6vog

Chloroplast ATP synthase (O2, CF1)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit alpha, chloroplastic

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP synthase subunit beta, chloroplastic × 3 （P00825） ATP synthase delta chain, chloroplastic × 1 （P11402） ATP synthase gamma chain, chloroplastic × 1 （P05435） ATP synthase epsilon chain, chloroplastic × 1 （P00833） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPA_SPIOL
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507 作者链 B； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507 作者链 C； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507

ATP synthase subunit beta, chloroplastic

物种未注明

UniProt P00825

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP synthase subunit alpha, chloroplastic × 3 （P06450） ATP synthase delta chain, chloroplastic × 1 （P11402） ATP synthase gamma chain, chloroplastic × 1 （P05435） ATP synthase epsilon chain, chloroplastic × 1 （P00833） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPB_SPIOL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–498； UniProt 1–498 作者链 E； PDB构建体 1–498； UniProt 1–498 作者链 F； PDB构建体 1–498； UniProt 1–498

ATP synthase delta chain, chloroplastic

物种未注明

UniProt P11402

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP synthase subunit alpha, chloroplastic × 3 （P06450） ATP synthase subunit beta, chloroplastic × 3 （P00825） ATP synthase gamma chain, chloroplastic × 1 （P05435） ATP synthase epsilon chain, chloroplastic × 1 （P00833） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPD_SPIOL
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–257； UniProt 1–257

ATP synthase gamma chain, chloroplastic

物种未注明

UniProt P05435

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP synthase subunit alpha, chloroplastic × 3 （P06450） ATP synthase subunit beta, chloroplastic × 3 （P00825） ATP synthase delta chain, chloroplastic × 1 （P11402） ATP synthase epsilon chain, chloroplastic × 1 （P00833） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPG_SPIOL
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364

ATP synthase epsilon chain, chloroplastic

物种未注明

UniProt P00833

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	ATP synthase subunit alpha, chloroplastic × 3 （P06450） ATP synthase subunit beta, chloroplastic × 3 （P00825） ATP synthase delta chain, chloroplastic × 1 （P11402） ATP synthase gamma chain, chloroplastic × 1 （P05435） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPE_SPIOL
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6vog
沉积日期 deposition_date	2020-01-30
结构标题 title	Chloroplast ATP synthase (O2, CF1)
关键词 keywords	CF1FO, ATP synthase, PHOTOSYNTHESIS, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE, PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6vog__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6vog__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6vog__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.77 Å
Rg（电子密度）	45.24 Å
总 Rg	45.54 Å
原子数	27137
残基数	3562
排除体积	484670 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6vog__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP synthase subunit alpha, chloroplastic
分子量 formula_weight	55505.2 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.2.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	27137

MATIRADEISKIIRERIEGYNREVKVVNTGTVLQVGDGIARIHGLDEVMAGELVEFEEGTIGIALNLESNNVGVVLMGDGLMIQEGSSVKATGRIAQIPVSEAYLGRVINALAKPIDGRGEITASESRLIESPAPGIMSRRSVYEPLQTGLIAIDAMIPVGRGQRELIIGDRQTGKTAVATDTILNQQGQNVICVYVAIGQKASSVAQVVTNFQERGAMEYTIVVAETADSPATLQYLAPYTGAALAEYFMYRERHTLIIYDDLSKQAQAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSSLLGEGSMTALPIVETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLSADLFNAGIRPAINVGISVSRVGSAAQIKAMKKVAGKLKLELAQFAELEAFAQFASDLDKATQNQLARGQRLRELLKQPQSAPLTVEEQVMTIYTGTNGYLDSLELDQVRKYLVELRTYVKTNKPEFQEIISSTKTFTEEAEALLKEAIQEQMERFLLQEQA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP synthase subunit beta, chloroplastic
分子量 formula_weight	53797.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.2.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MRINPTTSDPGVSTLEKKNLGRIAQIIGPVLDVAFPPGKMPNIYNALIVKGRDTAGQPMNVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLTRGMEVIDTGAPLSVPVGGATLGRIFNVLGEPVDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFTQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFGGVGERTREGNDLYMEMKESGVINEQNIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLSTEMGSLQERITSTKEGSITSIQAVYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRGLAAKGIYPAVDPLDSTSTMLQPRIVGEEHYEIAQRVKETLQRYKELQDIIAILGLDELSEEDRLTVARARKIERFLSQPFFVAEVFTGSPGKYVGLAETIRGFQLILSGELDSLPEQAFYLVGNIDEATAKAMNLEMESKLKK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP synthase delta chain, chloroplastic
分子量 formula_weight	27708.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MAALQNPVALQSRTTTAVAALSTSSTTSTPKPFSLSFSSSTATFNPLRLKILTASKLTAKPRGGALGTRMVDSTASRYASALADVADVTGTLEATNSDVEKLIRIFSEEPVYYFFANPVISIDNKRSVLDEIITTSGLQPHTANFINILIDSERINLVKEILNEFEDVFNKITGTEVAVVTSVVKLENDHLAQIAKGVQKITGAKNVRIKTVIDPSLVAGFTIRYGNEGSKLVDMSVKKQLEEIAAQLEMDDVTLAV

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP synthase gamma chain, chloroplastic
分子量 formula_weight	40119.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

MACSLSFSSSVSTFHLPTTTQSTQAPPNNATTLPTTNPIQCANLRELRDRIGSVKNTQKITEAMKLVAAAKVRRAQEAVVNGRPFSETLVEVLYNMNEQLQTEDVDVPLTKIRTVKKVALMVVTGDRGLCGGFNNMLLKKAESRIAELKKLGVDYTIISIGKKGNTYFIRRPEIPVDRYFDGTNLPTAKEAQAIADDVFSLFVSEEVDKVEMLYTKFVSLVKSDPVIHTLLPLSPKGEICDINGKCVDAAEDELFRLTTKEGKLTVERDMIKTETPAFSPILEFEQDPAQILDALLPLYLNSQILRALQESLASELAARMTAMSNATDNANELKKTLSINYNRARQAKITGEILEIVAGANACV

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP synthase epsilon chain, chloroplastic
分子量 formula_weight	14715.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MTLNLCVLTPNRSIWNSEVKEIILSTNSGQIGVLPNHAPTATAVDIGILRIRLNDQWLTLALMGGFARIGNNEITILVNDAERGSDIDPQEAQQTLEIAEANLRKAEGKRQKIEANLALRRARTRVEASNTISS

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	4.35 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	114542

Chloroplast ATP synthase (O2, CF1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit alpha, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase subunit beta, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase delta chain, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase gamma chain, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase epsilon chain, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6vog__assembly_1__model_1

6vog__assembly_1__model_1 | I(q)

6vog__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Chloroplast ATP synthase (O2, CF1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit alpha, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit beta, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase delta chain, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase gamma chain, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase epsilon chain, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6vog__assembly_1__model_1

6vog__assembly_1__model_1 | I(q)

6vog__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)