6ur8

CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with varenicline

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimera of soluble cytochrome b562 (BRIL) and neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4

Homo sapiens

UniProt P0ABE7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 5 Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2 × 3 (P17787) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 VARENICLINE × 2 beta-D-mannopyranose × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C562_ECOLX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 343–443; UniProt 23–123 作者链 D; PDB构建体 343–443; UniProt 23–123

Chimera of soluble cytochrome b562 (BRIL) and neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4

Homo sapiens

UniProt P43681

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 5 Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2 × 3 (P17787) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 VARENICLINE × 2 beta-D-mannopyranose × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHA4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–338; UniProt 27–364 作者链 A; PDB构建体 449–487; UniProt 589–627 作者链 D; PDB构建体 1–338; UniProt 27–364 作者链 D; PDB构建体 449–487; UniProt 589–627

Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2

Homo sapiens

UniProt P17787

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 5 Chimera of soluble cytochrome b562 (BRIL) and neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4 × 2 (P0ABE7,P43681) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 VARENICLINE × 2 beta-D-mannopyranose × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–326; UniProt 26–351 作者链 B; PDB构建体 327–387; UniProt 442–502 作者链 C; PDB构建体 1–326; UniProt 26–351 作者链 C; PDB构建体 327–387; UniProt 442–502 作者链 E; PDB构建体 1–326; UniProt 26–351 作者链 E; PDB构建体 327–387; UniProt 442–502

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ur8
沉积日期 deposition_date2019-10-22
结构标题 titleCryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with varenicline
关键词 keywordsacetylcholine receptor, nicotine, varenicline, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ur8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ur8__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ur8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)42.44 Å
Rg(电子密度)41.82 Å
总 Rg42.05 Å
原子数14880
残基数1798
排除体积270390 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6ur8__assembly_1__model_1 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id6ur8A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain
结构域编号 domain_id6ur8B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain
结构域编号 domain_id6ur8C01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain
结构域编号 domain_id6ur8D01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain
结构域编号 domain_id6ur8E01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain
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7. 引用文献 (1)