6wgt

Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 CHOLESTEROL × 2 OLEIC ACID × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 OLEIC ACID × 1 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PHOSPHATE ION × 1 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C562_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 227–332； UniProt 23–128 作者链 B； PDB构建体 227–332； UniProt 23–128 作者链 C； PDB构建体 227–332； UniProt 23–128

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion

Homo sapiens

UniProt P28223

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 CHOLESTEROL × 2 OLEIC ACID × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 OLEIC ACID × 1 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PHOSPHATE ION × 1 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	5HT2A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 27–226； UniProt 66–265 作者链 A； PDB构建体 333–427； UniProt 311–405 作者链 B； PDB构建体 27–226； UniProt 66–265 作者链 B； PDB构建体 333–427； UniProt 311–405 作者链 C； PDB构建体 27–226； UniProt 66–265 作者链 C； PDB构建体 333–427； UniProt 311–405

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6wgt
沉积日期 deposition_date	2020-04-06
结构标题 title	Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist
关键词 keywords	HTR2A, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6wgt__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6wgt__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6wgt__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.95 Å
Rg（电子密度）	27.49 Å
总 Rg	27.83 Å
原子数	2745
残基数	376
排除体积	49440 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6wgt__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6wgt__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6wgt__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion
分子量 formula_weight	50534.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	8100

MKTIIALSYIFCLVFADYKDDDDGAPLSLLHLQEKNWSALLTAVVIILTIAGNILVIMAVSLEKKLQNATNYFLMSLAIADMLLGFLVMPVSMLTILYGYRWPLPSKLCAVWIYLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIQNPIHHSRFNSRTKAFLKIIAVWTISVGISMPIPVFGLQDDSKVFKEGSCLLADDNFVLIGSFVSFFIPATIMVITYFLTIKSLQKEAADLEDNWETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQAAAEQLKTTRNAYIQKYLTMQSISNEQKACKVLGIVFFLFVVMWCPFFITNIMAVICKESCNEDVIGALLNVFVWIGYASSAVNPLVYTLFNKTYRSAFSRYIQCQYKENKKPGRPLEVLFQGPHHHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	(8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide
分子量 formula_weight	323.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	OLEIC ACID
分子量 formula_weight	282.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PENTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	81.640 Å
晶胞边长 b length_b	175.260 Å
晶胞边长 c length_c	280.670 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	34.540 Å
R 因子 r_factor	0.2669
R_work r_work	0.2648
R_free r_free	0.3054

Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6wgt__assembly_3__model_1

6wgt__assembly_3__model_1 | I(q)

6wgt__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562 fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6wgt__assembly_3__model_1

6wgt__assembly_3__model_1 | I(q)

6wgt__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)