6r1d

Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7d, co-crystallized

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 62.5 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cereblon isoform 4

Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–124	未记录	ZN ZINC ION × 1 JP5 (phenylmethyl) ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；15 % PEG 6K, 5 % Glycerol	分辨率 1.10 Å R-free 0.150
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–124	未记录	ZN ZINC ION × 1 JP5 (phenylmethyl) ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；15 % PEG 6K, 5 % Glycerol	分辨率 1.10 Å R-free 0.150

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6R1D	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4V2Y Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE PH 5, 15%(W/V) PEG 4000	分辨率 1.40 Å R-free 0.195
4V2Y Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE PH 5, 15%(W/V) PEG 4000	分辨率 1.40 Å R-free 0.195
4V2Y Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE PH 5, 15%(W/V) PEG 4000	分辨率 1.40 Å R-free 0.195
4V2Z Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Pomalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 Y70 S-Pomalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.45 Å R-free 0.203
4V2Z Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Pomalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 Y70 S-Pomalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.45 Å R-free 0.203
4V2Z Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Pomalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 Y70 S-Pomalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.45 Å R-free 0.203
4V30 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Lenalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 LVY S-Lenalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 15 %(W/V) PEG 6000, 5 %(W/V) GLYCEROL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
4V30 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Lenalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 LVY S-Lenalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 15 %(W/V) PEG 6000, 5 %(W/V) GLYCEROL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
4V30 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Lenalidomide 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 LVY S-Lenalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 15 %(W/V) PEG 6000, 5 %(W/V) GLYCEROL	分辨率 1.85 Å R-free 0.239
4V31 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Deoxyuridine 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 DUR 2'-DEOXYURIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M CITRIC ACID PH 3.5, 25 %(W/V) PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4V31 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Deoxyuridine 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 DUR 2'-DEOXYURIDINE × 1 FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M CITRIC ACID PH 3.5, 25 %(W/V) PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4V31 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Deoxyuridine 提交 2014-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 DUR 2'-DEOXYURIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M CITRIC ACID PH 3.5, 25 %(W/V) PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4V32 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Y101F mutant 提交 2014-10-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	突变：YES	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M PHOSPHATE-CITRATE PH 4.2, 20 %(W/V) PEG 8000	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4V32 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Y101F mutant 提交 2014-10-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	突变：YES	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M PHOSPHATE-CITRATE PH 4.2, 20 %(W/V) PEG 8000	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4V32 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Y101F mutant 提交 2014-10-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	突变：YES	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M PHOSPHATE-CITRATE PH 4.2, 20 %(W/V) PEG 8000	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
5AMH Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, trigonal crystal form 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 7 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6, 2.2 M CALCIUM CHLORIDE	分辨率 1.20 Å R-free 0.157
5AMI Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Wash I structure 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6, 20 %(W/V) PEG 6000	分辨率 1.75 Å R-free 0.209
5AMI Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Wash I structure 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6, 20 %(W/V) PEG 6000	分辨率 1.75 Å R-free 0.209
5AMI Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Wash I structure 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.6, 20 %(W/V) PEG 6000	分辨率 1.75 Å R-free 0.209
5AMJ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Wash II structure 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM TRI-SODIUM CITRATE PH 5.6, 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE	分辨率 1.75 Å R-free 0.191
5AMJ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Wash II structure 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM TRI-SODIUM CITRATE PH 5.6, 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE	分辨率 1.75 Å R-free 0.191
5AMJ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thalidomide, Wash II structure 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM TRI-SODIUM CITRATE PH 5.6, 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE	分辨率 1.75 Å R-free 0.191
5AMK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in multiple conformations, hexagonal crystal form 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 64 MM SODIUM CITRATE PH 7.0, 100 MM HEPES PH 7.0, 10 %(W/V) PEG 5000 MME	分辨率 2.90 Å R-free 0.217
5AMK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in multiple conformations, hexagonal crystal form 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 64 MM SODIUM CITRATE PH 7.0, 100 MM HEPES PH 7.0, 10 %(W/V) PEG 5000 MME	分辨率 2.90 Å R-free 0.217
5AMK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in multiple conformations, hexagonal crystal form 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 64 MM SODIUM CITRATE PH 7.0, 100 MM HEPES PH 7.0, 10 %(W/V) PEG 5000 MME	分辨率 2.90 Å R-free 0.217
5AMK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in multiple conformations, hexagonal crystal form 提交 2015-03-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 64 MM SODIUM CITRATE PH 7.0, 100 MM HEPES PH 7.0, 10 %(W/V) PEG 5000 MME	分辨率 2.90 Å R-free 0.217
5OH1 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Aminoglutethimide 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate PH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.70 Å R-free 0.210
5OH1 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Aminoglutethimide 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate PH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.70 Å R-free 0.210
5OH1 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Aminoglutethimide 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UQ (3~{R})-3-(4-aminophenyl)-3-ethyl-piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate PH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.70 Å R-free 0.210
5OH2 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Pyrrolidin-2-one (Butyrolactam) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BAQ pyrrolidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.90 Å R-free 0.225
5OH2 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Pyrrolidin-2-one (Butyrolactam) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BAQ pyrrolidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.90 Å R-free 0.225
