6s8y

Crystal structure of cytochrome c in complex with a sulfonated quinoline-derived foldamer

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 63.7 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c iso-1

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 3–109	未记录	HEC HEME C × 1 ZN ZINC ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 L0T 8-acetamido-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[(2-carboxy-4-sulfonato-quinolin-8-yl)carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]quinoline-4-sulfonate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；5 % PEG 3350, 100 mM sodium acetate pH 4.5, 200 mM zinc acetate	分辨率 2.09 Å R-free 0.267

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6S8Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CHH STRUCTURAL STUDIES OF THE ROLES OF RESIDUES 82 AND 85 AT THE INTERACTIVE FACE OF CYTOCHROME C 提交 1994-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.97 Å
1CHI STRUCTURAL STUDIES OF THE ROLES OF RESIDUES 82 AND 85 AT THE INTERACTIVE FACE OF CYTOCHROME C 提交 1994-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1CHJ STRUCTURAL STUDIES OF THE ROLES OF RESIDUES 82 AND 85 AT THE INTERACTIVE FACE OF CYTOCHROME C 提交 1994-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1CIE STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C 提交 1994-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1CIF STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C 提交 1994-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1CIG STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C 提交 1994-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1CIH STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C 提交 1994-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1CRG THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C 提交 1993-08-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1CRH THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C 提交 1993-08-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1CRI THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C 提交 1993-08-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1CRJ THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C 提交 1993-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.05 Å
1CSU REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C 提交 1994-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.81 Å
1CSV REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C 提交 1994-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1CSW REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C 提交 1994-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1CSX REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C 提交 1994-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1CTY MUTATION OF TYROSINE-67 IN CYTOCHROME C SIGNIFICANTLY ALTERS THE LOCAL HEME ENVIRONMENT 提交 1993-02-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1CTZ MUTATION OF TYROSINE-67 IN CYTOCHROME C SIGNIFICANTLY ALTERS THE LOCAL HEME ENVIRONMENT 提交 1993-02-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1FHB THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURE OF THE CYANIDE ADDUCT OF A MET80ALA VARIANT OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE ISO-1-CYTOCHROME C. IDENTIFICATION OF LIGAND-RESIDUE INTERACTIONS IN THE DISTAL HEME CAVITY 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：H39Q, M80A, C102S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CYN CYANIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1IRV CYTOCHROME C ISOZYME 1, REDUCED, MUTANT WITH ILE 75 REPLACED BY MET AND CYS 102 REPLACED BY THR 提交 1996-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：I75M, C102T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1IRW CYTOCHROME C ISOZYME 1, REDUCED, MUTANT WITH ASN 52 REPLACED BY ALA AND CYS 102 REPLACED BY THR 提交 1996-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：N52A, C102T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric	链 W 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1LMS Structural model for an alkaline form of ferricytochrome c 提交 2002-05-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：K72A,K79A,C102T	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 11.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate；压力 1 NMR样品组成 2mM protein \| 50 mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; pH 11.1	分辨率未提供
1NMI Solution structure of the imidazole complex of iso-1 cytochrome c 提交 2003-01-10	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	IMD IMIDAZOLE × 1 HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K NMR样品组成 1mM iso-1 cytochrome c, 120mM d5imidazole \| H2O NMR样品组成 1mM 15N labeled iso-1 cytochrome c, 120mM d5imidazole \| H2O	分辨率未提供
