7muw

Reconstruction of the Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS 3DVA Map 4

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IcmE protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O53087_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Ag； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 BG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Bg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 CG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Cg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 DG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Dg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 EG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Eg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 FG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Fg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 GG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Gg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 HG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Hg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 IG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Ig； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 JG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Jg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 KG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Kg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 LG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Lg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 MG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 Mg； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 NG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 OG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 PG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 VG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 WG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 XG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 YG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 ZG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048

Type IV secretion protein IcmK

物种未注明

UniProt A0A2S6FBG9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A2S6FBG9_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 AH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 BH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 CH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 DH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 EH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 FH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 GH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 HH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 IH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 JH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 KH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 LH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 MH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 VH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 WH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 XH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 YH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 ZH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361

Inner membrane lipoprotein YiaD

物种未注明

UniProt O53086

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O53086_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 AK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 BK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 CK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 DK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 EK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 FK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 GK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 HK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 IK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 JK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 KK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 LK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 MK； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189

Outer membrane protein, OmpA family protein

物种未注明

UniProt Q5ZXS4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q5ZXS4_LEGPH
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 AL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 BL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 CL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 DL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 EL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 FL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 GL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 HL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 IL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 JL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 KL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 LL； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 ML； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

DUF2807 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A2S6F0F8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A2S6F0F8_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 AM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 BM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 CM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 DM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 EM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 FM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 GM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 HM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 IM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 JM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 KM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 LM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320 作者链 MM； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

Neurogenic locus notch

物种未注明

UniProt A0A2S6FAR3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A2S6FAR3_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 AN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 BN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 CN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 DN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 EN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 FN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 GN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 HN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 IN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 JN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 KN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 LN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124 作者链 MN； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

DotD

物种未注明

UniProt O52183

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotF × 31 （O54615） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O52183_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 AD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Ad； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 BD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Bd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 CD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Cd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 DD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Dd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 ED； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Ed； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 FD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Fd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 GD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Gd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 HD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Hd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 ID； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Id； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 JD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Jd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 KD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Kd； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 LD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Ld； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 MD； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Md； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163

DotF

物种未注明

UniProt O54615

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotC × 13 （O52184）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O54615_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 AF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Af； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 BF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Bf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 CF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Cf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 DF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Df； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 EF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Ef； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 FF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Ff； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 GF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Gf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 HF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Hf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 IF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 If； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 JF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Jf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 KF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Kf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 LF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Lf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 MF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 Mf； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 VF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 WF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 XF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 YF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 ZF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269

DotC

物种未注明

UniProt O52184

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 205	IcmE protein × 34 （O53087） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Inner membrane lipoprotein YiaD × 13 （O53086） Outer membrane protein, OmpA family protein × 13 （Q5ZXS4） DUF2807 domain-containing protein × 13 （A0A2S6F0F8） Neurogenic locus notch × 13 （A0A2S6FAR3） Unknown protein fragment × 13 Unknown protein fragment × 18 DotD × 26 （O52183） DotF × 31 （O54615）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O52184_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 AC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 BC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 CC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 DC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 EC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 FC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 GC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 HC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 IC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 JC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 KC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 LC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303 作者链 MC； PDB构建体 1–303； UniProt 1–303

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7muw
沉积日期 deposition_date	2021-05-14
结构标题 title	Reconstruction of the Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS 3DVA Map 4
关键词 keywords	Dot/Icm, Secretion, T4SS, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7muw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7muw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7muw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	121.20 Å
总 Rg	121.20 Å
原子数	192116
残基数	25087
排除体积	3429600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7muw__assembly_1__model_1`	205-meric （205）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	IcmE protein
分子量 formula_weight	107911.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	34

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AG,Fg,Gg,BG,Hg,Bg,Ig,CG,Jg,Kg,DG,Lg,Mg,EG,VG,WG,XG,YG,FG,ZG,Cg,GG,Dg,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,Ag,Eg
原子数 atom_count	192116

