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7l97

Crystal structure of STAMBPL1 in complex with an engineered binder

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AMSH-like protease

Homo sapiens

UniProt Q96FJ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 263–436 未记录 Ubiquitin variant × 1 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M HEPES pH7.5 分辨率 2.01 Å R-free 0.214

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7L97 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2ZNR Crystal structure of the DUB domain of human AMSH-LP 提交 2008-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 264–436（173 aa） 片段：MPN domain, DUB domain, Unp residues 264-436
未记录 ZN ZINC ION × 2 PR PRASEODYMIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；45mM sodium acetate buffer (pH 4.6), 22% PEG 4000, 90mM ammonium acetate, 10mM praseodymium (III) acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.20 Å R-free 0.165
2ZNV Crystal structure of human AMSH-LP DUB domain in complex with Lys63-linked ubiquitin dimer 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 264–436（173 aa） 片段：MPN domain, DUB domain, UNP residues 264-436
突变：E292A ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；180mM tri-ammonium citrate (pH 7.0), 24% PEG 3350, 3% 1,6-Hexanediol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.215
2ZNV Crystal structure of human AMSH-LP DUB domain in complex with Lys63-linked ubiquitin dimer 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 264–436（173 aa） 片段：MPN domain, DUB domain, UNP residues 264-436
突变：E292A ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；180mM tri-ammonium citrate (pH 7.0), 24% PEG 3350, 3% 1,6-Hexanediol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.215

共 2 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 STALP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–175； UniProt 263–436

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7l97
沉积日期 deposition_date2021-01-02
结构标题 titleCrystal structure of STAMBPL1 in complex with an engineered binder
关键词 keywordsSTAMBP1, Ubv, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (0)