SAXSdb — 7btr

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antirestriction protein ArdA

Enterococcus faecalis EnGen0302

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Type I restriction enzyme R Protein × 1 （Q304R3） Type I restriction enzyme EcoR124II M protein × 2 （P10484） Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein × 1 （P10485）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0M2A928_ENTFL
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165 作者链 F； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165

Type I restriction enzyme R Protein

Escherichia coli

UniProt Q304R3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Antirestriction protein ArdA × 2 （A0A0M2A928） Type I restriction enzyme EcoR124II M protein × 2 （P10484） Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein × 1 （P10485）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q304R3_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–1038； UniProt 1–1038

Type I restriction enzyme EcoR124II M protein

Escherichia coli

UniProt P10484

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Antirestriction protein ArdA × 2 （A0A0M2A928） Type I restriction enzyme R Protein × 1 （Q304R3） Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein × 1 （P10485）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T1M1_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–520； UniProt 1–520 作者链 D； PDB构建体 1–520； UniProt 1–520

Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein

Escherichia coli

UniProt P10485

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Antirestriction protein ArdA × 2 （A0A0M2A928） Type I restriction enzyme R Protein × 1 （Q304R3） Type I restriction enzyme EcoR124II M protein × 2 （P10484）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T1S1_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–404； UniProt 1–404

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7btr
沉积日期 deposition_date	2020-04-02
结构标题 title	EcoR124I-ArdA in the Restriction-Alleviation State
关键词 keywords	Cryoelectron microscopy, Innate immune mechanism, Complex, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7btr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7btr__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7btr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	44.19 Å
Rg（电子密度）	43.79 Å
总 Rg	44.16 Å
原子数	16737
残基数	2087
排除体积	297670 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7btr__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Antirestriction protein ArdA
分子量 formula_weight	19135.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F
原子数 atom_count	16737

MDDMQVYIANLGKYNEGELVGAWFTFPIDFEEVKEKIGLNDEYEEYAIHDYELPFTVDEYTSIGELNRLWEMVSELPEELQSELSALLTHFSSIEELSEHQEDIIIHSDCDDMYDVARYYIEETGALGEVPASLQNYIDYQAYGRDLDLSGTFISTNHGIFEIVY

来源 Source

来源生物 organism	Enterococcus faecalis EnGen0302
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1158660
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Type I restriction enzyme R Protein
分子量 formula_weight	120278.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.21.3
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MTHQTHTIAESNNFIVLDKYIKAEPTGDSYQSESDLERELIQDLRNQGYEFISVKSQSAMLANVREQLQNLNGVVFNDSEWRRFTEQYLDNPSDGILDKTRKIHIDYICDFIFDDERLENIYLIDKKNLMRNKVQIIQQFEQAGSHANRYDVTILVNGLPLVQIELKKRGVAIREAFNQIHRYSKESFNSENSLFKYLQLFVISNGTDTRYFANTTKRDKNSFDFTMNWAKSDNTLIKDLKDFTATCFQKHTLLNVLVNYSVFDSSQTLLVMRPYQIAATERILWKIKSSFTAKNWSKPESGGYIWHTTGSGKTLTSFKAARLATELDFIDKVFFVVDRKDLDYQTMKEYQRFSPDSVNGSENTAGLKRNLDKDDNKIIVTTIQKLNNLMKAESDLPVYNQQVVFIFDECHRSQFGEAQKNLKKKFKRYYQFGFTGTPIFPENALGSETTASVFGRELHSYVITDAIRDEKVLKFKVDYNDVRPQFKSLETETDEKKLSAAENQQAFLHPMRIQEITQYILNNFRQKTHRTFPGSKGFNAMLAVSSVDAAKAYYATFKRLQEEAANKSATYKPLRIATIFSFAANEEQNAIGEISDETFDTSAMDSSAKEFLDAAIREYNSHFKTNFSTDSNGFQNYYRDLAQRVKNQDIDLLIVVGMFLTGFDAPTLNTLFVDKNLRYHGLMQAFSRTNRIYDATKTFGNIVTFRDLERSTIDAITLFGDKNTKNVVLEKSYTEYMEGFTDAATGEAKRGFMTVVSELEQRFPDPTSIESEKEKKDFVKLFGEYLRAENILQNYDEFATLKALQQIDLSDPVAVEKFKAEHYVDDEKFAELQTIRLPADRKIQDYRSAYNDIRDWQRREKEAEKKEKSTTDWDDVVFEVDLLKSQEINLDYILGLIFEHNRQNKGKGEMIEEVKRLIRSSLGNRAKEGLVVDFIQQTNLDDLPDKASIIDAFFTFAQREQQREAEALIKEENLNEDAAKRYIRTSLKREYATENGTELNETLPKLSPLNPQYKTKKQAVFQKIVSFIEKFKGVGGKI

