7s6p

The crystal structure of human ISG15

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 92.5 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-like protein ISG15

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–157	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol	分辨率 2.15 Å R-free 0.268
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 2–157	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol	分辨率 2.15 Å R-free 0.268
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 2–157	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol	分辨率 2.15 Å R-free 0.268
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 2–157	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol	分辨率 2.15 Å R-free 0.268
5	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 2–157	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol	分辨率 2.15 Å R-free 0.268
6	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 2–157	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.04 M potassium phosphate, 16% PEG8000, 20% glycerol	分辨率 2.15 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7S6P	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1Z2M Crystal Structure of ISG15, the Interferon-Induced Ubiquitin Cross Reactive Protein 提交 2005-03-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 0–154（155 aa）	突变：c78s	OS4 OSMIUM 4+ ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；Tris-HCl buffer, PEG4K, MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.223
2HJ8 Solution NMR structure of the C-terminal domain of the interferon alpha-inducible ISG15 protein from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics target HR2873B 提交 2006-06-30	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 78–156（79 aa）片段：ISG15 C-terminal domain (8.9 kDa), Ubiquitin-like 2	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM ammonium citrate, 5 mM CaCl2；压力 ambient NMR样品组成 0.81 mM U-13C,15N HR2873B, 50 mM ammonium citrate, 5 mM CaCl2, 1x protease inhibitor, 0.02% NaN3, pH 6.5, 5% D2O / 95% H2O \| 5% D2O / 95% H2O NMR样品组成 0.9 mM 5%-13C,U-15N HR2873B, 50 mM ammonium citrate, 5 mM CaCl2, 1x protease inhibitor, 0.02% NaN3, pH 6.5, 5% D2O / 95% H2O \| 5% D2O / 95% H2O	分辨率未提供
3PHX OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with ISG15 提交 2010-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 79–156（78 aa）片段：UNP residues 79-156	未记录	ZN ZINC ION × 12 ACY ACETIC ACID × 2 NEH ETHANAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG8K, 0.2M zinc acetate, 0.1M MES sodium salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.192
3PHX OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with ISG15 提交 2010-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 79–156（78 aa）片段：UNP residues 79-156	未记录	ZN ZINC ION × 12 ACY ACETIC ACID × 2 NEH ETHANAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG8K, 0.2M zinc acetate, 0.1M MES sodium salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.192
3PSE Structure of a viral OTU domain protease bound to interferon-stimulated gene 15 (ISG15) 提交 2010-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–156（156 aa）	突变：C78S	4LJ 1.7.6 3-bromanylpropan-1-amine × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；100 mM MES, 23% PEG6000, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.224
3R66 Crystal structure of human ISG15 in complex with NS1 N-terminal region from influenza virus B, Northeast Structural Genomics Consortium Target IDs HX6481, HR2873, and OR2 提交 2011-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–157（157 aa）链 D 1–157（157 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15% PEG3350, 1% dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.265
3RT3 Complex of influenza virus protein with host anti-viral factor 提交 2011-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–158（158 aa）	突变：C78S	SIN SUCCINIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 8000, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.01 Å R-free 0.243
3SDL Crystal structure of human ISG15 in complex with NS1 N-terminal region from influenza B virus, Northeast Structural Genomics Consortium Target IDs HX6481, HR2873, and OR2 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–157（157 aa）链 D 1–157（157 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；15% PEG3350, 1% dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, EVAPORATION	分辨率 2.29 Å R-free 0.261
5TL6 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2016-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 80–157（78 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 80-157)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-tris [pH 6.5], 22% PEG 3350, supplemented with 30% (v/v) glycerol additive in a 1:5 dilution	分辨率 2.62 Å R-free 0.250
5TL6 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2016-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 80–157（78 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 80-157)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-tris [pH 6.5], 22% PEG 3350, supplemented with 30% (v/v) glycerol additive in a 1:5 dilution	分辨率 2.62 Å R-free 0.250
5W8T Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 80–156（77 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1 ZN ZINC ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD	分辨率 2.76 Å R-free 0.224
5W8T Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 80–156（77 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1 ZN ZINC ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD	分辨率 2.76 Å R-free 0.224
5W8U Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 80–156（77 aa）片段：UNP residues 80-156	未记录	ZN ZINC ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD	分辨率 2.41 Å R-free 0.237
5W8U Crystal structure of MERS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2017-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 80–156（77 aa）片段：UNP residues 80-156	未记录	ZN ZINC ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM CaCl2, 100 mM NaO2C2H3 pH 4.6, 28% (v/v) MPD	分辨率 2.41 Å R-free 0.237
6BI8 X-ray structure of MERS coronavirus papain-like protease in complex with human ISG15 提交 2017-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–156（156 aa）	突变：C78S	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；0.25 M Potassium Citrate, pH 8.3 20% PEG3350	分辨率 2.29 Å R-free 0.215
6BI8 X-ray structure of MERS coronavirus papain-like protease in complex with human ISG15 提交 2017-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–156（156 aa）	突变：C78S	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；0.25 M Potassium Citrate, pH 8.3 20% PEG3350	分辨率 2.29 Å R-free 0.215
6FFA FMDV Leader protease bound to substrate ISG15 提交 2018-01-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 79–155（77 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2 M Ammonium Sulfate 0.2 M Sodium potassium tartrate tetrahydrate 0.1 M Sodium citrate tribasic (pH 5.6)	分辨率 1.50 Å R-free 0.186
6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 79–157（79 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 79-157)	突变：G176 replaced with propargylamide 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.231
6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 79–157（79 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 79-157)	突变：G176 replaced with propargylamide 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.231
6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 79–157（79 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 79-157)	突变：G176 replaced with propargylamide 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.231
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–157（156 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100	分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–157（156 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100	分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2–157（156 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100	分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–157（156 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100	分辨率 2.98 Å R-free 0.236
7RBS The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with human ISG15 提交 2021-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2–157（156 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.02 M MgCl2, 0.1 M HEPES buffer, 22% poly(acrylicacid sodium salt) 5100	分辨率 2.98 Å R-free 0.236
8OIF Structure of the UBE1L activating enzyme bound to ISG15 and UBE2L6 提交 2023-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–157（157 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8SE9 Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex (Form 2) 提交 2023-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–157（157 aa）链 D 1–157（157 aa）	突变：C78S 突变：C78S	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SEA Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex (Form 1) 提交 2023-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–157（157 aa）链 D 1–157（157 aa）	突变：C78S 突变：C78S	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8SEB Cryo-EM structure of a single loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 adenylate complex 提交 2023-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–157（157 aa）	突变：C78S	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
8SV8 Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex from a composite map 提交 2023-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–157（157 aa）链 D 1–157（157 aa）	突变：C78S 突变：C78S	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
9NN9 ISG15 complexed with nanobody 提交 2025-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–157（157 aa）片段：residues 1-157	突变：C78S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；25 % PEG 3350, 0.1 M trisodium citrate pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 2.59 Å R-free 0.244
9NN9 ISG15 complexed with nanobody 提交 2025-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–157（157 aa）片段：residues 1-157	突变：C78S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；25 % PEG 3350, 0.1 M trisodium citrate pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 2.59 Å R-free 0.244
9NN9 ISG15 complexed with nanobody 提交 2025-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–157（157 aa）片段：residues 1-157	突变：C78S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；25 % PEG 3350, 0.1 M trisodium citrate pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 2.59 Å R-free 0.244
9ZFO Cryo-EM Structure of Human STAT2-USP18-ISG15 Complex 提交 2025-12-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–157（157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25mM HEPES (pH 8.0), 200mM NaCl and 1.0mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å