1RAP THE STRUCTURE AND FUNCTION OF OMEGA LOOP A REPLACEMENTS IN CYTOCHROME C 提交 1992-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.25 Å
1RAQ THE STRUCTURE AND FUNCTION OF OMEGA LOOP A REPLACEMENTS IN CYTOCHROME C 提交 1992-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1S6V Structure of a cytochrome c peroxidase-cytochrome c site specific cross-link 提交 2004-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–108（107 aa）	突变：A81C, C102T	IOD IODIDE ION × 1 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, KI, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.88 Å R-free 0.243
1S6V Structure of a cytochrome c peroxidase-cytochrome c site specific cross-link 提交 2004-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–108（107 aa）	突变：A81C, C102T	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, KI, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.88 Å R-free 0.243
1U74 Electron Transfer Complex between cytochrome C and cytochrome C peroxidase 提交 2004-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：C102S	PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, sodium chloride, n-octyl-beta-D-glucoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.40 Å R-free 0.287
1U74 Electron Transfer Complex between cytochrome C and cytochrome C peroxidase 提交 2004-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–108（108 aa）	突变：C102S	PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, sodium chloride, n-octyl-beta-D-glucoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.40 Å R-free 0.287
1YCC HIGH-RESOLUTION REFINEMENT OF YEAST ISO-1-CYTOCHROME C AND COMPARISONS WITH OTHER EUKARYOTIC CYTOCHROMES C 提交 1990-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.23 Å
1YFC Solution nmr structure of a yeast iso-1-ferrocytochrome C 提交 1996-08-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：C102S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K	分辨率未提供
1YIC THE OXIDIZED SACCHAROMYCES CEREVISIAE ISO-1-CYTOCHROME C, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-02-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：C102S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2B0Z Crystal structure of the protein-protein complex between F82I cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：F82I	ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
2B10 Crystal Structure of the Protein-Protein Complex between F82S cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：F82S	ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, NaCl, BOG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.306
2B10 Crystal Structure of the Protein-Protein Complex between F82S cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–108（108 aa）	突变：F82S	ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, NaCl, BOG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.306
2B11 Crystal structure of the protein-protein complex between F82W cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：F82W	ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, NaCl, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.293
2B11 Crystal structure of the protein-protein complex between F82W cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–108（108 aa）	突变：F82W	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, NaCl, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.293
2B12 Crystal structure of the protein-protein complex between F82Y cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：F82Y	ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, NaCl, BOG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.02 Å R-free 0.268
2BCN Solvent isotope effects on interfacial protein electron transfer between cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2005-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：C107S	ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 2 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；295 K；PEG3350, NaCl, BOG, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.230
2GB8 Solution structure of the complex between yeast iso-1-cytochrome c and yeast cytochrome c peroxidase 提交 2006-03-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；301 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.4mM Cc(Fe3+)-CcP(Fe3+), 1:1 complex; 20mM NaPi, 100mM NaCl pH 6.0 \| 20mM NaPi, 100mM NaCl pH 6.0	分辨率未提供
