Huntingtin
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–38 链 A; UniProt 39–3142 | 未记录 | 40-kDa huntingtin-associated protein × 1 (P23610) | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE | 分辨率 3.60 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7DXJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LD0 Solution structure of the N-terminal domain of huntingtin (htt17) in 50 % TFE 提交 2011-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–17(17 aa)
片段:N-terminal residues 1-17
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2;293 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR样品组成
0.2 - 0.3 mM 15N labeled at PHE11 htt17, 10 % D2O, 50 % d3 TFE, 40 % PBS, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
|
分辨率未提供 |
| 2LD2 Solution structure of the N-terminal domain of huntingtin (htt17) in presence of DPC micelles 提交 2011-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–17(17 aa)
片段:N-terminal residues 1-17
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;293 K;离子强度(mmCIF原始值)0.025;压力 ambient
NMR样品组成
0.2-0.3 mM 15N labeled at PHE11 htt17, 10 % D2O, 25 mM sodium phosphate, 100 mM d38 DPC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3IO4 Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - Crystal C90 提交 2009-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;277 K;12% polyethylene glycol, 200 mM Zn Acetate, 200 mM Sodium Acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5 to 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.63 Å R-free 0.304 |
| 3IO6 Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C92-a 提交 2009-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.293 |
| 3IOR Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C95 提交 2009-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;278 K;12% PEG 4000, 200 mM Zn acetate, 200 mM Sodium acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5-7.4 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.267 |
| 3IOT Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C92-b 提交 2009-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 CA CALCIUM ION × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;278 K;12% PEG 4000, 200 mM Zn acetate, 200 mM Sodium acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5-7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.295 |
| 3IOU Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C94 提交 2009-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 CA CALCIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;278 K;12% PEG 4000, 200 mM Zn acetate, 200 mM Sodium acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5-7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.299 |
| 3IOV Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C99 提交 2009-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;278 K;12% PEG 4000, 200 mM Zn acetate, 200 mM Sodium acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5-7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.280 |
| 3IOW Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C99-Hg 提交 2009-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 B
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
链 C
1–64(64 aa)
片段:Fusion protein, see remark 999,Fusion protein, see remark 999
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 CA CALCIUM ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;278 K;12% PEG 4000, 200 mM Zn acetate, 200 mM Sodium acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5-7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.281 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 J
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 L
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 N
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 3LRH Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide 提交 2010-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 P
5–18(14 aa)
片段:huntingtin peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;10 % PEG600, 0.1 mM potassium phosphate dibasic/citric acid, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.278 |
| 4FE8 Crystal Structure of Htt36Q3H-EX1-X1-C1(Alpha) 提交 2012-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain (UNP residues 1-164),Huntingtin protein exon1 domain (UNP residues 1-164)
链 B
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain (UNP residues 1-164),Huntingtin protein exon1 domain (UNP residues 1-164)
链 C
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain (UNP residues 1-164),Huntingtin protein exon1 domain (UNP residues 1-164)
|
突变:HQHQH,HQHQH 突变:HQHQH,HQHQH 突变:HQHQH,HQHQH | ZN ZINC ION × 31 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG12K, Na Acetate, Zn Acetate, Na Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 4FEB Crystal Structure of Htt36Q3H-EX1-X1-C2(Beta) 提交 2012-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
链 B
1–64(64 aa)
链 C
1–64(64 aa)
|
突变:HQHQH 突变:HQHQH 突变:HQHQH | ZN ZINC ION × 38 NA SODIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 6.5;278 K;PEG12K, Na Acetate, Zn Acetate, Na Cacodylate, pH 6.5, hanging drop, temperature 278K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 4FEC Crystal Structure of Htt36Q3H 提交 2012-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain
链 B
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain
链 C
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain
|
突变:HQHQH,HQHQH 突变:HQHQH,HQHQH 突变:HQHQH,HQHQH | ZN ZINC ION × 31 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG12K, Na Acetate, Zn Acetate, Na Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 4FED Crystal Structure of Htt36Q3H 提交 2012-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain,Huntingtin protein exon1 domain
链 B
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain,Huntingtin protein exon1 domain
链 C
1–64(64 aa)
片段:Huntingtin protein exon1 domain,Huntingtin protein exon1 domain
|
突变:HQHQH 突变:HQHQH 突变:HQHQH | ZN ZINC ION × 35 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG12K, Na Acetate, Zn Acetate, Na Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.269 |
| 4RAV Crystal structure of scFvC4 in complex with the first 17 AA of huntingtin 提交 2014-09-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 E
1–17(17 aa)
链 F
1–17(17 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;291 K;0.2 M ammonium sulphate, 25% PEG 4000 and 0.1 M sodium acetate buffer at pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.226 |
| 6EZ8 Human Huntingtin-HAP40 complex structure 提交 2017-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6N8C Structure of the Huntingtin tetramer/dimer mixture determined by paramagnetic NMR 提交 2018-11-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–24(23 aa)
链 B
2–24(23 aa)
链 C
2–24(23 aa)
链 D
2–24(23 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;278 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR测量条件
pH 6.5;283 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] httNT-Q7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM 2-13C glucose; U-15N httNT-Q7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-15N] httNT-Q7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.75 mM 2-13C glucose; U-15N httNT-Q7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM 2-13C glucose; U-15N httNT-Q7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6RMH The Rigid-body refined model of the normal Huntingtin. 提交 2019-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot 9 seconds
incubate 30 seconds
|
分辨率 9.60 Å |
| 6X9O High resolution cryoEM structure of huntingtin in complex with HAP40 提交 2020-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6YEJ Cryo-EM structure of the Full-length disease type human Huntingtin 提交 2020-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
18–3142(3125 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;30 seconds incubation
8 seconds blotting
|
分辨率 18.20 Å |
| 7DXK Human 128QHuntingtin-HAP40 complex structure 提交 2021-01-19 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–38(38 aa)
链 A
39–3142(3104 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8R2O Huntingtin-Q17, 1-66, N-MBP fusion 提交 2023-11-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–64(64 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.25;293 K;0.8 M KH2PO4, 0.8 M NaH2PO4,
and 0.1 M TRIS/HCl pH 8.25
|
分辨率 3.23 Å R-free 0.238 |
| 8R2O Huntingtin-Q17, 1-66, N-MBP fusion 提交 2023-11-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–64(64 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.25;293 K;0.8 M KH2PO4, 0.8 M NaH2PO4,
and 0.1 M TRIS/HCl pH 8.25
|
分辨率 3.23 Å R-free 0.238 |
| 8SAH Huntingtin C-HEAT domain in complex with HAP40 提交 2023-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2093–3136(1044 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8VLX HTT in complex with HAP40 and a small molecule. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | A1ACS N-[(1S,2R)-2-benzylcyclopentyl]-N'-{1-[(1S)-1-(pyridin-4-yl)ethyl]piperidin-4-yl}urea × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;25 mM Hepes, 300 mM NaCl, 0.025%CHAPS, 1mM DTT, 1mM Ligand, 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8W15 HTT in complex with HAP40 in the apo state. 提交 2024-02-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;25 mM Hepes, 300 mM NaCl, 0.025%CHAPS, 1mM DTT, 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 8YAE Cryo-ET structure of huntingtin actin complex 提交 2024-02-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.08 Å |
| 8YAO Cryo-ET structure of huntingtin actin dimer complex 提交 2024-02-09 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric |
链 A
1–3142(3142 aa)
链 a
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 20.80 Å |
| 9PMW Structure of HTTQ23-HAP40 complex bound to macrocycles HHL1, HD4 and HL2 提交 2025-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
| 9PN0 Structure of HTTQ23-HAP40 complex bound to macrocycles HHD3, HD4 and HL2 提交 2025-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 9YR6 Structure of HTTQ23-HAP40 complex bound to a small molecule ligand 提交 2025-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–3142(3142 aa)
|
未记录 | A1CYY 2-[(1R)-2,2-difluorocyclopropyl]-N-[(1-methyl-1H-indazol-6-yl)methyl]aniline × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
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| UniProt名称 | HD_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–38; UniProt 1–38 作者链 A; PDB构建体 64–3167; UniProt 39–3142 |