7muc

Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS C1 Reconstruction

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DotC

物种未注明

UniProt O52184

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 O52184_LEGPN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 AC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 BC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 CC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 DC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 EC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 FC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 GC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 HC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 IC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 JC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 KC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 LC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303 作者链 MC; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303

DotD

物种未注明

UniProt O52183

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 O52183_LEGPN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 AD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Ad; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 BD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Bd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 CD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Cd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 DD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Dd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 ED; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Ed; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 FD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Fd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 GD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Gd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 HD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Hd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 ID; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Id; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 JD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Jd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 KD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Kd; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 LD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Ld; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 MD; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 Md; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163

DotF

物种未注明

UniProt O54615

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 O54615_LEGPN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 AF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Af; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 BF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Bf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 CF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Cf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 DF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Df; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 EF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Ef; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 FF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Ff; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 GF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Gf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 HF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Hf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 IF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 If; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 JF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Jf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 KF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Kf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 LF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Lf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 MF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 Mf; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 VF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 WF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 XF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 YF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 ZF; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269

IcmE protein

物种未注明

UniProt O53087

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 O53087_LEGPN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 AG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 BG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 CG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 DG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 EG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 FG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 GG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 HG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 IG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 JG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 KG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 LG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 MG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 VG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 WG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 XG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 YG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048 作者链 ZG; PDB构建体 1–1048; UniProt 1–1048

Type IV secretion protein IcmK

物种未注明

UniProt A0A2S6FBG9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A2S6FBG9_LEGPN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 AH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 BH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 CH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 DH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 EH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 FH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 GH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 HH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 IH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 JH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 KH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 LH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 MH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 VH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 WH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 XH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 YH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361 作者链 ZH; PDB构建体 1–361; UniProt 1–361

Inner membrane lipoprotein YiaD

物种未注明

UniProt O53086

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 O53086_LEGPN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 AK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 BK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 CK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 DK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 EK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 FK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 GK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 HK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 IK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 JK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 KK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 LK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189 作者链 MK; PDB构建体 1–189; UniProt 1–189

Outer membrane protein, OmpA family protein

物种未注明

UniProt Q5ZXS4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q5ZXS4_LEGPH
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 AL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 BL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 CL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 DL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 EL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 FL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 GL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 HL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 IL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 JL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 KL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 LL; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249 作者链 ML; PDB构建体 1–249; UniProt 1–249

DUF2807 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A2S6F0F8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) Neurogenic locus notch × 13 (A0A2S6FAR3) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A2S6F0F8_LEGPN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 AM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 BM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 CM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 DM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 EM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 FM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 GM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 HM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 IM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 JM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 KM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 LM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320 作者链 MM; PDB构建体 1–320; UniProt 1–320

Neurogenic locus notch

物种未注明

UniProt A0A2S6FAR3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 189 DotC × 13 (O52184) DotD × 26 (O52183) DotF × 31 (O54615) IcmE protein × 18 (O53087) Type IV secretion protein IcmK × 18 (A0A2S6FBG9) Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 (O53086) Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 (Q5ZXS4) DUF2807 domain-containing protein × 13 (A0A2S6F0F8) Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A2S6FAR3_LEGPN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 AN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 BN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 CN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 DN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 EN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 FN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 GN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 HN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 IN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 JN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 KN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 LN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 MN; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7muc
沉积日期 deposition_date2021-05-14
结构标题 titleLegionella pneumophila Dot/Icm T4SS C1 Reconstruction
关键词 keywordsLegionella, Dot/Icm, Secretion, T4SS, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7muc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7muc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7muc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)130.00 Å
总 Rg130.00 Å
原子数180380
残基数23455
排除体积3217400 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7muc__assembly_1__model_1 189-meric (189) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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7. 引用文献 (1)