SAXSdb — 6plh

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-21 receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 202–232	片段：UNP Residues 202-232	Fab 5G12 light chain × 1 Fab 5G12 heavy chain × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% (w/v) polyethylene glycol 1500, 0.1 M succinate-phosphate-glycine, pH 7.0	分辨率 1.60 Å R-free 0.221

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6PLH	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 5 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 20–232（213 aa）链 B 20–232（213 aa）链 C 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NA SODIUM ION × 10 CL CHLORIDE ION × 22 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
7KQ7 Crystal structure of IL21R in complex with an antibody Fab fragment 提交 2020-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–233（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；10% PEG MME 5000 and 0.1M MES, pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242

共 5 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL21R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–31； UniProt 202–232

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6plh
沉积日期 deposition_date	2019-06-30
结构标题 title	FAB fragment complexed with C-mannosylated tryptophan peptide
关键词 keywords	C-mannosylation, FAB-fragment, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.17 Å
零角强度 I(0) i0	41148700.00
分子量 molecular_weight	48751.0 kDa
排除体积 excluded_volume	60545 Å³
包络体积 envelope_volume	76005 Å³
水化壳体积 shell_volume	25396 Å³
包络直径 envelope_diameter	85.1 Å
壳层 Rg shell_rg	32.34 Å
包络 Rg envelope_rg	24.71 Å
形状 Rg shape_rg	25.16 Å
总 Rg total_rg	26.01 Å
总原子数 total_atoms	3442
残基数 n_residues	445
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	81.7 Å
Rg (实空间) rg_real	26.31 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.58 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1150e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.6170e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.32 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	41150000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9110
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	28.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.246
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.623
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6783000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.970; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.949

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fab 5G12 light chain
分子量 formula_weight	24119.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3866

DVVMTHTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLVHSNGNTYLHWYLQKPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGADFTLKISRVEAEDLGVYFCSQSTHVPRTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Fab 5G12 heavy chain
分子量 formula_weight	23904.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QVHLQQPGADLVKPGASVKMSCKASGYTFTSYWITWVKLRPGQGLEWIGDIYPGSGSTNFIEKFKSKATLTVDTSSSTAYMQLRSLTSEDSAVYYCARRGHGNYEDYWGQGTTLIVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGPTIK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Interleukin-21 receptor
分子量 formula_weight	4302.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

AGPMPGSSYQGTWSEWSDPVIFQTQSEELKEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Komagataella pastoris

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	alpha-D-mannopyranose
分子量 formula_weight	180.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	370

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d6plha1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d6plha2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d6plhb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6plhA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6plhA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	43.232 Å
晶胞边长 b length_b	89.892 Å
晶胞边长 c length_c	59.317 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.94 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.600 Å
最低分辨率 resolution_low	44.946 Å
R 因子 r_factor	0.1908
R_work r_work	0.1892
R_free r_free	0.2207

fit	/app/data/saxs_computation/pl/6plh/6plh.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pl/6plh/6plh.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pl/6plh/6plh.dat

FAB fragment complexed with C-mannosylated tryptophan peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-21 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)