SAXSdb — 7lli

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor gamma variable 8 × 1 （A0A0C4DH27） T cell receptor delta variable 3 × 1 （A0JD37） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor gamma variable 8 × 1 （A0A0C4DH27） T cell receptor delta variable 3 × 1 （A0JD37） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HMR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–271； UniProt 23–292 作者链 C； PDB构建体 2–271； UniProt 23–292

Beta-2-microglobulin

Homo sapiens

UniProt P61769

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （Q95460） T cell receptor gamma variable 8 × 1 （A0A0C4DH27） T cell receptor delta variable 3 × 1 （A0JD37） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （Q95460） T cell receptor gamma variable 8 × 1 （A0A0C4DH27） T cell receptor delta variable 3 × 1 （A0JD37） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2MG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–100； UniProt 21–119 作者链 D； PDB构建体 2–100； UniProt 21–119

T cell receptor gamma variable 8

Homo sapiens

UniProt A0A0C4DH27

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （Q95460） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor delta variable 3 × 1 （A0JD37） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （Q95460） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor delta variable 3 × 1 （A0JD37） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRGV8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 3–101； UniProt 19–117 作者链 K； PDB构建体 3–101； UniProt 19–117

T cell receptor delta variable 3

Homo sapiens

UniProt A0JD37

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （Q95460） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor gamma variable 8 × 1 （A0A0C4DH27） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （Q95460） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor gamma variable 8 × 1 （A0A0C4DH27） 1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRDV3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 2–95； UniProt 19–112 作者链 L； PDB构建体 2–95； UniProt 19–112

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7lli
沉积日期 deposition_date	2021-02-04
结构标题 title	Stimulatory immune receptor protein complex
关键词 keywords	Immune receptor complex, metabolite immunity, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7lli__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7lli__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7lli__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.85 Å
Rg（电子密度）	36.70 Å
总 Rg	37.02 Å
原子数	6596
残基数	809
排除体积	116160 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7lli__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7lli__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Major histocompatibility complex class I-related gene protein
分子量 formula_weight	31711.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,A
原子数 atom_count	13201

MRTHSLRYFRLGVSDPIHGVPEFISVGYVDSHPITTYDSVTRQKEPRAPWMAENLAPDHWERYTQLLRGWQQMFKVELKRLQRHYNHSGSHTYQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWLAVDNVAHTIKQAWEANQHELLYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRKETFPGVTALFCKAHGFYPPEIYMTWMKNGEEIVQEIDYGDILPSGDGTYQAWASIELDPQSSNLYSCHVEHSGVHMVLQVP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin
分子量 formula_weight	11879.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,B

MIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYACRVNHVTLSQPKIVKWDRDM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	T cell receptor gamma variable 8
分子量 formula_weight	27757.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,E

TGSSNLEGRTKSVTRPTGSSAVITCDLPVENAVYTHWYLHQEGKAPQRLLYYDSYNSRVVLESGISREKYHTYASTGKSLKFILENLIERDSGVYYCATWDYKKLFGSGTTLVVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALNDSRYALSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRAD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	T cell receptor delta variable 3
分子量 formula_weight	24109.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,F

SDKVTQSSPDQTVASGSEVVLLCTYDTVYSNPDLFWYRIRPDYSFQFVFYGDNSRSEGADFTQGRFSVKHILTQKAFHLVISPVRTEDSATYYCATRLWLGDPHTDKLIFGKGTRVTVEPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1-deoxy-1-({2,6-dioxo-5-[(E)-propylideneamino]-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl}amino)-D-ribitol
分子量 formula_weight	316.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	296.976 Å
晶胞边长 b length_b	296.976 Å
晶胞边长 c length_c	122.635 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	trigonal

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	88.750 Å
R 因子 r_factor	0.2528
R_work r_work	0.2438
R_free r_free	0.2629

Stimulatory immune receptor protein complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T cell receptor gamma variable 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T cell receptor delta variable 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7lli__assembly_2__model_1

7lli__assembly_2__model_1 | I(q)

7lli__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Stimulatory immune receptor protein complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T cell receptor gamma variable 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T cell receptor delta variable 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7lli__assembly_2__model_1

7lli__assembly_2__model_1 | I(q)

7lli__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)