SAXSdb — 6qpw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein

Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 （Q12158） Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3 × 1 （P47037） MAGNESIUM ION × 2 PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0SGH3_CHATD
Isoform	—
PDB实体	1, 4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 A； PDB构建体 160–242； UniProt 160–242 作者链 E； PDB构建体 160–366； UniProt 1058–1264

Sister chromatid cohesion protein 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12158

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein × 1 （G0SGH3） Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3 × 1 （P47037） MAGNESIUM ION × 2 PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SCC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2, 4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–85； UniProt 481–564 作者链 E； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P47037

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein × 1 （G0SGH3） Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 （Q12158） Sister chromatid cohesion protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein × 1 （G0SGH3,Q12158） MAGNESIUM ION × 2 PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMC3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–262； UniProt 2–261 作者链 C； PDB构建体 275–535； UniProt 970–1230

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6qpw
沉积日期 deposition_date	2019-02-15
结构标题 title	Structural basis of cohesin ring opening
关键词 keywords	Chromatin, genome segregation, cohesin, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6qpw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6qpw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6qpw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.38 Å
Rg（电子密度）	32.60 Å
总 Rg	33.09 Å
原子数	6784
残基数	839
排除体积	120540 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6qpw__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein
分子量 formula_weight	27570.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6784

MGKLIRLELFNFKSYKGHHTLLFGDSYFTSIIGPNGSGKSNSMDAISFVLGIKSSHLRSSNLRDLIYRGRVMKTSKIQDDGTTAPATNGDVNGYENGDAGDDEDTSQRTSRNDPKTAWVMAVYEDDAGELHRWKRTITANGTSEYRINDRVVNAQQYNEALEKENILIKARNFLVFQGDVEAIASQSPQDLTRLIEQISGSLEYKEEYERLEEEVRQATEEQAYKLQRRRAANSEIKQYMEQ

来源 Source

来源生物 organism	Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	759272
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Sister chromatid cohesion protein 1
分子量 formula_weight	9489.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MASKAIVQMAKILRKELSEEKEVIFTDVLKSQANTEPENITKREASRGFFDILSLATEGCIGLSQTEAFGNIKIDAKPALFERFI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3
分子量 formula_weight	61051.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAYIKRVIIKGFKTYRNETIIDNFSPHQNVIIGSNGSGKSNFFAAIRFVLSDDYSNLKREERQGLIHQGSGGSVMSASVEIVFHDPDHSMILPSGVLSRGDDEVTIRRTVGLKKDDYQLNDRNVTKGDIVRMLETAGFSMNNPYNIVPQGKIVALTNAKDKERLQLLEDVVGAKSFEVKLKASLKKMEETEQKKIQINKEMGELNSKLSEMEQERKELEKYNELERNRKIYQFTLYDRELNEVINQMERLDGDYNNTVYSSESSKHPTSLVPRGSDITSDQLLQRLNDMNTEISGLKNVNKRAFENFKKFNERRKDLAERASELDESKDSIQDLIVKLKQQKVNAVDSTFQKVSENFEAVFERLVPRGTAKLIIHRKNDNANDHDESIDVDMDAESNESQNGKDSEIMYTGVSISVSFNSKQNEQLHVEQLSGGQKTVCAIALILAIQMVDPASFYLFDEIDACLDKQYRTAVATLLKELSKNAQFICTTFRTDMLQVADKFFRVKYECKISTVIEVNREEAIGFIRGSNKFAEV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Sister chromatid cohesion protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein
分子量 formula_weight	42292.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MVTENPQRLTVLRLATNKGPLAQIWLASNMSNIPRGSVIQTHIAESAKEIAKASGSDDESGDNEYITLRTSGELLQGIVRVYSKQATFLLTDIKDTLTKISMLFKTSQKMTSTVNRLNTVTRVHQLMLEDAVTEREVLVTPGLEFLDDTTIPVGLMAQENPNLRAMDRLDHVRKQLEQTEQEFEASKAKLRQARESFQAVKQKRLELFNKAFTHIQEQITHVYKELTRSEAYPLGGQAYLDIEEDTDTPFLSGVKYHAMPPCKRFRDMEHLSGGEKTMAALALLFAIHSYQPSPFFVLDEVDCALDNANVEKIKKYIREHAGPGMQFIVISLKPALFQASESLIGVYRDQEANTSRTLTLDLRKYRHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	759272
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6qpwA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6qpwB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	580 — Structural maintenance of chromosome 1. Chain E

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	178162

Structural basis of cohesin ring opening

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Sister chromatid cohesion protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qpw__assembly_1__model_1

6qpw__assembly_1__model_1 | I(q)

6qpw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structural basis of cohesin ring opening

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein,Structural maintenance of chromosomes protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Sister chromatid cohesion protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qpw__assembly_1__model_1

6qpw__assembly_1__model_1 | I(q)

6qpw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)