6uxp

Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylglycerol

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 99.5 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bcl-2 homologous antagonist/killer

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 68–148 链 B； UniProt 68–148	片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.247
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 68–148 链 D； UniProt 68–148	片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 3 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.247
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 68–148 链 F； UniProt 68–148	片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.247
4	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 68–148 链 H； UniProt 68–148	片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.247

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6UXP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BXL STRUCTURE OF BCL-XL/BAK PEPTIDE COMPLEX, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 72–87（16 aa）片段：RESIDUES 572 - 587 OF BAK PROTEIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 303 K	分辨率未提供
2IMS The X-ray Structure of a Bak Homodimer Reveals an Inhibitory Zinc Binding Site 提交 2006-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 16–186（171 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 3350 15-30% and 1-50 mM zinc acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.48 Å R-free 0.204
2IMT The X-ray Structure of a Bak Homodimer Reveals an Inhibitory Zinc Binding Site 提交 2006-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 16–186（171 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 3350 15-30% and 0.2 M ammonium fluoride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.49 Å R-free 0.220
2IMT The X-ray Structure of a Bak Homodimer Reveals an Inhibitory Zinc Binding Site 提交 2006-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 16–186（171 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 3350 15-30% and 0.2 M ammonium fluoride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.49 Å R-free 0.220
2JCN The crystal structure of BAK1 - a mitochondrial apoptosis regulator 提交 2006-12-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–190（170 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；22% PEG3350, 20% GLYCEROL, 0.2M SODIUM SULPHATE, 2MM TCEP, 0.3M NACL, 20 MM HEPES PH7.5, pH 7.50	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
2LP8 SOLUTION STRUCTURE OF AN APOPTOSIS ACTIVATING PHOTOSWITCHABLE BAK PEPTIDE BOUND to BCL-XL 提交 2012-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 72–87（16 aa）片段：BH3 domain residues 72-87	突变：Q73C, Q77A, I80A, I81F, D84C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	33B 3,3'-(E)-diazene-1,2-diylbis{6-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL- XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 5 MM 2- MERCAPTOETHANOL, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL- XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL-XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 100% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2M5B The NMR structure of the BID-BAK complex 提交 2013-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–186（169 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 ~0.5 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] human cBAK, ~0.5 mM human BID BH3 SAHB, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2XPX Crystal structure of BHRF1:Bak BH3 complex 提交 2010-08-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92	未记录	NO3 NITRATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.4；1.6 M NANO3, 50 MM MALIC ACID PH 4.4	分辨率 2.05 Å R-free 0.217
2YV6 Crystal structure of human Bcl-2 family protein Bak 提交 2007-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–185（163 aa）片段：residues 23-185	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；ammonium sulfate, iso-propanol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
3I1H Crystal structure of human BFL-1 in complex with BAK BH3 peptide 提交 2009-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 72–87（16 aa）片段：BH3	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；1.5 M sodium malonate, pH 5.8 protein 1.67 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
3QBR BakBH3 in complex with sjA 提交 2011-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 63–96（34 aa）片段：BH3 (UNP RESIDUES 63-96)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；1M tri-sodium citrate, 0.1M CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.234
3QBR BakBH3 in complex with sjA 提交 2011-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 63–96（34 aa）片段：BH3 (UNP RESIDUES 63-96)	未记录	NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；1M tri-sodium citrate, 0.1M CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.234
4D2L Vaccinia Virus F1L bound to Bak BH3 提交 2014-05-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 67–91（25 aa）片段：RESIDUES 67-91	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.18 M AMMONIUM SULFATE AND 2.25 M LICL., pH 7.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.228
4U2U Bak domain swapped dimer induced by BidBH3 with CHAPS 提交 2014-07-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186 链 B 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S 突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；26.7% PEG 3350, 0.05 M sodium acetate	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
4U2V Bak BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2014-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 68–148（81 aa）片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148 链 C 68–148（81 aa）片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CAC CACODYLATE ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；4.5% PEG 8000, 40% MPD, 100 mM tri-sodium citrate, 90 mM cacodylate acid pH 6.5 and 1% Octyl glucoside	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
4U2V Bak BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2014-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 68–148（81 aa）片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148 链 D 68–148（81 aa）片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CAC CACODYLATE ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；4.5% PEG 8000, 40% MPD, 100 mM tri-sodium citrate, 90 mM cacodylate acid pH 6.5 and 1% Octyl glucoside	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
4UF1 Deerpox virus DPV022 in complex with Bak BH3 提交 2014-12-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 67–92（26 aa）片段：BH3, UNP RESIDUES 67-92	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；17% PEG 8000, 0.2M MES PH 5.5, 0.2M AMMONIUM SULPHATE	分辨率 2.30 Å R-free 0.206
