7n8o

High-resolution structure of photosystem II from the mesophilic cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 6803

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA2_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360 作者链 a； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360

Photosystem II CP47 reaction center protein

物种未注明

UniProt P05429

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBB_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507 作者链 b； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507

Photosystem II CP43 reaction center protein

物种未注明

UniProt P09193

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–460； UniProt 1–460 作者链 c； PDB构建体 1–460； UniProt 1–460

Photosystem II D2 protein

物种未注明

UniProt P09192

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBD_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–352； UniProt 1–352 作者链 d； PDB构建体 1–352； UniProt 1–352

Cytochrome b559 subunit alpha

物种未注明

UniProt P09190

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 e； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Cytochrome b559 subunit beta

物种未注明

UniProt P09191

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBF_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–44； UniProt 1–44 作者链 f； PDB构建体 1–44； UniProt 1–44

Photosystem II reaction center protein H

物种未注明

UniProt P14835

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBH_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–64； UniProt 1–64 作者链 h； PDB构建体 1–64； UniProt 1–64

Photosystem II reaction center protein I

物种未注明

UniProt Q54697

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBI_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 i； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II reaction center protein J

物种未注明

UniProt P73070

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBJ_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39 作者链 j； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39

Photosystem II reaction center protein K

物种未注明

UniProt P15819

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBK_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–45； UniProt 1–45 作者链 k； PDB构建体 1–45； UniProt 1–45

Photosystem II reaction center protein L

物种未注明

UniProt Q55354

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBL_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39 作者链 l； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39

Photosystem II reaction center protein M

物种未注明

UniProt P72701

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBM_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35 作者链 m； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35

Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide

物种未注明

UniProt P10549

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBO_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–247； UniProt 28–274 作者链 o； PDB构建体 1–247； UniProt 28–274

Sll1638 protein

物种未注明

UniProt P73048

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	P73048_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 q； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

Photosystem II protein Y

物种未注明

UniProt P73676

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBY_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39 作者链 r； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39

Photosystem II reaction center protein T

物种未注明

UniProt P74787

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBT_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31 作者链 t； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

Photosystem II 12 kDa extrinsic protein

物种未注明

UniProt Q55332

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBU_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 u； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

Cytochrome c-550

物种未注明

UniProt Q55013

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CY550_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 v； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

Photosystem II reaction center X protein

物种未注明

UniProt P72575

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBX_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39 作者链 x； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39

Photosystem II reaction center protein Ycf12

物种未注明

UniProt Q55438

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P73528） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	YCF12_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39 作者链 y； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39

Photosystem II reaction center protein Z

物种未注明

UniProt P73528

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P16033） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P05429） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P09193） Photosystem II D2 protein × 2 （P09192） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P09190） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （P09191） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P14835） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q54697） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P73070） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P15819） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q55354） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P72701） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P10549） Sll1638 protein × 2 （P73048） Photosystem II protein Y × 2 （P73676） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P74787） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q55332） Cytochrome c-550 × 2 （Q55013） Photosystem II reaction center X protein × 2 （P72575） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q55438） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 18 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 12 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 14 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 62 BICARBONATE ION × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 8 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CALCIUM ION × 6 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 water × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBZ_SYNY3
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62 作者链 z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7n8o
沉积日期 deposition_date	2021-06-15
结构标题 title	High-resolution structure of photosystem II from the mesophilic cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 6803
关键词 keywords	Photosystem II, Cyanobacteria, Synechocystis 6803, Mesophile, CyanoQ, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7n8o__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7n8o__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7n8o__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.07 Å
Rg（电子密度）	58.38 Å
总 Rg	58.61 Å
原子数	53420
残基数	5536
排除体积	992770 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7n8o__assembly_1__model_1`	42-meric （42）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (38)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1 2
分子量 formula_weight	39744.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	54656

MTTTLQQRESASLWEQFCQWVTSTNNRIYVGWFGTLMIPTLLTATTCFIIAFIAAPPVDIDGIREPVAGSLLYGNNIISGAVVPSSNAIGLHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLVVFHFLIGIFCYMGRQWELSYRLGMRPWICVAYSAPVSAATAVFLIYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLVRETTEVESQNYGYKFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLGAWPVIGIWFTAMGVSTMAFNLNGFNFNQSILDSQGRVIGTWADVLNRANIGFEVMHERNAHNFPLDLASGEQAPVALTAPAVNG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	55954.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

