6yp7

PSII-LHCII C2S2 supercomplex from Pisum sativum grown in high light conditions

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic

Pisum sativum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB28_PEA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–219； UniProt 49–267 作者链 N； PDB构建体 1–219； UniProt 49–267 作者链 Y； PDB构建体 1–219； UniProt 49–267 作者链 g； PDB构建体 1–219； UniProt 49–267 作者链 n； PDB构建体 1–219； UniProt 49–267 作者链 y； PDB构建体 1–219； UniProt 49–267

Photosystem II protein D1

Pisum sativum

UniProt P06585

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA_PEA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–334； UniProt 11–344 作者链 a； PDB构建体 1–334； UniProt 11–344

Photosystem II CP47 reaction center protein

Pisum sativum

UniProt Q9XQR6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9XQR6_PEA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–503； UniProt 2–504 作者链 b； PDB构建体 1–503； UniProt 2–504

Photosystem II CP43 reaction center protein

Pisum sativum

UniProt P06004

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_PEA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–450； UniProt 24–473 作者链 c； PDB构建体 1–450； UniProt 24–473

Photosystem II D2 protein

Pisum sativum

UniProt P06006

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBD_PEA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–341； UniProt 13–353 作者链 d； PDB构建体 1–341； UniProt 13–353

Cytochrome b559 subunit alpha

Pisum sativum

UniProt P13554

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBE_PEA
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–75； UniProt 8–82 作者链 e； PDB构建体 1–75； UniProt 8–82

Cytochrome b559 subunit beta

Pisum sativum

UniProt P62096

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBF_PEA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–30； UniProt 10–39 作者链 f； PDB构建体 1–30； UniProt 10–39

Photosystem II reaction center protein H

Pisum sativum

UniProt Q9XQR3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBH_PEA
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–60； UniProt 13–72 作者链 h； PDB构建体 1–60； UniProt 13–72

Photosystem II reaction center protein I

Pisum sativum

UniProt D5MAJ9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D5MAJ9_PEA
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34 作者链 i； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34

Photosystem II reaction center protein J

Pisum sativum

UniProt P13555

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBJ_PEA
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–35； UniProt 6–40 作者链 j； PDB构建体 1–35； UniProt 6–40

Photosystem II reaction center protein K

Pisum sativum

UniProt D5MAJ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D5MAJ8_PEA
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–37； UniProt 25–61 作者链 k； PDB构建体 1–37； UniProt 25–61

Photosystem II reaction center protein L

Pisum sativum

UniProt P60147

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBL_PEA
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–37； UniProt 2–38 作者链 l； PDB构建体 1–37； UniProt 2–38

Photosystem II reaction center protein M

Pisum sativum

UniProt P69529

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBM_PEA
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33 作者链 m； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33

Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic

Pisum sativum

UniProt P14226

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBO_PEA
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–248； UniProt 82–329 作者链 o； PDB构建体 1–248； UniProt 82–329

Photosystem II reaction center protein T

Pisum sativum

UniProt Q8HS25

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBT_PEA
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32 作者链 t； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32

Photosystem II reaction center protein W

Pisum sativum

UniProt A0A2D0TCJ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2D0TCJ2_PEA
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–54； UniProt 1–54 作者链 w； PDB构建体 1–54； UniProt 1–54

Ultraviolet-B-repressible protein

Pisum sativum

UniProt Q8VYY1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8VYY1_PEA
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–39； UniProt 45–83 作者链 x； PDB构建体 1–39； UniProt 45–83

Photosystem II reaction center protein Z

Pisum sativum

UniProt Q32902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 44	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 6 （P27490） Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P62096） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I × 2 （D5MAJ9） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II reaction center protein W × 2 （A0A2D0TCJ2） Ultraviolet-B-repressible protein × 2 （Q8VYY1） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 CHLOROPHYLL B × 48 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 12 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 8 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 26 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 22 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 BICARBONATE ION × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBZ_PEA
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62 作者链 z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6yp7
沉积日期 deposition_date	2020-04-15
结构标题 title	PSII-LHCII C2S2 supercomplex from Pisum sativum grown in high light conditions
关键词 keywords	Cryo-EM, photosystem II, High Light, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6yp7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6yp7__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6yp7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	76.80 Å
Rg（电子密度）	77.83 Å
总 Rg	77.26 Å
原子数	71784
残基数	7002
排除体积	1338700 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6yp7__assembly_1__model_1`	44-meric （44）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (37)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic
分子量 formula_weight	23573.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,n,y,G,N,Y
原子数 atom_count	71784

GSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFSKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWATQVILMGAVEGYRIAGGPLGEVVDPLYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLSDPVNNNAWSYATNFVPG

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1
分子量 formula_weight	36972.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,A

ENLWGRFCNWITSTENRLYIGWFGVLMIPTLLTATSVFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIISGAIIPTSAAIGLHFYPIWEAASVDEWLYNGGPYELIVLHFLLGVACYMGREWELSFRLGMRPWIAVAYSAPVAAATAVFLIYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANEGYRFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVVGIWFTALGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADIINRANLGMEVMHERNAHNFPLDLA

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	55659.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,B

GLPWYRVHTVVLNDPGRLLSVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQGMFVIPFMTRLGITNSWGGWNITGGTITNPGIWSYEGVAAAHIVFSGLCFLAAIWHWLYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLAGVACFGFGAFHVTGLFGPGIWVSDPYGLTGRVQSVNPAWGVDGFDPFVPGGIASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGYFQQEIYRRVSAGHVENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPIFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRGDVPFRRAESKYSVEQVGVIVEFYGGELNGVTYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDLFAGIDPDLDAQVEFGAFQKLGDPTTR

