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6r3c

Solution structure of birch pollen allergen Bet v 1a

Method: SOLUTION NMR Dmax: 64.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major pollen allergen Bet v 1-A

Betula pendula

UniProt P15494

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–160 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成：0.5 mM [U-13C; U-15N] Betv1a, 0.05 mM sodium chloride, 0.05 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6R3C Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1B6F BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 提交 1999-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–159（159 aa）
突变：M139L 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
分辨率未提供
1BTV STRUCTURE OF BET V 1, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-01-30 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1BV1 BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 提交 1997-07-08 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY MIXING 5 MG/ML PROTEIN SOLUTION WITH EQUAL AMOUNT OF 2.0 M AMS, 100 MM SODIUM CITRATE, PH 6.3
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1LLT BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT E45S 提交 2002-04-30 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
突变：E45S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.301
1QMR BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT N28T, K32Q, E45S, P108G 提交 1999-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–159（159 aa）
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.00
分辨率 2.15 Å R-free 0.238
4A80 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in complex with 8-Anilinonaphthalene-1-sulfonate (ANS) 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 2AN 8-ANILINO-1-NAPHTHALENE SULFONATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.96 Å R-free 0.205
4A81 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in ternary complex with 8-Anilinonaphthalene-1-sulfonate (ANS) and deoxycholic acid 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 DXC (3ALPHA,5BETA,12ALPHA)-3,12-DIHYDROXYCHOLAN-24-OIC ACID × 1 2AN 8-ANILINO-1-NAPHTHALENE SULFONATE × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 2.05 Å R-free 0.230
4A83 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in complex with deoxycholate. 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 DXC (3ALPHA,5BETA,12ALPHA)-3,12-DIHYDROXYCHOLAN-24-OIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.54 Å R-free 0.168
4A84 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a F30V mutant in complex with deoxycholate. 提交 2011-11-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
突变：YES DXC (3ALPHA,5BETA,12ALPHA)-3,12-DIHYDROXYCHOLAN-24-OIC ACID × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.50 Å R-free 0.243
4A85 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in complex with kinetin. 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 H35 N-(FURAN-2-YLMETHYL)-7H-PURIN-6-AMINE × 1 SO4 SULFATE ION × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.40 Å R-free 0.180
4A86 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in ternary complex with kinetin and 8-Anilinonaphthalene-1-sulfonate (ANS) 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 2AN 8-ANILINO-1-NAPHTHALENE SULFONATE × 1 H35 N-(FURAN-2-YLMETHYL)-7H-PURIN-6-AMINE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.59 Å R-free 0.207
4A87 Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in complex with naringenin. 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 NAR NARINGENIN × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.24 Å R-free 0.162
4A88 Crystal Structure of native Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 isoform a 提交 2011-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 1.51 Å R-free 0.168
4A8G Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 a in complex with dimethylbenzylammonium propane sulfonate 提交 2011-11-21 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
未记录 DMX 3-[BENZYL(DIMETHYL)AMMONIO]PROPANE-1-SULFONATE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 2.10 Å R-free 0.249
4B9R Crystal structure of the Major Birch Pollen Allergen Bet v 1.0101 (isoform a) nitrated in vitro with tetranitromethan. 提交 2012-09-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；2M AMMONIUM SULFATE 1.5% 2-METHYL-2,4-PENTANDIOL, pH 7
分辨率 1.76 Å R-free 0.249
4BK6 Crystal Structure of a dimeric variant of Bet v 1 提交 2013-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–160（159 aa）
链 B 2–160（159 aa）
突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；27 % PEG 3350, 0.1 M NA-ACETAT TRIHYDRATE PH 5.5
分辨率 1.63 Å R-free 0.238
4BK7 Crystal Structure of a variant of the Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 提交 2013-04-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
突变：YES SO4 SULFATE ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5；2M AMMONIUM SULFATE, 1.5 % MPD, pH 4.5
分辨率 1.14 Å R-free 0.175
4BKC Crystal Structure of a unusually linked dimeric variant of Bet v 1 提交 2013-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–160（159 aa）
链 B 2–160（159 aa）
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M NA ACETATE PH 6.5, 27 % PEG 3350
分辨率 1.73 Å R-free 0.247
4BKD Crystal Structure of an unusually linked dimeric variant of Bet v 1 (b) 提交 2013-04-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–160（159 aa）
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；27 % PEG 3350, 0.1 M NA-ACETATE, PH 6.5
分辨率 1.17 Å R-free 0.202
4BTZ Crystal Structure of peroxinitrite treated Major Birch Pollen Allergen Bet v 1.0101 (isoform a) 提交 2013-06-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.47 Å R-free 0.235
4MNS Crystal structure of the major pollen allergen Bet v 1-A in complex with P303 提交 2013-09-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa） 片段：UNP residues 2-160
未记录 2AX (3R,4R,5aR,11aR)-3-methyl-6,11-dioxo-2,3,4,5,5a,6,11,11a-octahydrothiepino[3,2-g]isoquinoline-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；28% PEG MME 2000, 20mM ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.20 Å R-free 0.160
4QIP Crystal Structure of Major Birch Pollen Allergen Bet v 1 isoform a in complex with Sodium Dodecyl Sulfate 提交 2014-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa） 片段：UNP residues 2-160
突变：D125A SDS DODECYL SULFATE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；2M AMMONIUM SULFATE 1.5% 2-METHYL-2,4-PENTANDIOL, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.288
4Z3L CRYSTAL STRUCTURE OF BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT G26L, D69I, P90L, K97I 提交 2015-03-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–160（159 aa）
突变：G26L D69I P90L K97I SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；25% PEG8000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.4
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4Z3L CRYSTAL STRUCTURE OF BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT G26L, D69I, P90L, K97I 提交 2015-03-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–160（159 aa）
突变：G26L D69I P90L K97I SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；25% PEG8000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.4
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4Z3L CRYSTAL STRUCTURE OF BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT G26L, D69I, P90L, K97I 提交 2015-03-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2–160（159 aa）
突变：G26L D69I P90L K97I SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；25% PEG8000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.4
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4Z3L CRYSTAL STRUCTURE OF BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT G26L, D69I, P90L, K97I 提交 2015-03-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 2–160（159 aa）
突变：G26L D69I P90L K97I SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；25% PEG8000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.4
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4Z3L CRYSTAL STRUCTURE OF BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT G26L, D69I, P90L, K97I 提交 2015-03-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 2–160（159 aa）
突变：G26L D69I P90L K97I SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；25% PEG8000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.4
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4Z3L CRYSTAL STRUCTURE OF BIRCH POLLEN ALLERGEN BET V 1 MUTANT G26L, D69I, P90L, K97I 提交 2015-03-31 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 2–160（159 aa）
突变：G26L D69I P90L K97I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；25% PEG8000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.4
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
7MXL Complex of Bet v 1 with the Fab fragments of a three antibody cocktail 提交 2021-05-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7N0U Complex of recombinant Bet v 1 with Fab fragment of REGN5713 提交 2021-05-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–160（159 aa）
突变：F63L SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate, glycerol
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
7N0V Complex of recombinant Bet v 1 with Fab fragment of REGN5715 提交 2021-05-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–160（159 aa）
突变：F63L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG3350, PEG 400, Mg acetate
分辨率 3.71 Å R-free 0.378
9Y0A Crystal structure of Bet v 1.0101 in complex with human IgE Fab 2H22 提交 2025-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–160（160 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5; 0.05 M magnesium chloride hexahydrate; 30% PEG MME 550
分辨率 2.12 Å R-free 0.218
9Y0E Crystal structure of Bet v 1.0101 in complex with human IgE Fab 2H22 提交 2025-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–160（160 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.04 M potassium phosphate monobasic; 16% PEG 8000; 20% glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.257

