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7ldd

native AMPA receptor

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 215.1 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor 1

物种未注明

UniProt P23818

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 14 其他聚合物 6 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–907 链 C； UniProt 1–907 未记录 Glutamate receptor × 2 （G5E8H1） Protein cornichon homolog 2 × 2 （O35089） Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit × 2 （Q8VHW2） 11B8 scFv × 2 15F1 Fab light chain × 2 15F1 Fab heavy chain × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7LDD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7LDE native AMPA receptor 提交 2021-01-13 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–907（907 aa）
链 C 1–907（907 aa）
未记录 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9ZKM The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 4 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
9ZKN The TMD structure of native mouse AMPAR with 4 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 11 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9ZKO The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9ZKP The TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
9ZKQ The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKR The TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9ZKS The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKT The TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9ZKU The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
9ZKV The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
9ZKW The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 408–907（500 aa）
链 C 408–907（500 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GRIA1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 C； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907

Glutamate receptor

物种未注明

UniProt G5E8H1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 14 其他聚合物 6 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–883 链 D； UniProt 1–883 未记录 Glutamate receptor 1 × 2 （P23818） Protein cornichon homolog 2 × 2 （O35089） Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit × 2 （Q8VHW2） 11B8 scFv × 2 15F1 Fab light chain × 2 15F1 Fab heavy chain × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7LDD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7LDE native AMPA receptor 提交 2021-01-13 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–883（883 aa）
链 D 1–883（883 aa）
未记录 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G5E8H1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–883； UniProt 1–883 作者链 D； PDB构建体 1–883； UniProt 1–883

Protein cornichon homolog 2

物种未注明

UniProt O35089

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 14 其他聚合物 6 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–160 链 F； UniProt 1–160 未记录 Glutamate receptor 1 × 2 （P23818） Glutamate receptor × 2 （G5E8H1） Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit × 2 （Q8VHW2） 11B8 scFv × 2 15F1 Fab light chain × 2 15F1 Fab heavy chain × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7LDD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7LDE native AMPA receptor 提交 2021-01-13 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
未记录 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7LEP The composite LBD-TMD structure combined from all hippocampal AMPAR subtypes at 3.25 Angstrom resolution 提交 2021-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–160（159 aa）
链 F 2–160（159 aa）
未记录 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 30 C14 TETRADECANE × 1 D10 DECANE × 1 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 OCT N-OCTANE × 2 D12 DODECANE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9ZKO The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9ZKP The TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
9ZKQ The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKR The TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9ZKS The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKT The TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9ZKU The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 1–160（160 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CNIH2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 F； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit

物种未注明

UniProt Q8VHW2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 14 其他聚合物 6 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–423 链 H； UniProt 1–423 未记录 Glutamate receptor 1 × 2 （P23818） Glutamate receptor × 2 （G5E8H1） Protein cornichon homolog 2 × 2 （O35089） 11B8 scFv × 2 15F1 Fab light chain × 2 15F1 Fab heavy chain × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7LDD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7LDE native AMPA receptor 提交 2021-01-13 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 R16 HEXADECANE × 2 OCT N-OCTANE × 6 HP6 HEPTANE × 4 D10 DECANE × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 D12 DODECANE × 6 C14 TETRADECANE × 6 DD9 nonane × 4 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7LEP The composite LBD-TMD structure combined from all hippocampal AMPAR subtypes at 3.25 Angstrom resolution 提交 2021-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 19–233（215 aa）
链 H 19–233（215 aa）
未记录 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 30 C14 TETRADECANE × 1 D10 DECANE × 1 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 OCT N-OCTANE × 2 D12 DODECANE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9Z6U The structure of TMD with 2 TARPs and 2 CNIHs from all native AMPA receptor subtypes 提交 2025-11-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 2–423（422 aa）
链 H 2–423（422 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 20 C14 TETRADECANE × 18 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 D12 DODECANE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
9Z6V The structure of TMD with 3 TARPs and 1 CNIH from all native AMPA receptor subtypes 提交 2025-11-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 2–423（422 aa）
链 H 2–423（422 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 23 C14 TETRADECANE × 3 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9Z6W The structure of TMD with 4 TARPs from all native AMPA receptor subtypes 提交 2025-11-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 2–423（422 aa）
链 H 2–423（422 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 C14 TETRADECANE × 18 OCT N-OCTANE × 2 XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
9ZKM The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 4 TARPs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
9ZKN The TMD structure of native mouse AMPAR with 4 TARPs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 11 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9ZKO The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9ZKP The TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
9ZKQ The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKR The TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9ZKS The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKT The TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 2 CNIHs and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9ZKU The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
9ZKV The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 2 TARPs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
9ZKW The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 提交 2025-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–423（423 aa）
链 H 1–423（423 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CCG8_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423 作者链 H； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7ldd

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7ldd
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7ldd
沉积日期 deposition_date2021-01-13
结构标题 titlenative AMPA receptor
关键词 keywords;neurotransmitter, two-fold symmetry, hippocampus, ion-channel, MEMBRANE PROTEIN, SIGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex, MEMBRANE PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex ;; MEMBRANE PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier76.89 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron76.82 Å
零角强度 I(0) i03292320000.00
分子量 molecular_weight487950.0 kDa
排除体积 excluded_volume609330 ų
包络体积 envelope_volume1089900 ų
水化壳体积 shell_volume119250 ų
包络直径 envelope_diameter267.3 Å
壳层 Rg shell_rg71.98 Å
包络 Rg envelope_rg76.15 Å
形状 Rg shape_rg76.96 Å
总 Rg total_rg76.24 Å
总原子数 total_atoms34526
残基数 n_residues4990
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax215.1 Å
Rg (实空间) rg_real75.22 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.96 Å
I(0) (实空间) i0_real3.2470e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.7440e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal75.76 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3282000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6199
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary86.0 Å
偏度 Skewness skewness0.286
峰度 Kurtosis kurtosis-0.597
角度范围 angular_range— – 0.1000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0697
最高正则化参数 α highest_alpha113100000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.986; Stabil: 0.987; Sysdev: 0.002; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.003
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7lddJ01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id7lddJ02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id7lddM01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id7lddM02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)