2HV4 NMR solution structure refinement of yeast iso-1-ferrocytochrome c 提交 2006-07-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：C102T	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 2-3 mM cytochrome c, 50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2-3 mM cytochrome c U-15N, 50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2-3 mM cytochrome c U-15N,13C, 50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2JQR Solution model of crosslinked complex of cytochrome c and adrenodoxin 提交 2007-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：V28C, C102T	HEC HEME C × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；285 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.4；301 K；离子强度（mmCIF原始值）0.4；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-98% 15N] CcV28C, 0.2-0.6 mM AdxL80C, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-98% 15N] AdxL80C, 0.2-0.6 mM CcV28C, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-98% 15N] CcV28C, 5 mM DTT, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 15N] AdxL80C, 5 mM DTT, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2JTI Solution structure of the yeast iso-1-cytochrome c (T12A) : yeast cytochrome c peroxidase complex 提交 2007-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：T12A,C102T	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.4 mM [U-15N] CC, 0.3-0.4 mM CCP, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2LIR NMR Solution Structure of Yeast Iso-1-cytochrome c Mutant P71H in oxidized states 提交 2011-08-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P71H, K72A, C102T	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 ambient NMR样品组成 1 mM entity_1-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM entity_1-2, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LIT NMR Solution Structure of Yeast Iso-1-cytochrome c Mutant P71H in reduced states 提交 2011-08-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P71H, K72A, C102T	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 ambient NMR样品组成 1 mM entity_1-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM entity_1-2, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2MHM Solution structure of cytochrome c Y67H 提交 2013-11-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：Y67H	HEC HEME C × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1 mM cytc c y67h-1, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM cytc c y67h-2, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2N18 Dominant form of the low-affinity complex of yeast cytochrome c and cytochrome c peroxidase 提交 2015-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 3–109（107 aa）片段：UNP residues 3-109 链 C 2–109（108 aa）片段：UNP residues 2-109	突变：A81C, C102T	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HEC HEME C × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）15；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-2H; U-15N] CcP, 0.4 mM Cc, 0.4 mM Cc1, 20 mM sodium phosphate, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2ORL Solution structure of the cytochrome c- para-aminophenol adduct 提交 2007-02-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEC HEME C × 1 4NL 4-AMINOPHENOL × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM phosphate buffer；压力 1 NMR样品组成 2-3mM Cytochrome c U-15N, 50mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2PCC CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN ELECTRON TRANSFER PARTNERS, CYTOCHROME C PEROXIDASE AND CYTOCHROME C 提交 1993-04-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
2PCC CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN ELECTRON TRANSFER PARTNERS, CYTOCHROME C PEROXIDASE AND CYTOCHROME C 提交 1993-04-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–108（108 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
2YCC OXIDATION STATE-DEPENDENT CONFORMATIONAL CHANGES IN CYTOCHROME C 提交 1991-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric	链 W 2–109（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3TYI Crystal Structure of Cytochrome c - p-Sulfonatocalix[4]arene Complexes 提交 2011-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293.15 K；26 % PEG 8000, 100 mM Magnesium Chloride, 50 mM Sodium Chloride, 50 mM Sodium Cacodylate pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
3TYI Crystal Structure of Cytochrome c - p-Sulfonatocalix[4]arene Complexes 提交 2011-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293.15 K；26 % PEG 8000, 100 mM Magnesium Chloride, 50 mM Sodium Chloride, 50 mM Sodium Cacodylate pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4MU8 Crystal structure of an oxidized form of yeast iso-1-cytochrome c at pH 8.8 提交 2013-09-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：K78A, C108S	HEC HEME C × 1 SO4 SULFATE ION × 4 TBU TERTIARY-BUTYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；90% ammonia sulfate, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.8), 4% tert-butanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.45 Å R-free 0.154
