Stromal interaction molecule 1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 234–343 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.25；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1 NMR样品组成：0.3 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] STIM1 CC1, 20 mM TRIS, 7 mM [U-13C] SDS, 90 % v/v H2O, 10 % v/v [U-99% 2H] H2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6YEL | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2K60 NMR structure of calcium-loaded STIM1 EF-SAM 提交 2008-07-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
58–201（144 aa）
片段：UNP residues 58-201
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）105；压力 1
NMR测量条件
293 K；离子强度（mmCIF原始值）105；压力 1
NMR样品组成
0.5-1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] stromal interaction molecule 1,
20 mM TRIS, 100 mM sodium chloride, 5 mM CALCIUM ION, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5-1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] stromal interaction molecule 1,
20 mM [U-99% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 5 mM CALCIUM ION, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MAJ Solution Structure of the STIM1 CC1-CC2 homodimer. 提交 2013-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
312–387（76 aa）
片段：UNP residues 312-387
链 C
312–387（76 aa）
片段：UNP residues 312-387
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N] protein, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 0.5 mM protein, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MAK Solution structure of the STIM1 CC1-CC2 homodimer in complex with two Orai1 C-terminal domains. 提交 2013-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
312–387（76 aa）
片段：UNP residues 312-387
链 C
312–387（76 aa）
片段：UNP residues 312-387
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成
0.25 mM [U-100% 15N] protein_1, 3.0 mM protein_2, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.25 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 3.0 mM protein_2, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.25 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 3.0 mM protein_2, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
2.5 mM protein_1, 0.25 mM [U-99% 15N] protein_2, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2.5 mM protein_1, 0.25 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_2, 20 mM bis-TRIS, 0.175 v/v [U-99% 2H] TFE, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3TEQ Crystal structure of SOAR domain 提交 2011-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
344–444（101 aa）
片段：SOAR domain (UNP RESIDUES 344-444)
链 C
344–444（101 aa）
片段：SOAR domain (UNP RESIDUES 344-444)
|
突变：L374M, V419A, C437T 突变：L374M, V419A, C437T | PO4 PHOSPHATE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% PEG3350, 0.2M Ammonium dibasic phosphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 3TEQ Crystal structure of SOAR domain 提交 2011-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
344–444（101 aa）
片段：SOAR domain (UNP RESIDUES 344-444)
|
突变：L374M, V419A, C437T | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% PEG3350, 0.2M Ammonium dibasic phosphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 3TEQ Crystal structure of SOAR domain 提交 2011-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
344–444（101 aa）
片段：SOAR domain (UNP RESIDUES 344-444)
|
突变：L374M, V419A, C437T | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% PEG3350, 0.2M Ammonium dibasic phosphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 4O9B The Structure of CC1-IH in human STIM1. 提交 2014-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 D
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
|
突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M | CD CADMIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；24% PEGMME 2000, 0.1M sodium acetate, 0.02M magnesium chloride hexahydrate, 0.02M nickel chloride hexahydrate, 0.02M cadmium chloride hexahydrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 4O9B The Structure of CC1-IH in human STIM1. 提交 2014-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 C
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
|
突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M | CD CADMIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；24% PEGMME 2000, 0.1M sodium acetate, 0.02M magnesium chloride hexahydrate, 0.02M nickel chloride hexahydrate, 0.02M cadmium chloride hexahydrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 4O9B The Structure of CC1-IH in human STIM1. 提交 2014-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 B
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
|
突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M | CD CADMIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；24% PEGMME 2000, 0.1M sodium acetate, 0.02M magnesium chloride hexahydrate, 0.02M nickel chloride hexahydrate, 0.02M cadmium chloride hexahydrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 4O9B The Structure of CC1-IH in human STIM1. 提交 2014-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 D
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
|
突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M | CD CADMIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；24% PEGMME 2000, 0.1M sodium acetate, 0.02M magnesium chloride hexahydrate, 0.02M nickel chloride hexahydrate, 0.02M cadmium chloride hexahydrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 4O9B The Structure of CC1-IH in human STIM1. 提交 2014-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 B
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 C
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
链 D
237–340（104 aa）
片段：CC1-IH, UNP RESIDUES 237-340
|
突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M 突变：M244L, L321M | CD CADMIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；24% PEGMME 2000, 0.1M sodium acetate, 0.02M magnesium chloride hexahydrate, 0.02M nickel chloride hexahydrate, 0.02M cadmium chloride hexahydrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | STIM1_HUMAN |
| Isoform | Q13586-2 |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–115； UniProt 234–343 |