MGLPWYRVHTVVLNDPGRLISVHLMHTALVAGWAGSMALYELAIFDSSDAVLNPMWRQGMFVLPFMARLGVTSSWNGWSVTGETGLDPGFWSFEGVAAAHIVLSGLLFLAAVWHWVFWDLELFVDPRTGESALDLPKMFGIHLFLSGLLCFGFGAFHLTGVWGPGMWVSDPYGLTGHVQPVAPEWGPAGFNPFNPGGVVAHHIAAGIVGIIAGLFHLTVRPPERLYKALRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGNATTPIELFGPTRYQWDKGYFQEEIQRRVDSQLAEGASLSEAWSTIPEKLAFYDYVGNSPAKGGLFRTGAMNSGDGIAQEWIGHPIFKDKEGRELEVRRMPNFFETFPVIMTDADGVVRADIPFRRSESKFSVEQTGVTVSFYGGALDGQTFSNPSDVKKFARKAQLGEGFDFDTETFNSDGVFRTSPRGWFTFGHAVFALLFFFGHIWHGSRTLFRDVFAGVDPGLEEQVEFGVFAKVGDLSTRKEA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	50344.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MVTLSNTSMVGGRDLPSTGFAWWSGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMTLFEVAHFIPEKPMYEQGLILLPHIATLGWGVGPAGEVTDIFPFFVVGVLHLISSAVLGLGGIYHALRGPEVLEEYSSFFGYDWKDKNQMTNIIGYHLILLGCGALLLVFKAMFFGGVYDTWAPGGGDVRVITNPTLNPAIIFGYLLKAPFGGEGWIISVNNMEDIIGGHIWIGLICISGGIWHILTKPFGWARRALIWSGEAYLSYSLGALSLMGFIASVFVWFNNTAYPSEFYGPTGMEASQSQAFTFLVRDQRLGANIASAQGPTGLGKYLMRSPSGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLDKLRNDIQPWQVRRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVITDVNSFNYVSPRAWLATSHFVLGFFFLVGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRETEPTLFMPDLD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39519.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MTIAVGRAPVERGWFDVLDDWLKRDRFVFIGWSGLLLFPCAFMALGGWLTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGANFLTVAVSSPADAFGHSLLFLWGPEAQGNLTRWFQIGGLWPFVALHGAFGLIGFMLRQFEISRLVGIRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLMYPLGQSSWFFAPSFGVAGIFRFILFLQGFHNWTLNPFHMMGVAGILGGALLCAIHGATVENTLFEDGEDSNTFRAFEPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGIAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSSVGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNILLNEGMRAWMAPQDQPHENFIFPEEVLPRGNAL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9454.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MSGTTGERPFSDIVTSIRYWVIHSITIPMLFIAGWLFVSTGLAYDAFGTPRPDEYFTQTRQELPILQERYDINQEIQEFNQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	4935.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MATQNPNQPVTYPIFTVRWLAVHTLAVPSVFFVGAIAAMQFIQR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7120.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

MAQRTRLGDILRPLNSEYGKVVPGWGTTPVMGVFMALFLVFLLIILQIYNSSLILEGFSVDWAG

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	4338.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MLTLKIAVYIVVGLFISLFIFGFLSSDPTRNPGRKDFE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein J
分子量 formula_weight	3976.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MFAEGRIPLWVVGVVAGIGAIGVLGLFFYGAYAGLGSSM

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	5114.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

METIYLLAKLPEAYQIFDPLVDVLPVIPLFFLALAFVWQAAVGFK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4476.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MDRNSNPNRQPVELNRTSLYLGLLLVAVLGILFSSYFFN

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	3910.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

MQVNNLGFIASILFVLVPTVFLLILFIQTGKQSES

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide
分子量 formula_weight	26959.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,o

AVDKSQLTYDDIVNTGLANVCPEISSFTRGTIEVEPNTKYFVSDFCMEPQEYFVKEEPVNKRQKAEYVKGKVLTRQTTSLEQIRGSIAVGADGTLTFKEKDGIDFQPITVLLPGGEEVPFFFTVKNFTGTTEPGFTSINSSTDFVGDFNVPSYRGAGFLDPKARGLYTGYDNAVALPSAADKFRTNKKETPLGKGTLSLQVTQVDGSTGEIAGIFESEQPSDTDLGAKEPLDVKVRGIFYGRVDTDV

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Sll1638 protein
分子量 formula_weight	16494.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,q

MSRLRSLLSLILVLVTTVLVSCSSPQVEIPTTYSPEKIAQLQVYVNPIAVARDGMEKRLQGLIADQNWVDTQTYIHGPLGQLRRDMLGLASSLLPKDQDKAKTLAKEVFGHLERLDAAAKDRNGSQAKIQYQEALADFDSFLNLLPQAS

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II protein Y
分子量 formula_weight	4205.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,r

MDWRVIVVVSPLLIAATWAAINIGAAAIRQLQDVLGREA

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3571.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,t

MESVAYILVLTMALAVLFFAIAFREPPRIEK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem II 12 kDa extrinsic protein
分子量 formula_weight	14256.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,u

MKFISRLLVACSLLIGLMGFLGADLAQALTPNPILAELNAVDAKLTTDFGQKIDLNNSDIRDFRGLRGFYPNLASEIIKNAPYDTVEEVLDIPGLSETQKSRLEANLGSFTVTEPSIELTSGDDRINPGVY

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Cytochrome c-550
分子量 formula_weight	17901.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,v

MKRFFLVAIASVLFFFNTMVGSANAVELTESTRTIPLDEAGGTTTLTARQFTNGQKIFVDTCTQCHLQGKTKTNNNVSLGLADLAGAEPRRDNVLALVEFLKNPKSYDGEDDYSELHPNISRPDIYPEMRNYTEDDIFDVAGYTLIAPKLDERWGGTIYF

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center X protein
分子量 formula_weight	4189.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

MTPSLANFLWSLVLGAAIVLIPATVGLIFISQKDKITRS

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Ycf12
分子量 formula_weight	4144.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,y

MELLAALNLEPIFQLTFLGLIVLAGPAVVFVLAFRGGDL

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6736.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

MSIVFQIALAALVLFSFVMVVGVPVAYASPQNWDRSKPLLYLGSGIWAILVIVVALLNFLVV

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	CA-MN4-O5 CLUSTER
分子量 formula_weight	339.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	70

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	62

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	BICARBONATE ION
分子量 formula_weight	61.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 34 Entity 34 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 35 Entity 35 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 36 Entity 36 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 37 Entity 37 non-polymer

描述 description	(3R)-beta,beta-caroten-3-ol
分子量 formula_weight	552.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 38 Entity 38 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1236

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	7n8oA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	7n8oE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

结构域编号 domain_id	7n8oa01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	7n8oe01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.93 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	202844

High-resolution structure of photosystem II from the mesophilic cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 6803

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体