6zk9

Peripheral domain of open complex I during turnover

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5PUX0_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–464； UniProt 1–464

Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit

物种未注明

UniProt W5NRY1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5NRY1_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1

物种未注明

UniProt W5QB34

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5QB34_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–727； UniProt 1–727

NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3

物种未注明

UniProt W5PB27

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5PB27_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–266； UniProt 1–266

NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

物种未注明

UniProt W5PE07

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5PE07_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170

NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9

物种未注明

UniProt W5PI58

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5PI58_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–380； UniProt 1–380

NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

物种未注明

UniProt W5QAH8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5QAH8_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

Mitochondrial complex I, B13 subunit

物种未注明

UniProt W5PNX7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5PNX7_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6

物种未注明

UniProt W5QC06

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5QC06_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

Mitochondrial complex I, B14.5a subunit

物种未注明

UniProt W5P0I2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5P0I2_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 h； PDB构建体 1–114； UniProt 1–114

NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

物种未注明

UniProt B9VGZ9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） Acyl carrier protein × 1 （W5NQT7） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	B9VGZ9_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 i； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

Acyl carrier protein

物种未注明

UniProt W5NQT7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial × 1 （W5PUX0） Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit × 1 （W5NRY1） NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 × 1 （W5QB34） Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit × 1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 × 1 （W5PB27） Mitochondrial complex I, PSST subunit × 1 Mitochondrial complex I, TYKY subunit × 1 Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit × 1 Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit × 1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial × 1 （W5PE07） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 × 1 （W5PI58） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 × 1 （W5QAH8） Mitochondrial complex I, B13 subunit × 1 （W5PNX7） NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 × 1 （W5QC06） Mitochondrial complex I, B14.5a subunit × 1 （W5P0I2） NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 × 1 （B9VGZ9） Mitochondrial complex I, B16.6 subunit × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 POTASSIUM ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 ZINC ION × 1 NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate × 1 CARDIOLIPIN × 1 water × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W5NQT7_SHEEP
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 j； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6zk9
沉积日期 deposition_date	2020-06-30
结构标题 title	Peripheral domain of open complex I during turnover
关键词 keywords	complex, respiration, NADH, proton pump, mitochondria, iron-sulphur cluster, oxidoreductase, membrane protein, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6zk9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6zk9__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6zk9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.15 Å
Rg（电子密度）	48.30 Å
总 Rg	48.30 Å
原子数	28115
残基数	3478
排除体积	502300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6zk9__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (30)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
分子量 formula_weight	50687.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.99.3,7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1
原子数 atom_count	29587

MLAARRLLGGSLPARVSVRFSGDTTAPKKTSFGSLKDEDRIFTNLYGRHDWRLKGAQSRGDWYKTKEILLKGPDWILGEVKTSGLRGRGGAGFPTGLKWSFMNKPSDGRPKYLVVNADEGEPGTCKDREIIRHDPHKLVEGCLVGGRAMGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSGYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGAWFASFGRERNSGTKLFNISGHVNNPCTVEEEMSVPLKELIEKHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALIQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVRGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEERMQRFAQQHQARQAAS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit
分子量 formula_weight	27373.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MPVLQYEHLEECIRWGKHIRNLHKTAVQNGAGGALFVHRDTPKNNPETPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHKAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEILQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRNSDSILEAIQKKLGIKVGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKIPKPGPRSGRFSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGVQAGL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1
分子量 formula_weight	79519.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MLRIPVRKALVGLSKSSKGCVRTTATAASNLIEVFVDGQSVMVEPGTTVLQACEKVGMQIPRFCYHERLSVAGNCRMCLVEIEKAPKVVAACAMPVMKGWNILTNSEKTKKAREGVMEFLLANHPLDCPICDQGGECDLQDQSMMFGSDRSRFLEGKRAVEDKNIGPLVKTIMTRCIQCTRCIRFASEIAGVDDLGTTGRGNDMQVGTYIEKMFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTARPWETRKTESIDVMDAVGSNIVVSTRTGEVMRILPRMHEDINEEWISDKTRFAYDGLKRQRLTEPMVRNEKGLLTHTTWEDALSRVAGMLQSCQGNDVAAIAGGLVDAEALIALKDLLNRVDSDTLCTEEVFPTAGAGTDLRSNYLLNTTIAGVEEADVVLLVGTNPRFEAPLFNARIRKSWLHNDLKVALIGSPVDLTYRYDHLGDSPKILQDIASGSHPFSQVLQEAKKPMVVLGSSALQRNDGAAILAAVSNIAQKIRTSSGVTGDWKVMNILHRIASQVAALDLGYKPGVEAIRKNPPKMLFLLGADGGCVTRQDLPKDCFIVYQGHHGDVGAPIADVILPGAAYTEKSATYVNTEGRAQQTKVAVMPPGLAREDWKIIRALSEIAGMTLPYDTLDQVRNRLEEVSPNLVRYDDVEGANYFQQASELSKLVNQQLLADPLVPPQLTIKDFYMTDSISRASQTMAKCVKAVTEGAHAVEEPSIC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit
分子量 formula_weight	52661.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MAALRALRRLRGAAAQVLRPGAGARLPIQPSRGARQWQPDVEWAEQYGGAVMYPTKETAHWKPPPWNDVDPPKDTLVSNLTLNFGPQHPAAHGVLRLVMELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSLAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRLLNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYVRPGGVHQDLPLGLMDDIYEFSKNFSLRIDELEEMLTNNRIWRNRTVDIGVVTAEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSIRIISQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAGLDKMSKGHMLADVVAIIGTQDIVFGEVDR

