|
11OY
Crystal structure of Human p38 alpha MAPK in Complex with MW01-18-122SRM
提交 2026-03-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
A1C99 (3P)-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-(naphthalen-1-yl)-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;20% PEG 10000
0.1M Ammonium Acetate
0.1M Bis-Tris (pH 5.5)
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.234
|
|
1A9U
THE COMPLEX STRUCTURE OF THE MAP KINASE P38/SB203580
提交 1998-04-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:19 RESIDUES INSERTED AT N-TERMINUS
|
SB2 4-[5-(4-FLUORO-PHENYL)-2-(4-METHANESULFINYL-PHENYL)-3H-IMIDAZOL-4-YL]-PYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.240
|
|
1BL6
THE COMPLEX STRUCTURE OF THE MAP KINASE P38/SB216995
提交 1998-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:19 RESIDUES INSERTED AT N-TERMINUS
|
SB6 4-(4-FLUOROPHENYL)-1-CYCLOROPROPYLMETHYL-5-(4-PYRIDYL)-IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4;THE PROTEIN CRYSTALLIZED IN 18% PEG 8000, 0.2M MG(OAC)2, 0.1M HEPES, PH 7.0.
THE PROTEIN CONCENTRATION WAS ~10MG/ML IN A BUFFER OF 50MM NACL, 1MM EDTA,
10MM DTT, 1MM BENZAMIDINE, 1UM PEPSTATIN, 10UG/ML LEUPEPTIN, 25MM HEPES, PH 7.4.
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.251
|
|
1BL7
THE COMPLEX STRUCTURE OF THE MAP KINASE P38/SB220025
提交 1998-07-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:19 RESIDUES INSERTED AT N-TERMINUS
|
SB4 4-(4-FLUOROPHENYL)-1-(4-PIPERIDINYL)-5-(2-AMINO-4-PYRIMIDINYL)-IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4;18% PEG 8000, 0.2M MG(OAC)2, 0.1M HEPES, PH 7.0, pH 7.4
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.265
|
|
1BMK
THE COMPLEX STRUCTURE OF THE MAP KINASE P38/SB218655
提交 1998-07-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:19 RESIDUES INSERTED AT N-TERMINUS
|
SB5 4-(FLUOROPHENYL)-1-CYCLOPROPYLMETHYL-5-(2-AMINO-4-PYRIMIDINYL)IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4;18% PEG 8000, 0.2M MG(OAC)2, 0.1M HEPES, PH7.0, pH 7.4
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.245
|
|
1DI9
THE STRUCTURE OF P38 MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE IN COMPLEX WITH 4-[3-METHYLSULFANYLANILINO]-6,7-DIMETHOXYQUINAZOLINE
提交 1999-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
MSQ 4-[3-METHYLSULFANYLANILINO]-6,7-DIMETHOXYQUINAZOLINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;100MM HEPES, 250MM (NH4)2SO4, 30% PEG6000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.253
|
|
1IAN
HUMAN P38 MAP KINASE INHIBITOR COMPLEX
提交 1997-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:N-TERMINAL HIS-TAG
|
D13 4-[5-(3-IODO-PHENYL)-2-(4-METHANESULFINYL-PHENYL)-1H-IMIDAZOL-4-YL]-PYRIDINE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.301
|
|
1KV1
p38 MAP Kinase in Complex with Inhibitor 1
提交 2002-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BMU 1-(5-TERT-BUTYL-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-(4-CHLORO-PHENYL)-UREA × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;300 K;30% PEG1500, 5 mM DTT, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.284
|
|
1KV2
Human p38 MAP Kinase in Complex with BIRB 796
提交 2002-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;300 K;30% PEG1500, 5 mM DTT, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.318
|
|
1M7Q
Crystal structure of p38 MAP kinase in complex with a dihydroquinazolinone inhibitor
提交 2002-07-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
DQO 1-(2,6-DICHLOROPHENYL)-5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-7-PIPERAZIN-1-YL-3,4-DIHYDROQUINAZOLIN-2(1H)-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;Sodium citrate, Ammonium sulfate, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.254
|
|
1OUK
The structure of p38 alpha in complex with a pyridinylimidazole inhibitor
提交 2003-03-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
084 4-[5-[2-(1-PHENYL-ETHYLAMINO)-PYRIMIDIN-4-YL]-1-METHYL-4-(3-TRIFLUOROMETHYLPHENYL)-1H-IMIDAZOL-2-YL]-PIPERIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;Sodium citrate, Ammunium sulfate, HEPES buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.264
|
|
1OUY
The structure of p38 alpha in complex with a dihydropyrido-pyrimidine inhibitor
提交 2003-03-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
094 1-(2,6-DICHLOROPHENYL)-6-[(2,4-DIFLUOROPHENYL)SULFANYL]-7-(1,2,3,6-TETRAHYDRO-4-PYRIDINYL)-3,4-DIHYDROPYRIDO[3,2-D]PYRIMIDIN-2(1H)-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;Sodium citrate, Ammonium sulfate, HEPES buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.256
|
|
1OVE
The structure of p38 alpha in complex with a dihydroquinolinone
提交 2003-03-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:C162S
|
358 1-(2,6-DICHLOROPHENYL)-5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-7-PIPERIDIN-4-YL-3,4-DIHYDROQUINOLIN-2(1H)-ONE × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;Sodium citrate, Ammonium sulfate, HEPES buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.233
|
|
1OZ1
P38 MITOGEN-ACTIVATED KINASE IN COMPLEX WITH 4-AZAINDOLE INHIBITOR
提交 2003-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FPH 3-(4-FLUOROPHENYL)-2-PYRIDIN-4-YL-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-1-OL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;PEG 3350, calcium chloride, Hepes buffer, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.251
|
|
1R39
THE STRUCTURE OF P38ALPHA
提交 2003-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;SODIUM CITRATE, AMMONIUM SULFATE, HEPES, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.249
|
|
1R3C
THE STRUCTURE OF P38ALPHA C162S MUTANT
提交 2003-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:C162S
|
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;SODIUM CITRATE, AMMONIUM SULFATE, HEPES, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.224
|
|
1W7H
p38 Kinase crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2004-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
3IP 3-(BENZYLOXY)PYRIDIN-2-AMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.233
|
|
1W82
p38 Kinase crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2004-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
L10 N-[(3Z)-5-TERT-BUTYL-2-PHENYL-1,2-DIHYDRO-3H-PYRAZOL-3-YLIDENE]-N'-(4-CHLOROPHENYL)UREA × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.235
|
|
1W83
p38 Kinase crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2004-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
L11 N-[4-CHLORO-3-(PYRIDIN-3-YLOXYMETHYL)-PHENYL]-3-FLUORO- × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.322
|
|
1W84
p38 Kinase crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2004-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
L12 3-(2-PYRIDIN-4-YLETHYL)-1H-INDOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
1WBN
fragment based p38 inhibitors
提交 2004-11-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
L09 N-(3-TERT-BUTYL-1H-PYRAZOL-5-YL)-N'-{4-CHLORO-3-[(PYRIDIN-3-YLOXY)METHYL]PHENYL}UREA × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.244
|
|
1WBO
fragment based p38 inhibitors
提交 2004-11-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
2CH 2-CHLOROPHENOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.220
|
|
1WBS
Identification of novel p38 alpha MAP Kinase inhibitors using fragment-based lead generation.
提交 2004-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-360
|
未记录
|
LI2 3-FLUORO-5-MORPHOLIN-4-YL-N-[3-(2-PYRIDIN-4-YLETHYL)-1H-INDOL-5-YL]BENZAMIDE × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.234
|
|
1WBT
Identification of novel p38 alpha MAP Kinase inhibitors using fragment-based lead generation.
提交 2004-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
WBT 3-FLUORO-5-MORPHOLIN-4-YL-N-[1-(2-PYRIDIN-4-YLETHYL)-1H-INDOL-6-YL]BENZAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.276
|
|
1WBV
Identification of novel p38 alpha MAP Kinase inhibitors using fragment-based lead generation.
提交 2004-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-360
|
未记录
|
LI3 3-FLUORO-N-1H-INDOL-5-YL-5-MORPHOLIN-4-YLBENZAMIDE × 1
GOL GLYCEROL × 3
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.233
|
|
1WBW
Identification of novel p38 alpha MAP Kinase inhibitors using fragment-based lead generation.
