7c4j

Cryo-EM structure of the yeast Swi/Snf complex in a nucleosome free state

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription regulatory protein SNF12

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SNF12_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–566； UniProt 1–566

SWI/SNF complex subunit SWI3

物种未注明

UniProt P32591

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SWI3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–825； UniProt 1–825 作者链 D； PDB构建体 1–825； UniProt 1–825

Transcription regulatory protein SNF6

物种未注明

UniProt P18888

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SNF6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–332； UniProt 1–332

SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82

物种未注明

UniProt P43554

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SWP82_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–623； UniProt 1–623

SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5

物种未注明

UniProt P18480

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SNF5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–905； UniProt 1–905

Transcription regulatory protein SNF2

物种未注明

UniProt P22082

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SNF2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–1703； UniProt 1–1703

SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1

物种未注明

UniProt P09547

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SWI1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–1314； UniProt 1–1314

Regulator of Ty1 transposition protein 102

物种未注明

UniProt P53330

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Actin-related protein 7 × 1 （Q12406） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RT102_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

Actin-related protein 7

物种未注明

UniProt Q12406

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-like protein ARP9 × 1 （Q05123）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–477； UniProt 1–477

Actin-like protein ARP9

物种未注明

UniProt Q05123

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Transcription regulatory protein SNF12 × 1 （P53628） SWI/SNF complex subunit SWI3 × 2 （P32591） Transcription regulatory protein SNF6 × 1 （P18888） SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82 × 1 （P43554） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5 × 1 （P18480） Transcription regulatory protein SNF2 × 1 （P22082） SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1 × 1 （P09547） Unkown × 1 Regulator of Ty1 transposition protein 102 × 1 （P53330） Actin-related protein 7 × 1 （Q12406）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7c4j
沉积日期 deposition_date	2020-05-18
结构标题 title	Cryo-EM structure of the yeast Swi/Snf complex in a nucleosome free state
关键词 keywords	SWI/SNF remodeling, Swi-Snf complex, nucleosome, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7c4j__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7c4j__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7c4j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.21 Å
Rg（电子密度）	65.25 Å
总 Rg	65.17 Å
原子数	29730
残基数	3659
排除体积	531960 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7c4j__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription regulatory protein SNF12
分子量 formula_weight	63947.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	29757

MSKVMKPSNGKGSRKSSKAATPDTKNFFHAKKKDPVNQDKANNASQITPTVPHSHPSDMVIPDHLAELIPELYSFQQLVDSEKRLDHFIHLRNLHMKRMVAQWERSKLSQEFLYPHLNFPNVKFLRIFISNVSENQPWQMDTNNEADLMALENATWTMRIEGRLLDNVQANDPAREKFSSFIESIVVDFKNKENDNVPSTKFNAAPEENATEGPSDKKLNLNLPLQFSLPNGDNSTTTNTDQNNATMGEETAKKDMSSTTPKLESVKWQYDPNNPVDFDGLDIKRVGSENVECTISILRKSSPEEPFMSYSPQLTAIIGLKSGTSHDAIFSIYKYIHLNELLTNDESAFENLMGNRNNHNSNTSTSKMLDAASSQVSIVKLDTQLITLLPSSLKESSPDTMKLTDLLSLINSTHLLPLQPIEIDYTVRVDKASTYGELVLDIEVPDVNALKFNNTQRESQIGAAELNENARELEQIKPKIALQDKEITSVLSNLHESNKRYRFFKKISEDPVKALNECIASTSNALKVLSGDEGYNEDMVRRANFYKENEAMLRENIEVILSNGRM