共 21 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ISG15_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–159； UniProt 2–157 作者链 B； PDB构建体 4–159； UniProt 2–157 作者链 C； PDB构建体 4–159； UniProt 2–157 作者链 D； PDB构建体 4–159； UniProt 2–157 作者链 E； PDB构建体 4–159； UniProt 2–157 作者链 F； PDB构建体 4–159； UniProt 2–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7s6p
沉积日期 deposition_date	2021-09-14
结构标题 title	The crystal structure of human ISG15
关键词 keywords	ISG15, ubiquitin, signaling protein, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases, CSGID; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.88 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	30.71 Å
零角强度 I(0) i0	151341000.00
分子量 molecular_weight	98975.0 kDa
排除体积 excluded_volume	124970 Å³
包络体积 envelope_volume	168620 Å³
水化壳体积 shell_volume	44011 Å³
包络直径 envelope_diameter	91.9 Å
壳层 Rg shell_rg	39.50 Å
包络 Rg envelope_rg	29.79 Å
形状 Rg shape_rg	30.72 Å
总 Rg total_rg	31.55 Å
总原子数 total_atoms	6965
残基数 n_residues	903
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	92.5 Å
Rg (实空间) rg_real	31.58 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.53 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.5130e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2440e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.71 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	151400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9071
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	42.6 Å
偏度 Skewness skewness	-0.025
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.622
角度范围 angular_range	— – 0.2500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	16720000.0000
实空间数据点数 n_real_points	51
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.963; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.919

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	7s6pA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	7s6pF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	52.210 Å
晶胞边长 b length_b	134.862 Å
晶胞边长 c length_c	78.016 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	108.42 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.150 Å
最低分辨率 resolution_low	46.540 Å
R 因子 r_factor	0.2228
R_work r_work	0.2205
R_free r_free	0.2677

描述 description	Ubiquitin-like protein ISG15
分子量 formula_weight	17304.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	7119

The crystal structure of human ISG15

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-like protein ISG15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	119

fit	/app/data/saxs_computation/s6/7s6p/7s6p.fit
pddf	/app/data/pr_computation/s6/7s6p/7s6p.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/s6/7s6p/7s6p.dat