6w7w

30S-Inactive-low-Mg2+ Class B

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S4

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS4_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206

30S ribosomal protein S5

物种未注明

UniProt P0A7W1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS5_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167

30S ribosomal protein S6

物种未注明

UniProt P02358

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS6_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

30S ribosomal protein S8

物种未注明

UniProt P0A7W7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS8_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

30S ribosomal protein S12

物种未注明

UniProt P0A7S3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS12_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

30S ribosomal protein S15

物种未注明

UniProt A0A4S5B232

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4S5B232_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

30S ribosomal protein S16

物种未注明

UniProt P0A7T3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS16_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

30S ribosomal protein S17

物种未注明

UniProt P0AG63

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S20 × 1 （P0A7U7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS17_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

30S ribosomal protein S20

物种未注明

UniProt P0A7U7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （P0A7V8） 30S ribosomal protein S5 × 1 （P0A7W1） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （P0A7W7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （P0A7S3） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A4S5B232） 30S ribosomal protein S16 × 1 （P0A7T3） 30S ribosomal protein S17 × 1 （P0AG63）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS20_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6w7w
沉积日期 deposition_date	2020-03-19
结构标题 title	30S-Inactive-low-Mg2+ Class B
关键词 keywords	30S subunit, conformations, inactive, activated, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6w7w__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6w7w__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6w7w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.85 Å
Rg（电子密度）	52.98 Å
总 Rg	53.07 Å
原子数	26883
残基数	1918
排除体积	409460 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6w7w__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16S rRNA
分子量 formula_weight	499690.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	2
原子数 atom_count	26883

AAAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAAGCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUGACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S4
分子量 formula_weight	23514.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAARLKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALELAEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S5
分子量 formula_weight	17629.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAHIEKQAGELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGTLQHPVKGVHTGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRGKSVEEILGK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	15727.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRFNDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEAGDSEEEEEE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S8
分子量 formula_weight	14146.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSMQDPIADMLTRIRNGQAANKAAVTMPSSKLKVAIANVLKEEGFIEDFKVEGDTKPELELTLKYFQGKAVVESIQRVSRPGLRIYKRKDELPKVMAGLGIAVVSTSKGVMTDRAARQAGLGGEIICYVA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	13768.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MATVNQLVRKPRARKVAKSNVPALEACPQKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVILIRGGRVKDLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	10319.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTRLIERLGLRR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S16
分子量 formula_weight	9207.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNKAA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	9724.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MTDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVEKAVL

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S20
分子量 formula_weight	9708.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTAQINKLA

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6w7wC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1050 — Ribosomal Protein S4 Delta 41; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S4/S9, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6w7wC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	290 — Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA-binding S4 domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	236327

30S-Inactive-low-Mg2+ Class B

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6w7w__assembly_1__model_1

6w7w__assembly_1__model_1 | I(q)

6w7w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment