7m30

Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by antibodies 1-103, 1-32 and 2-25

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 136.1 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope glycoprotein L

Human cytomegalovirus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 31–278	未记录	Envelope protein UL128 × 1 （C8BLJ3） Envelope glycoprotein UL130 × 1 （A0A0G2TB82） UL131A × 1 （Q38M21） 2-25 Fab Heavy Chain × 1 2-25 Fab Light Chain × 1 1-32 Fab Heavy Chain × 1 1-32 Fab Light Chain × 1 1-103 Fab Heavy Chain × 1 1-103 Fab Light Chain × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for six seconds with a force of "1" before plunging	分辨率 3.81 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7M30	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7RAM Cryo-EM Structure of the HCMV gHgLgO Trimer Derived from AD169 and TR strains in complex with PDGFRalpha 提交 2021-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 37–278（242 aa）片段：UNP Residues 31-278	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；300mM NaCl and 20mM HEPES7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GL_HCMVA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–248； UniProt 31–278

Envelope protein UL128

Human cytomegalovirus

UniProt C8BLJ3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 28–171	未记录	Envelope glycoprotein L × 1 （P16832） Envelope glycoprotein UL130 × 1 （A0A0G2TB82） UL131A × 1 （Q38M21） 2-25 Fab Heavy Chain × 1 2-25 Fab Light Chain × 1 1-32 Fab Heavy Chain × 1 1-32 Fab Light Chain × 1 1-103 Fab Heavy Chain × 1 1-103 Fab Light Chain × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for six seconds with a force of "1" before plunging	分辨率 3.81 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7M30	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7KBB Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by Fabs 2-18 and 8I21 提交 2020-10-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 C 28–171（144 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7M22 Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by human neuropilin 2 提交 2021-03-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 28–171（144 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grid was blotted with a force of -6 for 3 seconds	分辨率 3.65 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C8BLJ3_HCMV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–144； UniProt 28–171

Envelope glycoprotein UL130

Human cytomegalovirus

UniProt A0A0G2TB82

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 26–214	未记录	Envelope glycoprotein L × 1 （P16832） Envelope protein UL128 × 1 （C8BLJ3） UL131A × 1 （Q38M21） 2-25 Fab Heavy Chain × 1 2-25 Fab Light Chain × 1 1-32 Fab Heavy Chain × 1 1-32 Fab Light Chain × 1 1-103 Fab Heavy Chain × 1 1-103 Fab Light Chain × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for six seconds with a force of "1" before plunging	分辨率 3.81 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7M30	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7KBB Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by Fabs 2-18 and 8I21 提交 2020-10-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 26–214（189 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7M22 Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by human neuropilin 2 提交 2021-03-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 26–214（189 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grid was blotted with a force of -6 for 3 seconds	分辨率 3.65 Å
8TEA HCMV Pentamer in complex with CS2pt1p2_A10L Fab and CS3pt1p4_C1L Fab 提交 2023-07-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 26–214（189 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0G2TB82_HCMV
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–189； UniProt 26–214

UL131A

Human cytomegalovirus

UniProt Q38M21

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 19–129	未记录	Envelope glycoprotein L × 1 （P16832） Envelope protein UL128 × 1 （C8BLJ3） Envelope glycoprotein UL130 × 1 （A0A0G2TB82） 2-25 Fab Heavy Chain × 1 2-25 Fab Light Chain × 1 1-32 Fab Heavy Chain × 1 1-32 Fab Light Chain × 1 1-103 Fab Heavy Chain × 1 1-103 Fab Light Chain × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for six seconds with a force of "1" before plunging	分辨率 3.81 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7M30	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7KBB Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by Fabs 2-18 and 8I21 提交 2020-10-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 19–129（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7M22 Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by human neuropilin 2 提交 2021-03-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grid was blotted with a force of -6 for 3 seconds	分辨率 3.65 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q38M21_HCMV
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–111； UniProt 19–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7m30
沉积日期 deposition_date	2021-03-17
结构标题 title	Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by antibodies 1-103, 1-32 and 2-25
关键词 keywords	HCMV pentamer, Fab, cytomegalovirus, immunocomplex, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.59 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.26 Å
零角强度 I(0) i0	265810000.00
分子量 molecular_weight	130580.0 kDa
排除体积 excluded_volume	162130 Å³
包络体积 envelope_volume	237480 Å³
水化壳体积 shell_volume	47139 Å³
包络直径 envelope_diameter	140.7 Å
壳层 Rg shell_rg	47.84 Å
包络 Rg envelope_rg	40.44 Å
形状 Rg shape_rg	42.24 Å
总 Rg total_rg	42.60 Å
总原子数 total_atoms	9191
残基数 n_residues	1145
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	136.1 Å
Rg (实空间) rg_real	42.47 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.09 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.6580e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.5520e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.59 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	265800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6627
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	62.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.045
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.704
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	15440000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.893; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.016; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.889

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Envelope glycoprotein L
分子量 formula_weight	27664.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	9191

VAVSVAPTAAEKVPAECPELTRRCLLGEVFQGDKYESWLRPLVNVTRRDGPLSQLIRYRPVTPEAANSVLLDDAFLDTLALLYNNPDQLRALLTLLSSDTAPRWMTVMRGYSECGDGSPAVYTCVDDLCRGYDLTRLSYGRSIFTEHVLGFELVPPSLFNVVVAIRNEATRTNRAVRLPVSTAAAPEGITLFYGLYNAVKEFCLRHQLDPPLLRHLDKYYAGLPPELKQTRVNLPAHSRYGPQAVDAR

来源 Source

来源生物 organism	Human cytomegalovirus
通用名 common_name	HHV-5, Human herpesvirus 5
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10359
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Envelope protein UL128
分子量 formula_weight	16684.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

EECCEFINVNHPPERCYDFKMCNRFTVALRCPDGEVCYSPEKTAEIRGIVTTMTHSLTRQVVHNKLTSCNYNPLYLEADGRIRCGKVNDKAQYLLGAAGSVPYRWINLEYDKITRIVGLDQYLESVKKHKRLDVCRAKMGYMLQ

来源 Source

来源生物 organism	Human cytomegalovirus
通用名 common_name	HHV-5
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10359
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Envelope glycoprotein UL130
分子量 formula_weight	21761.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

SPWSTLTANQNPSPPWSKLTYSKPHDAATFYCPFLYPSPPRSPLQFSGFQQVSTGPECRNETLYLLYNREGQTLVERSSTWVKKVIWYLSGRNQTILQRMPQTASKPSDGNVQISVEDAKIFGAHMVPKQTKLLRFVVNDGTRYQMCVMKLESWAHVFRDYSVSFQVRLTFTEANNQTYTFCTHPNLIV

来源 Source

来源生物 organism	Human cytomegalovirus
通用名 common_name	HHV-5
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10359
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	UL131A
分子量 formula_weight	13005.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

QCQRETAEKNDYYRVPHYWDACSRALPDQTRYKYVEQLVDLTLNYHYDASHGLDNFDVLKRINVTEVSLLISDFRRQNRRGGTNKRTTFNAAGSLAPHARSLEFSVRLFAN

来源 Source

来源生物 organism	Human cytomegalovirus
通用名 common_name	HHV-5
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10359
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	2-25 Fab Heavy Chain
分子量 formula_weight	25206.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

QVQLVESGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYAIHWVRQAPGQRLEWMGWINAGRGNTKYSQKFQGRVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDAAVYFCARDESTGDYYYYMDVWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKGLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	2-25 Fab Light Chain
分子量 formula_weight	22724.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGDRLDDKYASWYQQKAGQSPVLVIYQDNKRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISGTQAMDEADYYCQAWDSDTYVFGTGTKVTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHKSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	1-32 Fab Heavy Chain
分子量 formula_weight	26082.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

QVKLVESGGGVVQPGRSLRLSCAGSGFAFDNYAMHWVRQAPGKGLEWVAVISLEGRNKYYAGPAKGRFSISRDNSRNTVHLQMNSLRPEDTAVYFCARDMRYYYDSNGHYRNRYGMDVWGQGTTVIVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKGLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	1-32 Fab Light Chain
分子量 formula_weight	23319.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

DIQMTQSPSSLSASVGDSVTITCQASQDINQFVSWYQQKPGKPPKLLIYDASNLESGVPSRFSGSGSGTHFTFTISSLQPDDIATYYCQQYENLFTFGPGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	1-103 Fab Heavy Chain
分子量 formula_weight	24679.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

QLQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGDAISGSNYYWGWIRQPPGKGLQWIGSIYHTGSTFYNPSFSSRVTLSVDTSKNQFSLKLISVNAADTAVYYCARRIRGYSGTYDWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKGLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	1-103 Fab Light Chain
分子量 formula_weight	22839.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQDISSYVAWYQQKPGNAPKLLISSASTLPSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQLNNFGPGTTVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	7m30F01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7m30G01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7m30H01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7m30L01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7m30M01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7m30N01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.81 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	198946

fit	/app/data/saxs_computation/m3/7m30/7m30.fit
pddf	/app/data/pr_computation/m3/7m30/7m30.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/m3/7m30/7m30.dat

Cryo-EM structure of the HCMV pentamer bound by antibodies 1-103, 1-32 and 2-25

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope glycoprotein L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Envelope protein UL128

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Envelope glycoprotein UL130

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

UL131A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 11 Entity 11 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)