共 29 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BEV1A_BETPN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 2–160

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6r3c

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6r3c
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6r3c
沉积日期 deposition_date2019-03-20
结构标题 titleSolution structure of birch pollen allergen Bet v 1a
关键词 keywordsBet v 1, birch pollen allergen, ALLERGEN; ALLERGEN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier16.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron16.18 Å
零角强度 I(0) i01603270000.00
分子量 molecular_weight348690.0 kDa
排除体积 excluded_volume439290 ų
包络体积 envelope_volume37604 ų
水化壳体积 shell_volume17758 ų
包络直径 envelope_diameter69.7 Å
壳层 Rg shell_rg24.43 Å
包络 Rg envelope_rg18.74 Å
形状 Rg shape_rg16.18 Å
总 Rg total_rg16.30 Å
总原子数 total_atoms49040
残基数 n_residues3180
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax64.7 Å
Rg (实空间) rg_real16.52 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.64 Å
I(0) (实空间) i0_real1.6030e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0120e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal16.52 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1603000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7813
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary21.0 Å
偏度 Skewness skewness0.370
峰度 Kurtosis kurtosis0.232
角度范围 angular_range— – 0.4800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha454900.0000
实空间数据点数 n_real_points78
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.412; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.919; Smooth: 0.999
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6r3ca_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.129 — TBP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.129.3 — Bet v1-like
家族 Family familyd.129.3.1 — Pathogenesis-related protein 10 (PR10)-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6r3cA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology530 — Alpha-D-Glucose-1,6-Bisphosphate; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — START domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)