4MU8 Crystal structure of an oxidized form of yeast iso-1-cytochrome c at pH 8.8 提交 2013-09-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：K78A, C108S	HEC HEME C × 1 SO4 SULFATE ION × 4 TBU TERTIARY-BUTYL ALCOHOL × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；90% ammonia sulfate, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.8), 4% tert-butanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.45 Å R-free 0.154
4N0K Atomic resolution crystal structure of a cytochrome c-calixarene complex 提交 2013-10-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–107（106 aa）	突变：R13E	HEC HEME C × 1 T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K	分辨率 1.05 Å R-free 0.180
4N0K Atomic resolution crystal structure of a cytochrome c-calixarene complex 提交 2013-10-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–107（106 aa）	突变：R13E	HEC HEME C × 1 T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K	分辨率 1.05 Å R-free 0.180
4P4Q Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c 提交 2014-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–109（103 aa）片段：UNP residues 7-109	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.01 Å R-free 0.278
4P4Q Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c 提交 2014-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 7–109（103 aa）片段：UNP residues 7-109	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.01 Å R-free 0.278
4Q5P Lysine-Ligated Yeast Iso-1 Cytochrome C 提交 2014-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–109（106 aa）片段：UNP residues 7-109	突变：T78C, K79G	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.2 M ammonium phosphate, pH 8.1, 30% w/v PEG300, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.87 Å R-free 0.204
4Q5P Lysine-Ligated Yeast Iso-1 Cytochrome C 提交 2014-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–109（106 aa）片段：UNP residues 7-109	突变：T78C, K79G	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.2 M ammonium phosphate, pH 8.1, 30% w/v PEG300, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.87 Å R-free 0.204
4Q5P Lysine-Ligated Yeast Iso-1 Cytochrome C 提交 2014-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 4–109（106 aa）片段：UNP residues 7-109	突变：T78C, K79G	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.2 M ammonium phosphate, pH 8.1, 30% w/v PEG300, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.87 Å R-free 0.204
4QAO Lysine-ligated cytochrome c with F82H 提交 2014-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–107（104 aa）片段：UNP residues 8-109	突变：T78C, K79G, F82H	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；28% w/v PEG, 0.3 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.223
4QAO Lysine-ligated cytochrome c with F82H 提交 2014-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–107（104 aa）片段：UNP residues 8-109	突变：T78C, K79G, F82H	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；28% w/v PEG, 0.3 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.223
4QAO Lysine-ligated cytochrome c with F82H 提交 2014-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 4–107（104 aa）片段：UNP residues 8-109	突变：T78C, K79G, F82H	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；28% w/v PEG, 0.3 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.223
4YE1 A cytochrome c plus calixarene structure - alternative ligand binding mode 提交 2015-02-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：R13E	HEC HEME C × 1 T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K	分辨率 1.39 Å R-free 0.160
4YE1 A cytochrome c plus calixarene structure - alternative ligand binding mode 提交 2015-02-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：R13E	HEC HEME C × 1 T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K	分辨率 1.39 Å R-free 0.160
5CIB Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to 2,4-dimethylaniline with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–109（108 aa）片段：iso-1 cytochrome c 链 D 2–109（108 aa）片段：iso-1 cytochrome c	未记录	HEC HEME C × 4 51S 2,4-dimethylaniline × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 3.01 Å R-free 0.304
5CIC Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to 3-aminobenzotrifluoride with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–109（108 aa）链 D 2–109（108 aa）	未记录	HEC HEME C × 4 51R 3-(trifluoromethyl)aniline × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
5CID Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to o-toluidine with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–109（108 aa）链 D 2–109（108 aa）	未记录	HEC HEME C × 4 51V 2-methylaniline × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.76 Å R-free 0.268
5CIE Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to aniline with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–109（108 aa）链 D 2–109（108 aa）	未记录	HEC HEME C × 4 ANL ANILINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.60 Å R-free 0.294