提交 2004-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-360
|
未记录
|
LI4 3-(1-NAPHTHYLMETHOXY)PYRIDIN-2-AMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.273
|
|
1WFC
STRUCTURE OF APO, UNPHOSPHORYLATED, P38 MITOGEN ACTIVATED PROTEIN KINASE P38 (P38 MAP KINASE) THE MAMMALIAN HOMOLOGUE OF THE YEAST HOG1 PROTEIN
提交 1996-09-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.297
|
|
1YQJ
Crystal Structure of p38 Alpha in Complex with a Selective Pyridazine Inhibitor
提交 2005-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
6NP 6((S)-3-BENZYLPIPERAZIN-1-YL)-3-(NAPHTHALEN-2-YL)-4-(PYRIDIN-4-YL)PYRAZINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;298 K;sodium citrate, ammonium sulfate, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K, pH 7.50
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.257
|
|
1ZYJ
Human P38 MAP Kinase in Complex with Inhibitor 1a
提交 2005-06-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
0–359(360 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
BI5 4-PHENOXY-N-(PYRIDIN-2-YLMETHYL)BENZAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.267
|
|
1ZZ2
Two Classes of p38alpha MAP Kinase Inhibitors Having a Common Diphenylether Core but Exhibiting Divergent Binding Modes
提交 2005-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
0–359(360 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
B11 N-[3-(4-FLUOROPHENOXY)PHENYL]-4-[(2-HYDROXYBENZYL)AMINO]PIPERIDINE-1-SULFONAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid pH 6.0, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.290
|
|
1ZZL
Crystal structure of P38 with triazolopyridine
提交 2005-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–353(351 aa)
|
未记录
|
TZY 6-[4-(4-FLUOROPHENYL)-1,3-OXAZOL-5-YL]-3-ISOPROPYL[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A]PYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;Na.K Tartrate, Trimethylamine, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.273
|
|
2BAJ
p38alpha bound to pyrazolourea
提交 2005-10-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
1PP 1-(3-tert-butyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)-3-(2,3-dichlorophenyl)urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000 , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.303
|
|
2BAK
p38alpha MAP kinase bound to MPAQ
提交 2005-10-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
AQZ N-(3-{[7-METHOXY-6-(2-PYRROLIDIN-1-YLETHOXY)QUINAZOLIN-4-YL]AMINO}-4-METHYLPHENYL)-2-MORPHOLIN-4-YLISONICOTINAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.250
|
|
2BAL
p38alpha MAP kinase bound to pyrazoloamine
提交 2005-10-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
PQA [5-AMINO-1-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL][3-(PIPERIDIN-4-YLOXY)PHENYL]METHANONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10%(w/v) PEG-MME 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.265
|
|
2BAQ
p38alpha bound to Ro3201195
提交 2005-10-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
PQB [5-AMINO-1-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL](3-{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}PHENYL)METHANONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10 % (w/v) PEG-MME 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.296
|
|
2FSL
mitogen activated protein kinase p38alpha (D176A+F327S) activating mutant form-A
提交 2006-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–359(359 aa)
|
突变:D176A, F327S
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;277 K;18% PEG 3350, 0.2M KF, 0.1 HEPES, 25mM bOG, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.240
|
|
2FSM
mitogen activated protein kinase p38alpha (D176A+F327S) activating mutant form-B
提交 2006-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–359(359 aa)
|
突变:D176A, F327S
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;277 K;18% PEG 3350, 0.2M KF, 0.1 HEPES, 25mM bOG, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.277
|
|
2FSO
mitogen activated protein kinase p38alpha (D176A) activating mutant
提交 2006-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–359(359 aa)
|
突变:D176A
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;277 K;18% PEG 3350, 0.2M KF, 0.1 HEPES, 25mM bOG, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.224
|
|
2FST
mitogen activated protein kinase p38alpha (D176A+F327L) activating mutant
提交 2006-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–359(359 aa)
|
突变:D176A, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;277 K;18% PEG 3350, 0.2M KF, 0.1 HEPES, 25mM bOG, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.241
|
|
2GFS
P38 Kinase Crystal Structure in complex with RO3201195
提交 2006-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
PQB [5-AMINO-1-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL](3-{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}PHENYL)METHANONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;50mM HEPES pH 7.6, 50mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.239
|
|
2I0H
The structure of p38alpha in complex with an arylpyridazinone
提交 2006-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:C162S
|
222 2-(3-{(2-CHLORO-4-FLUOROPHENYL)[1-(2-CHLOROPHENYL)-6-OXO-1,6-DIHYDROPYRIDAZIN-3-YL]AMINO}PROPYL)-1H-ISOINDOLE-1,3(2H)-DIONE × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;284 K;SODIUM CITRATE, AMMONIUM SULFATE, HEPES, PH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 284K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.228
|
|
2LGC
Joint NMR and X-ray refinement reveals the structure of a novel dibenzo[a,d]cycloheptenone inhibitor/p38 MAP kinase complex in solution
提交 2011-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–354(353 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;25 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] P38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2NPQ
A Novel Lipid Binding Site in the p38 alpha MAP Kinase
提交 2006-10-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;277 K;15% PEG 3350, 0.2M KF, 0.1M Hepes pH 7.25, 25mM BOG, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.245
|
|
2OKR
Crystal Structure of the P38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer
提交 2007-01-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;298 K;25% Peg 3350, 250 mM Sodium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.272
|
|
2OKR
Crystal Structure of the P38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer
提交 2007-01-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–359(359 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;298 K;25% Peg 3350, 250 mM Sodium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.272
|
|
2ONL
Crystal Structure of the p38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer
提交 2007-01-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–359(359 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;298 K;3.75% Peg 2000, 100mM Hepes, Prior to crystallization, 1-s-nonyl-1-b-D-thioglucoside (1xcmc) and heptanetriol (1.5%) was added to the protein sample, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
|
分辨率 4.00 Å
R-free 0.331
|
|
2ONL
Crystal Structure of the p38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer
提交 2007-01-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–359(359 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;298 K;3.75% Peg 2000, 100mM Hepes, Prior to crystallization, 1-s-nonyl-1-b-D-thioglucoside (1xcmc) and heptanetriol (1.5%) was added to the protein sample, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
|
分辨率 4.00 Å
R-free 0.331
|
|
2QD9
P38 Alpha Map Kinase inhibitor based on heterobicyclic scaffolds
提交 2007-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
LGF 1-[5-[[3-[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6,8-dihydro-5~{H}-imidazo[1,5-a]pyrazin-7-yl]carbonyl]-6-methoxy-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]-2-[(3~{R})-3-oxidanylpyrrolidin-1-yl]ethane-1,2-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.282
|
|
2RG5
Phenylalanine pyrrolotriazine p38 alpha map kinase inhibitor compound 11B
提交 2007-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
279 N-ethyl-4-{[5-(methoxycarbamoyl)-2-methylphenyl]amino}-5-methylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.305
|
|
2RG6
Phenylalanine pyrrolotriazine p38 alpha map kinase inhibitor compound 11J
提交 2007-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
287 4-{[5-(methoxycarbamoyl)-2-methylphenyl]amino}-5-methyl-N-[(1S)-1-phenylethyl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.221
|
|
2Y8O
Crystal structure of human p38alpha complexed with a MAPK docking peptide
提交 2011-02-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:YES
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;22% PEG3350 100MM HEPES 7.5
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.209
|
|
2YIS
triazolopyridine inhibitors of p38 kinase.
提交 2011-05-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
YIS 1-[3-tert-butyl-1-(3-chloro-4-hydroxyphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-{2-[(3-{2-[(2-hydroxyethyl)sulfanyl]phenyl}[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl)sulfanyl]benzyl}urea × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.255
|
|
2YIW
triazolopyridine inhibitors of p38 kinase
提交 2011-05-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
YIW 1-(3-tert-butyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-yl)-3-(2-{[3-(1-methylethyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl]sulfanyl}benzyl)urea × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.259
|
|
2YIX
Triazolopyridine Inhibitors of p38
提交 2011-05-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4–354(351 aa)
片段:RESIDUES 4-354
|
未记录
|
YIX 1-ethyl-3-(2-{[3-(1-methylethyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl]sulfanyl}benzyl)urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.247
|
|
2ZAZ
Crystal structure of P38 in complex with 4-anilino quinoline inhibitor
提交 2007-10-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 1
GK1 4-{4-[(5-hydroxy-2-methylphenyl)amino]quinolin-7-yl}-1,3-thiazole-2-carbaldehyde × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.234
|
|
2ZB0
Crystal structure of P38 in complex with biphenyl amide inhibitor
提交 2007-10-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GK3 N-(3-cyanophenyl)-2'-methyl-5'-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)-4-biphenylcarboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.212
|
|
2ZB1
Crystal structure of P38 in complex with biphenyl amide inhibitor
提交 2007-10-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GK4 N-(cyclopropylmethyl)-2'-methyl-5'-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)biphenyl-4-carboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.239
|
|
3BV2
Morpholino pyrrolotriazine P38 Alpha map kinase inhibitor compound 30
提交 2008-01-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
P38 5-methyl-4-[(2-methyl-5-{[(2-morpholin-4-ylpyridin-4-yl)carbonyl]amino}phenyl)amino]-N-(1-phenylethenyl)pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K, 50 MM MES, 5 MM MAGNESIUM SULFATE, pH 6.0
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.263
|
|
3BV3
Morpholino pyrrolotriazine P38 Alpha Map Kinase inhibitor compound 2
提交 2008-01-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
P39 5-methyl-4-[(2-methyl-5-{[(3-morpholin-4-ylphenyl)carbonyl]amino}phenyl)amino]-N-[(1S)-1-phenylethyl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K, 50 MM MES, 5 MM MAGNESIUM SULFATE, pH 6.0
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.284
|
|
3BX5
P38 alpha map kinase complexed with BMS-640994
提交 2008-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
304 N-[2-methyl-5-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-{[(1R)-1-methylpropyl]amino}-1,3-thiazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.320
|
|
3C5U
P38 ALPHA map kinase complexed with a benzothiazole based inhibitor
提交 2008-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
P41 6-[4-(2-fluorophenyl)-1,3-oxazol-5-yl]-N-(1-methylethyl)-1,3-benzothiazol-2-amine × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.296
|
|
3CTQ
Structure of MAP kinase p38 in complex with a 1-o-tolyl-1,2,3-triazole-4-carboxamide
提交 2008-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–352(348 aa)
|
未记录
|
337 N-benzyl-1-[5-({5-tert-butyl-2-methoxy-3-[(methylsulfonyl)amino]phenyl}carbamoyl)-2-methylphenyl]-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.269
|
|
3D7Z
Crystal Structure of P38 Kinase in Complex with a biphenyl amide inhibitor
提交 2008-05-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
GK5 N~3~-cyclopropyl-N~4~'-(cyclopropylmethyl)-6-methylbiphenyl-3,4'-dicarboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;Authors suggest to see publication for details, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.227
|
|
3D83
Crystal structure of P38 kinase in complex with a biphenyl amide inhibitor
提交 2008-05-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GK6 N-{4'-[(cyclopropylmethyl)carbamoyl]-6-methylbiphenyl-3-yl}-2-morpholin-4-ylpyridine-4-carboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;Authors suggest to see publication for details, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.218
|
|
3DS6
P38 complex with a phthalazine inhibitor
提交 2008-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:Human P38 kinase
|
突变:remnants of his tag at Nterminal(GSHMLE)
|
A17 N-cyclopropyl-4-methyl-3-[1-(2-methylphenyl)phthalazin-6-yl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;31% PEG 4000, 100mM NaCitrate, 200mM ammonium acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.319
|
|
3DS6
P38 complex with a phthalazine inhibitor
提交 2008-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–360(360 aa)
片段:Human P38 kinase
|
突变:remnants of his tag at Nterminal(GSHMLE)
|
A17 N-cyclopropyl-4-methyl-3-[1-(2-methylphenyl)phthalazin-6-yl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;31% PEG 4000, 100mM NaCitrate, 200mM ammonium acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.319
|
|
3DS6
P38 complex with a phthalazine inhibitor
提交 2008-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1–360(360 aa)
片段:Human P38 kinase
|
突变:remnants of his tag at Nterminal(GSHMLE)
|
A17 N-cyclopropyl-4-methyl-3-[1-(2-methylphenyl)phthalazin-6-yl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;31% PEG 4000, 100mM NaCitrate, 200mM ammonium acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.319
|
|
3DS6
P38 complex with a phthalazine inhibitor
提交 2008-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1–360(360 aa)
片段:Human P38 kinase
|
突变:remnants of his tag at Nterminal(GSHMLE)
|
A17 N-cyclopropyl-4-methyl-3-[1-(2-methylphenyl)phthalazin-6-yl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;31% PEG 4000, 100mM NaCitrate, 200mM ammonium acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.319
|
|
3DT1
P38 Complexed with a quinazoline inhibitor
提交 2008-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
P40 N-cyclopropyl-4-methyl-3-{2-[(2-morpholin-4-ylethyl)amino]quinazolin-6-yl}benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;295 K;1.6 M ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.280
|
|
3E92
Crystal Structure of P38 Kinase in Complex with A Biaryl Amide Inhibitor
提交 2008-08-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
G6A N-cyclopropyl-2',6-dimethyl-4'-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)biphenyl-3-carboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;18-22% PEG 5000MME, 0.18M ammonium sulphate, 3-4% jeffamine, 0.1M ADA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.216
|
|
3E93
Crystal Structure of P38 Kinase in Complex with A Biaryl Amide Inhibitor
提交 2008-08-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
19B 4-methyl-N-(3-morpholin-4-ylphenyl)-3-(3-piperidin-4-yl-1,2-benzisoxazol-6-yl)benzamide × 1
