7pe8

cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase mTOR

Homo sapiens

UniProt P42345

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 1 (Q6R327) Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 1 (Q9BPZ7) DEP domain-containing mTOR-interacting protein × 1 (Q8TB45) INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 1 ACETYL GROUP × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MTOR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–2571; UniProt 1–2549

Target of rapamycin complex subunit LST8

Homo sapiens

UniProt Q9BVC4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 1 (Q6R327) Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 1 (Q9BPZ7) DEP domain-containing mTOR-interacting protein × 1 (Q8TB45) INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 1 ACETYL GROUP × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LST8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–326; UniProt 1–326

Rapamycin-insensitive companion of mTOR

Homo sapiens

UniProt Q6R327

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 1 (Q9BPZ7) DEP domain-containing mTOR-interacting protein × 1 (Q8TB45) INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 1 ACETYL GROUP × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RICTR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–1708; UniProt 1–1708

Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1

Homo sapiens

UniProt Q9BPZ7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 1 (Q6R327) DEP domain-containing mTOR-interacting protein × 1 (Q8TB45) INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 1 ACETYL GROUP × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SIN1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–522; UniProt 1–522

DEP domain-containing mTOR-interacting protein

Homo sapiens

UniProt Q8TB45

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Rapamycin-insensitive companion of mTOR × 1 (Q6R327) Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 × 1 (Q9BPZ7) INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 1 ACETYL GROUP × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPTOR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–409; UniProt 1–409

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7pe8
沉积日期 deposition_date2021-08-09
结构标题 titlecryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer
关键词 keywordsDEPTOR, mTOR, regulator, inhibitor, mTORC2, DEP-domain, PDZ-domain, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7pe8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7pe8__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7pe8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)63.28 Å
Rg(电子密度)62.89 Å
总 Rg62.68 Å
原子数29291
残基数3832
排除体积520200 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7pe8__assembly_1__model_1 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 引用文献 (1)