5CIF Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–109（103 aa）	未记录	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.01 Å R-free 0.268
5CIF Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 7–109（103 aa）	未记录	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.01 Å R-free 0.268
5CIG Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–109（108 aa）	未记录	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.06 Å R-free 0.298
5CIG Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–109（108 aa）	未记录	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.06 Å R-free 0.298
5CIH Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191Y) with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–109（103 aa）	未记录	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.60 Å R-free 0.310
5CIH Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191Y) with iso-1 cytochrome c 提交 2015-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 7–109（103 aa）	未记录	HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl	分辨率 2.60 Å R-free 0.310
5KKE Crystal Structure of a Domain-swapped Dimer of Yeast Iso-1-cytochrome c with CYMAL5 提交 2016-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：K72A, C102S	HEC HEME C × 2 SO4 SULFATE ION × 4 CM5 5-CYCLOHEXYL-1-PENTYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Reservior solution: 77% Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.5 Protein Solution: 18 mg/mL in 75 % Ammonium Sulfate Detergent Solution: 2.5 mM CYMAL-5 in deionized water Mixed 2:2:1	分辨率 1.70 Å R-free 0.204
5KLU Crystal Structure of a Domain-swapped Dimer of Yeast Iso-1-cytochrome c with omega-undecylenyl-beta-D-maltopyranoside 提交 2016-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–109（106 aa）链 B 4–109（106 aa）	突变：K72A, C102S 突变：K72A, C102S	HEC HEME C × 2 6UZ omega-undecylenyl-beta-D-maltopyranoside × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Reservior: 90% ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.5 Protein: 8 mg/mL in 75% ammonium sulfate Detergent: 12 mM w-undecylenyl-b-D-maltopyranoside in deionized water Mixed 2:2:1	分辨率 1.99 Å R-free 0.256
5KPF Crystal structure of cytochrome c - Phenyl-trisulfonatocalix[4]arene complex 提交 2016-07-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；20 mM PEG 3350, 200 mM Ammonium Nitrate pH 6.3 cyt c-sclx4 seed (grown in 18% PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM NaOAc pH 5.6)	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
5KPF Crystal structure of cytochrome c - Phenyl-trisulfonatocalix[4]arene complex 提交 2016-07-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 6VJ Phenyl-trisulfonatocalix[4]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；20 mM PEG 3350, 200 mM Ammonium Nitrate pH 6.3 cyt c-sclx4 seed (grown in 18% PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM NaOAc pH 5.6)	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
5LFT Crystal structure of cytochrome c - Bromo-trisulfonatocalix[4]arene complexes 提交 2016-07-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 BR BROMIDE ION × 2 6VB Bromo-trisulfonatocalix[4]arene × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；30% PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM NaOAc pH 5.6	分辨率 1.25 Å R-free 0.239
5LYC Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene 提交 2016-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–109（107 aa）链 B 3–109（107 aa）	突变：C102T 突变：C102T	HEC HEME C × 2 7AZ phosphonato-calix[6]arene × 2 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；3.15M ammonium sulfate 100 mM sodium citrate pH 5.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.199
5NCV Crystal Structure of Cytochrome c in complex with p-Methylphosphonatocalix[4]arene 提交 2017-03-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	突变：T-5A, C102T	HEC HEME C × 1 8TE p-Methylphosphonatocalix[4]arene × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；20 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 50 mM sodium acetate (pH 5.6). [Cytochrome c] = 0.75 mM and [Methylphosphonatocalix[4]arene] = 0.3 mM	分辨率 1.50 Å R-free 0.201
5NCV Crystal Structure of Cytochrome c in complex with p-Methylphosphonatocalix[4]arene 提交 2017-03-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–109（107 aa）	突变：T-5A, C102T	HEC HEME C × 1 8TE p-Methylphosphonatocalix[4]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；20 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 50 mM sodium acetate (pH 5.6). [Cytochrome c] = 0.75 mM and [Methylphosphonatocalix[4]arene] = 0.3 mM	分辨率 1.50 Å R-free 0.201
5T7H Crystal structure of dimeric yeast iso-1-cytochrome C with CYMAL6 提交 2016-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–109（109 aa）链 D 1–109（109 aa）	突变：K72A, C10S 突变：K72A, C10S	SO4 SULFATE ION × 4 ZE7 6-cyclohexylhexan-1-ol × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；75% (NH4)2SO4, AN 86% (NH4)2SO4 AND 0.1 M TRIS RESERVOIR SOLUTION, AND 5.6 MM CYMAL-6., PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
