7agf

HAd7 knob in complex with 3 EC2-EC3 modules of DSG-2

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fiber

Human adenovirus B serotype 7

UniProt Q5EY45

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Desmoglein-2 × 3 (Q14126) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q5EY45_ADE07
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–213; UniProt 117–325 作者链 B; PDB构建体 5–213; UniProt 117–325 作者链 C; PDB构建体 5–213; UniProt 117–325

Desmoglein-2

Homo sapiens

UniProt Q14126

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Fiber × 3 (Q5EY45) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DSG2_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 6–243; UniProt 149–386 作者链 E; PDB构建体 6–243; UniProt 149–386 作者链 F; PDB构建体 6–243; UniProt 149–386

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7agf
沉积日期 deposition_date2020-09-22
结构标题 titleHAd7 knob in complex with 3 EC2-EC3 modules of DSG-2
关键词 keywordsadenovirus, cell receptor, complex, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7agf__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7agf__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7agf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)35.86 Å
Rg(电子密度)34.85 Å
总 Rg35.43 Å
原子数10071
残基数1287
排除体积178560 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7agf__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd7agfa_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamilyb.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family familyb.21.1.1 — Adenovirus fiber protein 'knob' domain
结构域编号 domain_idd7agfb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamilyb.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family familyb.21.1.1 — Adenovirus fiber protein 'knob' domain
结构域编号 domain_idd7agfc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamilyb.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family familyb.21.1.1 — Adenovirus fiber protein 'knob' domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id7agfD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Cadherins
结构域编号 domain_id7agfD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Cadherins
结构域编号 domain_id7agfE01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Cadherins
结构域编号 domain_id7agfE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Cadherins
结构域编号 domain_id7agfF01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Cadherins
结构域编号 domain_id7agfF02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Cadherins

7. 引用文献 (1)