5OH2 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Pyrrolidin-2-one (Butyrolactam) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BAQ pyrrolidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.90 Å R-free 0.225
5OH3 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Ethosuximide 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9V2 (3~{S})-3-ethyl-3-methyl-pyrrolidine-2,5-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
5OH3 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Ethosuximide 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9V2 (3~{S})-3-ethyl-3-methyl-pyrrolidine-2,5-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
5OH3 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Ethosuximide 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
5OH4 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Piperidine-2,6-dione (Glutarimide) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UZ piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
5OH4 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Piperidine-2,6-dione (Glutarimide) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UZ piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
5OH4 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Piperidine-2,6-dione (Glutarimide) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UZ piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
5OH7 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Imidazolidine-2,4-dione (Hydantoin) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 HYN imidazolidine-2,4-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.85 Å R-free 0.203
5OH7 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Imidazolidine-2,4-dione (Hydantoin) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 HYN imidazolidine-2,4-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.85 Å R-free 0.203
5OH7 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Imidazolidine-2,4-dione (Hydantoin) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.85 Å R-free 0.203
5OH8 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Rolipram 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ROL ROLIPRAM × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5OH8 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Rolipram 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ROL ROLIPRAM × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5OH8 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Rolipram 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
5OH9 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thiazolidine-2,4-dione 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 OD3 1,3-thiazolidine-2,4-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.65 Å R-free 0.210
5OH9 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thiazolidine-2,4-dione 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 OD3 1,3-thiazolidine-2,4-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.65 Å R-free 0.210
5OH9 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Thiazolidine-2,4-dione 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 OD3 1,3-thiazolidine-2,4-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.65 Å R-free 0.210
5OHA Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with 2-Thiohydantoin 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UW 2-sulfanylideneimidazol-4-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.55 Å R-free 0.197
5OHA Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with 2-Thiohydantoin 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UW 2-sulfanylideneimidazol-4-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.55 Å R-free 0.197
5OHA Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with 2-Thiohydantoin 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9UW 2-sulfanylideneimidazol-4-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.55 Å R-free 0.197
5OHB Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Piperidin-2-one (Valerolactam) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 V1L piperidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.70 Å R-free 0.212
5OHB Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Piperidin-2-one (Valerolactam) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 V1L piperidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.70 Å R-free 0.212
5OHB Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Piperidin-2-one (Valerolactam) 提交 2017-07-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 V1L piperidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 15 %(W/V) PEG 20000	分辨率 1.70 Å R-free 0.212
6R0Q Mutant cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with thalidomide metabolite alpha-(o-carboxybenzamido)glutarimide 提交 2019-03-13	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–124（124 aa）	突变：A52H, M54Y, F56H, R68N, A72R, I87V, L89Q	ZN ZINC ION × 1 JNW 2-[[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamoyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Ammonium acetate	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
6R0Q Mutant cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with thalidomide metabolite alpha-(o-carboxybenzamido)glutarimide 提交 2019-03-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	突变：A52H, M54Y, F56H, R68N, A72R, I87V, L89Q	ZN ZINC ION × 1 JNW 2-[[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamoyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Ammonium acetate	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
6R0Q Mutant cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with thalidomide metabolite alpha-(o-carboxybenzamido)glutarimide 提交 2019-03-13	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–124（124 aa）	突变：A52H, M54Y, F56H, R68N, A72R, I87V, L89Q	ZN ZINC ION × 1 JNW 2-[[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamoyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Ammonium acetate	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
6R0Q Mutant cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with thalidomide metabolite alpha-(o-carboxybenzamido)glutarimide 提交 2019-03-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–124（124 aa）	突变：A52H, M54Y, F56H, R68N, A72R, I87V, L89Q	ZN ZINC ION × 1 JNW 2-[[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamoyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Ammonium acetate	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
6R0S Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 4a and hydrolysis product 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.55 Å R-free 0.213
6R0S Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 4a and hydrolysis product 提交 2019-03-13	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JOE 2-[[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamoyl]-6-nitro-benzoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.55 Å R-free 0.213
6R0S Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 4a and hydrolysis product 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JOH 2-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-4-nitro-isoindole-1,3-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.55 Å R-free 0.213
6R0U Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 5a and hydrolysis product 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
6R0U Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 5a and hydrolysis product 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 JO8 3-azanyl-2-[[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamoyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
6R0U Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 5a and hydrolysis product 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JO5 4-azanyl-2-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]isoindole-1,3-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