5T7H Crystal structure of dimeric yeast iso-1-cytochrome C with CYMAL6 提交 2016-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–109（109 aa）链 C 1–109（109 aa）	突变：K72A, C10S 突变：K72A, C10S	SO4 SULFATE ION × 5 ZE7 6-cyclohexylhexan-1-ol × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；75% (NH4)2SO4, AN 86% (NH4)2SO4 AND 0.1 M TRIS RESERVOIR SOLUTION, AND 5.6 MM CYMAL-6., PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
6EGY Crystal structure of cytochrome c in complex with mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene 提交 2017-09-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEC HEME C × 1 SO4 SULFATE ION × 1 B4T mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M sodium citrate, 0.1 M Sodium Chloride, and 0.1 M Sodium Sulfate	分辨率 2.70 Å R-free 0.273
6EGY Crystal structure of cytochrome c in complex with mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene 提交 2017-09-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEC HEME C × 1 B4T mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M sodium citrate, 0.1 M Sodium Chloride, and 0.1 M Sodium Sulfate	分辨率 2.70 Å R-free 0.273
6EGZ Crystal structure of cytochrome c in complex with di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene 提交 2017-09-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEC HEME C × 1 B4X di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M Sodium Citrate, 0.1 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Sulfate	分辨率 2.17 Å R-free 0.247
6EGZ Crystal structure of cytochrome c in complex with di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene 提交 2017-09-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：C102T	HEC HEME C × 1 B4X di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M Sodium Citrate, 0.1 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Sulfate	分辨率 2.17 Å R-free 0.247
6GD6 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, H3 form with ammonium sulfate 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.75 M ammonium sulfate 0.2 M NaCl (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 1.20 Å R-free 0.136
6GD7 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, H3 form with PEG 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5 % PEG 3350 (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 1.55 Å R-free 0.183
6GD8 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24 % PEG 3350 0.27 M NaCl 0.09 M MES pH 5.5 (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 2.50 Å R-free 0.200
6GD8 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24 % PEG 3350 0.27 M NaCl 0.09 M MES pH 5.5 (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 2.50 Å R-free 0.200
6GD8 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24 % PEG 3350 0.27 M NaCl 0.09 M MES pH 5.5 (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 2.50 Å R-free 0.200
6GD8 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24 % PEG 3350 0.27 M NaCl 0.09 M MES pH 5.5 (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 2.50 Å R-free 0.200
6GD9 Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P43212 form 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.85 M ammonium sulfate 0.1 M HEPES pH 7.0 0.2 M NaCl (2x protein solution : 1x crystallisation condition)	分辨率 2.65 Å R-free 0.286
6GDA Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P43212 form soaked with Spermine 提交 2018-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	突变：C102T, T-5A	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 SO4 SULFATE ION × 9 SPM SPERMINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.1 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.243
6P41 Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232E) in complex with iso-1 cytochrome c 提交 2019-05-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–109（103 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%	分辨率 2.90 Å R-free 0.273
6P41 Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232E) in complex with iso-1 cytochrome c 提交 2019-05-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 7–109（103 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%	分辨率 2.90 Å R-free 0.273
6P42 Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232H) in complex with iso-1 cytochrome c 提交 2019-05-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–109（103 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%, L-proline	分辨率 2.90 Å R-free 0.271
6P42 Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232H) in complex with iso-1 cytochrome c 提交 2019-05-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 7–109（103 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%, L-proline	分辨率 2.90 Å R-free 0.271