5AJK Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bak BH3 domain 提交 2015-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92 链 D 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；1.7 M MGSO4, 0.1 M NA-ACETATE PH 5.2	分辨率 2.55 Å R-free 0.240
5AJK Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bak BH3 domain 提交 2015-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92 链 L 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92	未记录	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；1.7 M MGSO4, 0.1 M NA-ACETATE PH 5.2	分辨率 2.55 Å R-free 0.240
5AJK Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bak BH3 domain 提交 2015-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92 链 J 67–92（26 aa）片段：RESIDUES 67-92	未记录	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；1.7 M MGSO4, 0.1 M NA-ACETATE PH 5.2	分辨率 2.55 Å R-free 0.240
5FMI Human Bak Q77L 提交 2015-11-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–184（162 aa）片段：UNP RESIDUES 23-184	突变：YES	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；10% PEG 3350, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.5, 20 MM ZINC ACETATE	分辨率 1.49 Å R-free 0.211
5FMK Bcl-xL with Bak BH3 complex 提交 2015-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 63–96（34 aa）片段：BH3 DOMAIN, UNP RESIDUES 63-96	未记录	GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.16M CALCIUM ACETATE, 0.08M SODIUM CACODYLATE, PH6.5, 20% GLYCEROL, 14.4% PEG 8000	分辨率 1.73 Å R-free 0.186
5VWV Bak core latch dimer in complex with Bim-BH3 - Cubic 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S	TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；18 % glycerol, 21.6 % PEG (poly-ethylene glycol) 1500 and 0.5 % ethyl acetate	分辨率 1.90 Å R-free 0.177
5VWV Bak core latch dimer in complex with Bim-BH3 - Cubic 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S	TFA trifluoroacetic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；18 % glycerol, 21.6 % PEG (poly-ethylene glycol) 1500 and 0.5 % ethyl acetate	分辨率 1.90 Å R-free 0.177
5VWW Bak core latch dimer in complex with Bim-RT - Tetragonal 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186 链 B 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S 突变：C166S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 BR BROMIDE ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；12.5 % MPD (2-methyl-2,4-pentanediol), 38 mM imidazole pH 6.5, 12.5 % PEG 1000, 12.5 % PEG 3350, 30 mM sodium fluoride, 30 mM sodium iodide, 62 mM sodium MES pH 6.5 and 30 mM sodium bromide	分辨率 2.80 Å R-free 0.281
5VWX Bak core latch dimer in complex with Bim-h0-h3Glt 提交 2017-05-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186 链 C 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；281 K；200 mM calcium acetate, 30 % PEG 400 and 100 mM sodium acetate-acetic acid pH 5.0	分辨率 2.49 Å R-free 0.305
5VWY Bak core latch dimer in complex with Bim-h3Pc-RT 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；15.8 % PEG 8000, 50 mM potassium dihydrogen phosphate, and 22.7 % glycerol	分辨率 1.55 Å R-free 0.216
5VWZ Bak in complex with Bim-h3Pc 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186 链 C 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S 突变：C166S	1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2 NH4 AMMONIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；10 % PEG 20000, 20 % PEG MME 550, 38 mM Imidazole pH 6.5, 20 mM ammonium acetate, 20 mM potassium sodium tartrate, 20 mM sodium formate, 62 mM sodium MES pH 6.5, 20 mM trisodium citrate, and 20 mM sodium oxamate	分辨率 1.62 Å R-free 0.191
5VX0 Bak in complex with Bim-h3Glg 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186 链 C 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：C166S 突变：C166S	MG MAGNESIUM ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；200 mM magnesium chloride, 25 % PEG 3350, and 100 mM bis-tris chloride (pH 6.5)	分辨率 1.60 Å R-free 0.200
5VX1 Bak L100A 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186 链 B 23–186（164 aa）片段：UNP residues 23-186	突变：L100A, C166S 突变：L100A, C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；1M sodium malonate-malonic acid pH 7.0 and 10 % DL-malate-MES-tris pH 9	分辨率 1.22 Å R-free 0.193
6ODH BH3 domain swapped dimer of a BAK fragment 提交 2019-03-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 71–147（77 aa）片段：residues 71-147 链 B 71–147（77 aa）片段：residues 71-147	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；12% PEG 3350 and 100 mM ammonium sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
6ODH BH3 domain swapped dimer of a BAK fragment 提交 2019-03-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 71–147（77 aa）片段：residues 71-147 链 D 71–147（77 aa）片段：residues 71-147	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；12% PEG 3350 and 100 mM ammonium sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
6ODH BH3 domain swapped dimer of a BAK fragment 提交 2019-03-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 71–147（77 aa）片段：residues 71-147 链 F 71–147（77 aa）片段：residues 71-147	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；12% PEG 3350 and 100 mM ammonium sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
6UXM Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with E. coli lipid 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 B 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, PEG 10000, sodium acetate, bis-tris chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.237
6UXM Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with E. coli lipid 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 D 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, PEG 10000, sodium acetate, bis-tris chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.237
6UXM Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with E. coli lipid 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 F 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, PEG 10000, sodium acetate, bis-tris chloride	分辨率 2.49 Å R-free 0.237
6UXN Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine 提交 2019-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 68–148（81 aa）链 B 68–148（81 aa）	未记录	8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulphate	分辨率 2.49 Å R-free 0.253
6UXN Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine 提交 2019-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 68–148（81 aa）链 D 68–148（81 aa）	未记录	8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulphate	分辨率 2.49 Å R-free 0.253