6R0V Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with hydrolysis product of compound 4b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JO2 2-[[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamoyl]-4-nitro-benzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.60 Å R-free 0.219
6R0V Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with hydrolysis product of compound 4b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JO2 2-[[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamoyl]-4-nitro-benzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.60 Å R-free 0.219
6R0V Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with hydrolysis product of compound 4b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JO2 2-[[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamoyl]-4-nitro-benzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.60 Å R-free 0.219
6R11 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 5b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JOB 5-azanyl-2-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]isoindole-1,3-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium Phosphate	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6R11 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 5b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JOB 5-azanyl-2-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]isoindole-1,3-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium Phosphate	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6R11 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 5b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium Phosphate	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6R12 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.74 Å R-free 0.234
6R12 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7b 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JOT ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-2-phenyl-ethanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.74 Å R-free 0.234
6R12 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7b 提交 2019-03-13	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.74 Å R-free 0.234
6R13 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7f 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.65 Å R-free 0.224
6R13 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7f 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JOK ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-3-phenyl-propanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.65 Å R-free 0.224
6R13 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7f 提交 2019-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.65 Å R-free 0.224
6R18 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 11a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.35 Å R-free 0.197
6R18 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 11a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JOQ [4-(aminomethyl)phenyl]methyl ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamate × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.35 Å R-free 0.197
6R18 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 11a 提交 2019-03-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.35 Å R-free 0.197
6R19 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
6R19 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JON [(2~{S})-pyrrolidin-2-yl]methyl ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
6R19 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
6R1A Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20b 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 m Ammonium phosphate	分辨率 1.54 Å R-free 0.208
6R1A Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20b 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 m Ammonium phosphate	分辨率 1.54 Å R-free 0.208
6R1A Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20b 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JP8 [(2~{R})-pyrrolidin-2-yl]methyl ~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 m Ammonium phosphate	分辨率 1.54 Å R-free 0.208
6R1C Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 12a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.50 Å R-free 0.215
6R1C Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 12a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JOW 4-[[4-[[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamoyloxymethyl]phenyl]methylamino]-4-oxidanylidene-butanoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.50 Å R-free 0.215
6R1C Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 12a 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.50 Å R-free 0.215
6R1K Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7c 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JPB ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-2,4,6-tris(chloranyl)benzamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.94 Å R-free 0.212
6R1K Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7c 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JPB ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-2,4,6-tris(chloranyl)benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.94 Å R-free 0.212
6R1K Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7c 提交 2019-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JPB ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-2,4,6-tris(chloranyl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.94 Å R-free 0.212
6R1W Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 16b 提交 2019-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium Phosphate	分辨率 1.35 Å R-free 0.198
6R1W Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 16b 提交 2019-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JPW (4-azanylcyclohexyl)methyl ~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium Phosphate	分辨率 1.35 Å R-free 0.198
6R1W Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 16b 提交 2019-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 JPW (4-azanylcyclohexyl)methyl ~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium Phosphate	分辨率 1.35 Å R-free 0.198
6R1X Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7a 提交 2019-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JPQ ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-3-methyl-but-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
6R1X Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7a 提交 2019-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 JPQ ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]-3-methyl-but-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
6R1X Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7a 提交 2019-03-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.4 M Ammonium phosphate	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
7PJK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with a benzotriazole analog of thalidomide 提交 2021-08-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 7SE (3S)-3-(benzotriazol-2-yl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M (NH4)2HPO4	分辨率 1.99 Å R-free 0.254
7PJK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with a benzotriazole analog of thalidomide 提交 2021-08-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 7SE (3S)-3-(benzotriazol-2-yl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M (NH4)2HPO4	分辨率 1.99 Å R-free 0.254
7PJK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with a benzotriazole analog of thalidomide 提交 2021-08-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M (NH4)2HPO4	分辨率 1.99 Å R-free 0.254
7PS9 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Iberdomide (CC-220) 提交 2021-09-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 8W7 (3S)-3-[4-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.80 Å R-free 0.246
7PS9 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Iberdomide (CC-220) 提交 2021-09-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 8W7 (3S)-3-[4-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.80 Å R-free 0.246