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SWI/SNF complex subunit SWI3
分子量 formula_weight	93034.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MENTLGEGSTVNASVDVDQHGNDNNSDSNANAAVAGVANTDTAGEESQQQDESLKDEATVPNTRDAESEAITVTAKQQPTMQANKLDSQETPSTEESRAQNVFGQDNEDSDNLFGETESSVSNNEANTPSIPTNPVDNENNKPAIKEDSTIQDSNGDVKNMEDVKIQKEEEPENNTVIEGVKEESQPDENTKEMDEVEEDDEDDDQPMISPDNSIFGDTKSESKQLGNTSSVANTPSEIPDAHKAEQEDIIEKTESVDKKVDSGEERNEQEREIMNDHSKSANPKKTTITRVEPETFEIPQAHEIVIPSYSKWFNLEKIHSIEVQSLPEFFTNRIPSKTPEVYMRYRNFMVNSYRLNPNEYFSVTTARRNVSGDAAALFRLHKFLTKWGLINYQVDSKLLPKNIEPPLTSQYSTRHDAPRGLFPFESYKPSVQLPDMAKLKKMMNTSDSESTLYKYLKESKRKYDEITHPPSTTDDENGDKNDNGGKMNNEVSTSTSMTGDANLLEEGETSRPLKKVKILEQIDENWSKEDLQKLLKGIQEFGADWYKVAKNVGNKSPEQCILRFLQLPIEDKFLYGDGNGKGDNDNGLGPLKYAPHLPFSKSENPVLSTIAFLVGLVNPKTVQSMTQRAIQSAESIKSQKEEISDQKPIEHIKEGSEIAISSLGYRSHIFATNEERQMNFLTNELIRLQMEKLDAKLNHLKKLEKFMELERKTLERQQENLLIQRLNFNQNSSKIVNVLSKCLNLISDSNINNSSVAEKEEIRSQIDHFKSMLSKPETLSIGKNPFNKPNIETGENHNGQSISNENDVKPISIEAPQFYRYWSA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Transcription regulatory protein SNF6
分子量 formula_weight	37652.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MGVIKKKRSHHGKASRQQYYSGVQVGGVGSMGAINNNIPSLTSFAEENNYQYGYSGSSAGMNGRSLTYAQQQLNKQRQDFERVRLRPEQLSNIIHDESDTISFRSNLLKNFISSNDAFNMLSLTTVPCDRIEKSRLFSEKTIRYLMQKQHEMKTQAAELQEKPLTPLKYTKLIAAAEDGSRSTKDMIDAVFEQDSHLRYQPDGVVVHRDDPALVGKLRGDLREAPADYWTHAYRDVLAQYHEAKERIRQKEVTAGEAQDEASLQQQQQQDLQQQQQVVTTVASQSPHATATEKEPVPAVVDDPLENMFGDYSNEPFNTNFDDEFGDLDAVFF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82
分子量 formula_weight	70366.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MLGEDEGNTVLEKGNNPSVKQGEVGAVFIVPKILIREHERVILKQILQILDQDELVQPPLDKFPYKKLELPKYIDELKTRDATNTSYKMIQLDAYGEKKVGSNGELFGGRHYLFNTFTFTAHMGVLLVLLQDVIKVLYQSNATHDEDEFIVQHDQILVMETSEEQTKFLAKNGVIPEESKGSFKYITARSAFVEFGASVIAGGQRIVDDYWESLAKKQNLSSHQRVFKLSTNLISKISLLRPSFQNNRISNANEISANTNNTCTISTSKFESQYPIVTEQPSAEIREAYIENFAKGEHISAIVPGQSISGTLELSAQFRVPRYHSKNSFQQALQMKAMDIPIGRHEELLAQYESQAPDGSASISLPNHIPSVNPSNKPIKRMLSSILDINVSSSKNKKSEENEMIKPMNKGQHKNNTSLNINGWKFESLPLKSAENSGKQQYYRGLPLYEKNTLLERLKQLTPNEIKELEHLHDAVFVNTGLQNVRKVRTKKWKKYWQYKAGIPIGLKRSQLDEFKNKYLKDVLAQTSVTTNFNEITNTDETITTKRVPNPNFLGNCNIKDFKPPYIYSHVNKVPQNVAGDKTAVKLDTEVKNTNANPVVATDPVAAKPDNLANFSNEVAMNN

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5
分子量 formula_weight	102642.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MNNQPQGTNSVPNSIGNIFSNIGTPSFNMAQIPQQLYQSLTPQQLQMIQQRHQQLLRSRLQQQQQQQQQTSPPPQTHQSPPPPPQQSQPIANQSATSTPPPPPAPHNLHPQIGQVPLAPAPINLPPQIAQLPLATQQQVLNKLRQQAIAKNNPQVVNAITVAQQQVQRQIEQQKGQQTAQTQLEQQRQLLVQQQQQQQLRNQIQRQQQQQFRHHVQIQQQQQKQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGQIPQSQQVPQVRSMSGQPPTNVQPTIGQLPQLPKLNLPKYQTIQYDPPETKLPYPTYWSDKKADTDTLLYEQIIQRDKINKYSLIRETNGYDPFSIYGFSNKEYISRLWHTLKYYQDLKNTRMKSITSTSQKIPSASIWGNGYSGYGNGITNTTTRVIPQVEVGNRKHYLEDKLKVYKQAMNETSEQLVPIRLEFDQDRDRFFLRDTLLWNKNDKLIKIEDFVDDMLRDYRFEDATREQHIDTICQSIQEQIQEFQGNPYIELNQDRLGGDDLRIRIKLDIVVGQNQLIDQFEWDISNSDNCPEEFAESMCQELELPGEFVTAIAHSIREQVHMYHKSLALLGYNFDGSAIEDDDIRSRMLPTITLDDVYRPAAESKIFTPNLLQISAAELERLDKDKDRDTRRKRRQGRSNRRGMLALSGTSASNTSMNGVHNTVAAGNASSLPPGEILLPDIADIPRTFRTPVPSTLMPGGVDVGPSVESYELRNTTTYKSRPDRPKPVSPPCYIIDHIPGHSLLLSIKLPGKVNTKEEFAAAPNDTSSGTNAMLPSPESLKTKLNSNIRAGVTIPSIPNPIANHTVTNSPNPTLQPVIPGGAASKSVPTPSLPIAPPVAPHDSEATLLTNSNNGSSNNNTQNT

