7d49

X-ray crystal Structure of E.coli Dihydrofolate Reductase complexed with folate and NADP+ at pH4.5

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dihydrofolate reductase

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	FOLIC ACID × 1 NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DYR_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7d49
沉积日期 deposition_date	2020-09-23
结构标题 title	X-ray crystal Structure of E.coli Dihydrofolate Reductase complexed with folate and NADP+ at pH4.5
关键词 keywords	dihydrofolate, reductase, alpha-beta sandiwitch, NADPH, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7d49__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7d49__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7d49__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.66 Å
Rg（电子密度）	15.25 Å
总 Rg	16.33 Å
原子数	1348
残基数	159
排除体积	23573 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7d49__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`7d49__assembly_1__model_2`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`7d49__assembly_1__model_3`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`7d49__assembly_1__model_4`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`7d49__assembly_1__model_5`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`7d49__assembly_1__model_6`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`7d49__assembly_1__model_7`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`7d49__assembly_1__model_8`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`7d49__assembly_1__model_9`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`7d49__assembly_1__model_10`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`7d49__assembly_1__model_11`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`7d49__assembly_1__model_12`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`7d49__assembly_1__model_13`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`7d49__assembly_1__model_14`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`7d49__assembly_1__model_15`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`7d49__assembly_1__model_16`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`7d49__assembly_1__model_17`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`7d49__assembly_1__model_18`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`7d49__assembly_1__model_19`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`7d49__assembly_1__model_20`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`7d49__assembly_1__model_21`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`7d49__assembly_1__model_22`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`7d49__assembly_1__model_23`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`7d49__assembly_1__model_24`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`7d49__assembly_1__model_25`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`7d49__assembly_1__model_26`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`7d49__assembly_1__model_27`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`7d49__assembly_1__model_28`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`7d49__assembly_1__model_29`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`7d49__assembly_1__model_30`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	31	`7d49__assembly_1__model_31`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	32	`7d49__assembly_1__model_32`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	33	`7d49__assembly_1__model_33`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	34	`7d49__assembly_1__model_34`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	35	`7d49__assembly_1__model_35`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	36	`7d49__assembly_1__model_36`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	37	`7d49__assembly_1__model_37`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	38	`7d49__assembly_1__model_38`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	39	`7d49__assembly_1__model_39`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	40	`7d49__assembly_1__model_40`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	41	`7d49__assembly_1__model_41`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	42	`7d49__assembly_1__model_42`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	43	`7d49__assembly_1__model_43`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	44	`7d49__assembly_1__model_44`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	45	`7d49__assembly_1__model_45`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	46	`7d49__assembly_1__model_46`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	47	`7d49__assembly_1__model_47`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	48	`7d49__assembly_1__model_48`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	49	`7d49__assembly_1__model_49`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	50	`7d49__assembly_1__model_50`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	51	`7d49__assembly_1__model_51`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	52	`7d49__assembly_1__model_52`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	53	`7d49__assembly_1__model_53`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	54	`7d49__assembly_1__model_54`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	55	`7d49__assembly_1__model_55`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	56	`7d49__assembly_1__model_56`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	57	`7d49__assembly_1__model_57`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	58	`7d49__assembly_1__model_58`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	59	`7d49__assembly_1__model_59`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	60	`7d49__assembly_1__model_60`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	61	`7d49__assembly_1__model_61`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	62	`7d49__assembly_1__model_62`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	63	`7d49__assembly_1__model_63`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	64	`7d49__assembly_1__model_64`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	65	`7d49__assembly_1__model_65`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	66	`7d49__assembly_1__model_66`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	67	`7d49__assembly_1__model_67`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	68	`7d49__assembly_1__model_68`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	69	`7d49__assembly_1__model_69`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	70	`7d49__assembly_1__model_70`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	71	`7d49__assembly_1__model_71`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	72	`7d49__assembly_1__model_72`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	73	`7d49__assembly_1__model_73`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	74	`7d49__assembly_1__model_74`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	75	`7d49__assembly_1__model_75`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	76	`7d49__assembly_1__model_76`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	77	`7d49__assembly_1__model_77`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	78	`7d49__assembly_1__model_78`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	79	`7d49__assembly_1__model_79`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	80	`7d49__assembly_1__model_80`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Dihydrofolate reductase
分子量 formula_weight	18020.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.5.1.3
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	113251

MISLIAALAVDRVIGMENAMPWNLPADLAWFKRNTLDKPVIMGRHTWESIGRPLPGRKNIILSSQPGTDDRVTWVKSVDEAIAACGDVPEIMVIGGGRVYEQFLPKAQKLYLTHIDAEVEGDTHFPDYEPDDWESVFSEFHDADAQNSHSYCFEILERR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	FOLIC ACID
分子量 formula_weight	441.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	743.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	79

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d7d49a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.71 — Dihydrofolate reductase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.71.1 — Dihydrofolate reductase-like
家族 Family family	c.71.1.1 — Dihydrofolate reductases

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晶胞边长 a length_a	34.102 Å
晶胞边长 b length_b	45.595 Å
晶胞边长 c length_c	99.113 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.651 Å
最低分辨率 resolution_low	27.309 Å
R 因子 r_factor	0.1367
R_work r_work	0.1350
R_free r_free	0.1705

X-ray crystal Structure of E.coli Dihydrofolate Reductase complexed with folate and NADP+ at pH4.5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dihydrofolate reductase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7d49__assembly_1__model_1

7d49__assembly_1__model_1 | I(q)

7d49__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

X-ray crystal Structure of E.coli Dihydrofolate Reductase complexed with folate and NADP+ at pH4.5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dihydrofolate reductase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7d49__assembly_1__model_1

7d49__assembly_1__model_1 | I(q)

7d49__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)