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3
分子量 formula_weight	30384.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

PVKMAAAAARGCWQRLVGSAAPARVAGRPSVLLLPVRRESASADTRPTVRPRNDVAHKQLSAFGEYVAEILPKYVQQVQVSCFSELEICIHPDGVIPVLTFLRDHSNAQFKSLADLTAVDIPTRQNRFEIVYNLLSLRFNSRIRVKTYTDELTPVESSVSVYKAANWYEREIWDMFGVFFANHPDLRRILTDYGFEGHPFRKDFPLSGYVELRYDDEVKRVVAEPVELAQEFRKFDLNSPWEAFPAYRQPPESLKLEAGDKKPEAK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, PSST subunit
分子量 formula_weight	24622.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

MLPLKFPGRGGAAPRLFHPILAVRSGMGAALQVRGVHSSMAADSPSSTQPAVSQARAVVPKPAALPSSRGEYVVAKLDDLINWARRSSLWPMTFGLACCAVEMMHMAAPRYDMDRFGVVFRASPRQSDVMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRYVVSMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDIYVPGCPPTAEALLYGILQLQKKIKREKRLRIWYRR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, TYKY subunit
分子量 formula_weight	24496.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	9

MRKPKMRCLTMPVLLRALAQAQAARAGHASGRGLHSSAVAATYKYVNLREPSMDMKSVTDRAAQTLLWTELIRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAVCPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit
分子量 formula_weight	11916.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MAASLLLRQGRPGTLKTVLLEAGVFRGLAPAVSLSAESGKNEKGLPPNPKKQSPPKKPASAAPTEPFDNTTYKNLQHHDYSTYTFLDLNLDLSKFRMPQPSSGRESPRH

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit
分子量 formula_weight	13457.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MAAAVTFLRLLGRGGAVTRGLPGGARCFGVRTSPTGEKVTHTGQVYDDEDYRRVRFVGRQKEVNENFAIDLIAEQPVSQVGSRVISCDGGGGALGHPRVYINLDKETKTGTCGYCGLQFRQQHH

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
分子量 formula_weight	19382.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSVALRQALWGRRVGTVAAVSVSKVSTRSLSTSTWRLAQDQTRDTQLITVDEKLDITTLTGVPEEHIKTRKARIFVPARNNMQSGVNNTKKWKMEFDTRERWENPLMGWASTADPLSNLVLTFSTKEDAIAFAEKNGWSYDVEERKVPKPKSKSYGANFSWNKRTRVSTK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9
分子量 formula_weight	43025.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MAAAVHLRVVRVLPMSRSSVPALAASVFHSPPQRQLHHAVIPHGKGGRSSVSGIVATVFGATGFLGRYLVNHLGRMGSQVIVPYRCEPYDTMHLRPMGDLGQIIFMDWNGRDKDSIRRAVEHSNVVINLVGREWETKNFDFEDVFVKIPQAIAQVSKEAGVEKFIHISHLNADIKSSSKYLRNKAVGEKEVRETFPEATIIKPADIFGREDRFLNYFANIRWFGGVPLISLGKKTVKQPVYIVDVTKGIINAIKDPDARGKTFAFVGPNRYLLFDLVQYVFAVAHRPFLPYPMPHFAYRWIGRLFEISPFEPWTTRDKVERIHTTDRTLPHLPGLEDLGVQATPLELKAIEVLRRHRTYRWLSSEIEDVQPAKTVPASGP