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Transcription regulatory protein SNF2
分子量 formula_weight	194315.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MNIPQRQFSNEEVNRCYLRWQHLRNEHGMNAPSVPEFIYLTKVLQFAAKQRQELQMQRQQQGISGSQQNIVPNSSDQAELPNNASSHISASASPHLAPNMQLNGNETFSTSAHQSPIMQTQMPLNSNGGNNMLPQRQSSVGSLNATNFSPTPANNGENAAEKPDNSNHNNLNLNNSELQPQNRSLQEHNIQDSNVMPGSQINSPMPQQAQMQQAQFQAQQAQQAQQAQQAQQAQARLQQGRRLPMTMFTAEQSELLKAQITSLKCLVNRKPIPFEFQAVIQKSINHPPDFKRMLLSLSEFARRRQPTDQNNQSNLNGGNNTQQPGTNSHYNNTNTDNVSGLTRNAPLDSKDENFASVSPAGPSSVHNAKNGTLDKNSQTVSGTPITQTESKKEENETISNVAKTAPNSNKTHTEQNNPPKPQKPVPLNVLQDQYKEGIKVVDIDDPDMMVDSFTMPNISHSNIDYQTLLANSDHAKFTIEPGVLPVGIDTHTATDIYQTLIALNLDTTVNDCLDKLLNDECTESTRENALYDYYALQLLPLQKAVRGHVLQFEWHQNSLLTNTHPNFLSKIRNINVQDALLTNQLYKNHELLKLERKKTEAVARLKSMNKSAINQYNRRQDKKNKRLKFGHRLIATHTNLERDEQKRAEKKAKERLQALKANDEEAYIKLLDQTKDTRITHLLRQTNAFLDSLTRAVKDQQKYTKEMIDSHIKEASEEVDDLSMVPKMKDEEYDDDDDNSNVDYYNVAHRIKEDIKKQPSILVGGTLKDYQIKGLQWMVSLFNNHLNGILADEMGLGKTIQTISLLTYLYEMKNIRGPYLVIVPLSTLSNWSSEFAKWAPTLRTISFKGSPNERKAKQAKIRAGEFDVVLTTFEYIIKERALLSKVKWVHMIIDEGHRMKNAQSKLSLTLNTHYHADYRLILTGTPLQNNLPELWALLNFVLPKIFNSVKSFDEWFNTPFANTGGQDKIELSEEETLLVIRRLHKVLRPFLLRRLKKDVEKELPDKVEKVVKCKMSALQQIMYQQMLKYRRLFIGDQNNKKMVGLRGFNNQIMQLKKICNHPFVFEEVEDQINPTRETNDDIWRVAGKFELLDRILPKLKATGHRVLIFFQMTQIMDIMEDFLRYINIKYLRLDGHTKSDERSELLRLFNAPDSEYLCFILSTRAGGLGLNLQTADTVIIFDTDWNPHQDLQAQDRAHRIGQKNEVRILRLITTNSVEEVILERAYKKLDIDGKVIQAGKFDNKSTSEEQEALLRSLLDAEEERRKKRESGVEEEEELKDSEINEILARNDEEMAVLTRMDEDRSKKEEELGVKSRLLEKSELPDIYSRDIGAELKREESESAAVYNGRGARERKTATYNDNMSEEQWLRQFEVSDDEKNDKQARKQRTKKEDKSEAIDGNGEIKGENIDADNDGPRINNISAEDRADTDLAMNDDDFLSKKRKAGRPRGRPKKVKLEGSENSEPPALESSPVTGDNSPSEDFMDIPKPRTAGKTSVKSARTSTRGRGRGRGRGRGRGRGRGRPPKARNGLDYVRTPAAATSPIDIREKVAKQALDLYHFALNYENEAGRKLSDIFLSKPSKALYPDYYMIIKYPVAFDNINTHIETLAYNSLKETLQDFHLIFSNARIYNTEGSVVYEDSLELEKVVTKKYCEIMGDNSQLDFTEFDEQYGTRPLVLPPVVTSSVAESFTDEADSSMTEASV

