7d8t

MITF bHLHLZ complex with M-box DNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microphthalmia-associated transcription factor,Methionyl-tRNA synthetase beta subunit

Aquifex aeolicus VF5

UniProt O66738

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*TP*GP*TP*TP*AP*CP*AP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*AP*CP*AP*TP*GP*TP*GP*TP*CP*CP*CP*C)-3') ; × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O66738_AQUAE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 92–195; UniProt 8–111 作者链 B; PDB构建体 92–195; UniProt 8–111

Microphthalmia-associated transcription factor,Methionyl-tRNA synthetase beta subunit

Aquifex aeolicus VF5

UniProt O75030

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*TP*GP*TP*TP*AP*CP*AP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*AP*CP*AP*TP*GP*TP*GP*TP*CP*CP*CP*C)-3') ; × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MITF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–91; UniProt 306–395 作者链 B; PDB构建体 2–91; UniProt 306–395

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7d8t
沉积日期 deposition_date2020-10-09
结构标题 titleMITF bHLHLZ complex with M-box DNA
关键词 keywordsTRANSCRIPTION FACTOR, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7d8t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7d8t__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7d8t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)34.42 Å
Rg(电子密度)34.06 Å
总 Rg34.47 Å
原子数3599
残基数430
排除体积62058 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7d8t__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7d8tA01
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology280 — MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id7d8tA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id7d8tB01
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology280 — MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Helix-loop-helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id7d8tB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
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7. 引用文献 (1)