7PS9 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Iberdomide (CC-220) 提交 2021-09-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 8W7 (3S)-3-[4-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1-oxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.80 Å R-free 0.246
7PSO Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Avadomide (CC-122) 提交 2021-09-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.52 Å R-free 0.217
7PSO Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Avadomide (CC-122) 提交 2021-09-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.52 Å R-free 0.217
7PSO Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Avadomide (CC-122) 提交 2021-09-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 835 (3S)-3-(5-azanyl-2-methyl-4-oxidanylidene-quinazolin-3-yl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.52 Å R-free 0.217
7SHH Bacterial cereblon homologue in complex with (R)-3-(4-methoxyphenyl)piperidine-2,6-dione 提交 2021-10-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9FT (3R)-3-(4-methoxyphenyl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0. 1M sodium acetate and 16% PEG 6000	分辨率 1.90 Å R-free 0.216
7SHH Bacterial cereblon homologue in complex with (R)-3-(4-methoxyphenyl)piperidine-2,6-dione 提交 2021-10-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9FT (3R)-3-(4-methoxyphenyl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0. 1M sodium acetate and 16% PEG 6000	分辨率 1.90 Å R-free 0.216
7SHH Bacterial cereblon homologue in complex with (R)-3-(4-methoxyphenyl)piperidine-2,6-dione 提交 2021-10-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 9FT (3R)-3-(4-methoxyphenyl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0. 1M sodium acetate and 16% PEG 6000	分辨率 1.90 Å R-free 0.216
8AOP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 14r 提交 2022-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MW6 (3S)-3-[(3-aminophenyl)sulfanylmethyl]piperidine-2,6-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.4M Ammonium Phosphate	分辨率 1.94 Å R-free 0.227
8AOP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 14r 提交 2022-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MW6 (3S)-3-[(3-aminophenyl)sulfanylmethyl]piperidine-2,6-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.4M Ammonium Phosphate	分辨率 1.94 Å R-free 0.227
8AOP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 14r 提交 2022-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.4M Ammonium Phosphate	分辨率 1.94 Å R-free 0.227
8AOQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20a 提交 2022-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 N8F (3~{S})-3-(phenylsulfonylmethyl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.4M Ammonium Phosphate	分辨率 2.09 Å R-free 0.233
8AOQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20a 提交 2022-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 N8F (3~{S})-3-(phenylsulfonylmethyl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.4M Ammonium Phosphate	分辨率 2.09 Å R-free 0.233
8AOQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 20a 提交 2022-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.4M Ammonium Phosphate	分辨率 2.09 Å R-free 0.233
8BC6 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex an aspartimide degron peptide 提交 2022-10-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.223
8BC6 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex an aspartimide degron peptide 提交 2022-10-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.223
8BC6 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex an aspartimide degron peptide 提交 2022-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.223
8BC7 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex an aminoglutarimide degron peptide 提交 2022-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.211
8BC7 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex an aminoglutarimide degron peptide 提交 2022-10-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.211
8BC7 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex an aminoglutarimide degron peptide 提交 2022-10-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EF2 S-Thalidomide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.211
8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.71 Å R-free 0.210
8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.71 Å R-free 0.210
8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.71 Å R-free 0.210
8OU3 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 8d 提交 2023-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–124（124 aa）链 B 1–124（124 aa）链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 EF2 S-Thalidomide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 3 W1T 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-fluoranyl-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.47 Å R-free 0.238
8OU4 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11a 提交 2023-04-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 W2F 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-chloranyl-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 2.25 Å R-free 0.269
8OU4 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11a 提交 2023-04-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 W2F 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-chloranyl-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 2.25 Å R-free 0.269
8OU4 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11a 提交 2023-04-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 2.25 Å R-free 0.269
8OU5 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11b 提交 2023-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–124（124 aa）链 B 1–124（124 aa）链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 W1X 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-(trifluoromethyl)benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 2.30 Å R-free 0.253
8OU6 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11c 提交 2023-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 20–123（104 aa）链 B 20–123（104 aa）链 C 20–123（104 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 W26 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-methyl-benzamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.84 Å R-free 0.225
8OU7 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11d 提交 2023-04-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 W1F 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
8OU7 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11d 提交 2023-04-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 W1F 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
8OU7 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11d 提交 2023-04-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 W1F 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-methoxy-benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
8OU9 Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11e 提交 2023-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 18–123（106 aa）链 B 18–123（106 aa）链 C 18–123（106 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 W1B 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-oxidanyl-benzamide × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.75 Å R-free 0.224
8OUA Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11f 提交 2023-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 19–123（105 aa）链 B 19–123（105 aa）链 C 18–123（106 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 W0Z 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2,5-bis(fluoranyl)-3-methoxy-benzamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；0.5 M (NH4)H2PO4	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
8RDP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8a 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ7 (5~{S})-3-(2-chlorophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.76 Å R-free 0.230