MASKKENLKSLFSNTRTRVIIIFTAALLIIAVVIGFFKIRGATTGSIAAAEVSTVPGGIQSIPGVLDPTAQYAKLQEEQNITQAQVAEKTGGSAIPTIIRTQALGEGVGVIGSQSGVGFAALAQEELGGPQRSLWIQELQDGSCSKSVITKVVNQGAQLTDLKAACSCVQLKDSGYGLQELEQVCECKELKSAGYNARQLKEAGYSAGRLRNCGFDACELRNAGFTAQEMKDGGFSDGELKGAGFSDAEIAKASGLPDGITADDVRKAGCGAAALAKLRQAGVSASAIRKISGCTAEQLKAAGYTAKELKDAGFSAADLRRAGFSAAELKDAGFTARDLLNAGFTPADLAKAGFSDAQIKAAQAELPPGITPQDVKNAGCDVEALKKEREAGVSAALIRQYAGCSAQALKAAGFTDADLANAGFTPAQISAATPLSDAEIKAAGCDPDKLKKLFSAGVSAKRIKELNGCSAEALKAAGYDAQSLLAAGFTPQELLAAGFTPKQLEDAGLNPVSIIADGRVADCSVESLKKARAAGVSALTIKQTLGCSAAALKAAGYTAKELKDAGFTAAELKAAGFSAKELKDAGFTAKELRDAGFSAQELKDVGFSAKDLKDAGFSAAELKAAGFTAAQLKAAGFSAKDLKDAGFSAAELKAAGFSAKELKDAGFSASDLKNAGFSAKELKDAGFSASDLKSAGFSASELKNAGYSADELKKAGYTSAELRNAGFSPQESAVAGLQGPDLQQLDSSITGIPSIPGATPRPTTSDAASSAEQLQAILQKQNEQLAEQKYQQEIQQRTSDMLTAATQLVQDWKQVETQVYTEGTEETKTSGGESAVPGTGTGTGSNNQPVDQGAVSAQNQAIIKTGDIMFAVLDTSVNSDEPGPILATIVTGKLKGSKLIGSFNLPSNADKMVITFNTMSIPGAEKTISISAYAIDPNTARTALASRTNHHYLMRYGSLFASSFLQGFGNAFQSANTTITIGGTGGGNNITVANGVGRSTLENAVIGLATVGKAWSQQAQQLFNTPTTVEVYSGTGLGILFTQDVTTI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Type IV secretion protein IcmK
分子量 formula_weight	38958.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EH,FH,GH,HH,IH,JH,AH,KH,LH,MH,VH,WH,XH,YH,ZH,BH,CH,DH

MMKKYDQLCKYCLVIGLTFSMSCSIYAADQSDDAQQALQQLRMLQQKLSQNPSPDAQSGAGDGGDNAASDSTQQPNQSGQANAPAANQTATAGGDGQIISQDDAEVIDKKAFKDMTRNLYPLNPEQVVKLKQIYETSEYAKAATPGTPPKPTATSQFVNLSPGSTPPVIRLSQGFVSSLVFLDSTGAPWPIAAYDLGDPSSFNIQWDKTSNTLMIQATKLYNYGNLAVRLRGLNTPVMLTLIPGQKAVDYRVDLRVQGYGPNAKSMPTEEGIPPSANDLLLHVLEGVPPPGSRRLVVSGGDARAWLSNEKMYVRTNLTILSPGWLASMTSADGTHAYEMQKSPVLLVSWHGKVMQLKVEGL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Inner membrane lipoprotein YiaD
分子量 formula_weight	21096.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EK,FK,GK,HK,IK,JK,KK,LK,AK,MK,BK,CK,DK

MRSLRTNYIYVLFKTTGLLFLLLLSACNRSGYIPENEVPKLPCRVDGACDATIIKMMTDLNKKGIKVASVGQNYLISIPASALFADQSPRLNWASYSLLNEIAAFLKQFRKIAITVTSYSSKYVSVKRERALTLARSRVVSEYLWSQGVDSRIIFTQGLGSDKPITSYTLGGDRSPNARVEITFRRAVA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Outer membrane protein, OmpA family protein
分子量 formula_weight	27582.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EL,FL,GL,HL,IL,JL,KL,LL,ML,AL,BL,CL,DL

MRNLMRCLIMIKSLIKGVDMSRKLAKTRILGYGLMICFLAGCFHPPYNNFQPDRRAVKRVGVDTGIGAVAGAIASGTASGTLIGAAAGGTVGLVASIYRDSKRKIIRDLQKQDIQYVEYGDTRTLIIPTDKYFMFSSPRLNEICYPGLNNVIRLLNFYPQSTIYVAGFTDNVGSRSHKRKLSQAQAETMMTFLWANGIAAKRLKAEGYGDKNAISDNAIIHGSAQNRRIEIQWFTSPAQPPQPQMAYVK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DUF2807 domain-containing protein
分子量 formula_weight	36095.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EM,FM,GM,HM,IM,JM,KM,LM,MM,AM,BM,CM,DM