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
分子量 formula_weight	11097.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MAAAAAIRGVRGKLGLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQEKNVSLNNFSADQVTRALENVLSSKA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, B13 subunit
分子量 formula_weight	13287.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MAGLLKKTTGLVGLAVCETPHERLKILYTKILDVLGHIPKNAAYRKYTEQITNEKLSIVKAEPDVKKLEEQLQGGQIEEVILQAENELSLARKMIQWKPWEPLVEEPPASQWKWPI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6
分子量 formula_weight	16302.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

NGVELGSDFLSKMAASGLRQAAVAASTSVKPIFSRDMNEAKRRVRELYRAWYREVPNTVHLFQLDISVKQGRDKVREMFKKNAHVTDPRVVDLLVIKGKMELEETINVWKQRTHVMRFFHETEAPRPKDFLSKFYVGHDP

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, B14.5a subunit
分子量 formula_weight	12701.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

KMASATRLIQGLRNWASGRDLQAKLQLRYQEISKRTQPPPKLPVGPSHRLSNNYYCARDGRREAMPPSIVMSSQKVLVAGKPAESSAVAASEKKAVSPAPPIKRWELSQDEPYL

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
分子量 formula_weight	17115.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MELLQVLKRGLQQVSGHGGLRGYLRVLFRANDVRVGTLVGEDKYGNKYYEDNKQFFGRHRWVIYTTEMNGKNTFWDVDGSMVPPEWHRWLHCMTDDPPTVKPPTARKFIWTNHKFNLSGTPQQYVPYSTTRKKIQEWVPPSTPYK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Acyl carrier protein
分子量 formula_weight	17608.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

VEVKDFYTTNYQTAVSFSPLGPMPSMALMAVSLSGANVPKSGGRPEESRVPVLTQRKVPGRVTPLCRQYSDAPPLTLEGIKDRVLYVLKLYDKIDPEKLSVNSHFMKDLGLDSLDQVEIIMAMEDEFGFEIPDIDAEKLMCPQEIVDYIADKKDVYE

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Mitochondrial complex I, B16.6 subunit
分子量 formula_weight	16766.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	q

MAASKVKQDMPPVGGYGPIDYKRNLPRRGLSGYSMFAVGIGALLFGYWSMMRWNRERRRLQIEDFEARIALMPLLQAEKDRRVLQMLRENLEEEATIMKDVPGWKVGESVFHTTRWVTPMMGELYGLRTGEEILSSTYGFIWYT

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	FLAVIN MONONUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	456.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	665.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
分子量 formula_weight	790.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	745.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
分子量 formula_weight	568.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 30 Entity 30 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1472

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d6zk911
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.142 — Nqo1 FMN-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	c.142.1 — Nqo1 FMN-binding domain-like
家族 Family family	c.142.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6zk912
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.13 — Nqo1 middle domain-like
家族 Family family	d.15.13.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6zk913
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.12 — Nqo1C-terminal domain-like
家族 Family family	a.29.12.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6zk94_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.18 — HydB/Nqo4-like
超家族 Superfamily superfamily	e.18.1 — HydB/Nqo4-like
家族 Family family	e.18.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6zk9g_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.71 — LYR proteins from mammalian respiratory complex I
超家族 Superfamily superfamily	f.71.1 — LYR protein-like
家族 Family family	f.71.1.1 — LYR proteins

结构域编号 domain_id	d6zk9j_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.28.1 — ACP-like
家族 Family family	a.28.1.0 — automated matches

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	315484

Peripheral domain of open complex I during turnover

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial complex I, B13 subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial complex I, B14.5a subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体