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;18-22% PEG 5000MME, 0.18M ammonium sulphate, 3-4% jeffamine, 0.1M ADA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.228
|
|
3FC1
Crystal structure of p38 kinase bound to pyrimido-pyridazinone inhibitor
提交 2008-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
52P 5-(2,6-dichlorophenyl)-2-[(2,4-difluorophenyl)sulfanyl]-6H-pyrimido[1,6-b]pyridazin-6-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10 mg/mL Protein, 20 % PEG 3350, 0.1 M Tris-HCl pH 7.0, 50 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.251
|
|
3FI4
P38 kinase crystal structure in complex with RO4499
提交 2008-12-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FI4 (2S)-1-{[3-(2-chlorophenyl)-6-(2,4-difluorophenoxy)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl]amino}propan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
3FKL
P38 kinase crystal structure in complex with RO9552
提交 2008-12-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FKL N-cyclopropyl-4-methyl-3-[8-methyl-7-oxo-2-(tetrahydro-2H-pyran-4-ylamino)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.254
|
|
3FKN
P38 kinase crystal structure in complex with RO7125
提交 2008-12-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FKN 3-[2-chloro-5-(methylsulfonyl)phenyl]-6-(2,4-difluorophenoxy)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
|
3FKO
P38 kinase crystal structure in complex with RO3668
提交 2008-12-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:R57K
|
FKO 3-(2-chlorophenyl)-6-(2-fluorophenoxy)-2H-indazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.253
|
|
3FL4
P38 kinase crystal structure in complex with RO5634
提交 2008-12-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FL4 6-(2,4-difluorophenoxy)-3-(2-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.243
|
|
3FLN
P38 kinase crystal structure in complex with R1487
提交 2008-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1–360(360 aa)
|
未记录
|
3FN 6-(2,4-difluorophenoxy)-8-methyl-2-(tetrahydro-2H-pyran-4-ylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.234
|
|
3FLQ
P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-difluoro-phenoxy)-2-((s)-2-methanesulfonyl-1-methyl-ethylamino)-8-methyl-8h-pyrido[2,3-d]pyrimidin
提交 2008-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
891 6-(2,4-difluorophenoxy)-8-methyl-2-{[(1S)-1-methyl-2-(methylsulfonyl)ethyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.275
|
|
3FLS
P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-Difluoro-phenoxy)-2-((R)-2-methanesulfonyl-1-methyl-ethylamino)-8-methyl-8H-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
提交 2008-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FLS 6-(2,4-difluorophenoxy)-8-methyl-2-{[(1R)-1-methyl-2-(methylsulfonyl)ethyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.294
|
|
3FLW
P38 kinase crystal structure in complex with pamapimod
提交 2008-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FLW 6-(2,4-difluorophenoxy)-2-{[3-hydroxy-1-(2-hydroxyethyl)propyl]amino}-8-methylpyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.237
|
|
3FLY
P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-difluoro-phenoxy)-2-isopropylamino-8-methyl-8h-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
提交 2008-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FLY 6-(2,4-difluorophenoxy)-8-methyl-2-[(1-methylethyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.245
|
|
3FLZ
P38 kinase crystal structure in complex WITH 8-Methyl-6-phenoxy-2-(tetrahydro-pyran-4-ylamino)-8H-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
提交 2008-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FLZ 8-methyl-6-phenoxy-2-(tetrahydro-2H-pyran-4-ylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.251
|
|
3FMH
P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-Difluoro-phenoxy)-8-methyl-2-((R)-1-methyl-2-tetrazol-2-yl-ethylamino)-8H-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
提交 2008-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
533 6-(2,4-difluorophenoxy)-8-methyl-2-{[(1R)-1-methyl-2-(2H-tetrazol-2-yl)ethyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.246
|
|
3FMJ
P38 kinase crystal structure in complex with 4-(5-Methyl-3-phenyl-isoxazol-4-yl)-pyrimidin-2-ylamine
提交 2008-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FMJ 4-(5-methyl-3-phenylisoxazol-4-yl)pyrimidin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.268
|
|
3FMK
P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-Difluoro-phenoxy)-8-methyl-2-((S)-1-methyl-2-tetrazol-2-yl-ethylamino)-8H-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
提交 2008-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FMK 6-(2,4-difluorophenoxy)-8-methyl-2-{[(1S)-1-methyl-2-(2H-tetrazol-2-yl)ethyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.224
|
|
3FML
P38 kinase crystal structure in complex with RO6224
提交 2008-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FML 6-(2,4-difluorophenoxy)-N-[(1S)-1-methyl-2-(methylsulfonyl)ethyl]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.245
|
|
3FMM
P38 kinase crystal structure in complex with RO6226
提交 2008-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
XI2 6-(2,4-difluorophenoxy)-N-[(1R)-1-methyl-2-(methylsulfonyl)ethyl]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
|
3FMN
P38 kinase crystal structure in complex with RO2530
提交 2008-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
530 6-(2,4-difluorophenoxy)-N-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.242
|
|
3FSF
P38 kinase crystal structure in complex with 3-(2,6-Dichloro-phenyl)-7-[4-(2-diethylamino-ethoxy)-phenylamino]-1-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrimido[4,5-d]pyrimidin-2-one
提交 2009-01-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FSS 3-(2,6-dichlorophenyl)-7-({4-[(diethylamino)methoxy]phenyl}amino)-1-methyl-3,4-dihydropyrimido[4,5-d]pyrimidin-2(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.259
|
|
3FSK
P38 kinase crystal structure in complex with RO6257
提交 2009-01-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
RO6 3-(2-chlorophenyl)-7-[(trans-4-hydroxycyclohexyl)amino]-3,4-dihydropyrimido[4,5-d]pyrimidin-2(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;290 K;50 mM Hepes pH 7.6, 50 mM CaCl2, 17% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.243
|
|
3GC7
The structure of p38alpha in complex with a dihydroquinazolinone
提交 2009-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:C162S
|
B45 5-(2-chloro-4-fluorophenyl)-1-(2,6-dichlorophenyl)-7-[1-(1-methylethyl)piperidin-4-yl]-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;Sodium Citrate, ammonium sulphate, Hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.208
|
|
3GCP
Human P38 MAP Kinase in Complex with SB203580
提交 2009-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
SB2 4-[5-(4-FLUORO-PHENYL)-2-(4-METHANESULFINYL-PHENYL)-3H-IMIDAZOL-4-YL]-PYRIDINE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.9;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.276
|
|
3GCQ
Human P38 MAP kinase in complex with RL45
提交 2009-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
1BU 1-{4-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.9;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG 4000, 50 mM n-beta-octyl-glucoside, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.270
|
|
3GCS
Human P38 MAP kinase in complex with Sorafenib
提交 2009-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BAX 4-{4-[({[4-CHLORO-3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}CARBONYL)AMINO]PHENOXY}-N-METHYLPYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.9;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG 4000, 50 mM n-beta-octyl-glucoside, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.262
|
|
3GCU
Human P38 MAP kinase in complex with RL48
提交 2009-02-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–360(359 aa)
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
R48 1-{3-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 2
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 4
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.9;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG 4000, 50 mM n-beta-octyl-glucoside, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.235
|
|
3GCU
Human P38 MAP kinase in complex with RL48
提交 2009-02-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–360(359 aa)
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
R48 1-{3-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 2
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 4
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.9;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG 4000, 50 mM n-beta-octyl-glucoside, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.235
|
|
3GCV
Human P38 MAP Kinase in Complex with RL62
提交 2009-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
SS6 1-{3-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.9;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.254
|
|
3GFE
Crystal Structure of p38a Mitogen-Activated Protein Kinase in Complex with a Pyrazolopyridinone Inhibitor
提交 2009-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
P37 N-cyclopropyl-3-{[1-(2,4-difluorophenyl)-7-methyl-6-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;25% PEG 3350, 0.2M Magnesium Chloride, 0.1M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.250
|
|
3GI3
Crystal structure of a N-Phenyl-N'-Naphthylurea analog in complex with p38 MAP kinase
提交 2009-03-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
B10 N-{5-tert-butyl-2-methoxy-3-[({4-[6-(morpholin-4-ylmethyl)pyridin-3-yl]naphthalen-1-yl}carbamoyl)amino]phenyl}methanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;16% PEG4000, 0.1 M Citrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.289
|
|
3HA8
THE COMPLEX STRUCTURE OF THE MAP KINASE P38/Compound 14b
提交 2009-05-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
5JZ N~2~-{4-[6-(3,4-dihydroquinolin-1(2H)-ylcarbonyl)-1H-benzimidazol-1-yl]-6-ethoxy-1,3,5-triazin-2-yl}-3-(2,2-dimethyl-4H-1,3-benzodioxin-6-yl)-N-methyl-L-alaninamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.248
|
|
3HEC
P38 in complex with Imatinib
提交 2009-05-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–352(348 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 5-352
|
未记录
|
STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M Cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.300
|
|
3HEG
P38 in complex with Sorafenib
提交 2009-05-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–352(348 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 5-352
|
未记录
|
BAX 4-{4-[({[4-CHLORO-3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}CARBONYL)AMINO]PHENOXY}-N-METHYLPYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M Cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.309
|
|
3HL7
Crystal Structure of Human p38alpha complexed with SD-0006
提交 2009-05-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
I47 2-{4-[5-(4-chlorophenyl)-4-pyrimidin-4-yl-1H-pyrazol-3-yl]piperidin-1-yl}-2-oxoethanol × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;298 K;20-30% PEG3000, 10 mM CaCl2, 50 mM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.228
|
|
3HLL
Crystal Structure of Human p38alpha complexed with PH-797804
提交 2009-05-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
I45 3-{3-bromo-4-[(2,4-difluorobenzyl)oxy]-6-methyl-2-oxopyridin-1(2H)-yl}-N,4-dimethylbenzamide × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
PO2 HYPOPHOSPHITE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;298 K;20-30% PEG3000, 10 mM CaCl2, 50 mM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.254
|
|
3HP2
Crystal Structure of Human p38alpha complexed with a pyridinone compound
提交 2009-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
P36 1-benzyl-4-(benzyloxy)-3-bromopyridin-2(1H)-one × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;298 K;20-30% PEG3000, 10 mM CaCl2, 50 mM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.252
|
|
3HP5
Crystal Structure of Human p38alpha complexed with a pyrimidopyridazinone compound
提交 2009-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
52P 5-(2,6-dichlorophenyl)-2-[(2,4-difluorophenyl)sulfanyl]-6H-pyrimido[1,6-b]pyridazin-6-one × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;298 K;20-30% PEG3000, 10 mM CaCl2, 50 mM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.262
|
|
3HRB
p38 kinase Crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2009-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
I39 [3-amino-2-(2-methylphenyl)-1-oxidopyridin-4-yl](2,4-difluorophenyl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;22% PEG 3350, 0.2M NaCl, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 1mM THP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.260
|
|
3HUB
Human p38 MAP Kinase in Complex with Scios-469
提交 2009-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
469 2-(6-chloro-5-{[(2R,5S)-4-(4-fluorobenzyl)-2,5-dimethylpiperazin-1-yl]carbonyl}-1-methyl-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-2-oxoacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.292
|
|
3HUC
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL40
提交 2009-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
G97 N-[2-phenyl-4-(1H-pyrazol-3-ylamino)quinazolin-7-yl]prop-2-enamide × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.232
|
|
3HV3
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL49
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
R49 1-{4-[(6-aminoquinolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.300
|
|
3HV4
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL51
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
L51 1-{3-[(6-aminoquinolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.271
|
|
3HV4
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL51
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
L51 1-{3-[(6-aminoquinolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.271
|
|
3HV5
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL24
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
R24 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-{3-[(6-nitroquinolin-4-yl)amino]phenyl}urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.260
|
|
3HV5
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL24
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
R24 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-{3-[(6-nitroquinolin-4-yl)amino]phenyl}urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.260
|
|
3HV6
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL39
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
R39 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(2-morpholin-4-ylethoxy)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.254
|
|
3HV7
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL38
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1AU 1-[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]-3-naphthalen-1-ylurea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.279
|
|
3HVC
Crystal structure of human p38alpha MAP kinase
提交 2009-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;293 K;Protein solution: 10 mg/ml Protein in 50 mM Tris-HCl pH 7.0, 150 mM NaCl, 1 mM Ethylenediaminetetraacetic acid, 1 mM DTT buffer. Precipitant solution: 28% PEG 1500, 5mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.267
|
|
3IPH
Crystal structure of p38 in complex with a biphenylamide inhibitor
提交 2009-08-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
G11 6-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]-N-(cyclopropylmethyl)pyridine-3-carboxamide × 1
SO4 SULFATE ION × 1
GOL GLYCEROL × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;0.1M ADA, 0.18M (NH4)2SO4, 18-20% PEG5000MME, 3-4% Jeffamine ED600, 2mM b-Mercaptoethanol.
, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.249
|
|
3ITZ
Crystal Structure of p38a Mitogen-Activated Protein Kinase in Complex with a Pyrazolopyridazine Inhibitor
提交 2009-08-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
P66 4-chloro-N-cyclopropyl-3-{[1-(2,6-difluorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyridazin-4-yl]amino}benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;25% PEG 3350, 0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.249
|
|
3IW5
Human p38 MAP Kinase in Complex with an Indole Derivative
提交 2009-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
DF3 N-[2-(3-{[2-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-ylamino)-2-oxoethyl]sulfanyl}-1H-indol-1-yl)ethyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100mM MES, 20-30% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.291
|
|
3IW6
Human p38 MAP Kinase in Complex with a Benzylpiperazin-Pyrrol
提交 2009-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
PP0 ethyl 4-[(4-benzylpiperazin-1-yl)carbonyl]-1-ethyl-3,5-dimethyl-1H-pyrrole-2-carboxylate × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100mM MES, 20-30% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.273
|
|
3IW7
Human p38 MAP Kinase in Complex with an Imidazo-pyridine
提交 2009-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
IPK 2-({4-[(4-benzylpiperidin-1-yl)carbonyl]benzyl}sulfanyl)-3H-imidazo[4,5-c]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100mM MES, 20-30% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.282
|
|
3IW8
Structure of Inactive Human p38 MAP Kinase in Complex with a Thiazole-Urea
提交 2009-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
HIZ 1-{4-[(1S)-1-amino-2-(benzyloxy)ethyl]-1,3-thiazol-2-yl}-3-(3-chloro-4-fluorophenyl)urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100mM MES, 20-30% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.298
|
|
3K3I
p38alpha bound to novel DGF-out compound PF-00215955
提交 2009-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–352(348 aa)
片段:UNP residues 5-352
|
未记录
|
JZJ (3S)-3-[4-(4-bromophenyl)-1H-imidazol-2-yl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
The compound 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine is required to obtain the crystal form.
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.242
|
|
3K3J
P38alpha bound to novel DFG-out compound PF-00416121
提交 2009-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
F4C 2-(4-fluorophenyl)-3-oxo-6-pyridin-4-yl-N-[2-(trifluoromethyl)benzyl]-2,3-dihydropyridazine-4-carboxamide × 1
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;The compound 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine is required to obtain the crystal form, Vapor Diffusion, Hanging Drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.245
|
|
3KF7
Crystal Structure of Human p38alpha Complexed With a Triazolopyrimidine compound
提交 2009-10-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
L9G 3-{6-[2-(2,4-difluorophenyl)ethyl][1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-yl}-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;298 K;20-30% PEG3000, 10 mM CaCl2, 50 mM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.274
|
|
3KQ7
Structure of human p38alpha with N-[4-methyl-3-(6-{[2-(1-methylpyrrolidin-2-yl)ethyl]amino}pyridine-3-amido)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)pyridine-4-carboxamide
提交 2009-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
KQ7 N-(2-methyl-5-{[(2-morpholin-4-ylpyridin-4-yl)carbonyl]amino}phenyl)-6-({2-[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]ethyl}amino)py ridine-3-carboxamide × 1
ACT ACETATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;296 K;14-16%(w/v) PEG8000, 300mM Magnesium acetate, 100mM Hepes pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.233
|
|
3L8S
Human p38 MAP Kinase in Complex with CP-547632
提交 2010-01-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
片段:p38 MAP Kinase
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
BFF 3-[(4-bromo-2,6-difluorobenzyl)oxy]-5-{[(4-pyrrolidin-1-ylbutyl)carbamoyl]amino}isothiazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.307
|
|
3L8X
P38 alpha kinase complexed with a pyrazolo-pyrimidine based inhibitor
提交 2010-01-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
N4D N,4-dimethyl-3-[(1-phenyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl)amino]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5 MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.319
|
|
3LFA
Human p38 MAP Kinase in Complex with Dasatinib
提交 2010-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1N1 N-(2-CHLORO-6-METHYLPHENYL)-2-({6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-2-METHYLPYRIMIDIN-4-YL}AMINO)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.254
|
|
3LFB
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL98
提交 2010-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
Z87 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-(1,3-thiazol-2-yl)urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.320
|
|
3LFC
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL99
提交 2010-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
Z86 (4-{5-[({4-[2-(benzyloxy)ethyl]-1,3-thiazol-2-yl}carbamoyl)amino]-3-tert-butyl-1H-pyrazol-1-yl}phenyl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.326
|
|
3LFD
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL113
提交 2010-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
Z85 1-{4-[2-(benzyloxy)ethyl]-1,3-thiazol-2-yl}-3-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å
R-free 0.305
|
|
3LFE
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL116
提交 2010-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
Z84 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-{4-[2-(pyridin-4-ylmethoxy)ethyl]-1,3-thiazol-2-yl}urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.274
|
|
3LFF
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL166
提交 2010-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
Z83 (4-{3-tert-butyl-5-[(1,3-thiazol-2-ylcarbamoyl)amino]-1H-pyrazol-1-yl}phenyl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.225
|
|
3LHJ
Crystal Structure of p38a Mitogen-Activated Protein Kinase in Complex with a Pyrazolopyridinone Inhibitor.
提交 2010-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
LHJ N-cyclopropyl-3-[1-(2,4-difluorophenyl)-7-methyl-6-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl]-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;25% PEG 3350,
0.2M Magnesium Chloride,
0.1M BIS-TRIS, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.31 Å
R-free 0.289
|
|
3MGY
Mutagenesis of p38 MAP Kinase eshtablishes key roles of Phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel DFG-out state
提交 2010-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.291
|
|
3MH0
Mutagenesis of p38 MAP Kinase eshtablishes key roles of Phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel DFG-out state
提交 2010-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:F169A
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.280
|
|
3MH1
Mutagenesis of p38 MAP kinase establishes key roles of Phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel DFG-out state
提交 2010-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:F169G
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.296
|
|
3MH2
Mutagenesis of p38 MAP kinase establishes key roles of Phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel DFG-out state
提交 2010-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:F169Y
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.318
|
|
3MH3
Mutagenesis of p38 MAP kinase establishes key roles of Phe169 in function and structural dynamics and reveals a novel DFG-out state
提交 2010-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:F169R
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.293
|
|
3MPA
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG motif mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-04-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:D168G
|
SB2 4-[5-(4-FLUORO-PHENYL)-2-(4-METHANESULFINYL-PHENYL)-3H-IMIDAZOL-4-YL]-PYRIDINE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG 4000, 0.1 M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.289
|
|
3MPT
Crystal structure of P38 kinase in complex with a pyrrole-2-carboxamide inhibitor
提交 2010-04-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
1GK N-(furan-2-ylmethyl)-4-[(2-methylphenyl)carbonyl]-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;See publication for details , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.298
|
|
3MVL
P38 Alpha Map Kinase complexed with pyrrolotriazine inhibitor 7K
提交 2010-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
38P 4-{[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]amino}-5-methyl-N-propylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.335
|
|
3MVL
P38 Alpha Map Kinase complexed with pyrrolotriazine inhibitor 7K
提交 2010-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
38P 4-{[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]amino}-5-methyl-N-propylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.335
|
|
3MVM
P38 Alpha Map Kinase complexed with pyrrolotriazine inhibitor 7V
提交 2010-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
39P 4-{[5-(isoxazol-3-ylcarbamoyl)-2-methylphenyl]amino}-5-methyl-N-propylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.238
|
|
3MVM
P38 Alpha Map Kinase complexed with pyrrolotriazine inhibitor 7V
提交 2010-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
39P 4-{[5-(isoxazol-3-ylcarbamoyl)-2-methylphenyl]amino}-5-methyl-N-propylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.238
|
|
3MW1
p38 kinase Crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2010-05-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
MIH 8-(2,6-dichlorophenyl)-4-(2,4-difluorophenyl)-2-piperidin-4-yl-1,7-naphthyridine 7-oxide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;22% PEG 3350, 0.2M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.339
|
|
3NEW
p38-alpha complexed with Compound 10
提交 2010-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
3NE 4-(trifluoromethyl)-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,7-dihydro-6H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;291 K;30 mg/mL protein in 25 mM Tris pH 8, 100 mM NaCl, 10% glycerol, and 10 mM DTT co-crystallized with 1 mM Compound 10 in 20% PEG 2000MME and 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 at 18 C., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.306
|
|
3NNU
Crystal structure of P38 alpha in complex with DP1376
提交 2010-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–354(354 aa)
|
未记录
|
EDB 2-{3-[(5E)-5-{[(2,3-dichlorophenyl)carbamoyl]imino}-3-thiophen-2-yl-2,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]phenyl}acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;20% PEG 3350, 200MM LITIUM CITRATE, SOAKED WITH COMPOUND, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 290K, pH 7.0
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.227
|
|
3NNV
Crystal structure of P38 alpha in complex with DP437
提交 2010-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–354(354 aa)
|
未记录
|
437 1-{3-tert-butyl-1-[4-(hydroxymethyl)phenyl]-1H-pyrazol-5-yl}-3-naphthalen-1-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;20% PEG 3350, 200MM LITIUM CITRATE, SOAKED WITH COMPOUND, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 290K, pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.235
|
|
3NNW
Crystal structure of P38 alpha in complex with DP802
提交 2010-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–354(354 aa)
|
未记录
|
EDD 2-[3-(3-tert-butyl-5-{[(2,3-dichlorophenyl)carbamoyl]imino}-2,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl)phenyl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;20% PEG 3350, 200MM LITIUM CITRATE, SOAKED WITH COMPOUND, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 290K, pH 7.0
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.213
|
|
3NNX
Crystal structure of phosphorylated P38 alpha in complex with DP802
提交 2010-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–354(354 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