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	49275.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,C

TGRDQETTGFAWWAGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVAHFVPEKPMYEQGLILLPHLATLGWGVGPGGEVIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGIYHALLGPETLEESFPFFGYVWKDRNKMTTILGIHLILLGIGSFLLVFKAFYFGGIYDTWAPGGGDVRKITNFTLSPSILFGYLLKSPFGGEGWIVSVDDLEDIIGGHVWLGSICILGGIWHILTKPFAWARRALVWSGEAYLSYSLGALAVFGFIACCFVWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQAQAFTFLVRDQRLGANVGSAQGPTGLGKYLMRSPTGEVIFGGETMRFWDLRAPWLEPLRGPNGLDLSRLKKDIQPWQERRSAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINAVNYVSPRSWLATSHFVLGFFLFVGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRDFEPVLSMTPLN

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	38220.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,D

NDLFDIMDDWLRRDRFVFVGWSGLLLFPCAYFAVGGWFTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTAAVSTPANSLAHSLLLLWGPEAQGDLTRWCQLGGLWTFVALHGAFGLIGFMLRQFELARSVQLRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLIYPLGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSALGVVGLALNLRAYDFVSQEIRAAEDPEFETFYTKNILLNEGIRAWMATQDQPHENLIFPEEVLPRGNAL

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	8624.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e,E

RSFADIITSIRYWIIHSITIPSLFIAGWLFVSTGLAYDVFGSPRPNEYFTETRQGIPLITGRFDSLEQLDEFSRS

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	3396.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f,F

FTVRWLAVHGLAVPTVFFLGSISAMQFIQR

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	6455.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h,H

GPRRTAVGDLLKPLNSEYGKVAPGWGTTPLMGIAMALFAVFLSIILEIYNSSLLLDQISM

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	3926.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i,I

MLTLKLFVYTIVIFFVSLFIFGFLSNDPGRNPGR

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein J
分子量 formula_weight	3598.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j,J

GRIPLWIIGTVAGIVVIGLIGLFFYGSYSGLGSSL

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	4287.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k,K

KLPEAYAFLNPIVDFMPVIPLLFFLLAFVWQAAVSFR

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4366.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l,L

TQSNPNEQNVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSNYFFN

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	3641.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m,M

MEVNILAFIATALFILVPTAFLLIIYVKTVSQS

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic
分子量 formula_weight	26554.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o,O

EGAPKRLTFDEIQSKTYLEVKGTGTANQCPTIDGGVDSFSFKPGKYNAKKLCLEPTSFTVKSEGVTKNTPLAFQNTKLMTRLTYTLDEIEGPFEVSADGSVKFEEKDGIDYAAVTVQLPGGERVPFLFTIKQLVASGKPDSFSGEFLVPSYRGSSFLDPKGRGASTGYDNAVALPAGGRGDEEELGKENNKSAASSKGKITLSVTQTKPETGEVIGVFESIQPSDTDLGAKAPKDVKIQGVWYAQLES

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3692.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	t,T

MEALVYTFLLVSTLGIIFFAIFFREPPKVPTK

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein W
分子量 formula_weight	5914.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	w,W

LVDDRMSTEGTGLPFGLSNNLLGWILFGVFGLIWALYFIYASGLDEDEESGLSL

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Ultraviolet-B-repressible protein
分子量 formula_weight	3929.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	x,X

ATVSPSLKNFLLSIVSGGVVVTAILGAVIGVSNFDPVKR

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6555.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	z,Z

MTIAFQLAVFALIVTSSILLISVPVVFASPDGWSSNKNVVFSGTSLWIGLVFLVGILNSLIS

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4.3
分子量 formula_weight	24460.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	r,R

GLVWFPGAQPPEWLDGTMIGDRGFDPLGFAKPAEYLQFDLDSLDQNLAKNLAGDVIGTRVEAGEVKPTPFQPYSEVFGIERFRECELIHGRWAMLGALGALAVEAFTGVAWQDAGKVELVEGASYFGFSLPFSLTALIWIEVLVIGYIEFQRNAELDPEKRLYPGGKFFDPLGLANDPEEKERLQLAEIKHSRLAMVVFLVFAIQAAVSGKGPIGFIATFNQ

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26
分子量 formula_weight	23839.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s,S

ANEELAKWYGPDRRIFLPDGLLDRSEIPEYLTGEVPGDYGYDPFGLSKKPEDFAKYQGYELIHARWAMLGAAGFIIPEAFNKYGANCGPEAVWFKTGALLLDGGTLNYFGKPIPINLILAVVAEVVLLGGAEYYRITNGLDLEDKFHPGGPFDPLGLANDPDQAAILKVKEIKNGRLAMFAMLGFFIQAYVTGEGPVENFAKHLSDPFGNNLLTVIAG

来源 Source

来源生物 organism	Pisum sativum
通用名 common_name	Pea
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3888
宿主生物 host_organism	Pisum sativum

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	48

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	150

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	26

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	CA-MN4-O5 CLUSTER
分子量 formula_weight	339.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 34 Entity 34 non-polymer

描述 description	BICARBONATE ION
分子量 formula_weight	61.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 35 Entity 35 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 36 Entity 36 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 37 Entity 37 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	6yp7A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	6yp7G01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7N01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7S01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7Y01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7a01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	6yp7g01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7n01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7s01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	6yp7y01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	27942

PSII-LHCII C2S2 supercomplex from Pisum sativum grown in high light conditions

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II protein D1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体