SAXSdb — 6qpq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein

Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 （Q12158） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 （Q12158） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0SGH3_CHATD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242 作者链 A； PDB构建体 251–451； UniProt 1064–1264 作者链 C； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242 作者链 C； PDB构建体 251–451； UniProt 1064–1264

Sister chromatid cohesion protein 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12158

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein × 1 （G0SGH3） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein × 1 （G0SGH3） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SCC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–566； UniProt 1–566 作者链 D； PDB构建体 1–566； UniProt 1–566

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6qpq
沉积日期 deposition_date	2019-02-14
结构标题 title	The structure of the cohesin head module elucidates the mechanism of ring opening
关键词 keywords	Cohesin, cell division, genome regulation, sister chromatid cohesion, SMC, kleisin, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6qpq__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6qpq__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6qpq__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.55 Å
Rg（电子密度）	31.63 Å
总 Rg	32.01 Å
原子数	7661
残基数	474
排除体积	68200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6qpq__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6qpq__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein
分子量 formula_weight	51883.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	15820

MGKLIRLELFNFKSYKGHHTLLFGDSYFTSIIGPNGSGKSNSMDAISFVLGIKSSHLRSSNLRDLIYRGRVMKTSKIQDDGTTAPATNGDVNGYENGDAGDDEDTSQRTSRNDPKTAWVMAVYEDDAGELHRWKRTITANGTSEYRINDRVVNAQQYNEALEKENILIKARNFLVFQGDVEAIASQSPQDLTRLIEQISGSLEYKEEYERLEEEVRQATEEQAYKLQRRRAANSEIKQYMEQSPGLEVLFMDRLDHVRKQLEQTEQEFEASKAKLRQARESFQAVKQKRLELFNKAFTHIQEQITHVYKELTRSEAYPLGGQAYLDIEEDTDTPFLSGVKYHAMPPLKRFRDMEHLSGGEKTMAALALLFAIHSYQPSPFFVLDEVDAALDNANVEKIKKYIREHAGPGMQFIVISLKPALFQASESLIGVYRDQEANTSRTLTLDLRKYRHH

来源 Source

来源生物 organism	Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	759272
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Sister chromatid cohesion protein 1
分子量 formula_weight	63352.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MVTENPQRLTVLRLATNKGPLAQIWLASNMSNIPRGSVIQTHIAESAKEIAKASGCDDESGDNEYITLRTSGELLQGIVRVYSKQATFLLTDIKDTLTKISMLFKTSQKMTSTVNRLNTVTRVHQLMLEDAVTEREVLVTPGLEFLDDTTIPVGLMAQENSMERKVQGAAPWDTSLEVGRRFSPDEDFEHNNLSSMNLDFDIEEGPITSKSWEEGTRQSSRNFDTHENYIQDDDFPLDDAGTIGWDLGITEKNDQNNDDDDNSVEQGRRLGESIMSEEPTDFGFDLDIEKEAPAGNIDTITDAMTESQPKQTGTRRNSKLLNTKSIQIDEETENSESIASSNTYKEERSNNLLTPQPTNFTTKRLWSEITESMSYLPDPILKNFLSYESLKKRKIHNGREGSIEEPELNVSLNLTDDVISNAGTNDNSFNELTDNMSDFVPIDAGLNEAPFPEENIIDAKTRNEQTTIQTEKVRPTPGEVASKAIVQMAKILRKELSEEKEVIFTDVLKSQANTEPENITKREASRGFFDILSLATEGCIGLSQTEAFGNIKIDAKPALFERFINA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	343

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d6qpqa1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6qpqa2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6qpqb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family family	a.4.5.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6qpqc1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6qpqc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6qpqd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family family	a.4.5.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6qpqB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	580 — Structural maintenance of chromosome 1. Chain E

结构域编号 domain_id	6qpqD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	580 — Structural maintenance of chromosome 1. Chain E

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晶胞边长 a length_a	80.752 Å
晶胞边长 b length_b	111.130 Å
晶胞边长 c length_c	166.195 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 2 21 21
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	45.700 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

The structure of the cohesin head module elucidates the mechanism of ring opening

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Sister chromatid cohesion protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qpq__assembly_2__model_1

6qpq__assembly_2__model_1 | I(q)

6qpq__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

The structure of the cohesin head module elucidates the mechanism of ring opening

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Sister chromatid cohesion protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qpq__assembly_2__model_1

6qpq__assembly_2__model_1 | I(q)

6qpq__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)