SAXSdb — 7rno

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Beta-2-microglobulin × 1 （P01888） TAP binding protein-like variant × 1 （Q53GH5） N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HMR1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 181–271； UniProt 198–288

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

Bos taurus

UniProt Q95460

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Beta-2-microglobulin × 1 （P01888） TAP binding protein-like variant × 1 （Q53GH5） N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HMR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–180； UniProt 23–201

Beta-2-microglobulin

Bos taurus

UniProt P01888

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （C1ITJ8,Q95460） TAP binding protein-like variant × 1 （Q53GH5） N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2MG_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–99； UniProt 21–118

TAP binding protein-like variant

Homo sapiens

UniProt Q53GH5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Major histocompatibility complex class I-related gene protein × 1 （C1ITJ8,Q95460） Beta-2-microglobulin × 1 （P01888） N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q53GH5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–384； UniProt 22–405

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7rno
沉积日期 deposition_date	2021-07-29
结构标题 title	Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD
关键词 keywords	TAPBPR, MR1, MHC-I, chaperones, adaptive immune system, antigen processing and presentation, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7rno__assembly_1__model_9

Assembly 1 · Model 9 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7rno__assembly_1__model_9 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7rno__assembly_1__model_9 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.08 Å
Rg（电子密度）	30.29 Å
总 Rg	30.97 Å
原子数	11702
残基数	747
排除体积	105060 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7rno__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`7rno__assembly_1__model_2`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`7rno__assembly_1__model_3`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`7rno__assembly_1__model_4`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`7rno__assembly_1__model_5`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`7rno__assembly_1__model_6`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`7rno__assembly_1__model_7`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`7rno__assembly_1__model_8`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`7rno__assembly_1__model_9`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`7rno__assembly_1__model_10`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Major histocompatibility complex class I-related gene protein
分子量 formula_weight	31724.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	117020

MRTHSLRYFRLGVSDPIHGVPEFISVGYVDSHPITTYDSVTRQKEPRAPWMAENLAPDHWERYTQLLRGWQQMFKVELKRLQRHYNHSGSHTYQRMIGCELLEDGSTTGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWLAVDNVAHTIKQAWEANQHELLYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDTLQRTEPPKVRVNHKETFPGITTLYCRAYGFYPPEISINWMKNGEEIFQDTDYGGILPSGDGTYQTWVSVELDPQNGDIYSCHVEHGGVHMVLQGF

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	Bovine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin
分子量 formula_weight	11784.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MIQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDL

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	Bovine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	TAP binding protein-like variant
分子量 formula_weight	42608.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

KPHPAEGQWRAVDVVLDCFLVKDGAHRGAXASSEDRARASLVLKQVPVLDDGSLEDFTDFQGGTLAQDDPPIIFEASVDLVQIPQAEALLHADCSGKEVTCEISRYFLQMTETTVKTAAWFMANVQVSGGGPSISLVMKTPRVAKNEVLWHPTLNLPLSPQGTVRTAVEFQVMTQTQSLSFLLGSSASLDCGFSMAPGLDLISVEWRLQHKGRGQLVYSWTAGQGQAVRKGATLEPAQLGMARDASLTLPGLTIQDEGTYICQITTSLYRAQQIIQLNIQASPKVRLSLANEALLPTLICDIAGYYPLDVVVTWTREELGGSPAQVSGASFSSLRQSVAGTYSISSSLTAEPGSAGATYTCQVTHISLEEPLGASTQVVPPERRLEGGLEVLFQGP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Drosophila melanogaster

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide
分子量 formula_weight	233.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7rnoA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	7rnoA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Major histocompatibility complex class I-related gene protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TAP binding protein-like variant

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rno__assembly_1__model_9

7rno__assembly_1__model_9 | I(q)

7rno__assembly_1__model_9 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)