EDD 2-[3-(3-tert-butyl-5-{[(2,3-dichlorophenyl)carbamoyl]imino}-2,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl)phenyl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;290 K;25% PEG 3350, 100MM SODIUM ACETATE PH 4.5, CO-CRSTALLIZED WITH COMPOUND, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 290K
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.285
|
|
3NWW
P38 Alpha kinase complexed with a 2-aminothiazol-5-yl-pyrimidine based inhibitor
提交 2010-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
3NW 1-[2-(2-{[2-(dimethylamino)ethyl]amino}-6-{2-[(1-methylethyl)amino]-1,3-thiazol-5-yl}pyrimidin-4-yl)benzyl]-3-ethylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.254
|
|
3O8P
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG motif mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:kinase domain
|
突变:D168G
|
BMU 1-(5-TERT-BUTYL-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-(4-CHLORO-PHENYL)-UREA × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG4000, 0.1M cacodylic acid, 50mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.276
|
|
3O8T
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG-motif mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:kinase domain
|
突变:F169A
|
BMU 1-(5-TERT-BUTYL-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-(4-CHLORO-PHENYL)-UREA × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG4000, 0.1M Cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.282
|
|
3O8U
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG motif mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:kinase domain
|
突变:F169Y
|
BMU 1-(5-TERT-BUTYL-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-(4-CHLORO-PHENYL)-UREA × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG4000, 0.1M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.285
|
|
3OBG
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:kinase domain
|
突变:F169G
|
SB2 4-[5-(4-FLUORO-PHENYL)-2-(4-METHANESULFINYL-PHENYL)-3H-IMIDAZOL-4-YL]-PYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-15% PEG 4000, 0.1M Cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.323
|
|
3OBJ
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:kinase domain
|
突变:F169R
|
BMU 1-(5-TERT-BUTYL-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-(4-CHLORO-PHENYL)-UREA × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-15% PEG 4000, 0.1M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.287
|
|
3OC1
Conformational plasticity of p38 MAP kinase DFG motif mutants in response to inhibitor binding
提交 2010-08-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
片段:kinase domain
|
突变:F169G
|
BMU 1-(5-TERT-BUTYL-2-METHYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-(4-CHLORO-PHENYL)-UREA × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;10-20% PEG4000, 0.1M cacodylic acid, 50 mM n-octyl-beta-D-glucoside, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.303
|
|
3OCG
P38 Alpha kinase complexed with a 5-amino-pyrazole based inhibitor
提交 2010-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
OCG 5-amino-N-[5-(isoxazol-3-ylcarbamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.270
|
|
3OD6
Crystal structure of p38alpha Y323T active mutant
提交 2010-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–360(360 aa)
|
突变:Y323T
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M KF, 17% PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.68 Å
R-free 0.283
|
|
3ODY
Crystal structure of p38alpha Y323Q active mutant
提交 2010-08-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–360(360 aa)
|
突变:Y323Q
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;17% PEG 3350, 0.15 M KF, 0.1 M Hepes, 25mM b-OG, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.304
|
|
3ODZ
Crystal structure of P38alpha Y323R active mutant
提交 2010-08-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–360(360 aa)
|
突变:Y323R
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;17% PEG 3350, 0.15M KF, 0.1M Hepes, 25mM b-OG, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.282
|
|
3OEF
Crystal structure of Y323F inactive mutant of p38alpha MAP kinase
提交 2010-08-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–360(360 aa)
|
突变:Y323F
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;277 K;17% (w/v) PEG 3350, 0.1M Hepes pH 7.25, 0.2M KF, and 25mM b-OG, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.221
|
|
3PG3
Human p38 MAP Kinase in Complex with RL182
提交 2010-10-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:C119S, C162S, A172C, F327L
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
DG7 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-{4-[2-(pyridin-3-ylmethoxy)ethyl]-1,3-thiazol-2-yl}urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
3QUD
Human p38 MAP Kinase in Complex with 2-amino-phenylamino-benzophenone
提交 2011-02-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
N3F {4-[(2-aminophenyl)amino]phenyl}(phenyl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.278
|
|
3QUE
Human p38 MAP Kinase in Complex with Skepinone-L
提交 2011-02-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
3FF 2-[(2,4-difluorophenyl)amino]-7-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-10,11-dihydro-5H-dibenzo[a,d][7]annulen-5-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100mM MES, 20-30% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.311
|
|
3RIN
p38 kinase crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2011-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
I2O N-cyclopropyl-4-methyl-3-(2'-oxo-1',2'-dihydrospiro[cyclopentane-1,3'-indol]-6'-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;22% PEG3350, 0.2 M sodium chloride, 1 mM THP, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.308
|
|
3ROC
Crystal structure of human p38 alpha complexed with a pyrimidinone compound
提交 2011-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
29A 3-{5-chloro-4-[(2,4-difluorobenzyl)oxy]-6-oxopyrimidin-1(6H)-yl}-N-(2-hydroxyethyl)-4-methylbenzamide × 1
29B 4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;298 K;20-30% PEG3000, 10MM CaCl2, 50MM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.276
|
|
3S3I
p38 kinase crystal structure in complex with small molecule inhibitor
提交 2011-05-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4–352(349 aa)
|
未记录
|
CQ0 3-(3-tert-butyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-7-yl)-N-cyclopropyl-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;22% PEG3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 1 mM THP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.258
|
|
3S4Q
P38 alpha kinase complexed with a pyrazolo-triazine based inhibitor
提交 2011-05-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
NK0 3-[(6-benzoyl-5-methylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-yl)amino]-N-cyclopropyl-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5 MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.327
|
|
3U8W
Crystal Structure of p38a Mitogen-Activated Protein Kinase in Complex with a Triazolopyridazinone inhibitor
提交 2011-10-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
09J 3-[3-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-ethyl-6-oxo-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-7-yl]-N-cyclopropyl-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;25% PEG3350, 0.2M Magnesium Chloride, 0.1M BIS-TRIS, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.255
|
|
3UVP
Human p38 MAP Kinase in Complex with a Benzamide Substituted Benzosuberone
提交 2011-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
048 N-{2-fluoro-5-[(5-oxo-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzo[7]annulen-2-yl)amino]phenyl}benzamide × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;100mM MES, 25% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.297
|
|
3UVQ
Human p38 MAP Kinase in Complex with a Dibenzosuberone Derivative
提交 2011-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
FS8 N-{5-[(7-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-5-oxo-10,11-dihydro-5H-dibenzo[a,d][7]annulen-2-yl)amino]-2-fluorophenyl}benzamide × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;100mM MES, 24 % PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.318
|
|
3UVR
Human p38 MAP Kinase in Complex with KM064
提交 2011-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
06F 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-{3-[(5-oxo-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzo[7]annulen-2-yl)amino]phenyl}urea × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100mM MES, 22% PEG 4000, 50mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.245
|
|
3ZS5
Structural basis for kinase selectivity of three clinical p38alpha inhibitors
提交 2011-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
片段:RESIDUES 2-360
|
未记录
|
SB2 4-[5-(4-FLUORO-PHENYL)-2-(4-METHANESULFINYL-PHENYL)-3H-IMIDAZOL-4-YL]-PYRIDINE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;HANGING DROP, ROOM TEMP, 20 MM HEPES PH7.1, 50 MM NACL, 10 MM DTT, 5% GLYCEROL, 0.1 G/L METHIONINE, 28% PEG 4K,0.1 M MES PH=6.5, 50 MM N-OCTYL-BETAGLUCOSIDE. CRYOPROTECTANT 28% PEG 4K, 0.1M MES PH5.9, 50 MM N-OCTYL-BETAGLUCOSIDE, 20% ETHYLENE GLYCOL.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.215
|
|
3ZSG
X-ray structure of p38alpha bound to TAK-715
提交 2011-06-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
T75 TAK-715 × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.233
|
|
3ZSH
X-ray structure of p38alpha bound to SCIO-469
提交 2011-06-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
469 2-(6-chloro-5-{[(2R,5S)-4-(4-fluorobenzyl)-2,5-dimethylpiperazin-1-yl]carbonyl}-1-methyl-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-2-oxoacetamide × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.255
|
|
3ZSI
X-ray structure of p38alpha bound to VX-745
提交 2011-06-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
52P 5-(2,6-dichlorophenyl)-2-[(2,4-difluorophenyl)sulfanyl]-6H-pyrimido[1,6-b]pyridazin-6-one × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.271
|
|
3ZYA
Human p38 MAP Kinase in Complex with 2-amino-phenylamino- dibenzosuberone
提交 2011-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
2A8 2-AMINO-PHENYLAMINO-DIBENZOSUBERONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
100 MM HEPES (PH 7.4), 20 % PEG 8000, 1 MM MGCL2
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.209
|
|
4A9Y
P38ALPHA MAP KINASE BOUND TO CMPD 8
提交 2011-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
AQZ N-(3-{[7-METHOXY-6-(2-PYRROLIDIN-1-YLETHOXY)QUINAZOLIN-4-YL]AMINO}-4-METHYLPHENYL)-2-MORPHOLIN-4-YLISONICOTINAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.250
|
|
4AA0
P38ALPHA MAP KINASE BOUND TO CMPD 2
提交 2011-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
AA0 N-[4-methyl-3-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-4-oxidanylidene-quinazolin-3-yl]phenyl]-2-morpholin-4-yl-pyridine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.255
|
|
4AA4
P38ALPHA MAP KINASE BOUND TO CMPD 22
提交 2011-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
QC0 N-[4-METHYL-3-[6-(4-METHYLPIPERAZIN-1-YL)-4-OXIDANYLIDENE-QUINAZOLIN-3-YL]PHENYL]FURAN-3-CARBOXAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.255
|
|
4AA5
P38ALPHA MAP KINASE BOUND TO CMPD 33
提交 2011-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
NQB N-CYCLOPROPYL-4-METHYL-3-[6-(4-METHYLPIPERAZIN-1-YL)-4-OXIDANYLIDENE-QUINAZOLIN-3-YL]BENZAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.260
|
|
4AAC
P38ALPHA MAP KINASE BOUND TO CMPD 29
提交 2011-12-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
AAV N-isoxazol-3-yl-4-methyl-3-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-4-oxo-quinazolin-3-yl]benzamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;6-10% PEG-MME 5000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.305
|
|
4DLI
Human p38 MAP kinase in complex with RL87
提交 2012-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.255
|
|
4DLJ
Human p38 MAP kinase in complex with RL163
提交 2012-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
6RG 2-phenyl-N~4~-(2-phenylethyl)quinazoline-4,7-diamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 20-30% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.314
|
|
4E5A
The W197A mutant of p38a MAP kinase
