7eqg

Structure of Csy-AcrIF5

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CRISPR type I-F/YPEST-associated protein Csy2

Pseudomonas aeruginosa

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 14 DNA 2 RNA 1	CRISPR-associated protein Csy3 × 6 （A0A659BSG0） AcrIF5 × 5 （A0A7M3A7R4） type I-F CRISPR-associated endoribonuclease Cas6/Csy4 × 1 RNA (60-MER) × 1 DNA (54-MER) × 1 Type I-F CRISPR-associated protein Csy1 × 1 （A0A3A8DDU9） DNA (54-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B3G161_PSEAI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–327； UniProt 1–327

CRISPR-associated protein Csy3

Pseudomonas aeruginosa

UniProt A0A659BSG0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 14 DNA 2 RNA 1	CRISPR type I-F/YPEST-associated protein Csy2 × 1 （B3G161） AcrIF5 × 5 （A0A7M3A7R4） type I-F CRISPR-associated endoribonuclease Cas6/Csy4 × 1 RNA (60-MER) × 1 DNA (54-MER) × 1 Type I-F CRISPR-associated protein Csy1 × 1 （A0A3A8DDU9） DNA (54-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A659BSG0_PSEAI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 E； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 F； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 G； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 H； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 I； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342

AcrIF5

Pseudomonas aeruginosa

UniProt A0A7M3A7R4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 14 DNA 2 RNA 1	CRISPR type I-F/YPEST-associated protein Csy2 × 1 （B3G161） CRISPR-associated protein Csy3 × 6 （A0A659BSG0） type I-F CRISPR-associated endoribonuclease Cas6/Csy4 × 1 RNA (60-MER) × 1 DNA (54-MER) × 1 Type I-F CRISPR-associated protein Csy1 × 1 （A0A3A8DDU9） DNA (54-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A7M3A7R4_PSEAI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 K； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 P； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 Q； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 R； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

Type I-F CRISPR-associated protein Csy1

Pseudomonas aeruginosa

UniProt A0A3A8DDU9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 14 DNA 2 RNA 1	CRISPR type I-F/YPEST-associated protein Csy2 × 1 （B3G161） CRISPR-associated protein Csy3 × 6 （A0A659BSG0） AcrIF5 × 5 （A0A7M3A7R4） type I-F CRISPR-associated endoribonuclease Cas6/Csy4 × 1 RNA (60-MER) × 1 DNA (54-MER) × 1 DNA (54-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A3A8DDU9_PSEAI
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–434； UniProt 1–434

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7eqg
沉积日期 deposition_date	2021-05-01
结构标题 title	Structure of Csy-AcrIF5
关键词 keywords	complex, inhibitor, IMMUNE SYSTEM, IMMUNE SYSTEM-RNA-DNA complex; IMMUNE SYSTEM/RNA/DNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7eqg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7eqg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7eqg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.69 Å
Rg（电子密度）	55.36 Å
总 Rg	55.37 Å
原子数	26301
残基数	3249
排除体积	455370 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7eqg__assembly_1__model_1`	heptadecameric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CRISPR type I-F/YPEST-associated protein Csy2
分子量 formula_weight	36244.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	26301

MSVTDPEALLLLPRLSIQNANAISSPLTWGFPSPGAFTGFVHALQRRVGISLDIELDGVGIVCHRFEAQISQPAGKRTKVFNLTRNPLNRDGSTAAIVEEGRAHLEVSLLLGVHGDGLDDHPAQEIARQVQEQAGAMRLAGGSILPWCNERFPAPNAELLMLGGSDEQRRKNQRRLTRRLLPGFALVSREALLQQHLETLRTTLPEATTLDALLDLCRINFEPPATSSEEEASPPDAAWQVRDKPGWLVPIPAGYNALSPLYLPGEVRNARDRETPLRFVENLFGLGEWLSPHRVAALSDLLWYHHAEPDKGLYRWSTPRFVEHAIA

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CRISPR-associated protein Csy3
分子量 formula_weight	37623.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F,G,H,I

MSKPILSTASVLAFERKLDPSDALMSAGAWAQRDASQEWPAVTVREKSVRGTISNRLKTKDRDPAKLDASIQSPNLQTVDVANLPSDADTLKVRFTLRVLGGAGTPSACNDAAYRDKLLQTVATYVNEQGFAELARRYAHNLANARFLWRNRVGAEAVEVRINHIRQGEVARTWRFDALAIGLRDFKADAELDALAELIASGLSGSGHVLLEVVAFARIGDGQEVFPSQELILDKGDKKGQKSKTLYSVRDAAAIHSQKIGNALRTIDTWYPDEDGLGPIAVEPYGSVTSQGKAYRQPKQKLDFYTLLDNWVLRDEAPAVEQQHYVIANLIRGGVFGEAEEK

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	AcrIF5
分子量 formula_weight	8531.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,K,P,Q,R

MSRPTVVTVTETPRNPGSYEVNVERDGKMVVGRARAGSDPGAAAAKAMQMAMEWGSPNYVILGSNKVLAFIPEQLRVKM

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	type I-F CRISPR-associated endoribonuclease Cas6/Csy4
分子量 formula_weight	21429.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MDHYLDIRLRPDPEFPPAQLMSVLFGKLHQALVAQGGDRIGVSFPDLDESRSRLGERLRIHASADDLRALLARPWLEGLRDHLQFGEPAVVPHPTPYRQVSRVQAKSNPERLRRRLMRRHDLSEEEARKRIPDTVARTLDLPFVTLRSQSTGQHFRLFIRHGPLQATAEEGGFTCYGLSKGGFVPWF

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	RNA (60-MER)
分子量 formula_weight	19265.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	M

CUAAGAAAUUCACGGCGGGCUUGAUGUCCGCGUCUACCUGGUUCACUGCCGUGUAGGCAG

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA (54-MER)
分子量 formula_weight	16708.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

GGAAGCCATCCAGGTAGACGCGGACATCAAGCCCGCCGTGAAGGTGCAGCTGCT

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Type I-F CRISPR-associated protein Csy1
分子量 formula_weight	49313.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTSPLPTPTWQELRQFIESFIQERLQGKLDKLHPDEDDKRQTLLATHRREAWLADAARRVGQLQLVTHTLKPIHPDARGSNLHSLPQAPGQPGLAGSHELGDRLVSDVVGNAAALDVFKFLSLQYQGKNLLNWLTEDSAEAVQALSDNAEQAREWRQAFIGITAVKGAPASHSLAKQLYFPLPGSGYHLLAPLFPTSLVHHVHALLREARFGDAAKAAREARSRQESWPHGFSEYPNLAIQKFGGTKPQNISQLNSERYGENWLLPSLPPHWQRQDQRAPIRHSSVFEHDFGRSPEVSRLTRTLQRLLAKTRHNNFTIRRYRAQLVGQICDEALQYAARLRELEPGWSATPGCQLHDAEQLWLDPLRAQTDETFLQRRLRGDWPAEVGNRFANWLNRAVSSDSQILGSPEAAQWSQELSKELTMFKEILEDERD

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA (54-MER)
分子量 formula_weight	16574.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	O

AGCAGCTGCACCTTCACGGCGGGCTTGATGTCCGCGTCTACCTGGATGGCTTCC

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	173096

Structure of Csy-AcrIF5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CRISPR type I-F/YPEST-associated protein Csy2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CRISPR-associated protein Csy3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AcrIF5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type I-F CRISPR-associated protein Csy1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7eqg__assembly_1__model_1

7eqg__assembly_1__model_1 | I(q)

7eqg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)