SAXSdb — 7bvf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Probable arabinosyltransferase B

Mycobacterium tuberculosis H37Rv

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Probable arabinosyltransferase A × 1 （P9WNL9） Meromycolate extension acyl carrier protein × 1 （A0R0B3） CALCIUM ION × 1 Ethambutol × 1 MONO-TRANS, OCTA-CIS DECAPRENYL-PHOSPHATE × 1 CARDIOLIPIN × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EMBB_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1098； UniProt 1–1098

Probable arabinosyltransferase A

Mycobacterium tuberculosis H37Rv

UniProt P9WNL9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Probable arabinosyltransferase B × 1 （P9WNL7） Meromycolate extension acyl carrier protein × 1 （A0R0B3） CALCIUM ION × 1 Ethambutol × 1 MONO-TRANS, OCTA-CIS DECAPRENYL-PHOSPHATE × 1 CARDIOLIPIN × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EMBA_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 10–1102； UniProt 2–1094

Meromycolate extension acyl carrier protein

物种未注明

UniProt A0R0B3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Probable arabinosyltransferase B × 1 （P9WNL7） Probable arabinosyltransferase A × 1 （P9WNL9） CALCIUM ION × 1 Ethambutol × 1 MONO-TRANS, OCTA-CIS DECAPRENYL-PHOSPHATE × 1 CARDIOLIPIN × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACPM_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7bvf
沉积日期 deposition_date	2020-04-10
结构标题 title	Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis arabinosyltransferase EmbA-EmbB-AcpM2 in complex with ethambutol
关键词 keywords	;Mycobacterium tuberculosis, cell wall synthesis, drug target, ethambutol, arabinosyltransferase, EmbA, EmbB, EmbC, acyl carrier protein, arabinogalactan, lipoarabinomannan, drug resistance, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7bvf__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7bvf__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7bvf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	42.36 Å
Rg（电子密度）	41.48 Å
总 Rg	42.02 Å
原子数	16933
残基数	2221
排除体积	305830 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7bvf__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Probable arabinosyltransferase B
分子量 formula_weight	120332.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	16933

MTQCASRRKSTPNRAILGAFASARGTRWVATIAGLIGFVLSVATPLLPVVQTTAMLDWPQRGQLGSVTAPLISLTPVDFTATVPCDVVRAMPPAGGVVLGTAPKQGKDANLQALFVVVSAQRVDVTDRNVVILSVPREQVTSPQCQRIEVTSTHAGTFANFVGLKDPSGAPLRSGFPDPNLRPQIVGVFTDLTGPAPPGLAVSATIDTRFSTRPTTLKLLAIIGAIVATVVALIALWRLDQLDGRGSIAQLLLRPFRPASSPGGMRRLIPASWRTFTLTDAVVIFGFLLWHVIGANSSDDGYILGMARVADHAGYMSNYFRWFGSPEDPFGWYYNLLALMTHVSDASLWMRLPDLAAGLVCWLLLSREVLPRLGPAVEASKPAYWAAAMVLLTAWMPFNNGLRPEGIIALGSLVTYVLIERSMRYSRLTPAALAVVTAAFTLGVQPTGLIAVAALVAGGRPMLRILVRRHRLVGTLPLVSPMLAAGTVILTVVFADQTLSTVLEATRVRAKIGPSQAWYTENLRYYYLILPTVDGSLSRRFGFLITALCLFTAVFIMLRRKRIPSVARGPAWRLMGVIFGTMFFLMFTPTKWVHHFGLFAAVGAAMAALTTVLVSPSVLRWSRNRMAFLAALFFLLALCWATTNGWWYVSSYGVPFNSAMPKIDGITVSTIFFALFAIAAGYAAWLHFAPRGAGEGRLIRALTTAPVPIVAGFMAAVFVASMVAGIVRQYPTYSNGWSNVRAFVGGCGLADDVLVEPDTNAGFMKPLDGDSGSWGPLGPLGGVNPVGFTPNGVPEHTVAEAIVMKPNQPGTDYDWDAPTKLTSPGINGSTVPLPYGLDPARVPLAGTYTTGAQQQSTLVSAWYLLPKPDDGHPLVVVTAAGKIAGNSVLHGYTPGQTVVLEYAMPGPGALVPAGRMVPDDLYGEQPKAWRNLRFARAKMPADAVAVRVVAEDLSLTPEDWIAVTPPRVPDLRSLQEYVGSTQPVLLDWAVGLAFPCQQPMLHANGIAEIPKFRITPDYSAKKLDTDTWEDGTNGGLLGITDLLLRAHVMATYLSRDWARDWGSLRKFDTLVDAPPAQLELGTATRSGLWSPGKIRIGPHLGGIKAFHHHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis H37Rv
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis MC2 155

