6uk1

Crystal structure of nucleotide-binding domain 2 (NBD2) of the human Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 92.2 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1202–1430	突变：S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；277 K；24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0	分辨率 2.69 Å R-free 0.304
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1202–1430	突变：S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；277 K；24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0	分辨率 2.69 Å R-free 0.304
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1202–1430	突变：S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；277 K；24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0	分辨率 2.69 Å R-free 0.304
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1202–1430	突变：S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；277 K；24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0	分辨率 2.69 Å R-free 0.304

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6UK1	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1XMI Crystal structure of human F508A NBD1 domain with ATP 提交 2004-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 B 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 C 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 D 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 E 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one	突变：F508A 突变：F508A 突变：F508A 突变：F508A 突变：F508A	MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；PEG 400, glycerol, ethylene glycol, tris, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.25 Å R-free 0.265
1XMI Crystal structure of human F508A NBD1 domain with ATP 提交 2004-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 B 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 C 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 D 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one 链 E 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one	突变：F508A 突变：F508A 突变：F508A 突变：F508A 突变：F508A	MG MAGNESIUM ION × 10 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；PEG 400, glycerol, ethylene glycol, tris, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.25 Å R-free 0.265
1XMJ Crystal structure of human deltaF508 human NBD1 domain with ATP 提交 2004-10-02	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 388–678（291 aa）片段：nucleotide binding domain one	突变：deltaF508	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, glycerol, ethylene glycol, tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.287
2BBO Human NBD1 with Phe508 提交 2005-10-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–678（290 aa）片段：residues 389-678	突变：F409L, F429S, F433L, G550E, R553Q, R555K, H667R	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；280 K；30% PEG4000, 0.2M LiCl, 50mM Tris, pH 9, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 2.55 Å R-free 0.274
2BBS Human deltaF508 NBD1 with three solubilizing mutations 提交 2005-10-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–678（290 aa）片段：residues 389-678	突变：F429S, F494N, Q636R	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；280 K；39% PEG4000, 0.1M LiCl, 50mM Tris, pH 9.0, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 2.05 Å R-free 0.291
2BBS Human deltaF508 NBD1 with three solubilizing mutations 提交 2005-10-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 389–678（290 aa）片段：residues 389-678	突变：F429S, F494N, Q636R	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；280 K；39% PEG4000, 0.1M LiCl, 50mM Tris, pH 9.0, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 2.05 Å R-free 0.291
2BBT Human deltaF508 NBD1 with two solublizing mutations. 提交 2005-10-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–678（290 aa）片段：residues 389-678	突变：F504N, Q646R	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；280 K；35% PEG4000, 0.2M LiCl, 50mM Tris pH 7.5, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 2.30 Å R-free 0.295
2BBT Human deltaF508 NBD1 with two solublizing mutations. 提交 2005-10-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 389–678（290 aa）片段：residues 389-678	突变：F504N, Q646R	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；280 K；35% PEG4000, 0.2M LiCl, 50mM Tris pH 7.5, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K	分辨率 2.30 Å R-free 0.295
2LOB PDZ Domain of CAL (Cystic Fibrosis Transmembrane Regulator-Associated Ligand) 提交 2012-01-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1473–1480（8 aa）片段：PDZ-binding motif residues 1473-1480	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）1.0；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2PZE Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer 提交 2007-05-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–404（18 aa）片段：CFTR NBD1 387-646(del405-436) 链 A 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 387-646(del405-436)	突变：del405-436 突变：del405-436	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 7.5, 25% PEG 6K; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 1.70 Å R-free 0.247
2PZE Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer 提交 2007-05-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 387–404（18 aa）片段：CFTR NBD1 387-646(del405-436) 链 B 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 387-646(del405-436)	突变：del405-436 突变：del405-436	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 7.5, 25% PEG 6K; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 1.70 Å R-free 0.247
2PZF Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer with delta F508 提交 2007-05-18	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–404（18 aa）片段：CFTR NBD1 387-646 链 A 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 387-646	突变：del405-436, delF508 突变：del405-436, delF508	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Tris pH 8.5, 35% PEG 4K, 0.2M NaAcetate; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2PZF Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer with delta F508 提交 2007-05-18	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 387–404（18 aa）片段：CFTR NBD1 387-646 链 B 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 387-646	突变：del405-436, delF508 突变：del405-436, delF508	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Tris pH 8.5, 35% PEG 4K, 0.2M NaAcetate; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2PZF Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer with delta F508 提交 2007-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 387–404（18 aa）片段：CFTR NBD1 387-646 链 A 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 387-646 链 B 387–404（18 aa）片段：CFTR NBD1 387-646 链 B 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 387-646	突变：del405-436, delF508 突变：del405-436, delF508 突变：del405-436, delF508 突变：del405-436, delF508	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Tris pH 8.5, 35% PEG 4K, 0.2M NaAcetate; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2PZG Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a monomer 提交 2007-05-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–404（30 aa）片段：CFTR NBD1 375-646(del405-436) 链 A 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 375-646(del405-436)	突变：del405-436 突变：del405-436	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 6.5, 25% PEG 10K ; Cryo: 25% glycerol, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 1.80 Å R-free 0.234
2PZG Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a monomer 提交 2007-05-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 375–404（30 aa）片段：CFTR NBD1 375-646(del405-436) 链 B 437–646（210 aa）片段：CFTR NBD1 375-646(del405-436)	突变：del405-436 突变：del405-436	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；281 K；Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 6.5, 25% PEG 10K ; Cryo: 25% glycerol, vapor diffusion, temperature 281K	分辨率 1.80 Å R-free 0.234
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1193–1427（235 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1193–1427（235 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1193–1427（235 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1193–1427（235 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1193–1427（235 aa）链 B 1193–1427（235 aa）链 C 1193–1427（235 aa）链 D 1193–1427（235 aa）	突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变：Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION	分辨率 2.70 Å R-free 0.308
3ISW Crystal structure of filamin-A immunoglobulin-like repeat 21 bound to an N-terminal peptide of CFTR 提交 2009-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 5–22（18 aa）片段：UNP residues 5-22	突变：R21A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 7.0, 60% Tacsimate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.298
4WZ6 Human CFTR aa389-678 (NBD1), deltaF508 with three solubilizing mutations, bound ATP 提交 2014-11-18	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–678（290 aa）片段：UNP residues 389-678	突变：F429S, F494N, deltaF508, Q637R	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；283 K；0.2M Magnesium Chloride, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 33% PEG 4000	分辨率 2.05 Å R-free 0.239
5D2D Crystal structure of human 14-3-3 zeta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 提交 2015-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–774（28 aa）片段：UNP residues 747-774	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；HEPES, NaCl, DTT, Li2SO4, Glycine, K2HPO4	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 762–801（40 aa）片段：UNP residues 762-801	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100	分辨率 2.75 Å R-free 0.244
5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 762–801（40 aa）片段：UNP residues 762-801	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100	分辨率 2.75 Å R-free 0.244
5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 762–801（40 aa）片段：UNP residues 762-801	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100	分辨率 2.75 Å R-free 0.244
5D3F Crystal structure of human 14-3-3 zeta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 and stabilizer fusicoccin-A 提交 2015-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–774（28 aa）片段：UNP residues 747-774	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FSC FUSICOCCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；HEPES, NaCl, DTT, PEG6000	分辨率 2.74 Å R-free 0.303
5TF7 Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP 提交 2016-09-24	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.93 Å R-free 0.200
5TF8 Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dTTP 提交 2016-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer:containing 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5, Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.86 Å R-free 0.187
5TFA Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dUTP 提交 2016-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5; Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.87 Å R-free 0.195
5TFB Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with 7-methyl-GTP 提交 2016-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5 Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.87 Å R-free 0.199
5TFC Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with GTP 提交 2016-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5; Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.92 Å R-free 0.201
5TFD Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with CTP 提交 2016-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5; Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.89 Å R-free 0.195
5TFF Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with UTP 提交 2016-09-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5; Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.89 Å R-free 0.190
5TFG Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with 5-methyl-UTP 提交 2016-09-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 M5T 5-Methyluridine triphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5; Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.91 Å R-free 0.184
5TFI Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dGTP 提交 2016-09-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 10% (v/v) glycerol,10% (v/v) Ethylene glycol, 10mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5. Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.89 Å R-free 0.201
5TFJ Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dCTP 提交 2016-09-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 10% (v/v) glycerol,10% (v/v) Ethylene glycol, 10mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5. Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.85 Å R-free 0.185
5TGK Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dATP 提交 2016-09-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 387–646（260 aa）片段：Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)	突变：V470M	MG MAGNESIUM ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；279 K；Protein buffer: 150 mM NaCl, 10% (v/v) glycerol,10% (v/v) Ethylene glycol, 10mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5. Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6	分辨率 1.91 Å R-free 0.198
5UAK Dephosphorylated, ATP-free human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2016-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
6HEP Crystal structure of human 14-3-3 beta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 提交 2018-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–774（28 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；0.1M Tris, 25% v/v PEG350 MME	分辨率 1.86 Å R-free 0.251
6HEP Crystal structure of human 14-3-3 beta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 提交 2018-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 747–774（28 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；0.1M Tris, 25% v/v PEG350 MME	分辨率 1.86 Å R-free 0.251
6MSM Phosphorylated, ATP-bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2018-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6O1V Complex of human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) and GLPG1837 提交 2019-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	LJP N-(3-carbamoyl-5,5,7,7-tetramethyl-4,7-dihydro-5H-thieno[2,3-c]pyran-2-yl)-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6O2P Complex of ivacaftor with cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2019-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 AJP Digitonin × 1 VX7 N-(2,4-di-tert-butyl-5-hydroxyphenyl)-4-oxo-1,4-dihydroquinoline-3-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6RQR Extended NHERF1 PDZ2 domain in complex with the PDZ-binding motif of CFTR 提交 2019-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1477–1480（4 aa）链 B 1477–1480（4 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；1.65 M ammonium sulphate, 100 mM tri-sodium citrate pH 5.6	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
