6tqo

rrn anti-termination complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol monophosphatase

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A5B7PBT3_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 5–267； UniProt 1–263

Inositol-1-monophosphatase

Escherichia coli

UniProt P0ADG4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SUHB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 5–271； UniProt 1–267

Transcription termination/antitermination protein NusA

Escherichia coli

UniProt A0A4P8BVH6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4P8BVH6_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–497； UniProt 1–495

Transcription antitermination protein NusB

Escherichia coli

UniProt A0A4P8C5Y7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4P8C5Y7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–141； UniProt 1–139

30S ribosomal protein S10

Escherichia coli

UniProt A0A073G203

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A073G203_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 4–106； UniProt 1–103

Transcription termination/antitermination protein NusG

Escherichia coli

UniProt V0ZS55

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	V0ZS55_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 4–184； UniProt 1–181

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

Escherichia coli

UniProt P0A7Z4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–329； UniProt 1–329 作者链 V； PDB构建体 1–329； UniProt 1–329

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

Escherichia coli

UniProt P0A800

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOZ_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

Escherichia coli

UniProt P0A8V4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOB_ECO57
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–1342； UniProt 1–1342

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

Escherichia coli

UniProt S1HM87

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） 30S ribosomal protein S4 × 1 （I2X692） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	S1HM87_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–1407； UniProt 1–1407

30S ribosomal protein S4

Escherichia coli

UniProt I2X692

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	Inositol monophosphatase × 1 （A0A5B7PBT3） Inositol-1-monophosphatase × 1 （P0ADG4） Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （A0A4P8BVH6） Transcription antitermination protein NusB × 1 （A0A4P8C5Y7） 30S ribosomal protein S10 × 1 （A0A073G203） Transcription termination/antitermination protein NusG × 1 （V0ZS55） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V4） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （S1HM87） rrnGnut RNA × 1 tDNA × 1 ntDNA × 1 MAGNESIUM ION × 3 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I2X692_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–208； UniProt 1–206

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6tqo
沉积日期 deposition_date	2019-12-17
结构标题 title	rrn anti-termination complex
关键词 keywords	rrn, anti-termination complex, RNAP, Nus factors, SuhB, S4, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6tqo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6tqo__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6tqo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	60.14 Å
Rg（电子密度）	60.38 Å
总 Rg	60.38 Å
原子数	40993
残基数	5056
排除体积	721820 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6tqo__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Inositol monophosphatase
分子量 formula_weight	29066.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T
原子数 atom_count	40993

GAMAMHPMLNIAVRAARKAGNLIAKNYETPDAVEASQKGSNDFVTNVDKAAEAVIIDTIRKSYPQHTIITEESGELEGTDQDVQWVIDPLDGTTNFIKRLPHFAVSIAVRIKGRTEVAVVYDPMRNELFTATRGQGAQLNGYRLRGSTARDLDGTILATGFPFKAKQYATTYINIVGKLFNECADFRRTGSAALDLAYVAAGRVDGFFEIGLRPWDFAAGELLVREAGGIVSDFTGGHNYMLTGNIVAGNPRVVKAMLANMRDELSD

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Inositol-1-monophosphatase
分子量 formula_weight	29537.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.3.25
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Transcription termination/antitermination protein NusA
分子量 formula_weight	55030.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

GAMNKEILAVVEAVSNEKALPREKIFEALESALATATKKKYEQEIDVRVQIDRKSGDFDTFRRWLVVDEVTQPTKEITLEAARYEDESLNLGDYVEDQIESVTFDRITTQTAKQVIVQKVREAERAMVVDQFREHEGEIITGVVKKVNRDNISLDLGNNAEAVILREDMLPRENFRPGDRVRGVLYSVRPEARGAQLFVTRSKPEMLIELFRIEVPEIGEEVIEIKAAARDPGSRAKIAVKTNDKRIDPVGACVGMRGARVQAVSTELGGERIDIVLWDDNPAQFVINAMAPADVASIVVDEDKHTMDIAVEAGNLAQAIGRNGQNVRLASQLSGWELNVMTVDDLQAKHQAEAHAAIDAFTKYLDIDEDFATVLVEEGFSTLEELAYVPMKELLEIEGLDEPTVEALRERAKNALATIAQAQEESLGDNKPADDLLNLEGVDRDLAFKLAARGVCTLEDLAEQGIDDLADIEGLTDEKAGALIMAARNICWFGDEA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Transcription antitermination protein NusB
分子量 formula_weight	15838.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GAMKPAARRRARECAVQALYSWQLSQNDIADVEYQFLAEQDVKDVDVLYFRELLAGVATNTAYLDGLMKPYLSRLLEELGQVEKAVLRIALYELSKRSDVPYKVAINEAIELAKSFGAEDSHKFVNGVLDKAAPVIRPNKK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S10
分子量 formula_weight	12012.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