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Probable arabinosyltransferase A
分子量 formula_weight	116789.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

DYKDDDDKVPHDGNERSHRIARLAAVVSGIAGLLLCGIVPLLPVNQTTATIFWPQGSTADGNITQITAPLVSGAPRALDISIPCSAIATLPANGGLVLSTLPAGGVDTGKAGLFVRANQDTVVVAFRDSVAAVAARSTIAAGGCSALHIWADTGGAGADFMGIPGGAGTLPPEKKPQVGGIFTDLKVGAQPGLSARVDIDTRFITTPGALKKAVMLLGVLAVLVAMVGLAALDRLSRGRTLRDWLTRYRPRVRVGFASRLADAAVIATLLLWHVIGATSSDDGYLLTVARVAPKAGYVANYYRYFGTTEAPFDWYTSVLAQLAAVSTAGVWMRLPATLAGIACWLIVSRFVLRRLGPGPGGLASNRVAVFTAGAVFLSAWLPFNNGLRPEPLIALGVLVTWVLVERSIALGRLAPAAVAIIVATLTATLAPQGLIALAPLLTGARAIAQRIRRRRATDGLLAPLAVLAAALSLITVVVFRDQTLATVAESARIKYKVGPTIAWYQDFLRYYFLTVESNVEGSMSRRFAVLVLLFCLFGVLFVLLRRGRVAGLASGPAWRLIGTTAVGLLLLTFTPTKWAVQFGAFAGLAGVLGAVTAFTFARIGLHSRRNLTLYVTALLFVLAWATSGINGWFYVGNYGVPWYDIQPVIASHPVTSMFLTLSILTGLLAAWYHFRMDYAGHTEVKDNRRNRILASTPLLVVAVIMVAGEVGSMAKAAVFRYPLYTTAKANLTALSTGLSSCAMADDVLAEPDPNAGMLQPVPGQAFGPDGPLGGISPVGFKPEGVGEDLKSDPVVSKPGLVNSDASPNKPNAAITDSAGTAGGKGPVGINGSHAALPFGLDPARTPVMGSYGENNLAATATSAWYQLPPRSPDRPLVVVSAAGAIWSYKEDGDFIYGQSLKLQWGVTGPDGRIQPLGQVFPIDIGPQPAWRNLRFPLAWAPPEADVARIVAYDPNLSPEQWFAFTPPRVPVLESLQRLIGSATPVLMDIATAANFPCQRPFSEHLGIAELPQYRILPDHKQTAASSNLWQSSSTGGPFLFTQALLRTSTIATYLRGDWYRDWGSVEQYHRLVPADQAPDAVVEEGVITVPGWGRPGPIRALP

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis H37Rv
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis MC2 155

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Meromycolate extension acyl carrier protein
分子量 formula_weight	10743.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MAATQEEIIAGLAEIIEEVTGIEPSEVTPEKSFVDDLDIDSLSMVEIAVQTEDKYGVKIPDEDLAGLRTVGDVVAYIQKLEEENPEAAAALREKFAADQ

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	Ethambutol
分子量 formula_weight	204.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MONO-TRANS, OCTA-CIS DECAPRENYL-PHOSPHATE
分子量 formula_weight	779.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d7bvfp_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.28.1 — ACP-like
家族 Family family	a.28.1.0 — automated matches

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.97 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	521803

Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis arabinosyltransferase EmbA-EmbB-AcpM2 in complex with ethambutol

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Probable arabinosyltransferase B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable arabinosyltransferase A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Meromycolate extension acyl carrier protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bvf__assembly_1__model_1

7bvf__assembly_1__model_1 | I(q)

7bvf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis arabinosyltransferase EmbA-EmbB-AcpM2 in complex with ethambutol

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Probable arabinosyltransferase B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable arabinosyltransferase A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Meromycolate extension acyl carrier protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bvf__assembly_1__model_1

7bvf__assembly_1__model_1 | I(q)

7bvf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)