提交 2012-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;3%-17% (w/v) PEG 3350, 0.1M Hepes pH 6.5-7.25, 0.2M KF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.253
|
|
4E5B
Structure of p38a MAP kinase without BOG
提交 2012-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;3%-17% (w/v) PEG 3350, 0.1M Hepes pH 6.5-7.25, 0.2M KF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.279
|
|
4E6A
p38a-PIA23 complex
提交 2012-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
0O9 (2S)-2-methoxy-3-(octadecyloxy)propyl (1R,2R,3R,4S,6S)-2,3,4-trihydroxy-6-(2-methylpropoxy)cyclohexyl hydrogen (S)-phosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;13%-17% (w/v) PEG 3350, 0.1M Hepes pH 6.5-7.25, 0.2M KF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.273
|
|
4E6C
p38a-perifosine Complex
提交 2012-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
0O8 (1,1-dimethylpiperidin-1-ium-4-yl) octadecyl hydrogen phosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;13%-17% (w/v) PEG 3350, 0.1M Hepes pH 6.5-7.25, 0.2M KF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.292
|
|
4E8A
The crystal structure of p38a MAP kinase in complex with PIA24
提交 2012-03-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
0OA (1R,2S,3R,4S,6S)-6-(cyclohexylmethoxy)-2,3,4-trihydroxycyclohexyl (2R)-2-methoxy-3-(octadecyloxy)propyl hydrogen (S)-phosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;277 K;13%-17% (w/v) PEG 3350, 0.1M Hepes pH 6.5-7.25, 0.2M KF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.313
|
|
4EH2
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F1 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0OK 3-phenylquinazolin-4(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.274
|
|
4EH3
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F2 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
NAR NARINGENIN × 1
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.277
|
|
4EH4
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F3 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0OL phenyl(piperidin-1-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, pH 6.5, 19-24% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.317
|
|
4EH5
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F4 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0OM benzyl pyridine-3-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.285
|
|
4EH6
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F5 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0ON N-phenylpyridine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.277
|
|
4EH7
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F6 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0OO (3-phenoxyphenyl)methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.265
|
|
4EH8
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F7 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0OP [3-(benzyloxy)phenyl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.282
|
|
4EH9
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F11 and RL87
提交 2012-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
0OQ (1R,5S)-3-[4-(trifluoromethyl)benzoyl]-1,2,3,4,5,6-hexahydro-8H-1,5-methanopyrido[1,2-a][1,5]diazocin-8-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.280
|
|
4EHV
Human p38 MAP kinase in complex with NP-F10 and RL87
提交 2012-04-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
0SJ (1R,5S)-3-(4-chlorobenzoyl)-1,2,3,4,5,6-hexahydro-8H-1,5-methanopyrido[1,2-a][1,5]diazocin-8-one × 3
IRG N~4~-cyclopropyl-2-phenylquinazoline-4,7-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM MES, 19-24% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.252
|
|
4EWQ
Human p38 alpha MAPK in complex with a pyridazine based inhibitor
提交 2012-04-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
片段:Mitogen-activated protein kinase 14
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
MWL 3-phenyl-4-(pyridin-4-yl)-6-[4-(pyrimidin-2-yl)piperazin-1-yl]pyridazine × 2
ZN ZINC ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1
GOL GLYCEROL × 1
ACT ACETATE ION × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1< BisTris (pH 5.5), 17% PEG 10,000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.229
|
|
4F9W
Human P38alpha MAPK in Complex with a Novel and Selective Small Molecule Inhibitor
提交 2012-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
LM4 N,N-dimethyl-6-(naphthalen-2-yl)-5-(pyridin-4-yl)pyridazin-3-amine × 1
ZN ZINC ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.216
|
|
4F9Y
Human P38 alpha MAPK In Complex With a Novel and Selective Small Molecule Inhibitor
提交 2012-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
LM3 N,N-dimethyl-6-(naphthalen-1-yl)-5-(pyridin-4-yl)pyridazin-3-amine × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.200
|
|
4FA2
Human P38 alpha Mitogen-Activated Kinase In Complex With SB239063
提交 2012-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
SB0 trans-4-[4-(4-fluorophenyl)-5-(2-methoxypyrimidin-4-yl)-1H-imidazol-1-yl]cyclohexanol × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.215
|
|
4GEO
P38a MAP kinase DEF-pocket penta mutant (M194A, L195A, H228A, I229A, Y258A)
提交 2012-08-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
突变:M194A,L195A,H228A,I229A,Y258A
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;277 K;15% w/v PEG3350, 0.1 M HEPES, pH 7.25, 0.2 M potassium fluoride, 25 mM beta-octyl glucoside, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.255
|
|
4KIN
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with 5-(2-CHLOROPHENYL)-N-(5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)-2-THIOPHENECARBOXAMIDE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1M8 5-(2-chlorophenyl)-N-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]thiophene-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.217
|
|
4KIN
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with 5-(2-CHLOROPHENYL)-N-(5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)-2-THIOPHENECARBOXAMIDE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1M8 5-(2-chlorophenyl)-N-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]thiophene-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.217
|
|
4KIN
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with 5-(2-CHLOROPHENYL)-N-(5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)-2-THIOPHENECARBOXAMIDE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1M8 5-(2-chlorophenyl)-N-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]thiophene-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.217
|
|
4KIN
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with 5-(2-CHLOROPHENYL)-N-(5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)-2-THIOPHENECARBOXAMIDE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1M8 5-(2-chlorophenyl)-N-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]thiophene-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.217
|
|
4KIP
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with 2-(2-CHLOROPHENYL)-N-(5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1R9 2-(2-chlorophenyl)-N-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]-1,3-thiazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.286
|
|
4KIP
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with 2-(2-CHLOROPHENYL)-N-(5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1R9 2-(2-chlorophenyl)-N-[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]-1,3-thiazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.286
|
|
4KIQ
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with ETHYL 6-((5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)CARBAMOYL)-1H-INDOLE-1-CARBOXYLATE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1RA ethyl 6-{[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]carbamoyl}-1H-indole-1-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.228
|
|
4KIQ
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with ETHYL 6-((5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)CARBAMOYL)-1H-INDOLE-1-CARBOXYLATE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1RA ethyl 6-{[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]carbamoyl}-1H-indole-1-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.228
|
|
4KIQ
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with ETHYL 6-((5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)CARBAMOYL)-1H-INDOLE-1-CARBOXYLATE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1RA ethyl 6-{[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]carbamoyl}-1H-indole-1-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.228
|
|
4KIQ
Crystal structure of mitogen-activated protein kinase 14 (P38-H5) complex with ETHYL 6-((5-(CYCLOPROPYLCARBAMOYL)-2-METHYLPHENYL)CARBAMOYL)-1H-INDOLE-1-CARBOXYLATE
提交 2013-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
2–360(359 aa)
|
未记录
|
1RA ethyl 6-{[5-(cyclopropylcarbamoyl)-2-methylphenyl]carbamoyl}-1H-indole-1-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;1-6% (W/V) PEG-4K 50 MM MES, PH 6.0, 5MM MAGNESIUM SULFATE
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.228
|
|
4L8M
Human p38 MAP kinase in complex with a Dibenzoxepinone
提交 2013-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
片段:p38 MAP Kinase
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
F46 N-[2-fluoro-5-({9-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]-11-oxo-6,11-dihydrodibenzo[b,e]oxepin-3-yl}amino)phenyl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;100 mM MES, 22% PEG4000, 50 mM n-BOG, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.279
|
|
4R3C
Crystal structure of p38 alpha MAP kinase in complex with a novel isoform selective drug candidate
提交 2014-08-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
3GF 6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-(naphthalen-2-yl)-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.075M Ammonium Acetate, 0.1M BisTris (pH 5.5), 16% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.217
|
|
4ZTH
Structure of human p38aMAPK-arylpyridazinylpyridine fragment complex used in inhibitor discovery
提交 2015-05-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
VVT 6-chloro-3-phenyl-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1 BisTris (pH 5.5), 17% PEG 10,000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.240
|
|
5ETA
Structure of MAPK14 with bound the KIM domain of the Toxoplasma protein GRA24
提交 2015-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M MgCl2, 0.1M Tris/HCl pH 8.5, 25-28% PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.290
|
|
5ETA
Structure of MAPK14 with bound the KIM domain of the Toxoplasma protein GRA24
提交 2015-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M MgCl2, 0.1M Tris/HCl pH 8.5, 25-28% PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.290
|
|
5ETC
Structure of inactive MAPK14 with ordered Activation Loop
提交 2015-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.5 to 1.6 M (NH4)2SO4, 50mM MgCl2 and 50 mM TRIS/HCl pH 8.0
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.242
|
|
5ETF
Structure of dead kinase MAPK14 with bound the KIM domain of MKK6
提交 2015-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;25% (w/v) PEG 3350 and 0.1 mM Bis-Tris pH6.5
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.231
|
|
5ETI
Structure of dead kinase MAPK14
提交 2015-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;3.5 M Na Formate pH 7.0
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.225
|
|
5ML5
Human p38alpha MAPK in complex with imidazolyl pyridine inhibitor 11b
提交 2016-12-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
1VI 3-(2,5-dimethoxyphenyl)-~{N}-[4-[4-(4-fluorophenyl)-2-methylsulfanyl-1~{H}-imidazol-5-yl]pyridin-2-yl]propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2,
20-30 % PEG4000,
50 mM BOG
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.240
|
|
5MTX
Dibenzooxepinone inhibitor 12b in complex with p38 MAPK
提交 2017-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FJI 3-[(3-benzamido-4-fluoranyl-phenyl)amino]-~{N}-(2-morpholin-4-ylethyl)-11-oxidanylidene-6~{H}-benzo[c][1]benzoxepine-9-carboxamide × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.3
20-30 % PEG4000
25 mM BOG
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.233
|
|
5MTY