8RDP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8a 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ7 (5~{S})-3-(2-chlorophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.76 Å R-free 0.230
8RDP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8a 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ7 (5~{S})-3-(2-chlorophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.76 Å R-free 0.230
8RDQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8b 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 YQO (5S)-3-(2,4-dichlorophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 2.03 Å R-free 0.249
8RDQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8b 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 YQO (5S)-3-(2,4-dichlorophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 2.03 Å R-free 0.249
8RDQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8b 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 2.03 Å R-free 0.249
8RDR Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8g 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ3 (5~{S})-3-(2-nitrophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.58 Å R-free 0.214
8RDR Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8g 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ3 (5~{S})-3-(2-nitrophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.58 Å R-free 0.214
8RDR Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8g 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ3 (5~{S})-3-(2-nitrophenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.58 Å R-free 0.214
8RDS Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8i 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ6 (5~{S})-3-(2-methoxyphenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8RDS Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8i 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ6 (5~{S})-3-(2-methoxyphenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8RDS Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8i 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8RDT Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8j 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ2 (5~{S})-3-(2,3,4-trimethoxyphenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM Thalidomide	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
8RDT Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8j 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1HZ2 (5~{S})-3-(2,3,4-trimethoxyphenyl)-1-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]dec-2-ene-8,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM Thalidomide	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
8RDT Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with spiro-isoxazol based compound 8j 提交 2023-12-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM Thalidomide	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
9GJQ Crystal structure of humanised cereblon from Magnetospirillum gryphiswaldense bound by dihydrouracil-indole compound [1-(1H-indol-6-yl)dihydro-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione]. 提交 2024-08-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–124（107 aa）	突变：A52H, M54Y, F56H, F77H, Y101F, R117A	A1IMN 1-(1H-indol-6-yl)-1,3-diazinane-2,4-dione × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10 % PEG8000, 8 % ethylene glycol and 100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5)	分辨率 1.39 Å R-free 0.209
9HTK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2n 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IXA (3S)-3-phenylsulfanylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.49 Å R-free 0.210
9HTK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2n 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1I4R (3R)-3-phenylsulfanylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.49 Å R-free 0.210
9HTK Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2n 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IXA (3S)-3-phenylsulfanylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.49 Å R-free 0.210
9HTL Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2j 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW9 (3~{R})-3-phenoxypiperidine-2,6-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.74 Å R-free 0.217
9HTL Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2j 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW9 (3~{R})-3-phenoxypiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.74 Å R-free 0.217
9HTL Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2j 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.74 Å R-free 0.217
9HTM Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2o 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW8 (3R)-3-phenylazanylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.85 Å R-free 0.237
9HTM Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2o 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW8 (3R)-3-phenylazanylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.85 Å R-free 0.237
9HTM Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2o 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1I4P (3S)-3-phenylazanylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.85 Å R-free 0.237
9HTN Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2s 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW7 (3R)-3-(3,4-dihydro-2H-quinolin-1-yl)piperidine-2,6-dione × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.92 Å R-free 0.235
9HTN Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2s 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1I4Q (3S)-3-(3,4-dihydro-2H-quinolin-1-yl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.92 Å R-free 0.235
9HTN Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2s 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1I4Q (3S)-3-(3,4-dihydro-2H-quinolin-1-yl)piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.92 Å R-free 0.235
9HTO Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2r 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW6 (3~{S})-3-indol-1-ylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.85 Å R-free 0.240
9HTO Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2r 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW6 (3~{S})-3-indol-1-ylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.85 Å R-free 0.240
9HTO Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2r 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW6 (3~{S})-3-indol-1-ylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 1.85 Å R-free 0.240
9HTP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2p 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 2.35 Å R-free 0.281
9HTP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2p 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW5 (3~{S})-3-[methyl(phenyl)amino]piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 2.35 Å R-free 0.281
9HTP Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2p 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3mM thalidomide	分辨率 2.35 Å R-free 0.281
9HTQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2u 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW4 (3~{S})-3-carbazol-9-ylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.63 Å R-free 0.202
9HTQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2u 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW4 (3~{S})-3-carbazol-9-ylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.63 Å R-free 0.202
9HTQ Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with glutarimide based compound 2u 提交 2024-12-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1IW4 (3~{S})-3-carbazol-9-ylpiperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4-0.6 M (NH4)H2PO4, ~17 mg/ml MSCI4 with 3 mM thalidomide	分辨率 1.63 Å R-free 0.202