6UXN Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine 提交 2019-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 68–148（81 aa）链 F 68–148（81 aa）	未记录	8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulphate	分辨率 2.49 Å R-free 0.253
6UXN Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine 提交 2019-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 68–148（81 aa）链 H 68–148（81 aa）	未记录	8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulphate	分辨率 2.49 Å R-free 0.253
6UXN Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine 提交 2019-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 68–148（81 aa）链 J 68–148（81 aa）	未记录	8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulphate	分辨率 2.49 Å R-free 0.253
6UXN Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine 提交 2019-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 68–148（81 aa）链 L 68–148（81 aa）	未记录	8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium sulphate	分辨率 2.49 Å R-free 0.253
6UXO Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 B 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 3 SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
6UXO Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 D 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 7 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
6UXO Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 F 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 5 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
6UXO Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 H 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 7 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
6UXO Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 J 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
6UXO Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 L 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 3 SO4 SULFATE ION × 4 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
6UXQ Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with POPC and C8E4 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 B 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, trisodium citrate, tetraethylene glycol monooctyl ether, 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-3-phosphocholine	分辨率 1.70 Å R-free 0.214
6UXQ Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with POPC and C8E4 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 D 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, trisodium citrate, tetraethylene glycol monooctyl ether, 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-3-phosphocholine	分辨率 1.70 Å R-free 0.214
6UXR Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with LysoPC 提交 2019-11-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148 链 B 68–148（81 aa）片段：Core/dimerisation domain, residues 68-148	未记录	K6G [(2~{R})-2-oxidanyl-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] hexadecanoate × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；calcium chloride, PEG 3350, sodium acetate, sodium HEPES	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
7K02 The crystal structure of a BAK dimer activated by detergent 提交 2020-09-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 67–186（120 aa）链 B 67–186（120 aa）	突变：C166S 突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；50% (v/v) methane pentane diol (MPD) and 0.1 M imidazole pH 7.0	分辨率 3.40 Å R-free 0.343
7K02 The crystal structure of a BAK dimer activated by detergent 提交 2020-09-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 67–186（120 aa）链 D 67–186（120 aa）	突变：C166S 突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；50% (v/v) methane pentane diol (MPD) and 0.1 M imidazole pH 7.0	分辨率 3.40 Å R-free 0.343
7K02 The crystal structure of a BAK dimer activated by detergent 提交 2020-09-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 67–186（120 aa）链 F 67–186（120 aa）	突变：C166S 突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；50% (v/v) methane pentane diol (MPD) and 0.1 M imidazole pH 7.0	分辨率 3.40 Å R-free 0.343
7LK4 Crystal structure of BAK L100A in complex with activating antibody fragments 提交 2021-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 P 23–186（164 aa）链 R 23–186（164 aa）	突变：L100A, C166S 突变：L100A, C166S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；38.9 % 2-methyl-2,4-pentanediol, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.44, 4 % Polyethylene glycol 8000	分辨率 3.10 Å R-free 0.262
7LK4 Crystal structure of BAK L100A in complex with activating antibody fragments 提交 2021-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Q 23–186（164 aa）链 S 23–186（164 aa）	突变：L100A, C166S 突变：L100A, C166S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；38.9 % 2-methyl-2,4-pentanediol, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.44, 4 % Polyethylene glycol 8000	分辨率 3.10 Å R-free 0.262
7M5A Crystal Structure of human BAK in complex with W3W5_BID 提交 2021-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–186（166 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；0.2 M Potassium Sodium tartrate, 20% PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.219
7M5B Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID 提交 2021-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–186（166 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5	分辨率 1.85 Å R-free 0.205
7M5B Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID 提交 2021-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–186（166 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5	分辨率 1.85 Å R-free 0.205
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–186（166 aa）链 B 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 21–186（166 aa）链 T 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–186（166 aa）链 D 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 21–186（166 aa）链 F 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 21–186（166 aa）链 H 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 21–186（166 aa）链 J 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 21–186（166 aa）链 L 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 21–186（166 aa）链 N 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 21–186（166 aa）链 P 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7M5C Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide 提交 2021-03-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 21–186（166 aa）链 R 68–89（22 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.06 Å R-free 0.249
7OFM NMR structure of the Bak transmembrane helix in DPC micelles 提交 2021-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 183–211（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 400 uM [U-13C; U-15N; U-2H] Bak-TMH, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM EDTA, 5 mM DTT, 300 mM DPC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
