6xy6

Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 123.5 Å Quality: EXCELLENT

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

anti-apoptotic membrane protein

Sheeppox virus (strain Turkey/TU-V02127)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 1–145	未记录	Apoptosis regulator BAX × 1 （Q07812）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6XY6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6XY4 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–145（145 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 20% w/vPEG 3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.234

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A3F2YKH3_SHEVT
Isoform	—
PDB实体	1, 3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–150； UniProt 1–145 作者链 G； PDB构建体 6–150； UniProt 1–145 作者链 C； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 E； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 I； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 K； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 M； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145 作者链 O； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

Apoptosis regulator BAX

物种未注明

UniProt Q07812

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 50–77	未记录	anti-apoptotic membrane protein × 1 （A0A3F2YKH3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6XY6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F16 SOLUTION STRUCTURE OF A PRO-APOPTOTIC PROTEIN BAX 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 AMBIENT NMR样品组成 1MM BAX U-15N,13C; 10mM TRIS-ACETATE PH 6.0 2MM DTT	分辨率未提供
2K7W BAX Activation is Initiated at a Novel Interaction Site 提交 2008-08-27	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.1-0.2 mM [U-99% 15N] protein, 0.1-0.2 mM peptide, 90% H2O/10%D20 \| 90% H2O/10%D20	分辨率未提供
2LR1 Structural Mechanism for Bax Inhibition by Cytomegalovirus Protein vMIA 提交 2012-03-20	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；310 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.1 mM protein_1, 0.1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 20 mM potassium phosphate, 5 M [U-100% 2H] D2O, 50 M H2O, DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1 mM [U-100% 15N] protein_1, 0.1 mM protein_2, 20 mM potassium phosphate, 5 M [U-100% 2H] D2O, 50 M H2O, DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3PK1 Crystal structure of Mcl-1 in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 48–81（34 aa）片段：BH3 domain, UNP residues 48-81	未记录	CD CADMIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M Sodium Acetate, 0.1M Hepes, 25mM Cadmium Sulfate, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.49 Å R-free 0.245
3PK1 Crystal structure of Mcl-1 in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 48–81（34 aa）片段：BH3 domain, UNP residues 48-81	未记录	CD CADMIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M Sodium Acetate, 0.1M Hepes, 25mM Cadmium Sulfate, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.49 Å R-free 0.245
3PL7 Crystal structure of Bcl-xL in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-14	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 48–81（34 aa）片段：BH3 domain, UNP residues 48-81	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；13% Peg 6000, 0.2M CaCl2, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.61 Å R-free 0.249
4BD2 Bax domain swapped dimer in complex with BidBH3 提交 2012-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.4 M SODIUM CITRATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 5.75	分辨率 2.21 Å R-free 0.227
4BD6 Bax domain swapped dimer in complex with BaxBH3 提交 2012-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 C 48–81（34 aa）片段：RESIDUES 48-81	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.4 M SODIUM CITRATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 5.75	分辨率 2.49 Å R-free 0.285
4BD7 Bax domain swapped dimer induced by octylmaltoside 提交 2012-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 B 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES 突变：YES	PR PRASEODYMIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
4BD7 Bax domain swapped dimer induced by octylmaltoside 提交 2012-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 D 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
4BD8 Bax domain swapped dimer induced by BimBH3 with CHAPS 提交 2012-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 B 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES 突变：YES	PR PRASEODYMIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.22 Å R-free 0.256
4BD8 Bax domain swapped dimer induced by BimBH3 with CHAPS 提交 2012-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 D 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES 突变：YES	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.22 Å R-free 0.256
4BDU Bax BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2012-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128 链 B 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10% PEG3350, 20% MPD, 0.5% CHAPS, 0.1 M TRIS PH 8.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
4BDU Bax BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2012-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128 链 D 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10% PEG3350, 20% MPD, 0.5% CHAPS, 0.1 M TRIS PH 8.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
4S0O Crystal Structure of the Autoinhibited Dimer of Pro-apoptotic BAX (I) 提交 2015-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）链 B 1–192（192 aa）	突变：P168G 突变：P168G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；1.6 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS , PH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.265
4S0P Crystal Structure of the Autoinhibited Dimer of Pro-apoptotic BAX (II) 提交 2015-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：G67R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；1.6 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.25 Å R-free 0.270
4S0P Crystal Structure of the Autoinhibited Dimer of Pro-apoptotic BAX (II) 提交 2015-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–192（192 aa）	突变：G67R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；1.6 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.25 Å R-free 0.270
4UF2 Deerpox virus DPV022 in complex with Bax BH3 提交 2014-12-23	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 50–77（28 aa）片段：BH3, UNP RESIDUES 50-77	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 6000, 0.2M MES PH 6.0, 0,2M AMMONIUM SULPHATE.	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
4ZIE Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BimBH3 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–166（166 aa）	突变：C62S C126S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；PEG6000, bicine	分辨率 1.80 Å R-free 0.229
4ZIF Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BimBH3mini 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–166（166 aa）	突变：C62S C126S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate	分辨率 2.40 Å R-free 0.255
4ZIG Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BidBH3mini 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–166（166 aa）	突变：C62S, C126S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