Dibenzosuberone inhibitor 8e in complex with p38 MAPK
提交 2017-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
HB9 ~{N}-[2,4-bis(fluoranyl)-5-[[14-(2-hydroxyethylcarbamoyl)-2-oxidanylidene-6-tricyclo[9.4.0.0^{3,8}]pentadeca-1(15),3(8),4,6,11,13-hexaenyl]amino]phenyl]thiophene-2-carboxamide × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.3
20-30 % PEG4000
25 mM BOG
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.271
|
|
5MZ3
P38 ALPHA MUTANT C162S IN COMPLEX WITH CMPD2 [N-(4-Methyl-3-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan-2-yl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)benzamide]
提交 2017-01-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:C162S
|
8EN ~{N}-[3-(2-acetamidoimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl)-4-methyl-phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;19% PEG8000, 20mM Mg acetate and 0.1M Hepes pH7
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.197
|
|
5N63
Crystal Structure of p38alpha in Complex with Lipid Pocket Ligand 9c
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
8OW ~{N}4-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-phenyl-quinazoline-4,7-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2,
20-30 % PEG4000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.228
|
|
5N64
Crystal Structure of p38alpha in Complex with Lipid Pocket Ligand 9g
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
8OH 2-phenyl-~{N}4-(thiophen-2-ylmethyl)quinazoline-4,7-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
50 mM BOG
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.241
|
|
5N65
Crystal Structure of p38alpha in Complex with Lipid Pocket Ligand 9h
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
8OT 2-phenyl-~{N}4-(2-thiophen-2-ylethyl)quinazoline-4,7-diamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
50 mM BOG
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.216
|
|
5N66
Crystal Structure of p38alpha in Complex with Lipid Pocket Ligand 9j
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BW1 ~{N}4-[[4-(cyclopropylmethyl)furan-2-yl]methyl]-2-phenyl-quinazoline-4,7-diamine × 1
B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
50 mM BOG
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.238
|
|
5N67
Crystal Structure of p38alpha in Complex with Lipid Pocket Ligand 9l
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
8ON 1-[4-[4-[7-azanyl-4-(2-phenylethylamino)quinazolin-2-yl]phenyl]piperazin-1-yl]ethanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
50 mM BOG
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.222
|
|
5N68
Crystal Structure of p38alpha in Complex with Lipid Pocket Ligand 9m
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
8OK 2-(4-morpholin-4-ylphenyl)-~{N}4-(2-phenylethyl)quinazoline-4,7-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
50 mM BOG
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.220
|
|
5O8U
Covalent Inhibitor 4b bound to the Lipid Pocket of p38alpha Mutant S252C
提交 2017-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:yes
|
9O5 4-[3-[7-azanyl-4-(2-phenylethylamino)quinazolin-2-yl]phenyl]butan-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.252
|
|
5O8V
Covalent Inhibitor 4a bound to the Lipid Pocket of p38alpha Mutant S251C
提交 2017-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
9O2 ~{N}-[3-[7-azanyl-4-(2-phenylethylamino)quinazolin-2-yl]phenyl]propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2
20-30 % PEG4000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.269
|
|
5OMG
p38alpha in complex with pyrazolobenzothiazine inhibitor COXP4M12
提交 2017-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
9Y8 3-(4-fluorophenyl)-4-methyl-1~{H}-pyrazolo[4,3-c][1,2]benzothiazine 5,5-dioxide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2,
20-30 % PEG4000,
50 mM BOG
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.245
|
|
5OMH
p38alpha in complex with pyrazolobenzothiazine inhibitor COXH11
提交 2017-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
9Y5 1-(3-chlorophenyl)-3-methyl-4~{H}-pyrazolo[4,3-c][1,2]benzothiazine 5,5-dioxide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;100 mM MES pH 5.6-6.2,
20-30 % PEG4000,
50 mM BOG
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.277
|
|
5TBE
Human p38alpha MAP Kinase in Complex with Dibenzosuberone Compound 2
提交 2016-09-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
78L ~{N}-[2,4-bis(fluoranyl)-5-[[9-(2-morpholin-4-ylethylcarbamoyl)-11-oxidanylidene-5,6-dihydrodibenzo[1,2-~{d}:1',2'-~{f}][7]annulen-3-yl]amino]phenyl]thiophene-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES, 21-29 % PEG4000, 25 mM BOG
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.254
|
|
5TCO
Human p38 MAP Kinase in Complex with Dibenzosuberone Compound 1
提交 2016-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
79Q 3-[(3-benzamido-4-fluoranyl-phenyl)amino]-~{N}-(2-morpholin-4-ylethyl)-11-oxidanylidene-5,6-dihydrodibenzo[1,2-~{d}:1',2'-~{f}][7]annulene-9-carboxamide × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;100 mM MES, 22% PEG4000, 50 mM n-BOG
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.270
|
|
5WJJ
Structure-based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Imidazo[1,2-b]pyridazine-based p38 MAP Kinase Inhibitors
提交 2017-07-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
AQY N-{4-[2-(4-fluoro-3-methylphenyl)imidazo[1,2-b]pyridazin-3-yl]pyridin-2-yl}-2-methyl-1-oxo-1lambda~5~-pyridine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;293 K;18.% PEG 3350, 0.06M MES, 0.04M MES_Na
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.237
|
|
5XYX
The structure of p38 alpha in complex with a triazol inhibitor
提交 2017-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
FTZ N-(2-chloro-6-fluorobenzyl)-5-(furan-2-yl)-2H-1,2,4-triazol-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Sodium citrate, Ammonium sulfate, HEPES
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.260
|
|
5XYY
The structure of p38 alpha in complex with a triazol inhibitor
提交 2017-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
P0F 3-(5-{[(2-chloro-6-fluorophenyl)methyl]amino}-4H-1,2,4-triazol-3-yl)phenol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;Sodium citrate, Ammonium sulfate, HEPES
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.201
|
|
6ANL
Structure-based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Imidazo[1,2-b]pyridazine-based p38 MAP Kinase Inhibitors
提交 2017-08-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:C119S, C162S
|
T75 TAK-715 × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;293 K;15.% PEG 8000, 0.08M NP_HEPES, 0.02M NP_HEPES_Na
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.263
|
|
6HWT
Crystal structure of p38alpha in complex with a reduced photoswitchable 2-Azothiazol-based Inhibitor (compound 31)
提交 2018-10-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
GXH 3-(2,5-dimethoxyphenyl)-~{N}-[4-[4-(4-fluorophenyl)-2-(2-phenylhydrazinyl)-1,3-thiazol-5-yl]pyridin-2-yl]propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES pH 5.6-6.2, 20-30 % PEG4000, 40mM BOG
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.234
|
|
6HWU
Crystal structure of p38alpha in complex with a photoswitchable 2-Azothiazol-based Inhibitor (compound 2)
提交 2018-10-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
GE5 3-(2,5-dimethoxyphenyl)-~{N}-[4-[4-(4-fluorophenyl)-2-[(~{E})-phenyldiazenyl]-1,3-thiazol-5-yl]pyridin-2-yl]propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES pH 5.6-6.2, 20-30 % PEG4000, 40mM BOG
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.247
|
|
6HWV
Crystal structure of p38alpha in complex with a photoswitchable 2-Azoimidazol-based Inhibitor (compound 3)
提交 2018-10-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3
GEW 3-(2,5-dimethoxyphenyl)-~{N}-[4-[5-(4-fluorophenyl)-2-[(~{E})-(4-fluorophenyl)diazenyl]-3-methyl-imidazol-4-yl]pyridin-2-yl]propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES pH 5.6-6.2, 20-30 % PEG4000, 40mM BOG
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.197
|
|
6M95
Structure-based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Imidazo[4,5-b]pyridine-2-one based p38 MAP Kinase Inhibitors by scaffold hopping: compound 1
提交 2018-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
J8S (4-benzylpiperidin-1-yl)[2-methoxy-4-(methylsulfanyl)phenyl]methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;277.15 K;16.% PEG 3350, 0.06M MES, 0.04M MES_Na
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.208
|
|
6M9L
Structure-based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Imidazo[4,5-b]pyridine-2-one based p38 MAP Kinase Inhibitors by scaffold hopping - compound 10
提交 2018-08-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
J9G 3-benzyl-6-[(2,4-difluorophenyl)amino]-1,3-dihydro-2H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;277.2 K;24.% PEG MME 5000, 0.1M MES_Na
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.270
|
|
6OHD
P38 in complex with T-3220137
提交 2019-04-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
MKP 3-(3-tert-butyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-6-yl)-4-methyl-N-(1,2-oxazol-3-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20.% PEG 3350, 0.1M MES_Na
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.253
|
|
6QDZ
P38 alpha complex with AR117045
提交 2019-01-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
HYK 1-[5-~{tert}-butyl-2-(4-methylphenyl)pyrazol-3-yl]-3-[(1~{S},4~{S})-4-[(3-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl)oxy]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 3000, Calcium Chloride, CHES
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.246
|
|
6QE1
P38 alpha complex with AR117046
提交 2019-01-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
I46 2-fluoro-4-[4-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-3-yl]pyridine × 1
HYW 1-[5-~{tert}-butyl-2-(4-methylphenyl)pyrazol-3-yl]-3-[(1~{S},4~{R})-4-[(3-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl)oxy]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;PEG 3000, Calcium Chloride, CHES
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.222
|
|
6RFO
ERK2 MAP kinase with the activation loop of p38alpha
提交 2019-04-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
162–182(21 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.8 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-tris pH 6.8 or 6.5, 2% (w/v) PEG 550
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.219
|
|
6SFI
Crystal structure of p38 alpha in complex with compound 75 (MCP33)
提交 2019-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
LB5 ~{N}-[(2~{S})-1-azanyl-4-cyclohexyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-2-[[[1-(2-methylphenyl)pyrazol-4-yl]carbonylamino]methyl]-1,3-thiazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;277.15 K;25% MMW PEG smears, 0.1M MES pH 6.2
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.203
|
|
6SFJ
Crystal structure of p38 alpha in complex with compound 77 (MCP41)
提交 2019-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
LBB ~{N}-[5-[[(2~{S})-1-azanyl-4-cyclohexyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamoyl]-2-methyl-phenyl]-1-(2-methylphenyl)pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;277.15 K;17.5% MMW PEG smears, 0.1M MES pH 6.2
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.227
|
|
6SFK
Crystal structure of p38 alpha in complex with compound 81 (MCP42)
提交 2019-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
LB8 ~{N}-[5-[[(2~{S})-1-azanyl-4-cyclohexyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamoyl]-2-methyl-phenyl]-1-phenyl-5-(trifluoromethyl)pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;277.15 K;17.5% MMW PEG smears, 0.1M MES pH 6.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.218
|
|
6SFO
MAPK14 with bound inhibitor SR-318
提交 2019-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
LBE 5-azanyl-~{N}-[[4-(3-cyclohexylpropylcarbamoyl)phenyl]methyl]-1-phenyl-pyrazole-4-carboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;278 K;5% HMW PEG smears, 0.1M MES
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.236
|
|
6TCA
Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor
提交 2019-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO.