LGSMQNQRIRIRLKAFDHRLIDQATAEIVETAKRTGAQVRGPIPLPTRKERFTVLISPHVNKDARDQYEIRTHLRLVDIVEPTEKTVDALMRLDLAAGVDVQISLG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Transcription termination/antitermination protein NusG
分子量 formula_weight	20817.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

LGSMSEAPKKRWYVVQAFSGFEGRVATSLREHIKLHNMEDLFGEVMVPTEEVVEIRGGQRRKSERKFFPGYVLVQMVMNDASWHLVRSVPRVMGFIGGTSDRPAPISDKEVDAIMNRLQQVGDKPRPKTLFEPGEMVRVNDGPFADFNGVVEEVDYEKSRLKVSVSIFGRATPVELDFSQVEKA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha
分子量 formula_weight	36558.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,V

MQGSVTEFLKPRLVDIEQVSSTHAKVTLEPLERGFGHTLGNALRRILLSSMPGCAVTEVEIDGVLHEYSTKEGVQEDILEILLNLKGLAVRVQGKDEVILTLNKSGIGPVTAADITHDGDVEIVKPQHVICHLTDENASISMRIKVQRGRGYVPASTRIHSEEDERPIGRLLVDACYSPVERIAYNVEAARVEQRTDLDKLVIEMETNGTIDPEEAIRRAATILAEQLEAFVDLRDVRQPEVKEEKPEFDPILLRPVDDLELTVRSANCLKAEAIHYIGDLVQRTEVELLKTPNLGKKSLTEIKDVLASRGLSLGMRLENWPPASIADE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit omega
分子量 formula_weight	10249.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MARVTVQDAVEKIGNRFDLVLVAARRARQMQVGGKDPLVPEENDKTTVIALREIEEGLINNQILDVRERQEQQEQEAAELQAVTAIAEGRR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	150820.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MVYSYTEKKRIRKDFGKRPQVLDVPYLLSIQLDSFQKFIEQDPEGQYGLEAAFRSVFPIQSYSGNSELQYVSYRLGEPVFDVQECQIRGVTYSAPLRVKLRLVIYEREAPEGTVKDIKEQEVYMGEIPLMTDNGTFVINGTERVIVSQLHRSPGVFFDSDKGKTHSSGKVLYNARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPATIILRALNYTTEQILDLFFEKVIFEIRDNKLQMELVPERLRGETASFDIEANGKVYVEKGRRITARHIRQLEKDDVKLIEVPVEYIAGKVVAKDYIDESTGELICAANMELSLDLLAKLSQSGHKRIETLFTNDLDHGPYISETLRVDPTNDRLSALVEIYRMMRPGEPPTREAAESLFENLFFSEDRYDLSAVGRMKFNRSLLREEIEGSGILSKDDIIDVMKKLIDIRNGKGEVDDIDHLGNRRIRSVGEMAENQFRVGLVRVERAVKERLSLGDLDTLMPQDMINAKPISAAVKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCPIETPEGPNIGLINSLSVYAQTNEYGFLETPYRKVTDGVVTDEIHYLSAIEEGNYVIAQANSNLDEEGHFVEDLVTCRSKGESSLFSRDQVDYMDVSTQQVVSVGASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPTLRADKPLVGTGMERAVAVDSGVTAVAKRGGVVQYVDASRIVIKVNEDEMYPGEAGIDIYNLTKYTRSNQNTCINQMPCVSLGEPVERGDVLADGPSTDLGELALGQNMRVAFMPWNGYNFEDSILVSERVVQEDRFTTIHIQELACVSRDTKLGPEEITADIPNVGEAALSKLDESGIVYIGAEVTGGDILVGKVTPKGETQLTPEEKLLRAIFGEKASDVKDSSLRVPNGVSGTVIDVQVFTRDGVEKDKRALEIEEMQLKQAKKDLSEELQILEAGLFSRIRAVLVAGGVEAEKLDKLPRDRWLELGLTDEEKQNQLEQLAEQYDELKHEFEKKLEAKRRKITQGDDLAPGVLKIVKVYLAVKRRIQPGDKMAGRHGNKGVISKINPIEDMPYDENGTPVDIVLNPLGVPSRMNIGQILETHLGMAAKGIGDKINAMLKQQQEVAKLREFIQRAYDLGADVRQKVDLSTFSDEEVMRLAENLRKGMPIATPVFDGAKEAEIKELLKLGDLPTSGQIRLYDGRTGEQFERPVTVGYMYMLKLNHLVDDKMHARSTGSYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVKSDDVNGRTKMYKNIVDGNHQMEPGMPESFNVLLKEIRSLGINIELEDE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;