6WBS Human CFTR first nucleotide binding domain with dF508/V510D 提交 2020-03-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 388–646（259 aa）	突变：deltaF508, V510D, delta405-436	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；CFTR NBD1 V510D in buffer A was crystallized by mixing equal amounts of protein at 6 mg/mL with 0.1 M Tris pH 7.6, 28% (w/v) polyethylene glycol 10,000. Crystallization was induced by streak-seeding using crystals grown in 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) polyethylene glycol 550 monomethylether, and plates incubated at 4C. Crystals grew over several days and were frozen by quick dip in reservoir solution supplemented with 25% (w/v) ethylene glycol	分辨率 1.86 Å R-free 0.213
6WBS Human CFTR first nucleotide binding domain with dF508/V510D 提交 2020-03-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 388–646（259 aa）	突变：deltaF508, V510D, delta405-436	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；CFTR NBD1 V510D in buffer A was crystallized by mixing equal amounts of protein at 6 mg/mL with 0.1 M Tris pH 7.6, 28% (w/v) polyethylene glycol 10,000. Crystallization was induced by streak-seeding using crystals grown in 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) polyethylene glycol 550 monomethylether, and plates incubated at 4C. Crystals grew over several days and were frozen by quick dip in reservoir solution supplemented with 25% (w/v) ethylene glycol	分辨率 1.86 Å R-free 0.213
7QI1 Crystal structure of human 14-3-3 protein beta in complex with CFTR peptide pS753pS768 and PPI stabilizer CY007424 提交 2021-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 E 747–774（28 aa）链 F 747–774（28 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ARG ARGININE × 2 Q95 [2-(2-methylphenyl)sulfanylphenyl]methanamine × 2 TYR TYROSINE × 2 GLN GLUTAMINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Qiagen Cryos Suite #44 (0.09 M HEPES sodium salt pH7.5, 1.26M tri-sodium citrate, 10% (v/v) glycerol) with an extra 2% (v/v) of glycerol.	分辨率 1.76 Å R-free 0.241
7SV7 The complex of phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP/Mg and Tezacaftor (VX-661) 提交 2021-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 DD9 nonane × 2 D12 DODECANE × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 C14 TETRADECANE × 1 PJ8 heptadecane × 1 CV6 Tezacaftor × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7SVD The complex of phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP/Mg and Lumacaftor (VX-809) 提交 2021-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 D12 DODECANE × 1 D10 DECANE × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 VX8 Lumacaftor × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7SVR The complex of dephosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) and Lumacaftor (VX-809) 提交 2021-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	VX8 Lumacaftor × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EIG The complex of phosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with elexacaftor (VX-445) and ATP/Mg 提交 2022-09-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 WJX (6P)-N-(1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-sulfonyl)-6-[3-(3,3,3-trifluoro-2,2-dimethylpropoxy)-1H-pyrazol-1-yl]-2-[(4S)-2,2,4-trimethylpyrrolidin-1-yl]pyridine-3-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EIO The complex of phosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with elexacaftor (VX-445), lumacaftor (VX-809) and ATP/Mg 提交 2022-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 D12 DODECANE × 1 VX8 Lumacaftor × 1 WJX (6P)-N-(1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-sulfonyl)-6-[3-(3,3,3-trifluoro-2,2-dimethylpropoxy)-1H-pyrazol-1-yl]-2-[(4S)-2,2,4-trimethylpyrrolidin-1-yl]pyridine-3-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8EIQ The complex of phosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with Trikafta [elexacaftor (VX-445), tezacaftor (VX-661), ivacaftor (VX-770)] and ATP/Mg 提交 2022-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1370Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 D12 DODECANE × 1 VX7 N-(2,4-di-tert-butyl-5-hydroxyphenyl)-4-oxo-1,4-dihydroquinoline-3-carboxamide × 1 WJX (6P)-N-(1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-sulfonyl)-6-[3-(3,3,3-trifluoro-2,2-dimethylpropoxy)-1H-pyrazol-1-yl]-2-[(4S)-2,2,4-trimethylpyrrolidin-1-yl]pyridine-3-carboxamide × 1 CV6 Tezacaftor × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8EJ1 Dephosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2022-09-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8FZQ Dehosphorylated, ATP-bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2023-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8GLS Complex of human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) and Z1834339853 提交 2023-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ZRH (2S)-1-(3-amino-6-fluoro-1H-indazol-1-yl)-2-methyl-3-phenoxypropan-1-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8UBR Complex of the phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with CFTRinh-172 and ATP/Mg 提交 2023-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 WG5 4-[(Z)-{(3M)-4-oxo-2-sulfanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,3-thiazolidin-5-ylidene}methyl]benzoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8V7Z Phosphorylated, ATP-bound, E1371Q human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (E1371Q-CFTR) 提交 2023-12-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–1431（1421 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8V81 Phosphorylated, ATP-bound, inhibitor 172-bound E1371Q human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator 提交 2023-12-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–1440（1438 aa）	突变：E1371Q	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1 WG5 4-[(Z)-{(3M)-4-oxo-2-sulfanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,3-thiazolidin-5-ylidene}methyl]benzoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9DW4 Dephosphorylated CFTR in 1:1 complex with PKA-C (site II) 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
9DW5 Dephosphorylated CFTR in 1:1 complex with PKA-C (site I) 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9DW7 Dephosphorylated CFTR in 1:2 complex with PKA-C 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1480（1480 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
9DW8 Dephosphorylated (E1371Q)CFTR in complex with PKA-C 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9DW9 Phosphorylated (E1371Q)CFTR in complex with PKA-C 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CLR CHOLESTEROL × 1 D10 DECANE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CL CHLORIDE ION × 4 UND UNDECANE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9MXL Complex of the phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with (R)-BPO-27 and ATP/Mg 提交 2025-01-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–1480（1480 aa）	突变：E1371Q	A1BUJ (6R,12R)-6-(5-bromofuran-2-yl)-7,9-dimethyl-8,10-dioxo-11-phenyl-7,8,9,10-tetrahydro-6H-pyrimido[4',5':3,4]pyrrolo[2,1-c][1,4]benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	CFTR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–229； UniProt 1202–1430 作者链 B； PDB构建体 1–229； UniProt 1202–1430 作者链 C； PDB构建体 1–229； UniProt 1202–1430 作者链 D； PDB构建体 1–229； UniProt 1202–1430