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Type I restriction enzyme EcoR124II M protein
分子量 formula_weight	58077.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.72
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,A

MKMTSIQQRAELHRQIWQIANDVRGSVDGWDFKQYVLGALFYRFISENFSSYIEAGDDSICYAKLDDSVITDDIKDDAIKTKGYFIYPSQLFCNVAAKANTNDRLNADLNSIFVAIESSAYGYPSEADIKGLFADFDTTSNRLGNTVKDKNARLAAVLKGVEGLKLGDFNEHQIDLFGDAYEFLISNYAANAGKSGGEFFTPQHVSKLIAQLAMHGQTHVNKIYDPAAGSGSLLLQAKKQFDNHIIEEGFFGQEINHTTYNLARMNMFLHNINYDKFDIKLGNTLTEPHFRDEKPFDAIVSNPPYSVKWIGSDDPTLINDERFAPAGVLAPKSKADFAFVLHALNYLSAKGRAAIVCFPGIFYRGGAEQKIRQYLVDNNYVETVISLAPNLFFGTTIAVNILVLSKHKTDTNVQFIDASELFKKETNNNILTDAHIEQIMQVFASKEDVAHLAKSVAFETVVANDYNLSVSSYVEAKDNREIIDIAELNAELKTTVSKIDQLRKDIDAIVAEIEGCEVQK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein
分子量 formula_weight	46235.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSEMSYLEKLLDGVEVEWLPLGEITKYEQPTKYLVKAKDYHDTYTIPVLTAGKTFILGYTNETHGIYQASKAPVIIFDDFTTANKWVDFDFKAKSSAMKMVTSCDDNKTLLKYVYYWLNTLPSEFAEGDHKRQWISNYSQKKIPIPCPDNPEKSLAIQSEIVRILDKFTALTAELTAELNMRKKQYNYYRDQLLSFKEGEVEWKTLGEIGKWYGGGTPSKNKIEFWENGSIPWISPKDMGRTLVDSSEDYITEEAVLHSSTKLIPANSIAIVVRSSILDKVLPSALIKVPATLNQDMKAVIPHENILVKYIYHMIGSRGSDILRAAKKTGGSVASIDSKKLFSFKIPVPNINEQQRIVEILDKFDTLTNSITEGLPREIELRQKQYEYYRDLLFSFPKPETVSN

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.54 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	263630

EcoR124I-ArdA in the Restriction-Alleviation State

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antirestriction protein ArdA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Type I restriction enzyme R Protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Type I restriction enzyme EcoR124II M protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7btr__assembly_1__model_1

7btr__assembly_1__model_1 | I(q)

7btr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

EcoR124I-ArdA in the Restriction-Alleviation State

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antirestriction protein ArdA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type I restriction enzyme R Protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type I restriction enzyme EcoR124II M protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type-1 restriction enzyme EcoR124II specificity protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7btr__assembly_1__model_1

7btr__assembly_1__model_1 | I(q)

7btr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)