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7no2

Structure of the mature RSV CA lattice: hexamer derived from tubes (C2-symmetric)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 105.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein p27, alternate cleaved 1

Rous sarcoma virus (strain Prague C)

UniProt P03322

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 240–468 链 B； UniProt 240–468 链 C； UniProt 240–468 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time 分辨率 4.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7NO2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A6S M-DOMAIN FROM GAG POLYPROTEIN OF ROUS SARCOMA VIRUS, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–87（86 aa） 片段：M-DOMAIN
突变：M1G 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM；压力 1
NMR样品组成 H20
分辨率未提供
1EM9 ROUS SARCOMA VIRUS CAPSID PROTEIN: N-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 240–393（154 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.1；277 K；Boric acid/Potassium Hydroxide, PEG 6000, Magnesium Nitrate, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.271
1EM9 ROUS SARCOMA VIRUS CAPSID PROTEIN: N-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 240–393（154 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.1；277 K；Boric acid/Potassium Hydroxide, PEG 6000, Magnesium Nitrate, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.271
1EOQ ROUS SARCOMA VIRUS CAPSID PROTEIN: C-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 394–488（95 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件 pH 4.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件 pH 4.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 U-15N RSV CA(155-249) (used for the 3D_15N-SEPARATED_NOESY, HNHA, HNHB expts) and U-15N/U-13C RSV CA(155-249) (used for the 3D_13C-SEPARATED_NOESY expt) both suspended in the same buffer (50 mM Sodium phosphate pH 4.9 50 mM NaCl 1 mM EDTA 1 mM DTT) | 90% H20, 10%D20
NMR样品组成 U-15N RSV CA(155-249) 50 mM Sodium phosphate pH 4.9 50 mM NaCl 1 mM EDTA 1 mM DTT | 90% H20, 10%D20
NMR样品组成 U-15N,13C RSV CA(155-249) 50 mM Sodium phosphate pH 4.9 50 mM NaCl 1 mM EDTA 1 mM DTT | 90% H20, 10%D20
分辨率未提供
1P7N Dimeric Rous Sarcoma virus Capsid protein structure with an upstream 25-amino acid residue extension of C-terminal of Gag p10 protein 提交 2003-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 215–386（172 aa） 片段：N-terminal domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10 mM HEPES-sodium buffer and 0.8M potassium sodium tartrate tetrahydrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.298
2IHX Solution Structure of the Rous Sarcoma Virus Nucleocapsid Protein:uPsi RNA Packaging Signal Complex 提交 2006-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 503–563（61 aa） 片段：Nucleocapsid domain (residues 503-563)
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）5 mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2；压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM unlabeled nucleocapsid protein, 1.0 mM A-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.2 mM unlabeled nucleocapsid protein, 1.2 mM G-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8 mM unlabeled nucleocapsid protein, 0.8 mM U-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8 mM unlabeled nucleocapsid protein, 0.8 mM C-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.2 mM unlabeled nucleocapsid protein, 1.2 mM unlabeled uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.2 mM 15N, 13C-labeled nucleocapsid protein, 1.2 mM unlabeled uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0; 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2RSP STRUCTURE OF THE ASPARTIC PROTEASE FROM ROUS SARCOMA RETROVIRUS REFINED AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1989-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 578–701（124 aa）
链 B 578–701（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-MERIC
链 A 240–465（226 aa） 片段：RESIDUES 240-465
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 240–465（226 aa） 片段：RESIDUES 240-465
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 240–465（226 aa） 片段：RESIDUES 240-465
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 240–465（226 aa） 片段：RESIDUES 240-465
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 240–465（226 aa） 片段：RESIDUES 240-465
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 18.30 Å
3G0V Crystal structure of the C-terminal domain from the Rous Sarcoma Virus capsid protein: mutant D179A 提交 2009-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
突变：D179A NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.3；291 K；0.2M Succinic acid/KOH, pH4.3, 24% PEG8000, 1M Sodium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3G1G Crystal structure of the C-terminal domain from the Rous Sarcoma Virus capsid protein: High pH 提交 2009-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 390–476（87 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476
链 B 390–476（87 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.3；291 K；0.2M Beta-Alanine/KOH, pH10.3, 10-25% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
3G1G Crystal structure of the C-terminal domain from the Rous Sarcoma Virus capsid protein: High pH 提交 2009-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 390–476（87 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476
链 B 390–476（87 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.3；291 K；0.2M Beta-Alanine/KOH, pH10.3, 10-25% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
3G1I Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: Intermediate pH 提交 2009-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
链 B 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2M Bis-tris propane/HCl, pH8.5, 0.75-1.85M Ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
3G21 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: Low pH 提交 2009-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
未记录 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.3；291 K；0.20M Succinic acid/KOH, pH4.3, 13-18% PEG8000, 0.75M Magnesium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 0.90 Å R-free 0.142
3G26 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: Mutant A184C 提交 2009-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
突变：A184C MLA MALONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.7；291 K；0.1M Malic acid/KOH, pH3.7, 1.4 M Malonic acid/KOH, pH3.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.55 Å R-free 0.214
3G28 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: mutant D179N, low pH 提交 2009-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
突变：D179N NO3 NITRATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.7；291 K；0.2M Formic acid/KOH, pH3.7, 12% PEG8000, 0.25M Ammonium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.64 Å R-free 0.200
3G29 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: D179N mutant, neutral pH 提交 2009-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
突变：D179N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；0.20M Tris/HCl, pH7.9, 1.5M Ammonium Citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.322
3G29 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: D179N mutant, neutral pH 提交 2009-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 389–465（77 aa） 片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465
突变：D179N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；0.20M Tris/HCl, pH7.9, 1.5M Ammonium Citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.322
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 84–577（494 aa）
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 F 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 K 84–577（494 aa）
链 R 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 L 84–577（494 aa）
链 M 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 G 84–577（494 aa）
链 N 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 H 84–577（494 aa）
链 O 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 I 84–577（494 aa）
链 P 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 84–577（494 aa）
链 C 84–577（494 aa）
链 D 84–577（494 aa）
链 E 84–577（494 aa）
链 J 84–577（494 aa）
链 Q 84–577（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.
分辨率 7.70 Å
7NO0 Structure of the mature RSV CA lattice: T=1 CA icosahedron 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 A 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time= 2.5 s blot force= 0
分辨率 3.10 Å
7NO1 Structure of the mature RSV CA lattice: T=3 CA icosahedron 提交 2021-02-25 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time = 2.5s blot force = 0
分辨率 7.60 Å
7NO3 Structure of the mature RSV CA lattice: pentamer derived from polyhedral VLPs 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 5.80 Å
7NO4 Structure of the mature RSV CA lattice: hexamer with 3 adjacent pentamers (C3 symmetric) 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.50 Å
7NO5 Structure of the mature RSV CA lattice: hexamer with 2 adjacent pentamers (C2 symmetric) 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.40 Å
7NO6 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-hexamer interface, class 1 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.00 Å
7NO7 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-hexamer interface, class 1"2 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.50 Å
7NO8 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-hexamer interface, class 1"6 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.90 Å
7NO9 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-pentamer interface, class 1'1 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.60 Å
7NOA Structure of the mature RSV CA lattice: Group II, hexamer-hexamer interface, class 6 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.40 Å
7NOB Structure of the mature RSV CA lattice: Group II, hexamer-hexamer interface, class 2'6 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.70 Å
7NOC Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 3'3 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.80 Å
7NOD Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 3'4 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.80 Å
7NOE Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 3'5 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.50 Å
7NOF Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 4'4 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.60 Å
7NOG Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 4'5 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.80 Å
7NOH Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 5'5 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.10 Å
7NOI Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 3'Alpha 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.20 Å
7NOJ Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 3'Beta 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.70 Å
7NOK Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 3'Gamma 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 9.10 Å
7NOL Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 4'Alpha 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 8.20 Å
7NOM Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 4'Beta 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.70 Å
7NON Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 4'Gamma 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.80 Å
7NOO Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 5'Alpha 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.90 Å
7NOP Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 5'Beta 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 7.80 Å
7NOQ Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 5'Gamma 提交 2021-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 240–468（229 aa）
链 B 240–468（229 aa）
链 C 240–468（229 aa）
链 D 240–468（229 aa）
链 E 240–468（229 aa）
链 F 240–468（229 aa）
链 G 240–468（229 aa）
链 H 240–468（229 aa）
链 I 240–468（229 aa）
链 J 240–468（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time
分辨率 6.50 Å