4ZIH Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BimBH3mini 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–164（164 aa）	突变：C62S, C126S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate	分辨率 2.50 Å R-free 0.233
4ZII Crystal Structure of core/latch dimer of BaxI66A in complex with BidBH3 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–170（170 aa）	突变：C62S, C126S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, sodium cacodylate	分辨率 2.19 Å R-free 0.223
5W5X Crystal structure of BAXP168G in complex with an activating antibody 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000, HEPES	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
5W5X Crystal structure of BAXP168G in complex with an activating antibody 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000, HEPES	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
5W5Z Crystal structure of BAXP168G in complex with an activating antibody at high resolution 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 32–192（161 aa）片段：UNP residues 32-192	突变：C62S C126S P168G	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Peg4000, MES	分辨率 2.00 Å R-free 0.268
5W60 Crystal structure of BAXP168G monomer cryo-protected with ethylene glycol 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium sulfate, TRIS	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
5W61 Crystal structure of BAXP168G monomer co-crystallized with glycerol 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium sulfate, bis-TRIS, glycerol	分辨率 2.30 Å R-free 0.252
6EB6 Crystal structure of BAX W139A monomer 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：W139A	FMT FORMIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium formate, TCEP	分辨率 2.02 Å R-free 0.201
6L8V membrane-bound Bax helix2-helix5 domain 提交 2019-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	突变：C62S, C126S 突变：C62S, C126S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM U-98% 15N;U-98% 13C;U-98% 2H human Bax core domain, 100 mM DMPC, 140 mM DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM U-98% 15N;U-98% 13C Bax a_2_a_5, 100 mM [U-2H] DMPC, 160 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM U-98% 15N;U-2H Bax a_2_a_5, 120 mM [U-2H] DMPC, 200 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM U-98% 15N;U-2H Bax a_2_a_5, 100 mM DMPC, 160 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM U-98% 15N;U-15% 13C Bax a_2_a_5, 80 mM DMPC, 140 mM DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM U-98% 13C Bax a_2_a_5, 120 mM [U-2H] DMPC, 200 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6L95 transmembrane-domain of Bax 提交 2019-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 166–192（27 aa）链 B 166–192（27 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 15N;U-98% 13C;U-98% 2H] human bax helix9, 0.1 % DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 15N;U-98% 13C] human bax helix9, 0.1 % [U-2H] DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-98% 15N;U-2H] human bax helix9, 0.1 % [U-2H] DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-98% 15N;U-15% 13C] human bax helix9, 0.1 % DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-98% 13C] human bax helix9, 0.1 % [U-2H] DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6TRR Structural insight into tanapoxvirus mediated inhibition of apoptosis 提交 2019-12-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 50–77（28 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium Chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0 20% PEG 6000	分辨率 2.12 Å R-free 0.254
7ADT Orf virus Apoptosis inhibitor ORFV125 提交 2020-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 50–77（28 aa）链 U 50–77（28 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 41	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.21 Å R-free 0.259
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 53–128（76 aa）链 F 53–128（76 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 53–128（76 aa）链 H 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 53–128（76 aa）链 R 53–128（76 aa）链 S 53–128（76 aa）链 T 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 53–128（76 aa）链 H 53–128（76 aa）链 U 53–128（76 aa）链 V 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 53–128（76 aa）链 F 53–128（76 aa）链 I 53–128（76 aa）链 J 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 53–128（76 aa）链 L 53–128（76 aa）链 M 53–128（76 aa）链 N 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 O 53–128（76 aa）链 P 53–128（76 aa）链 W 53–128（76 aa）链 X 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Y 53–128（76 aa）链 Z 53–128（76 aa）链 a 53–128（76 aa）链 b 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 c 53–128（76 aa）链 d 53–128（76 aa）链 e 53–128（76 aa）链 f 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 g 53–128（76 aa）链 h 53–128（76 aa）链 i 53–128（76 aa）链 j 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPF Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - hexameric fraction with 2-stearoyl lysoPC 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）链 E 53–128（76 aa）链 F 53–128（76 aa）	未记录	1GP SN-GLYCEROL-1-PHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 OCT N-OCTANE × 1 D12 DODECANE × 1 DD9 nonane × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 1.4 M trisodium citrate	分辨率 2.20 Å R-free 0.305
8SPZ Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - hexameric fraction with dioctanoyl phosphatidylserine 提交 2023-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.09 M DL maleate-MES-Tris pH 7, 2.25 M ammonium sulfate, 0.1 M trisodium citrate	分辨率 2.40 Å R-free 0.341
8SPZ Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - hexameric fraction with dioctanoyl phosphatidylserine 提交 2023-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.09 M DL maleate-MES-Tris pH 7, 2.25 M ammonium sulfate, 0.1 M trisodium citrate	分辨率 2.40 Å R-free 0.341
8SRX Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with lysoPC 提交 2023-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	K6G [(2~{R})-2-oxidanyl-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] hexadecanoate × 3 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；0.1 M Bis-tris chloride pH 5.5, 25% PEG 3350, 200 mM sodium acetate	分辨率 2.09 Å R-free 0.265
8SRY Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with C12E8 提交 2023-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 N8E 3,6,9,12,15-PENTAOXATRICOSAN-1-OL × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；30% PEG MME 2000, 0.1 M potassium thiocyanate, 0.01% C12E8	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
8SVK Crystal structure of Bax D71N core domain BH3-groove dimer 提交 2023-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	突变：C62S, D71N, C126S 突变：C62S, D71N, C126S	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.287
8SVK Crystal structure of Bax D71N core domain BH3-groove dimer 提交 2023-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	突变：C62S, D71N, C126S 突变：C62S, D71N, C126S	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.287
9IXU Overall reconstruction of the Bax line 提交 2024-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–192（192 aa）链 B 1–192（192 aa）链 C 1–192（192 aa）链 D 1–192（192 aa）链 E 1–192（192 aa）链 F 1–192（192 aa）链 G 1–192（192 aa）链 H 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å