7OFO NMR structure of the Bak transmembrane helix in lipid nanodiscs 提交 2021-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 183–211（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；315 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 400 uM [U-13C; U-15N; U-2H] Bak transmembrane helix, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
8CZF Human BAK in complex with the dF2 peptide 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–186（164 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.2 M sodium malonate	分辨率 1.30 Å R-free 0.180
8CZG Human BAK in complex with the dF3 peptide 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–186（164 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate	分辨率 1.99 Å R-free 0.267
8CZG Human BAK in complex with the dF3 peptide 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–186（164 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate	分辨率 1.99 Å R-free 0.267
8CZG Human BAK in complex with the dF3 peptide 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 23–186（164 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate	分辨率 1.99 Å R-free 0.267
8CZG Human BAK in complex with the dF3 peptide 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–186（164 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate	分辨率 1.99 Å R-free 0.267
8CZH Human BAK in complex with the dM2 peptide 提交 2022-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–186（164 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；3.5 M sodium formate	分辨率 1.30 Å R-free 0.201
8GSV Crystal structure of human BAK in complex with the Pxt1 BH3 domain 提交 2022-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 23–185（163 aa）链 C 23–185（163 aa）链 E 23–185（163 aa）链 G 23–185（163 aa）链 I 23–185（163 aa）链 K 23–185（163 aa）链 M 23–185（163 aa）链 O 23–185（163 aa）链 Q 23–185（163 aa）链 S 23–185（163 aa）链 U 23–185（163 aa）链 W 23–185（163 aa）	突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S 突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium citrate(pH 4.8) and 17 % PEG 3000	分辨率 2.20 Å R-free 0.266
8IGC Crystal structure of Bak bound to Bnip5 BH3 提交 2023-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–183（161 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.7 M sodium citrate tribasic dehydrate and 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5)	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
8IVB K113-Ubiquitinated BAK 提交 2023-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 18–186（169 aa）	突变：K113C	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 20 mM sodium phosphate, 0.1 M sodium chloride, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
8SRX Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with lysoPC 提交 2023-05-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–146（79 aa）链 C 68–146（79 aa）	未记录	K6G [(2~{R})-2-oxidanyl-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] hexadecanoate × 3 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；0.1 M Bis-tris chloride pH 5.5, 25% PEG 3350, 200 mM sodium acetate	分辨率 2.09 Å R-free 0.265
8SRY Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with C12E8 提交 2023-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 68–146（79 aa）链 C 68–146（79 aa）	未记录	PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 N8E 3,6,9,12,15-PENTAOXATRICOSAN-1-OL × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；30% PEG MME 2000, 0.1 M potassium thiocyanate, 0.01% C12E8	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
8UKY Crystal structure of BAK in complex with inhibiting antibody 14G6 提交 2023-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 23–186（164 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 CCN ACETONITRILE × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09 M Bis-Tris chloride, pH 5.5, 22.5% PEG3350, 4% acetonitrile	分辨率 2.40 Å R-free 0.252
8UKY Crystal structure of BAK in complex with inhibiting antibody 14G6 提交 2023-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 23–186（164 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09 M Bis-Tris chloride, pH 5.5, 22.5% PEG3350, 4% acetonitrile	分辨率 2.40 Å R-free 0.252
8Y1Y Crystal structure of the Mcl-1 in complex with a long BH3 peptide of BAK 提交 2024-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 72–92（21 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.01M Nickel (II) Chloride, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 20% polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 2.01 Å R-free 0.252
8Y1Z Crystal structure of the Mcl-1 in complex with a Short BH3 peptide of BAK 提交 2024-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 72–87（16 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M Lithium Acetate, 18-25% polyethylene glycol 3350	分辨率 1.91 Å R-free 0.235
9CLB Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK 提交 2024-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 86–186（101 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350	分辨率 2.86 Å R-free 0.270
9CLB Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK 提交 2024-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 86–186（101 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350	分辨率 2.86 Å R-free 0.270
9CLB Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK 提交 2024-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 86–186（101 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350	分辨率 2.86 Å R-free 0.270
9CLB Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK 提交 2024-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 86–186（101 aa）	突变：C166S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350	分辨率 2.86 Å R-free 0.270
9CPE Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–186（167 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, 0.1M HEPES pH 7.5	分辨率 1.49 Å R-free 0.212
9CPF Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
9CPF Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
9CPF Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
9CPF Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
9CPH Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 69–89（21 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9CPN Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.243
9CPN Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.243
9CPN Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.243
9CPN Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 68–89（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.243

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	BAK_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 B； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 C； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 D； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 E； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 F； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 G； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148 作者链 H； PDB构建体 5–85； UniProt 68–148

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6uxp
沉积日期 deposition_date	2019-11-07
结构标题 title	Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylglycerol
关键词 keywords	Pore-forming Protein, APOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.40 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	29.35 Å
零角强度 I(0) i0	84255000.00
分子量 molecular_weight	73391.0 kDa
排除体积 excluded_volume	92292 Å³
包络体积 envelope_volume	116490 Å³
水化壳体积 shell_volume	34002 Å³
包络直径 envelope_diameter	103.5 Å
壳层 Rg shell_rg	35.70 Å
包络 Rg envelope_rg	29.12 Å
形状 Rg shape_rg	29.32 Å
总 Rg total_rg	30.03 Å
总原子数 total_atoms	5185
残基数 n_residues	626
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	99.5 Å
Rg (实空间) rg_real	30.49 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.81 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.4260e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3660e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	84250000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8568
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	34.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.447
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.299
角度范围 angular_range	— – 0.2600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6994000.0000
实空间数据点数 n_real_points	53
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.766; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.850

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Bcl-2 homologous antagonist/killer
分子量 formula_weight	9500.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	5216

GPLGSSTMGQVGRQLAIIGDDINRRYDSEFQTMLQHLQPTAENAYEYFTKIATSLFESGINWGRVVALLGFGYRLALHVYQHGLT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL)
分子量 formula_weight	497.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	31

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6uxpA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpG01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6uxpH01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	50.161 Å
晶胞边长 b length_b	51.567 Å
晶胞边长 c length_c	61.472 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	83.86 °
晶胞夹角 β angle_beta	86.13 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	87.94 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.492 Å
最低分辨率 resolution_low	37.355 Å
R 因子 r_factor	0.1951
R_work r_work	0.1897
R_free r_free	0.2473

fit	/app/data/saxs_computation/ux/6uxp/6uxp.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ux/6uxp/6uxp.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ux/6uxp/6uxp.dat