共 61 个其他 PDB 条目、171 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A4TVL0_9PROT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–125； UniProt 1–124 作者链 B； PDB构建体 2–125； UniProt 1–124

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6r1d
沉积日期 deposition_date	2019-03-14
结构标题 title	Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with compound 7d, co-crystallized
关键词 keywords	proteolysis targeting chimera, PROTAC, protein degradation, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.66 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.77 Å
零角强度 I(0) i0	10890500.00
分子量 molecular_weight	24199.0 kDa
排除体积 excluded_volume	29962 Å³
包络体积 envelope_volume	34521 Å³
水化壳体积 shell_volume	16020 Å³
包络直径 envelope_diameter	62.0 Å
壳层 Rg shell_rg	24.14 Å
包络 Rg envelope_rg	18.86 Å
形状 Rg shape_rg	18.68 Å
总 Rg total_rg	19.81 Å
总原子数 total_atoms	1701
残基数 n_residues	211
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	62.5 Å
Rg (实空间) rg_real	19.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.37 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0890e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3490e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.65 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	10890000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8985
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	22.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.282
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.549
角度范围 angular_range	— – 0.4050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1530000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.922; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.935

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cereblon isoform 4
分子量 formula_weight	13703.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2080

AMPLDAGGQNSTQMVLAPGASIFRCRQCGQTISRRDWLLPMGGDHEHVVFNPAGMIFRVWCFSLAQGLRLIGAPSGEFSWFKGYDWTIALCGQCGSHLGWHYEGGSQPQTFFGLIKDRLAEGPAD

来源 Source

来源生物 organism	Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	431944
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	(phenylmethyl) ~{N}-[(3~{S})-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]carbamate
分子量 formula_weight	248.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	274

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	31.643 Å
晶胞边长 b length_b	52.482 Å
晶胞边长 c length_c	59.242 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.79 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.100 Å
最低分辨率 resolution_low	39.200 Å
R 因子 r_factor	0.1235
R_work r_work	0.1221
R_free r_free	0.1496

fit	/app/data/saxs_computation/r1/6r1d/6r1d.fit
pddf	/app/data/pr_computation/r1/6r1d/6r1d.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/r1/6r1d/6r1d.dat