6P43 Yeast cytochrome c peroxidase in complex with iso-1 cytochrome c (Y48K) 提交 2019-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：Y48K	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate, 175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 14%-20%	分辨率 1.91 Å R-free 0.228
6RGI Partially unfolded cytochrome c in complex with sulfonatocalix[6]arene 提交 2019-04-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 FWQ p-sulfonatocalix[6]arene × 1 IMD IMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；11 % PEG 8000, 0.1 M imidazole, 2 mM sulfonato-calix[6]arene	分辨率 2.64 Å R-free 0.250
6RSI cytochrome c co-crystallized with 25 eq. sulfonato-calix[8]arene - structure 0 提交 2019-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.20 M ammonium sulfate, 0.05 M sulfonato-calix[8]arene.	分辨率 2.48 Å R-free 0.199
6RSJ Cytochrome c co-crystallized with 20 eq. sulfonato-calix[8]arene and soaked with 25 eq. spermine - structure I 提交 2019-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 SPM SPERMINE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.2 M Ammonium sulfate, 0.04 M sulfonato-calix[8]arene	分辨率 2.27 Å R-free 0.212
6RSK Cytochrome c co-crystallized with 20 eq. sulfonato-calix[8]arene and 15 eq. spermine - structure II 提交 2019-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 SO4 SULFATE ION × 6 SPM SPERMINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.2 M Ammonium sulfate, 0.04 M sulfonato-calix[8]arene, 0.03 M spermine	分辨率 2.31 Å R-free 0.222
6RSK Cytochrome c co-crystallized with 20 eq. sulfonato-calix[8]arene and 15 eq. spermine - structure II 提交 2019-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 SO4 SULFATE ION × 5 SPM SPERMINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.2 M Ammonium sulfate, 0.04 M sulfonato-calix[8]arene, 0.03 M spermine	分辨率 2.31 Å R-free 0.222
6RSL Cytochrome c co-crystallized with 10 eq. sulfonato-calix[8]arene and 25 eq. spermine (dry-coating method) - structure III 提交 2019-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 SPM SPERMINE × 4 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.20 M Ammonium sulfate, 0.02 M sulfonato-calix[8]arene, 0.05 M spermine	分辨率 1.99 Å R-free 0.265
6RSL Cytochrome c co-crystallized with 10 eq. sulfonato-calix[8]arene and 25 eq. spermine (dry-coating method) - structure III 提交 2019-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 3 SPM SPERMINE × 4 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.20 M Ammonium sulfate, 0.02 M sulfonato-calix[8]arene, 0.05 M spermine	分辨率 1.99 Å R-free 0.265
6SUY Yeast cytochrome c in complex with an octa-anionic calix[4]arene 提交 2019-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–109（108 aa）链 B 2–109（108 aa）	未记录	HEC HEME C × 2 LVT octa-anionic calix[4]arene × 2 NA SODIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；3.15 M Ammonium sulfate + 0.1 M sodium citrate pH 5.0	分辨率 1.75 Å R-free 0.179
6Y0J Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene 提交 2020-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.269
6Y0J Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene 提交 2020-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 7AZ phosphonato-calix[6]arene × 2 EVB sulfonato-calix[8]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.269
6Y0J Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene 提交 2020-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 7AZ phosphonato-calix[6]arene × 1 EVB sulfonato-calix[8]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.269
6Y0J Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene 提交 2020-02-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 7AZ phosphonato-calix[6]arene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.269
7BBT Structure of cytochrome c in complex with a p-benzyl-sulfonato-calix[8]arene-PEG pseudorotaxane 提交 2020-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–109（107 aa）链 B 3–109（107 aa）链 C 3–109（107 aa）链 D 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 4 T8W 4-[[49,50,51,52,53,54,55,56-octahydroxy-11,17,23,29,35,41,47-heptakis[(4-sulfonatophenyl)methyl]-5-nonacyclo[43.3.1.13,7.19,13.115,19.121,25.127,31.133,37.139,43]hexapentaconta-1(49),3,5,7(56),9,11,13(55),15,17,19(54),21,23,25(53),27,29,31(52),33,35,37(51),39,41,43(50),45,47-tetracosaenyl]methyl]benzenesulfonate × 3 15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % PEG 3350 200mM Ammonium formate	分辨率 3.02 Å R-free 0.261
7MRI Crystal structure of N63T yeast iso-1-cytochrome c 提交 2021-05-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG1000	分辨率 2.46 Å R-free 0.208
7MRI Crystal structure of N63T yeast iso-1-cytochrome c 提交 2021-05-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG1000	分辨率 2.46 Å R-free 0.208
