SAXSdb — 6zca

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ;

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–92	未记录	RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A410WI33） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A0A063XB83） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A2J0WBQ0） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A063XB23） DNA helicase × 1 （A0A164TSE8） ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

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UniProt名称	A0A0D1KIU7_BACIU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

RNA polymerase subunit omega

物种未注明

UniProt A0A410WI33

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–69	未记录	;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ; × 1 （A0A0D1KIU7） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A0A063XB83） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A2J0WBQ0） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A063XB23） DNA helicase × 1 （A0A164TSE8） ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6ZCA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6ZFB Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (dimer) 提交 2020-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 E 1–69（69 aa）链 e 1–69（69 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

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UniProt名称	A0A410WI33_BACVA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

物种未注明

UniProt A0A063XB83

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 1–314 链 V； UniProt 1–314	未记录	;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ; × 1 （A0A0D1KIU7） RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A410WI33） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A2J0WBQ0） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A063XB23） DNA helicase × 1 （A0A164TSE8） ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6ZCA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6ZFB Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (dimer) 提交 2020-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 U 1–314（314 aa）链 V 1–314（314 aa）链 u 1–314（314 aa）链 v 1–314（314 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	A0A063XB83_BACIU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–314； UniProt 1–314 作者链 V； PDB构建体 1–314； UniProt 1–314

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

UniProt A0A2J0WBQ0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 1–1193	未记录	;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ; × 1 （A0A0D1KIU7） RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A410WI33） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A0A063XB83） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A063XB23） DNA helicase × 1 （A0A164TSE8） ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6ZCA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6WVJ Cryo-EM structure of Bacillus subtilis RNA Polymerase elongation complex 提交 2020-05-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric	链 C 1–1193（1193 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Sample loading volume ranged between 2 and 3 microlitres. Samples were blotted for 5 seconds prior to vitrification.	分辨率 3.36 Å
6ZFB Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (dimer) 提交 2020-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 X 1–1193（1193 aa）链 x 1–1193（1193 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

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UniProt名称	A0A2J0WBQ0_BACIU
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–1193； UniProt 1–1193

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

物种未注明

UniProt A0A063XB23

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 1–1199	未记录	;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ; × 1 （A0A0D1KIU7） RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A410WI33） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A0A063XB83） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A2J0WBQ0） DNA helicase × 1 （A0A164TSE8） ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6ZCA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6WVJ Cryo-EM structure of Bacillus subtilis RNA Polymerase elongation complex 提交 2020-05-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric	链 D 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Sample loading volume ranged between 2 and 3 microlitres. Samples were blotted for 5 seconds prior to vitrification.	分辨率 3.36 Å
6ZFB Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (dimer) 提交 2020-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 Y 1–1199（1199 aa）链 y 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

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UniProt名称	A0A063XB23_BACIU
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–1199； UniProt 1–1199

DNA helicase

物种未注明

UniProt A0A164TSE8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–774	未记录	;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ; × 1 （A0A0D1KIU7） RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A410WI33） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A0A063XB83） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A2J0WBQ0） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A063XB23） ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6ZCA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VSX X-ray crystal structure of the C-terminal domain of Bacillus subtilis RNA polymerase binding helicase HelD 提交 2020-02-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 608–774（167 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；300 K；0.1M Na/K phosphate, pH 6.2, 0.2 M NaCl, 50 % PEG200	分辨率 2.00 Å R-free 0.202
6ZFB Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (dimer) 提交 2020-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–774（774 aa）链 h 1–774（774 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

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UniProt名称	A0A164TSE8_BACIU
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–774； UniProt 1–774

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6zca
沉积日期 deposition_date	2020-06-10
结构标题 title	Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (monomer)
关键词 keywords	TRANSCRIPTION/DNA/RNA, DNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE, BACTERIAL, TRANSCRIPTION, Helicase; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	52.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	52.57 Å
零角强度 I(0) i0	2377160000.00
分子量 molecular_weight	408070.0 kDa
排除体积 excluded_volume	511210 Å³
包络体积 envelope_volume	770100 Å³
水化壳体积 shell_volume	118610 Å³
包络直径 envelope_diameter	170.1 Å
壳层 Rg shell_rg	59.06 Å
包络 Rg envelope_rg	51.17 Å
形状 Rg shape_rg	52.58 Å
总 Rg total_rg	52.72 Å
总原子数 total_atoms	28721
残基数 n_residues	3640
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	173.4 Å
Rg (实空间) rg_real	52.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.16 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3770e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.4500e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	53.13 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2378000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8771
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	69.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.185
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.424
角度范围 angular_range	— – 0.1500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	320000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	31
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.865; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.840

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ;
分子量 formula_weight	14914.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	28721

MGIKQYSQEELKEMALVEIAHELFEEHKKPVPFQELLNEIASLLGVKKEELGDRIAQFYTDLNIDGRFLALSDQTWGLRSWYPYDQLDEETQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RNA polymerase subunit omega
分子量 formula_weight	8228.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MIYKVFYQEKADEVPVREKTDSLYIEGVSERDVRTKLKEKKLNIEFITPVNGAFLEYEQQSENFKVLEL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha
分子量 formula_weight	34842.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,V

MIEIEKPKIETVEISDDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVTSIQIDGVLHEFSTIEGVVEDVTTIILHIKKLALKIYSDEEKTLEIDVQGEGTVTAADITHDSDVEILNPDLHIATLGENASFRVRLTAQRGRGYTPADANKRDDQPIGVIPIDSIYTPVSRVSYQVENTRVGQVANYDKLTLDVWTDGSTGPKEAIALGSKILTEHLNIFVGLTDEAQHAEIMVEKEEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVQELANKTEEDMMKVRNLGRKSLEEVKAKLEELGLGLRKDD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	133847.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MTGQLVQYGRHRQRRSYARISEVLELPNLIEIQTSSYQWFLDEGLREMFQDISPIEDFTGNLSLEFIDYSLGEPKYPVEESKERDVTYSAPLRVKVRLINKETGEVKDQDVFMGDFPIMTDTGTFIINGAERVIVSQLVRSPSVYFSGKVDKNGKKGFTATVIPNRGAWLEYETDAKDVVYVRIDRTRKLPVTVLLRALGFGSDQEILDLIGENEYLRNTLDKDNTENSDKALLEIYERLRPGEPPTVENAKSLLDSRFFDPKRYDLANVGRYKINKKLHIKNRLFNQRLAETLVDPETGEILAEKGQILDRRTLDKVLPYLENGIGFRKLYPNGGVVEDEVTLQSIKIFAPTDQEGEQVINVIGNAYIEEEIKNITPADIISSISYFFNLLHGVGDTDDIDHLGNRRLRSVGELLQNQFRIGLSRMERVVRERMSIQDTNTITPQQLINIRPVIASIKEFFGSSQLSQFMDQTNPLAELTHKRRLSALGPGGLTRERAGMEVRDVHYSHYGRMCPIETPEGPNIGLINSLSSYAKVNRFGFIETPYRRVDPETGKVTGRIDYLTADEEDNYVVAQANARLDDEGAFIDDSIVARFRGENTVVSRNRVDYMDVSPKQVVSAATACIPFLENDDSNRALMGANMQRQAVPLMQPEAPFVGTGMEYVSGKDSGAAVICKHPGIVERVEAKNVWVRRYEEVDGQKVKGNLDKYSLLKFVRSNQGTCYNQRPIVSVGDEVVKGEILADGPSMELGELALGRNVMVGFMTWDGYNYEDAIIMSERLVKDDVYTSIHIEEYESEARDTKLGPEEITRDIPNVGEDALRNLDDRGIIRIGAEVKDGDLLVGKVTPKGVTELTAEERLLHAIFGEKAREVRDTSLRVPHGGGGIIHDVKVFNREDGDELPPGVNQLVRVYIVQKRKISEGDKMAGRHGNKGVISKILPEEDMPYLPDGTPIDIMLNPLGVPSRMNIGQVLELHMGMAARYLGIHIASPVFDGAREEDVWETLEEAGMSRDAKTVLYDGRTGEPFDNRVSVGIMYMIKLAHMVDDKLHARSTGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEILTVKSDDVVGRVKTYEAIVKGDNVPEPGVPESFKVLIKELQSLGMDVKILSGDEEEIEMRDLEDEEDAKQADGLALSGDEEPEETASADVERDVVTKE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;
分子量 formula_weight	134445.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCERIFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAPVSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLLSEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQGQRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHLKMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDVLESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADFDGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNYYLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFTEEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGADVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKYSTKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYERVISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGLMANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYLTRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARKQVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCKRCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDITQGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETRSYTAPYNSRLKVAEGDKITRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHEVQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFTEANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAAIKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA helicase
分子量 formula_weight	90052.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MNQQDKEWKEEQSRIDEVLKELEKKERFLETSAGGLKHDIIGLRKSFWEDVKVNFDDAHEAIETMASIKQQAELLSDREHNHRRMDQQLKRIHQLKKSPYFGRIDFIENGEEQAERIYIGLASCLDEKEEHFLIYDWRAPISSLYYNYSPGKAEYEVPGETIEGEMVLKRQFMIKNGTLKAMFNTDMTIGDEMLQEVLSHHSDTQMKNIVSTIQKEQNQIIRNEKSKILIVQGAAGSGKTSAALQRVAYLLYRHRGVIDAGQIVLFSPNFLFNSYVSSVLPELGEENMEQATFQEYIEHRLGRKFKCESPFDQLEYCLTETKGGDFPTRLAGITWKAGLSFQQFINEYVTRLSSEGMIFKNIIFRGQKLITKEQIQSYFYSLDQNHSIPNRMEQTAKWLLSELNKLEKKERRKDWVVHEAELLDKEDYLDVYKKLQERKRFSESTFNDYQREQQLLAAIIVKKAFKPLKQAVRLLAFLDVTQLYLQLFSGWGGKFQHEKMDAIGELTRSAFTDNKLLYEDAAPFLYMQDLIEGRKKNTKIKHLFIDEAQDYSPFQMAYMRSIFPAASMTVLGDINQSIYAHTINGDQRMDACFEDEPAEYVRLKRTYRSTRQIVEFTKAMLQDGADIEPFNRSGEMPLVVKTEGHESLCQKLAQEIGRLKKKGHETIAVICKTAHQCIQAHAHMSEYTDVRLIHKENQPFQKGVCVIPVYLAKGIEFDAVLVYDASEEHYHTEHDRRLLYTACTRAMHMLAVFYTGEASPFVTAVPPHLYQIAE

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	4.200 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	81279

fit	/app/data/saxs_computation/zc/6zca/6zca.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zc/6zca/6zca.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zc/6zca/6zca.dat

Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (monomer)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta,Probable DNA-directed RNA polymerase subunit delta ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RNA polymerase subunit omega

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA helicase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)