyl-pyrazol-4-yl]-pyridin-2-yl-methyl]-5-methyl-pyrazol-3-ol × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.259
9J2X Human cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 AEV 2-(4,5-dichloro-1H-benzimidazol-2-yl)-5-methyl-4-[(1R)-3-oxo-1,3-dihydro-2-benzofuran-1-yl]-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 2 LLS (3~{S})-3-[1-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-3-methyl-5-oxidanyl-pyrazol-4-yl]-3~{H}-2-benzofuran-1-one × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 2.29 Å R-free 0.271
9J2Y Human cGAS catalytic domain bound with G150 提交 2024-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–522（366 aa）
链 B 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 JUJ 1-[9-(6-aminopyridin-3-yl)-6,7-dichloro-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl]-2-hydroxyethan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 2.08 Å R-free 0.244
9LIO Human cGAS catalytic domain bound with XL-3123 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa）
未记录 A1EKD 2-[bis[1-[4,6-bis(fluoranyl)-1,3-benzothiazol-2-yl]-3-methyl-5-oxidanyl-pyrazol-4-yl]methyl]benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 1.92 Å R-free 0.268
9LIO Human cGAS catalytic domain bound with XL-3123 提交 2025-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 157–522（366 aa）
未记录 A1EKD 2-[bis[1-[4,6-bis(fluoranyl)-1,3-benzothiazol-2-yl]-3-methyl-5-oxidanyl-pyrazol-4-yl]methyl]benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；18-20% V/V PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM CITRATE
分辨率 1.92 Å R-free 0.268
9MDC Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with compound 36; (S)-(6,7-dichloro-1-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl)(5-(2-hydroxyethoxy)pyrimidin-2-yl)methanone 提交 2024-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1BJA [(1S)-6,7-dichloro-1-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl][5-(2-hydroxyethoxy)pyrimidin-2-yl]methanone × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；(5mg/ml) HcGAS catalytic domain was mixed with 17/16 bp dsDNA in a molar ratio of 1:1.25 protein:DNA in a buffer containing 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 10mM MnCl2, 1mM TCEP, 5mM AMPPNP and 1mM compound. Crystals were obtained with sitting drop vapor diffusion in drops mixed 1:1 with a reservoir of 0.1M Tris pH 8.0, 0.1 M Lithium Sulfate, 20% PEG 4000 and cGAS crystal seeds. Crystals were cryo-protected using reservoir solution supplemented with 25% ethylene glycol and flash-frozen in Liquid N2.
分辨率 1.25 Å R-free 0.203
9MDD Crystal Structure of human cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with compound 23; (S)-1-(6,7-dichloro-1-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-pyrido[4,3-b]indol-2-yl)-2-methoxyethan-1-one 提交 2024-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–522（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1BJD 3-{[(2S)-1-{[(5P)-3-chloro-5-(1H-imidazol-2-yl)phenyl]amino}-1-oxopropan-2-yl](methyl)carbamoyl}pyridine-2-carboxylic acid × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；(5mg/ml) HcGAS catalytic domain was mixed with 17/16 bp dsDNA in a molar ratio of 1:1.25 protein:DNA in a buffer containing 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 10mM MnCl2, 1mM TCEP, 5mM AMPPNP and 1mM compound. Crystals were obtained with sitting drop vapor diffusion in drops mixed 1:1 with a reservoir of 0.1M Tris pH 8.0, 0.1 M Lithium Sulfate, 20% PEG 4000 and cGAS crystal seeds. Crystals were cryo-protected using reservoir solution supplemented with 25% ethylene glycol and flash-frozen in Liquid N2.
分辨率 1.60 Å R-free 0.220

共 106 个其他 PDB 条目、132 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CGAS_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–372； UniProt 152–522

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6o47

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6o47
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6o47
沉积日期 deposition_date2019-02-28
结构标题 titlehuman cGAS core domain (K427E/K428E) bound with RU-521
关键词 keywordshuman, cGAS, core domain, compound, RU-521, DNA BINDING PROTEIN, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier22.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron20.82 Å
零角强度 I(0) i028498200.00
分子量 molecular_weight41431.0 kDa
排除体积 excluded_volume52113 ų
包络体积 envelope_volume62389 ų
水化壳体积 shell_volume24498 ų
包络直径 envelope_diameter69.8 Å
壳层 Rg shell_rg27.82 Å
包络 Rg envelope_rg20.88 Å
形状 Rg shape_rg20.79 Å
总 Rg total_rg21.83 Å
总原子数 total_atoms2909
残基数 n_residues346
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax68.8 Å
Rg (实空间) rg_real22.00 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.34 Å
I(0) (实空间) i0_real2.8500e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4180e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal22.03 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal28500000.0000
解质量估计 total_estimate0.9033
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary28.7 Å
偏度 Skewness skewness0.107
峰度 Kurtosis kurtosis-0.501
角度范围 angular_range— – 0.3600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha5596000.0000
实空间数据点数 n_real_points68
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.917; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.993
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id6o47A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
结构域编号 domain_id6o47A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)