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1
分子量 formula_weight	148065.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MDFFNLNNNNNNNNTTTTTTTTNNNNTNNNNTNNNNNPANNTNNNNSTGHSSNTNNNTNNNNTNTGASGVDDFQNFFDPKPFDQNLDSNNNNSNSNNNDNNNSNTVASSTNFTSPTAVVNNAAPANVTGGKAANFIQNQSPQFNSPYDSNNSNTNLNSLSPQAILAKNSIIDSSNLPLQAQQQLYGGNNNNNSTGIANDNVITPHFITNVQSISQNSSSSTPNTNSNSTPNANQQFLPFNNSASNNGNLTSNQLISNYAASNSMDRSSSASNEFVPNTSDNNNNSNNHNMRNNSNNKTSNNNNVTAVPAATPANTNNSTSNANTVFSERAAMFAALQQKQQQRFQALQQQQQQQQNQQQQNQQPQQQQQQQQNPKFLQSQRQQQQRSILQSLNPALQEKISTELNNKQYELFMKSLIENCKKRNMPLQSIPEIGNRKINLFYLYMLVQKFGGADQVTRTQQWSMVAQRLQISDYQQLESIYFRILLPYERHMISQEGIKETQAKRIFLQQFLQELLKKVQQQQQAAALANANNNINSASSAPTPAAPGASVPATAAPGTEAGIVPVSANTPKSLNSNININVNNNNIGQQQVKKPRKQRVKKKTKKELELERKEREDFQKRQQKLLEDQQRQQKLLLETKLRQQYEIELKKLPKVYKRSIVRNYKPLINRLKHYNGYDINYISKIGEKIDSNKPIFLFAPELGAINLHALSMSLQSKNLGEINTALNTLLVTSADSNLKISLVKYPELLDSLAILGMNLLSNLSQNVVPYHRNTSDYYYEDAGSNQYYVTQHDKMVDKIFEKVNNNATLTPNDSNDEKVTILVDSLTGNQLPTPTPTEMEPDLDTECFISMQSTSPAVKQWDLLPEPIRFLPNQFPLKIHRTPYLTSLKKIKDEIDDPFTKINTRGAEDPKVLINDQLSTISMILRNISFSDNNSRIMSRNFYLKRFISDLLWLVLIHPENFTCNRKILNFKKDLVIVLSNISHLLEIASSIDCLLILILVISFGQPKLNPMASSSSFGSESLTFNEFQLQWGKYQTFGVDILAKLFSLEKPNLNYFKSILLNKNTGNNLYDRNSNNNHKDKKLLRRLLNLYNDNNKNNNNRHNLLNDVVSFLFSAIPLQQVLSQSADPSLLIDQFSPVISQSLTSILVIVQKILPLSNEVFEISENNSDSNSNNNGNKDSSFNFNKNLPFVWLSSEENIGSGLLKLSEIILNINNSTSKNTLLQQQNYSKVLLPSINISCVQLIKCLVEKSICFENCLNNDPEILKKIASIPNLFPTDLEIFQLFTNPSVDIQIINQYQLLYNLKNDILTNLE

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Unkown
分子量 formula_weight	7600.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

XXXXXGRXXXXXPXXXXXXXXXXXXXXXVXXTXXVTXLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTRXYLRFHXXXYXXXXXXX

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Regulator of Ty1 transposition protein 102
分子量 formula_weight	17817.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MDPQTLITKANKVSYYGNPTSKESWRYDWYQPSKVSSNVQQPQQQLGDMENNLEKYPFRYKTWLRNQEDEKNLQRESCEDILDLKEFDRRILKKSLMTSHTKGDTSKATGAPSANQGDEALSVDDIRGAVGNSEAIPGLSAGVNNDNTKESKDVKMN

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Actin-related protein 7
分子量 formula_weight	53863.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MTLNRKCVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQCIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEENDMENMADEQKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQEQLKQMDQQLQYTALTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKECYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSTNPNGLGTSHINTNVGDNNSTASSSNISPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRKQSQATNATN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Actin-like protein ARP9
分子量 formula_weight	53131.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MAPFRQDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRANKNQDAFEAELSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGNENEDEDEGTLNVAEIITSGRDTREVLEERERGQKVKNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGCNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQCPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	7c4jK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	7c4jK02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	7c4jK03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	7c4jL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	7c4jL02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.890 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.89 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	386469

Cryo-EM structure of the yeast Swi/Snf complex in a nucleosome free state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription regulatory protein SNF12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SWI/SNF complex subunit SWI3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription regulatory protein SNF6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SWI/SNF global transcription activator complex subunit SWP82

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SNF5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription regulatory protein SNF2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SWI/SNF chromatin-remodeling complex subunit SWI1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Regulator of Ty1 transposition protein 102

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-related protein 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-like protein ARP9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体