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UniProt名称	BAX_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 D； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 F； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 H； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 J； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 L； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 N； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77 作者链 P； PDB构建体 1–28； UniProt 50–77

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6xy6
沉积日期 deposition_date	2020-01-29
结构标题 title	Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis
关键词 keywords	Pox virus, Apoptosis, Bcl-2; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	38.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	38.13 Å
零角强度 I(0) i0	318429000.00
分子量 molecular_weight	146720.0 kDa
排除体积 excluded_volume	184850 Å³
包络体积 envelope_volume	254480 Å³
水化壳体积 shell_volume	55492 Å³
包络直径 envelope_diameter	122.2 Å
壳层 Rg shell_rg	44.49 Å
包络 Rg envelope_rg	37.13 Å
形状 Rg shape_rg	38.13 Å
总 Rg total_rg	38.51 Å
总原子数 total_atoms	20620
残基数 n_residues	1261
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	123.5 Å
Rg (实空间) rg_real	38.69 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.94 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1840e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.0260e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	38.79 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	318500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9014
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	48.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.192
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.544
角度范围 angular_range	— – 0.2050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	25860000.0000
实空间数据点数 n_real_points	42
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.940

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	anti-apoptotic membrane protein
分子量 formula_weight	17476.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,G
原子数 atom_count	20675

GPLGSMDNCNYNIEKVLNVYLRDLRIESLNNNELEILIMIRECCEVIKKDYKTEFNEICNFILQNNVKSCYDINDVKNIIIETINSDFRPSVILASISLLSIIIKKKKDENNEVVDDDLALNELINKFSSYQKDIISFVEKNKKKNKQND

来源 Source

来源生物 organism	Sheeppox virus (strain Turkey/TU-V02127)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	654928
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Apoptosis regulator BAX
分子量 formula_weight	3152.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P

VPQDASTKKLSECLKRIGDELDSNMELQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	anti-apoptotic membrane protein
分子量 formula_weight	17064.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,E,I,K,M,O

MDNCNYNIEKVLNVYLRDLRIESLNNNELEILIMIRECCEVIKKDYKTEFNEICNFILQNNVKSCYDINDVKNIIIETINSDFRPSVILASISLLSIIIKKKKDENNEVVDDDLALNELINKFSSYQKDIISFVEKNKKKNKQND

来源 Source

来源生物 organism	Sheeppox virus (strain Turkey/TU-V02127)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	654928
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	39

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6xy6A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6E01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6G01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6I01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6K01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6M01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	6xy6O01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	100.279 Å
晶胞边长 b length_b	78.560 Å
晶胞边长 c length_c	107.766 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	110.97 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	2.914 Å
最低分辨率 resolution_low	46.819 Å
R 因子 r_factor	0.2412
R_work r_work	0.2386
R_free r_free	0.2883

fit	/app/data/saxs_computation/xy/6xy6/6xy6.fit
pddf	/app/data/pr_computation/xy/6xy6/6xy6.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/xy/6xy6/6xy6.dat

Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

anti-apoptotic membrane protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Apoptosis regulator BAX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)