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6uk1
沉积日期 deposition_date	2019-10-03
结构标题 title	Crystal structure of nucleotide-binding domain 2 (NBD2) of the human Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR)
关键词 keywords	NBD2, CFTR, ABC transport, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.48 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	29.35 Å
零角强度 I(0) i0	166515000.00
分子量 molecular_weight	101820.0 kDa
排除体积 excluded_volume	127370 Å³
包络体积 envelope_volume	160650 Å³
水化壳体积 shell_volume	44276 Å³
包络直径 envelope_diameter	93.4 Å
壳层 Rg shell_rg	37.76 Å
包络 Rg envelope_rg	29.06 Å
形状 Rg shape_rg	29.42 Å
总 Rg total_rg	29.92 Å
总原子数 total_atoms	7149
残基数 n_residues	912
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	92.2 Å
Rg (实空间) rg_real	30.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.41 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.6650e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0720e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.36 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	166500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9053
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	39.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.099
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.531
角度范围 angular_range	— – 0.2600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	29510000.0000
实空间数据点数 n_real_points	53
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.946; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.947

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator
分子量 formula_weight	25552.3 kDa
EC 编号 ec_number	5.6.1.6
突变 mutation	S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	7231

DIWPSGGQMTVKDLTAKYTEGGNAILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLLAFLRLLNTEGEIQIDGVSWDSITLEQWRKAFGVIPQDVFIFSGTFRKNLDPNEQWSDQEIWKVADEVGLRSVIEQFPGGLDFVLVDGGCVLSHGHKQLMCLARAVLSKAKILLLDEPSAHLDPVTYQIIRRTLKQAFADCTVILCEARIEAMLECDQFLVIEENKVRQYDSIQKL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	74

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d6uk1a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6uk1b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6uk1c_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6uk1d_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6uk1A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6uk1B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6uk1C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6uk1D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	95.063 Å
晶胞边长 b length_b	60.132 Å
晶胞边长 c length_c	105.160 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.57 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.693 Å
最低分辨率 resolution_low	64.414 Å
R 因子 r_factor	0.2749
R_work r_work	0.2734
R_free r_free	0.3036

fit	/app/data/saxs_computation/uk/6uk1/6uk1.fit
pddf	/app/data/pr_computation/uk/6uk1/6uk1.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/uk/6uk1/6uk1.dat