分子量 formula_weight	156748.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MKDLLKFLKAQTKTEEFDAIKIALASPDMIRSWSFGEVKKPETINYRTFKPERDGLFCARIFGPVKDYECLCGKYKRLKHRGVICEKCGVEVTQTKVRRERMGHIELASPTAHIWFLKSLPSRIGLLLDMPLRDIERVLYFESYVVIEGGMTNLERQQILTEEQYLDALEEFGDEFDAKMGAEAIQALLKSMDLEQECEQLREELNETNSETKRKKLTKRIKLLEAFVQSGNKPEWMILTVLPVLPPDLRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLAAPDIIVRNEKRMLQEAVDALLDNGRRGRAITGSNKRPLKSLADMIKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVITVGPYLRLHQCGLPKKMALELFKPFIYGKLELRGLATTIKAAKKMVEREEAVVWDILDEVIREHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCAAYNADFDGDQMAVHVPLTLEAQLEARALMMSTNNILSPANGEPIIVPSQDVVLGLYYMTRDCVNAKGEGMVLTGPKEAERLYRSGLASLHARVKVRITEYEKDANGELVAKTSLKDTTVGRAILWMIVPKGLPYSIVNQALGKKAISKMLNTCYRILGLKPTVIFADQIMYTGFAYAARSGASVGIDDMVIPEKKHEIISEAEAEVAEIQEQFQSGLVTAGERYNKVIDIWAAANDRVSKAMMDNLQTETVINRDGQEEKQVSFNSIYMMADSGARGSAAQIRQLAGMRGLMAKPDGSIIETPITANFREGLNVLQYFISTHGARKGLADTALKTANSGYLTRRLVDVAQDLVVTEDDCGTHEGIMMTPVIEGGDVKEPLRDRVLGRVTAEDVLKPGTADILVPRNTLLHEQWCDLLEENSVDAVKVRSVVSCDTDFGVCAHCYGRDLARGHIINKGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAASRAAAESSIQVKNKGSIKLSNVKSVVNSSGKLVITSRNTELKLIDEFGRTKESYKVPYGAVLAKGDGEQVAGGETVANWDPHTMPVITEVSGFVRFTDMIDGQTITRQTDELTGLSSLVVLDSAERTAGGKDLRPALKIVDAQGNDVLIPGTDMPAQYFLPGKAIVQLEDGVQISSGDTLARIPQESGGTKDITGGLPRVADLFEARRPKEPAILAEISGIVSFGKETKGKRRLVITPVDGSDPYEEMIPKWRQLNVFEGERVERGDVISDGPEAPHDILRLRGVHAVTRYIVNEVQDVYRLQGVKINDKHIEVIVRQMLRKATIVNAGSSDFLEGEQVEYSRVKIANRELEANGKVGATYSRDLLGITKASLATESFISAASFQETTRVLTEAAVAGKRDELRGLKENVIVGRLIPAGTGYAYHQDRMRRRAAGEAPAAPQVTAEDASASLAELLNAGLGGSDNEHHHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S4
分子量 formula_weight	23656.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GAMARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAARLKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMAFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALELAEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	rrnGnut RNA
分子量 formula_weight	27435.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R

GCCGCGCCGCUGAGAAAAAGCGAAGCGGCACUGCUCUUUAACAAUUUAUCAGACAAUCUGUGUGGGUGUAGACCUGGCGUGUGGC

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	tDNA
分子量 formula_weight	10645.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	L

GTTATCCGCTCACAATGCCACACGCGCTGCTCGGC

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	ntDNA
分子量 formula_weight	10822.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	K

GCCGAGCAGCATAGCATTACTTGTGAGCGGATAAC

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	6tqoA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1480 — N Utilization Substance Protein A; Chain:P; domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — NusA, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6tqoA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6tqoA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain

结构域编号 domain_id	6tqoG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	940 — NusG, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6tqoY01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	33821

rrn anti-termination complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol monophosphatase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inositol-1-monophosphatase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription termination/antitermination protein NusA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription antitermination protein NusB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription termination/antitermination protein NusG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体