1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
|
分辨率 3.70 Å
R-free 0.297
|
|
6TCA
Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor
提交 2019-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO.
1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
|
分辨率 3.70 Å
R-free 0.297
|
|
6TCA
Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor
提交 2019-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO.
1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
|
分辨率 3.70 Å
R-free 0.297
|
|
6TCA
Phosphorylated p38 and MAPKAPK2 complex with inhibitor
提交 2019-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO.
1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir
|
分辨率 3.70 Å
R-free 0.297
|
|
6ZQS
Crystal structure of double-phosphorylated p38alpha with ATF2(83-102)
提交 2020-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
3FF 2-[(2,4-difluorophenyl)amino]-7-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-10,11-dihydro-5H-dibenzo[a,d][7]annulen-5-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;14% PEG 3350, 0.1 M cacodylate ph 6.5
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.223
|
|
6ZWP
p38a bound with SR348
提交 2020-07-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
OE8 5-azanyl-~{N}-[[4-[[(2~{S})-4-cyclohexyl-1-[(4-fluorophenyl)amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamoyl]phenyl]methyl]-1-phenyl-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;278 K;15% MMW PegSmear
0.1 M MES
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.251
|
|
8A8M
Structure of the MAPK p38alpha in complex with its activating MAP2K MKK6
提交 2022-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
突变:T180V
|
AP2 PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 3.5 seconds
|
分辨率 4.00 Å
|
|
8VXE
Structure of p38 alpha (Mitogen-activated protein kinase 14) complexed with inhibitor 6
提交 2024-02-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
未记录
|
A1AD9 (4M)-4-[3-(4-fluorophenyl)-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;277 K;10% PEG6000, 0.1 MES/NaOH pH 5.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.289
|
|
8X3M
Crystal structure of p38alpha with an allosteric inhibitor 2
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
B8Z ~{N}-(5,6-dimethoxy-1,3-benzothiazol-2-yl)-2-[(4-fluoranylphenoxy)methyl]-1,3-thiazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M Ammonium acetate, 0.1M HEPES pH7.5, 15% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.226
|
|
8YD9
Crystal structure of p38alpha with an allosteric inhibitor 3
提交 2024-02-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
6GI 13-[4-({Imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl}methoxy)phenyl]-4,8-dioxa-12,14,16,18-tetraazatetracyclo[9.7.0.0^{3,9}.0^{12,17}]octadeca-1(11),2,9,15,17-pentaen-15-amine × 1
GOL GLYCEROL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;277 K;anmonium acetate, HEPES, PEG 3350
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.205
|
|
9CJ1
Dual phosphorylated human p38 alpha bound to nilotinib
提交 2024-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
NIL Nilotinib × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;8mg/mL phosphorylated p38 alpha incubated with 250uM nilotinib with a final DMSO concentration of 5% set with a 1:1 ratio with 100 mM BIS-TRIS pH 6.0 and 23% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.232
|
|
9CJ2
Dual phosphorylated human p38 alpha
提交 2024-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;8mg/mL phosphorylated p38 alpha set at a 1:1 ratio with 100 mM MES pH 6.5, 200 mM ammonium sulfate, 4% 1,3-Propanediol, and 30% PEG8000
|
分辨率 2.83 Å
R-free 0.308
|
|
9CJ2
Dual phosphorylated human p38 alpha
提交 2024-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;8mg/mL phosphorylated p38 alpha set at a 1:1 ratio with 100 mM MES pH 6.5, 200 mM ammonium sulfate, 4% 1,3-Propanediol, and 30% PEG8000
|
分辨率 2.83 Å
R-free 0.308
|
|
9CJ3
Dual phosphorylated human p38 alpha bound to pexmetinib
提交 2024-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
GOL GLYCEROL × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
PDO 1,3-PROPANDIOL × 1
A1AWV Pexmetinib × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;8mg/mL phosphorylated p38 alpha incubated with 250uM pexmetinib with a final DMSO concentration of 5% set at a 1:1 ratio with 100 mM MES pH 6.5, 200 mM ammonium sulfate, 4% 1,3-Propanediol, and 30% PEG8000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.189
|
|
9CJ4
Dual phosphorylated human p38 alpha bound to BIRB796
提交 2024-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1
SO4 SULFATE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;8mg/mL phosphorylated p38 alpha was incubated with 250uM BIRB796 with a final DMSO concentration of 5% and set at a 1:1 ratio with 100 mM BIS-TRIS pH 5.5, 200 mM ammonium sulfate, and 25% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.199
|
|
9CJ5
Unphosphorylated human p38 alpha bound to pexmetinib
提交 2024-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
A1AWV Pexmetinib × 1
PDO 1,3-PROPANDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;8mg/mL p38 alpha incubated with 250uM pexmetinib with a final DMSO concentration of 5% set at a 1:1 ratio with 100 mM MES pH 6.0, 200 mM ammonium sulfate, 4% 1,3-Propanediol, and 20% PEG6000
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.276
|
|
9D6P
Human p38alpha MAP Kinase in complex with (Naphthalen-1-yl)pyridazine derivative GDK767-7
提交 2024-08-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–353(349 aa)
|
未记录
|
A1IKD N',N'-dimethyl-N-(6-naphthalen-1-yl-5-pyridin-4-yl-pyridazin-3-yl)ethane-1,2-diamine × 1
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1< BisTris (pH 5.5), 20% PEG 10,000
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.244
|
|
9D75
Human p38alpha MAP Kinase in complex with 1-(Cyclohexylmethyl)-1H-indazole derivative; OSF346
提交 2024-08-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–353(349 aa)
|
未记录
|
A1A2L 1-(cyclohexylmethyl)-5-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1H-indazole-6-carboxamide × 1
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1M BisTris (pH 5.5), 20% PEG 10,000
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.236
|
|
9D7N
Human p38alpha MAP Kinase in complex with 1-Isobutyl-1H-indazole derivative; OSF267
提交 2024-08-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5–353(349 aa)
|
未记录
|
A1A2O 5-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-(2-methylpropyl)-1H-indazole-6-carboxamide × 1
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1M BisTris (pH 5.5), 20% PEG 10,000
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.257
|
|
9D8G
Human p38alpha MAP Kinase in complex with (Naphthalen-2-yl)pyridazine derivative; KES29
提交 2024-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
A1IKC N',N'-dimethyl-N-(6-naphthalen-2-yl-5-pyridin-4-yl-pyridazin-3-yl)ethane-1,2-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.1M Ammonium Acetate, 0.1M BisTris (pH 5.5), 20% PEG 10,000
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.249
|
|
9MHB
Crystal Structure of Human P38 alpha MAPK In Complex with MW01-14-064SRM
提交 2024-12-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
A1BLA (5P)-N,N-dimethyl-5-(naphthalen-1-yl)-6-(pyridin-4-yl)pyrazin-2-amine × 1
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
ACT ACETATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;292 K;Protein: 20.0 mg/ml, 0.15M Sodium chloride, 0.02M Tris-HCl (pH 8.3), 1mM TCEP;
Screen: 0.15M Ammomium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 16% (w/v) PEG1000;
Soak: 3 hrs, 5mM ligand in screen solution;
Cryo: 10% Glycerol in screen solution.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.202
|
|
9NYT
Crystal structure of Human p38 alpha MAPK in Complex with MW01-32-154JS
提交 2025-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
A1B7S (3P)-3-(naphthalen-2-yl)-6-(piperazin-1-yl)-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
F50 ETHANEPEROXOIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;20% PEG 10000
0.1M Ammonium Acetate
0.1M Bis-Tris (pH 5.5)
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.240
|
|
9O4L
Crystal structure of Human p38 alpha MAPK in Complex with MW01-8 -066WH
提交 2025-04-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
A1B8B 6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-phenyl-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;295 K;0.075M Ammonium Acetate, 0.1M BisTris (pH 5.5), 16% PEG 10000
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.241
|
|
9Q5B
Crystal Structure of Human P38 alpha MAPK in Complex with MW01-21-114SRM
提交 2025-08-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–360(359 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
A1CRZ (3P)-6-chloro-3-(naphthalen-2-yl)-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;Protein: 9.2 mg/ml, 0.15M Sodium chloride, 0.02M Tris-HCl (pH 8.3), 1mM TCEP;
Screen: 0.1M Ammomium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 17% (w/v) PEG10000, 2mM 4FPP (4-[3-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyridine);
Soak: 24 hrs, 5mM ligand (MW01-25-195SRM) in screen solution;
Cryo: 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 20% (w/v) PEG10000
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.236
|
|
9R25
Sorafenib in complex with p38alpha (MAPK14)
提交 2025-04-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BAX 4-{4-[({[4-CHLORO-3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}CARBONYL)AMINO]PHENOXY}-N-METHYLPYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 1
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES, 21-29 % PEG4000, 25 mM BOG
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.210
|
|
9R27
Regorafenib in complex with p38alpha (MAPK14)
提交 2025-04-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1
A1JCR 4-[4-[[4-chloranyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoylamino]-3-fluoranyl-phenoxy]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES pH 5.6-6.3 20-30 % PEG4000 25 mM BOG
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.257
|
|
9Y8B
Human p38 ALPHA MAPK:MW164 pyridazine inhibitor complex
提交 2025-09-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 2
A1CTD (3P)-6-(1-methylpiperidin-4-yl)-3-(naphthalen-2-yl)-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;292 K;Protein: 20.0 mg/ml, 0.15M Sodium chloride, 0.02M Tris-HCl (pH 8.3), 1mM TCEP; Screen: 0.15M Ammomium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 16% (w/v) PEG1000; Soak: 24 hrs, 5mM ligand in screen solution; Cryo: 10% Glycerol in screen solution.
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.221
|
|
9YLH
Human p38 ALPHA MAPK:MW01-8-105SRM N,N-Dimethyl-6-phenyl-5-(4-pyridinyl)-3-pyridazinamine inhibitor complex
提交 2025-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
ZN ZINC ION × 1
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
A1CX9 N,N-dimethyl-6-phenyl-5-(pyridin-4-yl)pyridazin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Ammomium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 17% (w/v) PEG10000, 2mM 4FPP (4-[3-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyridine);
Soak: 24 hrs, 5mM ligand (MW01-8-105SRM) in screen solution;
Cryo: 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 25% (w/v) PEG10000
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.239
|
|
9YTY
Human p38 ALPHA MAPK:MW01-7-081aSRM inhibitor complex
提交 2025-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–360(360 aa)
|
未记录
|
GG5 4-[3-(4-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-4-YL]PYRIDINE × 1
A1BB6 3-chloro-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-4-(pyridin-4-yl)pyridazine × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M Ammomium acetate, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 17% (w/v) PEG10000, 2mM 4FPP (4-[3-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazol-4-yl]pyridine);
Soak: 24 hrs, 5mM ligand (MW01-7-081aSRM in screen solution;
Cryo: 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 25% (w/v) PEG10000
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.254
|