7MRI Crystal structure of N63T yeast iso-1-cytochrome c 提交 2021-05-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG1000	分辨率 2.46 Å R-free 0.208
7PR2 Cocrystal of cytochrome c and sulfonato-thiacalix[4]arene 提交 2021-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–109（107 aa）链 B 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 2 80M sulfonato-thiacalix[4]arene × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；25% PEG 3350, 100 mM tri-Sodium citrate pH 5.6, 100 mM Magnesium chloride	分辨率 1.73 Å R-free 0.251
7PR3 Cocrystal Form I of a cytochrome c, sulfonato-thiacalix[4]arene - zinc cluster 提交 2021-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–109（107 aa）链 B 3–109（107 aa）链 C 3–109（107 aa）链 D 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 4 ZN ZINC ION × 33 80M sulfonato-thiacalix[4]arene × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；20% PEG 3350, 100 mM sodium acetate pH 5.6, 30 mM zinc acetate	分辨率 2.37 Å R-free 0.253
7PR4 Cocrystal Form II of a cytochrome c, sulfonato-thiacalix[4]arene - zinc cluster 提交 2021-09-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–109（107 aa）	未记录	HEC HEME C × 1 80M sulfonato-thiacalix[4]arene × 1 ZN ZINC ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；20% PEG 3350, 100 mM sodium acetate pH 5.6, 10 mM zinc acetate	分辨率 1.32 Å R-free 0.225
9Q39 Structure of a sortase-linked cytochrome c peroxidase - cytochrome c fusion protein 提交 2025-08-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–109（103 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 HEC HEME C × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；295 K；Upon purification, CcP-GGSG(2x)LPATGGG was buffer exchanged into filtered nanopure water and concentrated to 0.5 mM. Initial crystal hits were obtained using a Gryphon robot (Arts Robbins Instrument). Larger crystals were optimized via vapor diffusion in 4 microliter sitting drops, which were mixed 1:1 with well solution (14-20 % PEG 8000, 40 mM KH2PO4, 20 % glycerol, pH 3.0-5.5). Crystals growing under these conditions formed within a week.	分辨率 3.24 Å R-free 0.331

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–107； UniProt 3–109

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6s8y
沉积日期 deposition_date	2019-07-10
结构标题 title	Crystal structure of cytochrome c in complex with a sulfonated quinoline-derived foldamer
关键词 keywords	Charge interactions, cytochrome c, protein assembly, protein recognition, quinoline foldamer, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.05 Å
零角强度 I(0) i0	6699130.00
分子量 molecular_weight	16996.0 kDa
排除体积 excluded_volume	20205 Å³
包络体积 envelope_volume	23083 Å³
水化壳体积 shell_volume	12540 Å³
包络直径 envelope_diameter	64.4 Å
壳层 Rg shell_rg	21.55 Å
包络 Rg envelope_rg	17.34 Å
形状 Rg shape_rg	17.00 Å
总 Rg total_rg	17.89 Å
总原子数 total_atoms	1181
残基数 n_residues	107
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	63.7 Å
Rg (实空间) rg_real	18.37 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.46 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.6990e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.1120e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.36 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6699000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7865
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.449
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.352
角度范围 angular_range	— – 0.4350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	622200.0000
实空间数据点数 n_real_points	75
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.801; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.818; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome c iso-1
分子量 formula_weight	11970.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1356

EFKAGSAKKGATLFKTRCLQCHTVEKGGPHKVGPNLHGIFGRHSGQAEGYSYTDANIKKNVLWDENNMSEYLTNPKKYIPGTKMAFGGLKKEKDRNDLITYLKKATE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	;8-acetamido-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[(2-carboxy-4-sulfonato-quinolin-8-yl)carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]quinoline-4-sulfonate ;
分子量 formula_weight	2053.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d6s8ya_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.1 — monodomain cytochrome c

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	39.138 Å
晶胞边长 b length_b	39.138 Å
晶胞边长 c length_c	187.366 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.090 Å
最低分辨率 resolution_low	33.900 Å
R 因子 r_factor	0.2270
R_work r_work	0.2250
R_free r_free	0.2670

fit	/app/data/saxs_computation/s8/6s8y/6s8y.fit
pddf	/app/data/pr_computation/s8/6s8y/6s8y.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/s8/6s8y/6s8y.dat