共 41 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GAG_RSVP
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–229； UniProt 240–468 作者链 B； PDB构建体 1–229； UniProt 240–468 作者链 C； PDB构建体 1–229； UniProt 240–468

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7no2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7no2
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7no2
沉积日期 deposition_date2021-02-25
结构标题 titleStructure of the mature RSV CA lattice: hexamer derived from tubes (C2-symmetric)
关键词 keywordsRetrovirus, Rous sarcoma virus, capsid protein, IP6, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier32.11 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron31.32 Å
零角强度 I(0) i082372500.00
分子量 molecular_weight71435.0 kDa
排除体积 excluded_volume89813 ų
包络体积 envelope_volume125680 ų
水化壳体积 shell_volume34982 ų
包络直径 envelope_diameter109.0 Å
壳层 Rg shell_rg36.62 Å
包络 Rg envelope_rg31.25 Å
形状 Rg shape_rg31.32 Å
总 Rg total_rg31.83 Å
总原子数 total_atoms5022
残基数 n_residues660
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax105.2 Å
Rg (实空间) rg_real32.14 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.88 Å
I(0) (实空间) i0_real8.2370e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2120e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal32.13 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal82370000.0000
解质量估计 total_estimate0.8939
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary36.5 Å
偏度 Skewness skewness0.332
峰度 Kurtosis kurtosis-0.417
角度范围 angular_range— – 0.2450 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha8463000.0000
实空间数据点数 n_real_points50
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.913; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.891
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)