MLKRCYLLILLMFVLASCAHHKPQTPPAEVKKQGTSSTRQFRQVSSFNQIVVQGRLNVNLHTGYNKPEVMLRGDPRDLVQVRTIVKQNTLYVSLGQGYPDYGAVTVDIKTKFLNRFRYEGAGVVTGNNLRTSYLDLYLANEGTTRLAGNIGLQKLEAVGNGVTQINGVSSRNLQIVLKGDPKVLISGFVNLRQLDMYGKGTLSLYWIKSDTLTIRAKKAAKIQLAGIVNRLDVELWDFAQFKGKYLRAQRSFVKTHDKSVAEISAVNHQSSLATDASDIYYYNLSKTRADFMAFNGSVLDMREWGQSDLKDFDRYNKQFP

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Neurogenic locus notch
分子量 formula_weight	13598.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EN,FN,GN,HN,IN,JN,KN,LN,MN,AN,BN,CN,DN

MLFLKIKTNQRTTMNILKPKAFLLASVFVLSISPAFAADGCCSKMGGINYCDSSAGRLVCNNGFYSTCYCTRHAVMDLQFLMGCCLWHGGVYPQLNSSGLVVCNDGYVSEECSLQKPVEQISVY

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Unknown protein fragment
分子量 formula_weight	784.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EU,FU,GU,HU,IU,JU,KU,LU,MU,AU,BU,CU,DU

XXXXXXXXX

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Unknown protein fragment
分子量 formula_weight	4103.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	EX,FX,GX,HX,IX,JX,KX,LX,MX,VX,WX,XX,YX,ZX,AX,BX,CX,DX

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DotD
分子量 formula_weight	17860.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ed,FD,Fd,GD,Gd,HD,Hd,ID,Id,JD,Jd,KD,Kd,CD,LD,Ld,MD,Md,Ad,BD,Bd,Cd,DD,Dd,AD,ED

MNNNKIVIMFIFSALLAGCAGTMKFKKPPINNPSDDATIKLAEAAVSVSDSMLEMAKVEKVITPPSKDNTLTIPNAYNLQARASVDWSGPIEELTARIAKAAHFRFRVLGKSPSVPVLISISTKDESLAEILRDIDYQAGKKASIHVYPNSQVVELRYAKIYS

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DotF
分子量 formula_weight	29730.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	31

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ef,FF,Ff,AF,GF,Gf,HF,Hf,IF,If,JF,Jf,KF,Kf,LF,Lf,MF,CF,Mf,VF,WF,XF,YF,ZF,Af,BF,Bf,Cf,DF,Df,EF

MMAEHDQNNDEYKFAELDSYDMDQAGESDLDSEASYQSGKEGLTKKKDIKRNALIAIGAVVFIMVMYKIIGWMFFSDKSSQVTSKPAIPPVTQVATPQPVQTIPTTTPIQQVQPTTIIEDDPDLKKKVSAIEMTQQSLRSEVNALSEQINAVNNNIKNLNAQIVNLNQIIGNMSNQIARQSEVINVLMARTTPKKVVKVSRPIVQARIIYYIQAVIPGRAWLIGSNGSTLTVREGSKIPGYGMVKLIDSLQGRILTSSGQVIKFSQEDS

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DotC
分子量 formula_weight	34162.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,AC

MRKFILSLSILLSALLVACSSRNHYGDTGSLAGLQAMADSKYTRAQKKQKMGKIREMALKETALSVGAQAGLAWRAKIIDEQLNKQARNLDAIYDFNSLVLEHNILPPVLLEGRNTLNLADAQSIRISDRTYKVAKQAHFITTPPTWRQYLWMDYVKPEAPNVTLLPKTKAEKEIWCIYTERGWKNGIDQANTILEENIARIKEDFGGMILYRKLLAMNMVSPPYVSHTDLGVTGDGSEIHIDDRVLRITALPELNVNSAEWRAAVAKDENALERFKNMEKLANQAKIVITNKSWQPIIAPVS

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	42013

Reconstruction of the Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS 3DVA Map 4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IcmE protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type IV secretion protein IcmK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inner membrane lipoprotein YiaD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Outer membrane protein, OmpA family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DUF2807 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Neurogenic locus notch

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DotD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DotF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DotC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7muw__assembly_1__model_1

7muw__assembly_1__model_1 | I(q)

7muw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment